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Prospektive Validierung einer DNA-Schadensreparatur-Hippo-Signalwegsignatur bei Patienten mit fortgeschrittenem Magenkrebs

16. Januar 2024 aktualisiert von: Regina Elena Cancer Institute

Wir stellten uns ein Szenario vor, in dem die Interaktion zwischen den ATM-Chk2/ATR-Chk1-Signalwegen und Hippo es GC-Zellen ermöglicht, durch Chemotherapie verursachte Todesreize zu überwinden. Erstens wurde festgestellt, dass ATM-Chk2 und ATR-Chk1 über alle GC-Molekülsubtypen hinweg aktiviert sind. Darüber hinaus werden eine Reihe von Genen, die mit ihrer Grundaktivierung verbunden sind, immer wieder mutiert oder amplifiziert.

Daher haben wir retrospektiv eine Kohorte von GC-Patienten, die mit einer Erstlinientherapie behandelt wurden, auf DDR- und Hippo-bezogene Marker charakterisiert und dabei eine Signatur identifiziert, die ein schlechteres PFS und OS vorhersagt. Diese explorative Analyse lieferte die notwendigen Informationen (Häufigkeit der Kandidaten-Biomarker und Wirkungsunterschiede zwischen den Gruppen) für eine prospektive Studie mit Validierungszwecken, was das Hauptziel dieser Studie ist.

Studienübersicht

Detaillierte Beschreibung

Diese prospektive, multizentrische, nicht-interventionelle Studie dient der prospektiven Validierung der DDR-Hippo-Signatur als Prädiktor für ein schlechteres PFS bei Patienten mit inoperablem lokal fortgeschrittenem oder metastasiertem GC, die eine Erstlinientherapie erhalten. Das Ansprechen der Patienten auf die Chemotherapie wird alle zwei Zyklen anhand der aktuellen RECIST-Kriterien beurteilt. PFS wird definiert als die Zeit, die zwischen dem Beginn der Chemotherapie und dem objektiven Fortschreiten des Tumors oder dem Tod vergeht, und OS als die Zeit, die zwischen dem Beginn der Chemotherapie und dem Tod aus irgendeinem Grund vergeht. Alle molekularen Analysen werden im Koordinierungszentrum zentralisiert. Forscher, die molekulare Analysen durchführen, werden auf klinische Ergebnisse beschränkt. Eine zentralisierte radiologische Untersuchung ist geplant. Die Studie wird in Übereinstimmung mit der Deklaration von Helsinki durchgeführt und entspricht den REMARK-Kriterien.

Die zweite Aufgabe dient der Untersuchung genetischer Ereignisse, die funktionell mit den DDR- und Hippo-Signalwegen zusammenhängen und die prädiktive Bedeutung der Signatur verändern können. Diese Gene werden schematisch auf der Grundlage der erwarteten Veränderung in folgenden Gruppen zusammengefasst: i) Mutierte Gene (Cluster 1), die durch gezielte DNA-Seq bewertet werden sollen, und amplifizierte Gene (Cluster 2), die durch FISH/CISH bewertet werden sollen. Cluster 1 umfasst TP53 (defekter Zellzyklusverlauf und apoptotische Reaktion, aberrante TAZ/YAP-vermittelte Transkription), KRAS (Onkogen-induzierter Replikationsstress und Aktivierung von Zellzyklus-Checkpoints zur Vermeidung von Apoptose und Seneszenz), BRCA1 und BRCA2 (defekte homologe Rekombinationsreparatur). ), ARID1A, ATR und ATM (veränderte ATM/ATR-initiierte DNA-Reparatur), RHOA (G-Protein-gekoppelte Rezeptor-vermittelte Aktivierung von TAZ/YAP), CTNNB1, APC und FBXW7 (Wnt-vermittelte Kontrolle von TAZ/YAP). Cluster 2 umfasst MYC und KRAS (Onkogen-induzierter Replikationsstress), CCNE1, CCND1 und CDK6 (dysfunktionaler G1-S-Übergang, der eine kompensatorische Aktivierung von Intra-S- und G2/M-Kontrollpunkten erfordert).

Ziel der vorliegenden Studie ist es, prospektive Belege für die Fähigkeit der untersuchten Biomarker zu generieren, die Wirksamkeit einer Erstlinien-Chemotherapie bei GC-Patienten vorherzusagen. Die Identifizierung von Patienten, die nur geringfügig von einer Chemotherapie profitieren, birgt das Potenzial, eine Welle interventioneller Studien mit Wirkstoffen anzustoßen, die auf das DDR-Hippo-Netzwerk abzielen (z. B. PARP-Inhibitoren und ATR-Chk1- und ATM-Chk2-Inhibitoren) sowie zur Abgrenzung der Zielgruppe für Studien mit anderen Verbindungen, wie z. B. Immun-Checkpoint-Inhibitoren. Insgesamt wird erwartet, dass der von uns vorgeschlagene experimentelle Ansatz in der Entwicklung eines neuen Werkzeugs für den routinemäßigen Einsatz gipfelt.

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Geschätzt)

167

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

      • Rome, Italien, 00144
        • "Regina Elena" National Cancer Institute

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

  • Erwachsene
  • Älterer Erwachsener

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

Patienten mit inoperablem lokal fortgeschrittenem oder metastasiertem GC, die Kandidaten für eine Erstlinien-Chemotherapie sind und die folgenden Kriterien erfüllen, werden in die Studie aufgenommen

Beschreibung

Einschlusskriterien:

Alter >18 Jahre; Histologische Diagnose eines lokal fortgeschrittenen oder metastasierten Magenkarzinoms (GC) oder eines gastroösophagealen Übergangskarzinoms (EJC); Biologisches Material, das für die Durchführung einer molekularen Analyse geeignet ist und vor der Verabreichung einer Antitumorbehandlung (Chemotherapie und/oder Strahlentherapie) entnommen wird (bei einer Operation oder durch Biopsie); ECOG PS 0-2; Ausreichende hämatologische, hepatische und renale Funktion; Messbare Krankheit gemäß RECIST-Kriterien; Schriftliche Einverständniserklärung.

Ausschlusskriterien:

Vorherige Chemotherapie bei metastasierender Erkrankung; Komorbiditäten, die nicht durch geeignete medizinische Therapie kontrolliert werden können; Hirnmetastasen; Der Patient ist nicht in der Lage, der Studie ausreichend zuzustimmen

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
Intervention / Behandlung
Bevölkerung
Ziel der vorliegenden Studie war es, solide Belege für die Prädiktion der untersuchten Biomarker hinsichtlich der Wirksamkeit der Erstlinien-Chemotherapie bei Patienten mit GC zu generieren

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Identifizieren Sie neue Biomarker, die die Aktivität der Erstlinien-Chemotherapie vorhersagen, um eine bessere Patientenauswahl zu erreichen.
Zeitfenster: 3 Jahre
Eine rechnergestützte Anreicherungsanalyse wird durchgeführt, um zu testen, ob Tumore von Patienten mit kürzerem PFS eine höhere als zufällig erwartete Darstellung eines bestimmten Signalwegs/einer bestimmten Funktion enthalten. Besonderes Augenmerk wird auf die DDR-Hippo-Wnt-Pfade gelegt, ist aber nicht darauf beschränkt. Für das Testen mehrerer Hypothesen wird eine Benjamini-Hochberg-False-Discovery-Rate-Korrektur angewendet (<5 %). Für die klinische Datenanalyse werden der Pearson-Chi-Quadrat-Unabhängigkeitstest (zweiseitig) und der Pearson-Korrelationskoeffizient verwendet, um die Beziehungen zwischen kategorialen bzw. kontinuierlichen Variablen zu bewerten.
3 Jahre
Identifizieren Sie zusätzliche genetische Ereignisse, die molekular mit der DDR-Hippo-Signatur verknüpft sind, und verbessern Sie möglicherweise deren Vorhersagefähigkeit.
Zeitfenster: 3 Jahre

RNA und DNA werden mit dem AllPrep DNA/RNA FFPE Kit (Qiagen) aus 5µm FFPE-Gewebeschnitten extrahiert. Bibliotheken für RNA-Seq werden mithilfe des TruSeq Stranded Total RNA-Kits mit einem ersten Schritt zur ribosomalen Depletion (Illumina) vorbereitet. Die gezielte DNA-Sequenzierung wird durchgeführt, indem mit DesignStudio ein benutzerdefiniertes Amplikon-Panel entworfen und das TruSeq Custom Amplicon Low Input Kit (Illumina) verwendet wird. Die RNA wird mit unserer Cloud-Pipeline (RAP, verfügbar unter https://bioinformatics.cineca.it/rap/) analysiert, die die Tuxedo Suite (Tophat, Cufflinks, Cuffdiff) verwendet.

Für die DNA-Analyse werden auf Basespace (Illumina) verfügbare Anwendungen verwendet. Die Sequenzierung wird auf unserem NextSeq500 durchgeführt

3 Jahre
Untersuchen Sie interessante Pfade auf einer tieferen Ebene und identifizieren Sie andere potenzielle Pfade/Funktionen, die sich auf die klinischen Ergebnisse auswirken.
Zeitfenster: 3 Jahre
Klinische, pathologische und molekulare Variablen werden in der univariaten Cox-Analyse getestet. Ein multivariates Cox-Proportional-Hazard-Modell für PFS wird mit Variablen erstellt, die bei der univariaten Bewertung signifikant sind, und den zugehörigen Schätzungen, die als HR und 95 %-KI angegeben werden.
3 Jahre

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

26. Oktober 2018

Primärer Abschluss (Tatsächlich)

30. August 2023

Studienabschluss (Geschätzt)

30. August 2024

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

28. März 2023

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

11. Januar 2024

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

12. Januar 2024

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

18. Januar 2024

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

16. Januar 2024

Zuletzt verifiziert

1. Januar 2024

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)

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UNENTSCHIEDEN

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

Klinische Studien zur Magenkrebs

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