Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Prospektiv validering av en DNA-skada reparations-flodhästvägsignatur hos patienter med avancerad magcancer

16 januari 2024 uppdaterad av: Regina Elena Cancer Institute

Vi föreställde oss ett scenario där interaktionen mellan ATM-Chk2/ATR-Chk1-vägarna och Hippo gör det möjligt för GC-celler att övervinna kemoterapi-inducerade dödsstimuli. Först visade sig ATM-Chk2 och ATR-Chk1 vara aktiverade över alla GC molekylära subtyper. Dessutom muteras eller amplifieras ett antal gener associerade med deras basala aktivering återkommande.

Således karakteriserade vi retrospektivt en kohort av GC-patienter som behandlades med första linjens terapi för DDR- och Hippo-relaterade markörer, vilket identifierade en signatur som förutsäger sämre PFS och OS. Denna explorativa analys gav den nödvändiga informationen (frekvens av kandidatbiomarkörer och effektskillnad mellan grupper) för en prospektiv studie med valideringssyften, vilket är huvudmålet med denna studie.

Studieöversikt

Detaljerad beskrivning

Denna prospektiva, multicenter, icke-interventionella studie är utformad för att prospektivt validera DDR-flodhästsignaturen som en prediktor för sämre PFS hos patienter med inoperabel lokalt avancerad eller metastaserad GC som får förstahandsbehandling. Patienterna kommer att utvärderas för svar på kemoterapi varannan cykel enligt gällande RECIST-kriterier. PFS kommer att definieras som tiden mellan påbörjandet av kemoterapi tills objektiv tumörprogression eller dödsfall, och OS som den tid som förflyter mellan initiering av kemoterapi till dödsfall av någon orsak. Alla molekylära analyser kommer att centraliseras till det koordinerande centret. Utredare som utför molekylära analyser kommer att maskeras till kliniska resultat. Centraliserad radiologisk granskning planeras. Studien kommer att genomföras i enlighet med Helsingforsdeklarationen och följer REMARK-kriterierna.

Den andra uppgiften är designad för att utforska genetiska händelser funktionellt relaterade till DDR- och Hippo-vägarna som kan modifiera signaturens prediktiva betydelse. Dessa gener är schematiskt klustrade på basis av den förväntade förändringen i: i) Muterade gener (kluster 1) som ska utvärderas av targeted DNA-Seq och amplifierade gener (kluster 2) som ska utvärderas av FISH/CISH. Kluster 1 inkluderar TP53 (defekt cellcykelprogression och apoptotisk respons, avvikande TAZ/YAP-medierad transkription), KRAS (onkogeninducerad replikationsstress och aktivering av cellcykelkontrollpunkter för att undvika apoptos och senescens), BRCA1 och BRCA2 (defekt reparationshomolog rekombination) ), ARID1A, ATR och ATM (förändrad ATM/ATR-initierad DNA-reparation), RHOA (G-proteinkopplad receptormedierad aktivering av TAZ/YAP), CTNNB1, APC och FBXW7 (Wnt-medierad kontroll av TAZ/YAP). Kluster 2 omfattar MYC och KRAS (onkogeninducerad replikationsstress), CCNE1, CCND1 och CDK6 (dysfunktionell G1-S-övergång som kräver kompensatorisk aktivering av intra-S- och G2/M-kontrollpunkter).

Den aktuella studien är utformad för att generera prospektiva bevis på förmågan hos de undersökta biomarkörerna att förutsäga effekten av första linjens kemoterapi hos GC-patienter. Identifieringen av patienter som drar marginell nytta av kemoterapi har potentialen att påskynda en våg av interventionsstudier med medel som riktar sig till DDR-flodhästnätverket (t.ex. PARP-hämmare och ATR-Chk1- och ATM-Chk2-hämmare), samt för att avgränsa målpopulationen för studier med andra föreningar, såsom immunkontrollpunktshämmare. Sammantaget förväntas det experimentella tillvägagångssätt som vi föreslår kulminera i genereringen av ett nytt verktyg som ska användas rutinmässigt.

Studietyp

Observationell

Inskrivning (Beräknad)

167

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studieorter

      • Rome, Italien, 00144
        • "Regina Elena" National Cancer Institute

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

  • Vuxen
  • Äldre vuxen

Tar emot friska volontärer

Nej

Testmetod

Icke-sannolikhetsprov

Studera befolkning

Patienter med inoperabel lokalt avancerad eller metastaserad GC som är kandidater för första linjens kemoterapibehandling och uppfyller följande kriterier kommer att inkluderas i studien

Beskrivning

Inklusionskriterier:

Ålder >18 år; Histologisk diagnos av lokalt avancerad eller metastatisk gastrisk karcinom (GC) eller gastroesofageal junction carcinoma (EJC); Biologiskt material som är lämpligt för molekylär analys som ska utföras, tas (vid operation eller genom biopsi) före administrering av någon antitumörbehandling (kemoterapi och/eller strålbehandling); ECOG PS 0-2; Adekvat hematologisk, lever- och njurfunktion; Mätbar sjukdom enligt RECIST-kriterier; Skriftligt informerat samtycke.

Exklusions kriterier:

Tidigare kemoterapi för metastaserande sjukdom; Samsjukligheter som inte kontrolleras med lämplig medicinsk terapi; Hjärnmetastaser; Patienten kan inte ge tillräckligt samtycke till studien

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

Kohorter och interventioner

Grupp / Kohort
Intervention / Behandling
Befolkning
Den aktuella studien var utformad för att generera solida bevis på förutsägbarheten hos de undersökta biomarkörerna angående effektiviteten av första linjens kemoterapi hos patienter med GC

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Identifiera nya biomarkörer som förutsäger aktiviteten av första linjens kemoterapi, för att uppnå bättre patientval.
Tidsram: Tre år
Beräkningsanrikningsanalys kommer att utföras för att testa om tumörer hos patienter med kortare PFS innehåller en högre än slumpmässigt förväntad representation av en specifik väg/funktion. Särskild vikt kommer att läggas på, men inte begränsat till, DDR-Hippo-Wnt-vägarna. För testning av flera hypoteser kommer en Benjamini-Hochberg False Discovery Rate-korrigering att tillämpas (<5%). För klinisk dataanalys kommer Pearsons Chi-kvadrattest av oberoende (2-tailed) och Pearsons korrelationskoefficient att användas för att bedöma sambanden mellan kategoriska respektive kontinuerliga variabler.
Tre år
Identifiera ytterligare genetiska händelser molekylärt kopplade till DDR-flodhästsignaturen och förbättra potentiellt dess prediktiva förmåga.
Tidsram: Tre år

RNA och DNA kommer att extraheras från 5µm FFPE-vävnadssnitt med hjälp av AllPrep DNA/RNA FFPE-kit (Qiagen). Bibliotek för RNA-Seq kommer att förberedas med hjälp av TruSeq Stranded Total RNA-kit med ett initialt ribosomalt utarmningssteg (Illumina). Riktad DNA-sekvensering kommer att utföras genom att designa en anpassad amplikonpanel med DesignStudio och använda TruSeq Custom Amplicon Low Input Kit (Illumina). RNA kommer att analyseras med vår molnpipeline (RAP, tillgänglig på https://bioinformatics.cineca.it/rap/) som använder Tuxedo Suite (Tophat, Cufflinks, Cuffdiff).

För DNA-analys kommer applikationer tillgängliga på Basespace (Illumina) att användas. Sekvensering kommer att utföras på vår NextSeq500

Tre år
Undersök vägar av intresse på en djupare nivå, samt identifiera andra potentiella vägar/funktioner som påverkar kliniska resultat.
Tidsram: Tre år
Kliniska, patologiska och molekylära variabler kommer att testas i univariat Cox-analys. En multivariat Cox proportionell riskmodell för PFS kommer att byggas med variabler som testas signifikant vid den univariata bedömningen, och de relaterade uppskattningarna rapporteras som HR och 95 %CI.
Tre år

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

26 oktober 2018

Primärt slutförande (Faktisk)

30 augusti 2023

Avslutad studie (Beräknad)

30 augusti 2024

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

28 mars 2023

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

11 januari 2024

Första postat (Faktisk)

12 januari 2024

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

18 januari 2024

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

16 januari 2024

Senast verifierad

1 januari 2024

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Plan för individuella deltagardata (IPD)

Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?

OBESLUTSAM

Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument

Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt

Nej

Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt

Nej

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Kliniska prövningar på Magcancer

3
Prenumerera