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Convalida prospettica di una firma del percorso di riparazione del danno al DNA-ippopotamo in pazienti con cancro gastrico avanzato

16 gennaio 2024 aggiornato da: Regina Elena Cancer Institute

Abbiamo immaginato uno scenario in cui l'interazione tra i percorsi ATM-Chk2/ATR-Chk1 e Hippo consente alle cellule GC di superare gli stimoli di morte indotti dalla chemioterapia. Innanzitutto, è stato scoperto che ATM-Chk2 e ATR-Chk1 sono attivati ​​in tutti i sottotipi molecolari GC. Inoltre, numerosi geni associati alla loro attivazione basale vengono mutati o amplificati in modo ricorrente.

Pertanto, abbiamo caratterizzato retrospettivamente una coorte di pazienti con GC trattati con terapia di prima linea per marcatori correlati a DDR e Hippo, identificando una firma predittiva di PFS e OS inferiori. Questa analisi esplorativa ha fornito le informazioni necessarie (frequenza dei biomarcatori candidati e differenza di effetto tra i gruppi) per uno studio prospettico con scopi di validazione, che è l'obiettivo principale di questo studio.

Panoramica dello studio

Descrizione dettagliata

Questo studio prospettico, multicentrico e non interventistico è progettato per convalidare prospetticamente la firma DDR-Hippo come predittore di PFS inferiore in pazienti con GC inoperabile localmente avanzato o metastatico sottoposti a terapia di prima linea. I pazienti saranno valutati per la risposta alla chemioterapia ogni due cicli secondo gli attuali criteri RECIST. La PFS sarà definita come il tempo che intercorre tra l'inizio della chemioterapia fino alla progressione oggettiva del tumore o alla morte, e l'OS come il tempo intercorrente tra l'inizio della chemioterapia fino alla morte per qualsiasi causa. Tutte le analisi molecolari saranno centralizzate presso il centro di coordinamento. Gli investigatori che eseguono analisi molecolari non potranno conoscere i risultati clinici. È prevista una revisione radiologica centralizzata. Lo studio sarà condotto in conformità con la Dichiarazione di Helsinki e aderisce ai criteri REMARK.

Il secondo compito è progettato per esplorare eventi genetici funzionalmente correlati ai percorsi DDR e Hippo che potrebbero modificare il significato predittivo della firma. Questi geni sono schematicamente raggruppati sulla base dell'alterazione prevista in: i) Geni mutati (cluster 1) da valutare mediante DNA-Seq mirato e geni amplificati (cluster 2) da valutare mediante FISH/CISH. Il cluster 1 include TP53 (progressione difettosa del ciclo cellulare e risposta apoptotica, trascrizione aberrante mediata da TAZ/YAP), KRAS (stress di replicazione indotto dall'oncogene e attivazione dei checkpoint del ciclo cellulare per evitare apoptosi e senescenza), BRCA1 e BRCA2 (riparazione difettosa della ricombinazione omologa ), ARID1A, ATR e ATM (riparazione alterata del DNA avviata da ATM/ATR), RHOA (attivazione mediata dal recettore accoppiato a proteine ​​G di TAZ/YAP), CTNNB1, APC e FBXW7 (controllo mediato da Wnt di TAZ/YAP). Il cluster 2 comprende MYC e KRAS (stress di replicazione indotto da oncogeni), CCNE1, CCND1 e CDK6 (transizione disfunzionale G1-S che richiede l'attivazione compensativa dei checkpoint intra-S e G2/M).

Il presente studio è progettato per generare prove prospettiche sulla capacità dei biomarcatori studiati di prevedere l'efficacia della chemioterapia di prima linea nei pazienti con GC. L’identificazione dei pazienti che traggono benefici marginali dalla chemioterapia ha il potenziale per accelerare un’ondata di studi interventistici con agenti mirati alla rete DDR-Hippo (ad es. PARP inibitori e inibitori ATR-Chk1 e ATM-Chk2), nonché per delineare la popolazione target per studi con altri composti, come gli inibitori del checkpoint immunitario. Nel complesso, si prevede che l'approccio sperimentale che proponiamo culminerà nella generazione di un nuovo strumento da utilizzare su base di routine.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Stimato)

167

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Luoghi di studio

      • Rome, Italia, 00144
        • "Regina Elena" National Cancer Institute

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

  • Adulto
  • Adulto più anziano

Accetta volontari sani

No

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

Saranno inclusi nello studio i pazienti con GC inoperabile localmente avanzato o metastatico candidati al trattamento chemioterapico di prima linea e che soddisfano i seguenti criteri

Descrizione

Criterio di inclusione:

Età >18 anni; Diagnosi istologica di carcinoma gastrico (GC) localmente avanzato o metastatico o carcinoma della giunzione gastroesofagea (EJC); Materiale biologico adeguato per analisi molecolari da effettuare, prelevato (in sede chirurgica o mediante biopsia) prima della somministrazione di qualsiasi trattamento antitumorale (chemioterapia e/o radioterapia); ECOGPS 0-2; Funzionalità ematologica, epatica e renale adeguata; Malattia misurabile secondo i criteri RECIST; Consenso informato scritto.

Criteri di esclusione:

Precedente chemioterapia per malattia metastatica; Comorbilità non controllate con terapia medica adeguata; Metastasi cerebrali; Paziente incapace di fornire un consenso adeguato per lo studio

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
Popolazione
Il presente studio è stato progettato per generare prove solide sulla predittività dei biomarcatori studiati riguardo all'efficacia della chemioterapia di prima linea nei pazienti con GC

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Identificare nuovi biomarcatori che predicono l'attività della chemioterapia di prima linea, al fine di ottenere una migliore selezione dei pazienti.
Lasso di tempo: Tre anni
Verrà effettuata un'analisi di arricchimento computazionale per verificare se i tumori di pazienti con PFS più breve contengono una rappresentazione più elevata di quella prevista casualmente di un percorso/funzione specifico. Particolare enfasi sarà posta, ma non limitata a, sui percorsi DDR-Hippo-Wnt. Per il test di ipotesi multiple verrà applicata una correzione del tasso di false scoperte Benjamini-Hochberg (<5%). Per l'analisi dei dati clinici, verranno utilizzati il ​​test di indipendenza Chi quadrato di Pearson (a due code) e il coefficiente di correlazione di Pearson per valutare rispettivamente le relazioni tra variabili categoriche e continue.
Tre anni
Identificare ulteriori eventi genetici legati a livello molecolare alla firma DDR-Hippo e potenzialmente migliorarne la capacità predittiva.
Lasso di tempo: Tre anni

L'RNA e il DNA verranno estratti da sezioni di tessuto FFPE da 5 µm utilizzando il kit AllPrep DNA/RNA FFPE (Qiagen). Le librerie per RNA-Seq verranno preparate utilizzando il kit TruSeq Stranded Total RNA con una fase iniziale di deplezione ribosomiale (Illumina). Il sequenziamento mirato del DNA verrà condotto progettando un pannello di ampliconi personalizzato con DesignStudio e utilizzando il kit TruSeq Custom Amplicon Low Input Kit (Illumina). L'RNA verrà analizzato con la nostra pipeline cloud (RAP, disponibile su https://bioinformatics.cineca.it/rap/) che utilizza la Tuxedo Suite (Tophat, Cufflinks, Cuffdiff).

Per l'analisi del DNA verranno utilizzate le applicazioni disponibili su Basespace (Illumina). Il sequenziamento verrà eseguito sul nostro NextSeq500

Tre anni
Esaminare i percorsi di interesse a un livello più profondo, nonché identificare altri potenziali percorsi/funzioni che incidono sui risultati clinici.
Lasso di tempo: Tre anni
Le variabili cliniche, patologiche e molecolari saranno testate mediante analisi di Cox univariata. Verrà costruito un modello di rischio proporzionale di Cox multivariato per la PFS con variabili risultate significative nella valutazione univariata e le relative stime riportate come HR e IC al 95%.
Tre anni

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

26 ottobre 2018

Completamento primario (Effettivo)

30 agosto 2023

Completamento dello studio (Stimato)

30 agosto 2024

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

28 marzo 2023

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

11 gennaio 2024

Primo Inserito (Effettivo)

12 gennaio 2024

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

18 gennaio 2024

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

16 gennaio 2024

Ultimo verificato

1 gennaio 2024

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

INDECISO

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

Prove cliniche su Tumore gastrico

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