Multirezistentní gramnegativní patogenní infekce u vysoce rizikových novorozenců na severovýchodě Mexika (InfGNMDR-Neo)

Vyšetřovatelé navrhují přístup smíšeného designu, kohortní studii s vnořenou analýzou případ-kontrola. Předměty studie budou gramnegativní izoláty v klinické laboratoři studijní nemocnice. Expozičním faktorem kohorty bude přítomnost nebo nepřítomnost gramnegativního bakteriálního izolátu multirezistence.

Prospektivní kohorta umožní odhad zátěže gramnegativními infekcemi ve studované populaci a charakterizaci všech izolátů mikroorganismů od studovaných subjektů na úrovni fenotypu a genotypu, konkrétně ve vztahu k expresi multirezistence (MDR) spojené geny (Molekulární charakterizace gramnegativních izolátů MDR); kohortu bude tvořit každý novorozenec od přijetí do zvláštní péče, přes termín izolace a následné sledování až do vyřešení, ať už je to propuštění živé, mrtvé nebo převozem do jiného zařízení. Pro každý z těchto výsledků budou vypočteny rizikové poměry.

Analýza případů a kontrol umožní výzkumnému týmu identifikovat hlavní rizikové faktory přítomné u těch jedinců, kteří dále měli nebo neměli gramnegativní izolát MDR, výpočtem souvisejících poměrů šancí pro souběžné perinatální faktory. Dalším cílem projektu je stanovit korelace a změřit rizikové faktory (odds ratios) mezi gramnegativní infekcí organismy s MDR a souběžným onemocněním a léčbou nabízenou v jeslích speciální péče (lékařské [antibiotika, nesteroidní protizánětlivé léky, steroidy, jiné ], chirurgické a klinické postupy) u novorozenců se zvláštní péčí, bude také dosaženo prostřednictvím vnořených případů a kontrolních studií.

A konečně derivátem tohoto projektu bude zřízení regionálního úložiště bakteriálních izolátů v severovýchodním Mexiku u novorozenců se zvláštní péčí. V první fázi bude toto úložiště uchovávat vzorky bakterií, jak gramnegativních, tak grampozitivních, spolu se speciálně vyvinutou anonymní databází osob hostitelů těchto infekcí. V blízké budoucnosti se zaměření tohoto úložiště může rozšířit na ochranu hub, parazitů a možná i virových izolátů.

Výzkumný tým také navrhl výzkumný cíl v závislosti na dostupnosti rozpočtu, a to je charakterizace a srovnání imunofenotypu jedinců postižených gramnegativní infekcí s organismy rezistentními na MDR, jedinců s infekcí jinými organismy a jedinců, kteří nejsou postižených infekčními komplikacemi.

Všechny gramnegativní izoláty budou testovány na genovou expresi 38 vybraných lokusů antibiotické rezistence a 96 vybraných vzorků bude dále studováno sekvenací nové generace.