Multidrug-resistente gramnegatieve pathogene infecties bij pasgeborenen met een hoog risico in het noordoosten van Mexico (InfGNMDR-Neo)

De onderzoekers stellen een gemengde opzet voor, een cohortstudie met een geneste case-control analyse. Studieonderwerpen zullen de gramnegatieve isolaten zijn in het klinische laboratorium van het onderzoeksziekenhuis. De blootstellingsfactor van het cohort is de aanwezigheid of afwezigheid van een multidrug-resistent gramnegatief bacterieel isolaat.

Het prospectieve cohort zal de schatting van de Gram-negatieve infectielast in de onderzoekspopulatie mogelijk maken, en de karakterisering van alle micro-organismen isolaten van proefpersonen op fenotype- en genotypeniveau, met name met betrekking tot de expressie van multi-drugresistentie (MDR) geassocieerd genen (Moleculaire karakterisering van Gram-negatieve MDR-isolaten); het cohort wordt gevormd door elke pasgeborene, vanaf de opname tot speciale zorg, de isolatiedatum en vervolgens de follow-up tot de oplossing, hetzij levend, dood of door overplaatsing naar een andere faciliteit. Voor elk van deze uitkomsten worden risicoverhoudingen berekend.

Cases-controls-analyse zal het onderzoeksteam in staat stellen de belangrijkste risicofactoren te identificeren die aanwezig zijn bij die personen die al dan niet een gramnegatief MDR-isolaat hadden, door berekening van bijbehorende odds ratio's voor gelijktijdige perinatale factoren. Een ander projectdoel is om correlaties vast te stellen en risicofactoren (Odds ratio's) te meten tussen Gram-negatieve infectie met MDR-organismen en gelijktijdige ziekte en behandelingen die worden aangeboden in de speciale zorgkwekerij (medische [antibiotica, niet-steroïde anti-inflammatoire geneesmiddelen, steroïden, andere ], chirurgische en klinische procedures) bij pasgeborenen onder speciale zorg, zal ook worden bereikt door middel van de geneste casussen en controles-studiebenadering.

Ten slotte zal een afgeleide van dit project de oprichting zijn van de Noordoost-Mexico Regionale Repository van bacteriële isolaten bij neonaten onder speciale zorg. In de eerste fase zal deze repository specimens van bacteriën bewaren, zowel Gram-negatieve als Gram-positieve, samen met een speciaal ontwikkelde anonieme database van de individuen die deze infecties hosten. In de nabije toekomst kan de focus van deze repository zich uitbreiden naar het behoud van schimmels, parasieten en misschien virale isolaten.

Het onderzoeksteam heeft ook een verkennend doel voorgesteld, afhankelijk van de beschikbaarheid van het budget, en dat is de karakterisering en vergelijking van het immunofenotype van die individuen die getroffen zijn door Gram-negatieve infectie met MDR-resistente organismen, die met infectie met andere organismen en die niet. getroffen door infectieuze complicaties.

Alle gramnegatieve isolaten zullen worden onderzocht op de genexpressie van 38 geselecteerde loci voor antibioticaresistentie, en 96 geselecteerde monsters zullen verder worden bestudeerd door sequentiëring van de volgende generatie.