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Validation prospective d'une signature de la voie de réparation des dommages à l'ADN-Hippo chez les patients atteints d'un cancer gastrique avancé

16 janvier 2024 mis à jour par: Regina Elena Cancer Institute

Nous avons envisagé un scénario dans lequel l'interaction entre les voies ATM-Chk2/ATR-Chk1 et Hippo permet aux cellules GC de surmonter les stimuli de mort induits par la chimiothérapie. Premièrement, ATM-Chk2 et ATR-Chk1 se sont révélés activés dans tous les sous-types moléculaires de GC. De plus, un certain nombre de gènes associés à leur activation basale sont mutés ou amplifiés de manière récurrente.

Ainsi, nous avons caractérisé rétrospectivement une cohorte de patients GC traités avec un traitement de première intention pour les marqueurs liés à la DDR et à l'Hippo, identifiant une signature prédisant une SSP et une SG inférieures. Cette analyse exploratoire a fourni les informations nécessaires (fréquence des biomarqueurs candidats et différence d'effet entre les groupes) pour une étude prospective à des fins de validation, ce qui est l'objectif principal de cet essai.

Aperçu de l'étude

Description détaillée

Cet essai prospectif, multicentrique et non interventionnel est conçu pour valider prospectivement la signature DDR-Hippo en tant que prédicteur d'une SSP inférieure chez les patients atteints de GC localement avancée ou métastatique inopérable recevant un traitement de première intention. Les patients seront évalués pour leur réponse à la chimiothérapie tous les deux cycles selon les critères RECIST actuels. La SSP sera définie comme le temps s'écoulant entre le début de la chimiothérapie jusqu'à la progression objective de la tumeur ou le décès, et la SG comme le temps s'écoulant entre le début de la chimiothérapie jusqu'au décès quelle qu'en soit la cause. Toutes les analyses moléculaires seront centralisées au centre de coordination. Les enquêteurs effectuant des analyses moléculaires seront masqués par les résultats cliniques. Un examen radiologique centralisé est prévu. L'étude sera menée conformément à la Déclaration d'Helsinki et adhère aux critères REMARK.

La deuxième tâche est conçue pour explorer les événements génétiques fonctionnellement liés aux voies DDR et Hippo qui peuvent modifier la signification prédictive de la signature. Ces gènes sont schématiquement regroupés sur la base de l'altération attendue dans : i) Les gènes mutés (groupe 1) à évaluer par DNA-Seq ciblé et les gènes amplifiés (groupe 2) à évaluer par FISH/CISH. Le groupe 1 comprend TP53 (progression défectueuse du cycle cellulaire et réponse apoptotique, transcription aberrante médiée par TAZ/YAP), KRAS (stress de réplication induit par un oncogène et activation des points de contrôle du cycle cellulaire pour éviter l'apoptose et la sénescence), BRCA1 et BRCA2 (réparation par recombinaison homologue défectueuse ), ARID1A, ATR et ATM (réparation altérée de l'ADN initiée par ATM/ATR), RHOA (activation médiée par le récepteur couplé à la protéine G de TAZ/YAP), CTNNB1, APC et FBXW7 (contrôle médié par Wnt de TAZ/YAP). Le cluster 2 englobe MYC et KRAS (stress de réplication induit par un oncogène), CCNE1, CCND1 et CDK6 (transition G1-S dysfonctionnelle nécessitant une activation compensatoire des points de contrôle intra-S et G2/M).

La présente étude est conçue pour générer des preuves prospectives sur la capacité des biomarqueurs étudiés à prédire l'efficacité de la chimiothérapie de première intention chez les patients GC. L'identification des patients qui tirent un bénéfice marginal de la chimiothérapie pourrait potentiellement accélérer une vague d'essais interventionnels avec des agents ciblant le réseau DDR-Hippo (par ex. (inhibiteurs de PARP et inhibiteurs d'ATR-Chk1 et ATM-Chk2), ainsi que pour délimiter la population cible des études avec d'autres composés, tels que les inhibiteurs de point de contrôle immunitaire. Dans l’ensemble, l’approche expérimentale que nous proposons devrait aboutir à la génération d’un nouvel outil à utiliser de manière routinière.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Estimé)

167

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

      • Rome, Italie, 00144
        • "Regina Elena" National Cancer Institute

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

  • Adulte
  • Adulte plus âgé

Accepte les volontaires sains

Non

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Les patients atteints de GC localement avancée ou métastatique inopérable, candidats à un traitement de chimiothérapie de première intention et répondant aux critères suivants, seront inclus dans l'étude.

La description

Critère d'intégration:

Âge >18 ans ; Diagnostic histologique d'un carcinome gastrique (GC) ou d'un carcinome de la jonction gastro-œsophagienne (EJC) localement avancé ou métastatique ; Matériel biologique adéquat à l'analyse moléculaire à réaliser, prélevé (chirurgical ou par biopsie) avant l'administration de tout traitement antitumoral (chimiothérapie et/ou radiothérapie) ; ECOGPS 0-2 ; Fonction hématologique, hépatique et rénale adéquate ; Maladie mesurable selon les critères RECIST ; Consentement éclairé écrit.

Critère d'exclusion:

Chimiothérapie antérieure pour une maladie métastatique ; Comorbidités non contrôlées par un traitement médical approprié ; Métastases cérébrales ; Patient incapable de donner son consentement adéquat pour l'étude

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
Population
La présente étude a été conçue pour générer des preuves solides sur la prédictivité des biomarqueurs étudiés concernant l'efficacité de la chimiothérapie de première intention chez les patients atteints de GC.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Identifier de nouveaux biomarqueurs prédisant l'activité de la chimiothérapie de première intention, afin de parvenir à une meilleure sélection des patients.
Délai: Trois ans
Une analyse d'enrichissement informatique sera effectuée pour tester si les tumeurs des patients avec une SSP plus courte contiennent une représentation plus élevée que prévu de manière aléatoire d'une voie/fonction spécifique. Un accent particulier sera mis, sans toutefois s'y limiter, sur les parcours DDR-Hippo-Wnt. Pour tester plusieurs hypothèses, une correction du taux de fausses découvertes Benjamini-Hochberg sera appliquée (<5 %). Pour l'analyse des données cliniques, le test d'indépendance du chi carré de Pearson (bilatéral) et le coefficient de corrélation de Pearson seront utilisés pour évaluer les relations entre les variables catégorielles et continues, respectivement.
Trois ans
Identifiez des événements génétiques supplémentaires liés moléculairement à la signature DDR-Hippo et améliorez potentiellement sa capacité prédictive.
Délai: Trois ans

L'ARN et l'ADN seront extraits de coupes de tissus FFPE de 5 µm à l'aide du kit AllPrep DNA/RNA FFPE (Qiagen). Les bibliothèques pour RNA-Seq seront préparées à l'aide du kit TruSeq Stranded Total RNA avec une étape initiale de déplétion ribosomale (Illumina). Le séquençage ciblé de l'ADN sera effectué en concevant un panneau d'amplicons personnalisé avec DesignStudio et en utilisant le kit TruSeq Custom Amplicon Low Input (Illumina). L'ARN sera analysé avec notre pipeline cloud (RAP, disponible sur https://bioinformatics.cineca.it/rap/) qui utilise la suite Tuxedo (Tophat, Cufflinks, Cuffdiff).

Pour l'analyse de l'ADN, les applications disponibles sur Basespace (Illumina) seront utilisées. Le séquençage sera effectué sur notre NextSeq500

Trois ans
Étudier les voies d’intérêt à un niveau plus profond et identifier d’autres voies/fonctions potentielles ayant un impact sur les résultats cliniques.
Délai: Trois ans
Les variables cliniques, pathologiques et moléculaires seront testées en analyse univariée de Cox. Un modèle multivarié à risque proportionnel de Cox pour la SSP sera construit avec des variables testées significatives lors de l'évaluation univariée et les estimations associées rapportées sous forme de HR et d'IC ​​à 95 %.
Trois ans

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

26 octobre 2018

Achèvement primaire (Réel)

30 août 2023

Achèvement de l'étude (Estimé)

30 août 2024

Dates d'inscription aux études

Première soumission

28 mars 2023

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

11 janvier 2024

Première publication (Réel)

12 janvier 2024

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

18 janvier 2024

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

16 janvier 2024

Dernière vérification

1 janvier 2024

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

INDÉCIS

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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