Étude de l'intérêt du séquençage du trio d'exomes dans l'évaluation étiologique de troubles spécifiques non syndromiques du langage et des apprentissages (TSLA ES)

Les troubles spécifiques du langage et des apprentissages (SLLD) touchent environ 5 à 10 % des enfants d'âge scolaire, soit 1 à 2 enfant(s) par classe. Les SLLD correspondent à l'altération d'une fonction cognitive spécifique et sont répartis en 5 catégories : dyslexie, dysphasie, dyspraxie, dyscalculie et trouble déficitaire de l'attention avec hyperactivité (TDAH) (DSM-5). Ces dernières années, de réels progrès ont été réalisés dans leur diagnostic clinique et leur prise en charge, grâce à une meilleure description de ces troubles dans le DSM-5 et à l'avènement des traitements de réadaptation (neuropsychologie, orthophonie, ergothérapie, orthoptique, etc.). Le SLLD peut survenir dans un contexte sporadique ou familial (implication d'une fratrie, d'un parent symptomatique, d'autres apparentés pouvant mimer une transmission dominante avec une expressivité variable et une pénétrance incomplète).

On soupçonne depuis longtemps que le SLLD est secondaire à une hérédité multifactorielle, avec une combinaison de variations génétiques fréquentes et de facteurs environnementaux. En France, en l'absence de diagnostic syndromique évident, la stratégie actuelle est de prescrire l'array CGH, associé chez les filles à la recherche d'un syndrome de l'X fragile (chez les garçons, ce syndrome entraîne une déficience intellectuelle systématique, ce qui ne justifie pas son étude en SLD). Quelques gènes ont été décrits comme étant spécifiquement impliqués dans une faible proportion de SLLD, le plus souvent avec des variations de novo ou héritées d'un parent symptomatique. Il n'y a pas de caractéristiques cliniques distinctives pour guider le séquençage ciblé de ces gènes. De plus, notre expérience récente montre que des gènes impliqués dans la déficience intellectuelle peuvent également être impliqués dans le SLLD. Très peu d'études ont été publiées dans la littérature évaluant l'intérêt du séquençage de l'exome dans le SLLD. Seules deux études ont été identifiées, impliquant 10 et 43 patients atteints de SLLD spécifique.

Dans la perspective du déploiement du Plan Médecine Génomique France (PFMG 2025), il est important de mettre en place une étude visant à évaluer l'intérêt du séquençage pangénomique dans le bilan étiologique des SLLD.

La participation à l'étude consiste à :

• une visite d'inclusion, où un échantillon de sang supplémentaire sera prélevé lors du bilan de référence
• une visite de résultats (4 mois après la visite d'inclusion)

Étude qualitative facultative : entretien semi-directif 1 an après la visite d'inclusion proposé à 20 patients ou familles avec un résultat positif et à 10 patients avec un résultat négatif.