Multiresistente gramnegative patogeninfeksjoner hos nyfødte med høy risiko i nordøst i Mexico (InfGNMDR-Neo)

Etterforskerne foreslår en blandet designtilnærming, en kohortstudie med en nestet case-control analyse. Studieemner vil være de gramnegative isolatene ved studiesykehusets kliniske laboratorium. Kohortens eksponeringsfaktor vil være tilstedeværelse eller fravær av et multiresistens gram-negativt bakterieisolat.

Den prospektive kohorten vil tillate estimering av Gram-negativ infeksjonsbyrde i studiepopulasjonen, og karakterisering av alle mikroorganismer isolater fra studieobjekter på fenotype- og genotypenivå, spesielt i forhold til uttrykk for multi-medikamentresistens (MDR) assosiert gener (molekylær karakterisering av gramnegative MDR-isolater); kohorten vil bli dannet av hver nyfødt, fra innleggelse til spesialomsorg, isolasjonsdato og deretter oppfølging til resolusjon, enten det er utskrevet levende, død eller ved overføring til et annet anlegg. Risikoforhold for hvert av disse utfallene vil bli beregnet.

Kasuskontrollanalyse vil tillate forskerteamet å identifisere hovedrisikofaktorer som er tilstede hos de individene som videre hadde eller ikke hadde et gramnegativt MDR-isolat, ved å beregne assosierte oddsforhold for samtidige perinatale faktorer. Et annet prosjektmål, å etablere korrelasjoner og måle risikofaktorer (oddsforhold) mellom Gram-negativ infeksjon med MDR-organismer og samtidig sykdom og behandlinger som tilbys i spesialbarnehagen (medisinsk [antibiotika, ikke-steroide antiinflammatoriske legemidler, steroider, andre ], kirurgiske og kliniske prosedyrer) hos nyfødte under spesiell omsorg, vil også bli oppnådd gjennom tilnærmingen til nestede tilfeller og kontrollstudier.

Til slutt vil et derivat fra dette prosjektet være etableringen av North-East Mexico Regional Repository av bakterieisolater i nyfødte under spesiell omsorg. I det første trinnet vil dette depotet bevare prøver av bakterier, både gramnegative og grampositive, sammen med en spesialutviklet anonym database over individene som er vert for disse infeksjonene. I nær fremtid kan fokuset til dette depotet utvides til bevaring av sopp, parasitter og kanskje virale isolater.

Forskerteamet har også foreslått et utforskende mål, avhengig av tilgjengelighet i budsjettet, og det er karakterisering og sammenligning av immunfenotypen til de individene som er påvirket av Gram-negativ infeksjon med MDR-resistente organismer, de med infeksjon med andre organismer og de som ikke påvirket av smittsomme komplikasjoner.

Alle gram-negative isolater vil bli undersøkt for genuttrykk av 38 utvalgte antibiotikaresistens loki, og 96 utvalgte prøver vil bli studert videre ved neste generasjons sekvensering.