Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

Prospektywna walidacja naprawy uszkodzeń DNA - sygnatury ścieżki hipopotama u pacjentów z zaawansowanym rakiem żołądka

16 stycznia 2024 zaktualizowane przez: Regina Elena Cancer Institute

Wyobraziliśmy sobie scenariusz, w którym interakcja między szlakami ATM-Chk2/ATR-Chk1 i Hippo umożliwia komórkom GC przezwyciężenie bodźców śmierci wywołanych chemioterapią. Po pierwsze, stwierdzono, że ATM-Chk2 i ATR-Chk1 są aktywowane we wszystkich podtypach molekularnych GC. Co więcej, wiele genów związanych z ich podstawową aktywacją ulega cyklicznym mutacjom lub amplifikacji.

W związku z tym retrospektywnie scharakteryzowaliśmy kohortę pacjentów z GC leczonych terapią pierwszego rzutu pod kątem markerów związanych z DDR i Hippo, identyfikując sygnaturę przewidującą gorszy PFS i OS. Ta analiza eksploracyjna dostarczyła niezbędnych informacji (częstotliwość potencjalnych biomarkerów i różnica efektów między grupami) do prospektywnego badania w celach walidacyjnych, co jest głównym celem tego badania.

Przegląd badań

Szczegółowy opis

To prospektywne, wieloośrodkowe, nieinterwencyjne badanie ma na celu prospektywną walidację sygnatury DDR-Hippo jako czynnika predykcyjnego gorszego PFS u pacjentów z nieoperacyjną miejscowo zaawansowaną lub przerzutową GC otrzymujących terapię pierwszego rzutu. Odpowiedź pacjentów na chemioterapię będzie oceniana co dwa cykle według aktualnych kryteriów RECIST. PFS będzie definiowane jako czas, jaki upływa od rozpoczęcia chemioterapii do obiektywnej progresji nowotworu lub śmierci, a OS jako czas, jaki upływa od rozpoczęcia chemioterapii do śmierci z jakiejkolwiek przyczyny. Wszystkie analizy molekularne będą scentralizowane w ośrodku koordynującym. Badacze przeprowadzający analizy molekularne będą maskowani wynikami klinicznymi. Planowana jest scentralizowana ocena radiologiczna. Badanie zostanie przeprowadzone zgodnie z Deklaracją Helsińską i będzie zgodne z kryteriami UWAGI.

Drugie zadanie ma na celu zbadanie zdarzeń genetycznych funkcjonalnie powiązanych ze szlakami DDR i Hippo, które mogą modyfikować znaczenie predykcyjne sygnatury. Geny te są schematycznie pogrupowane na podstawie oczekiwanych zmian w: i) Zmutowanych genach (skupienie 1) do oceny za pomocą docelowej sekwencji DNA i amplifikowanych genach (skupienie 2) do oceny metodą FISH/CISH. Skupienie 1 obejmuje TP53 (wadliwa progresja cyklu komórkowego i odpowiedź apoptotyczna, nieprawidłowa transkrypcja za pośrednictwem TAZ/YAP), KRAS (stres replikacyjny indukowany onkogenem i aktywacja punktów kontrolnych cyklu komórkowego w celu uniknięcia apoptozy i starzenia), BRCA1 i BRCA2 (wadliwa naprawa rekombinacji homologicznej ), ARID1A, ATR i ATM (zmieniona naprawa DNA inicjowana przez ATM/ATR), RHOA (aktywacja TAZ/YAP za pośrednictwem receptora sprzężonego z białkiem G), CTNNB1, APC i FBXW7 (kontrola TAZ/YAP za pośrednictwem Wnt). Skupienie 2 obejmuje MYC i KRAS (stres replikacyjny indukowany onkogenem), CCNE1, CCND1 i CDK6 (dysfunkcjonalne przejście G1-S wymagające kompensacyjnej aktywacji punktów kontrolnych wewnątrz S i G2/M).

Celem niniejszego badania jest wygenerowanie prospektywnych dowodów na zdolność badanych biomarkerów do przewidywania skuteczności chemioterapii pierwszego rzutu u pacjentów z GC. Identyfikacja pacjentów, którzy czerpią marginalne korzyści z chemioterapii, może przyspieszyć falę badań interwencyjnych z użyciem środków ukierunkowanych na sieć DDR-Hippo (np. inhibitory PARP oraz inhibitory ATR-Chk1 i ATM-Chk2), a także w celu wyznaczenia populacji docelowej do badań z innymi związkami, takimi jak inhibitory immunologicznych punktów kontrolnych. Ogólnie rzecz biorąc, oczekuje się, że proponowane przez nas podejście eksperymentalne zakończy się wygenerowaniem nowego narzędzia do rutynowego stosowania.

Typ studiów

Obserwacyjny

Zapisy (Szacowany)

167

Kontakty i lokalizacje

Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.

Lokalizacje studiów

      • Rome, Włochy, 00144
        • "Regina Elena" National Cancer Institute

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

  • Dorosły
  • Starszy dorosły

Akceptuje zdrowych ochotników

Nie

Metoda próbkowania

Próbka bez prawdopodobieństwa

Badana populacja

Do badania zostaną włączeni pacjenci z nieoperacyjną, miejscowo zaawansowaną lub przerzutową GC, którzy są kandydatami do chemioterapii pierwszego rzutu i spełniają poniższe kryteria:

Opis

Kryteria przyjęcia:

Wiek > 18 lat; Diagnostyka histologiczna miejscowo zaawansowanego lub przerzutowego raka żołądka (GC) lub raka połączenia żołądkowo-przełykowego (EJC); Materiał biologiczny odpowiedni do przeprowadzenia analizy molekularnej, pobrany (podczas operacji lub biopsji) przed zastosowaniem jakiegokolwiek leczenia przeciwnowotworowego (chemioterapii i/lub radioterapii); ECOG PS 0-2; Odpowiednia czynność hematologiczna, wątroby i nerek; Choroba mierzalna według kryteriów RECIST; Pisemna świadoma zgoda.

Kryteria wyłączenia:

Poprzednia chemioterapia z powodu choroby przerzutowej; Choroby współistniejące, których nie można kontrolować odpowiednią terapią medyczną; przerzuty do mózgu; Pacjent nie jest w stanie wyrazić odpowiedniej zgody na badanie

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

Kohorty i interwencje

Grupa / Kohorta
Interwencja / Leczenie
Populacja
Celem niniejszego badania było wygenerowanie solidnych dowodów na przewidywalność badanych biomarkerów w odniesieniu do skuteczności chemioterapii pierwszego rzutu u pacjentów z GC

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Identyfikacja nowych biomarkerów prognozujących aktywność chemioterapii pierwszego rzutu, aby zapewnić lepszą selekcję pacjentów.
Ramy czasowe: Trzy lata
Przeprowadzona zostanie analiza wzbogacania obliczeniowego w celu sprawdzenia, czy guzy pacjentów z krótszym PFS zawierają wyższą niż losowo oczekiwana reprezentację określonej ścieżki/funkcji. Szczególny nacisk zostanie położony między innymi na ścieżki DDR-Hippo-Wnt. W przypadku testowania wielu hipotez zostanie zastosowana korekta współczynnika fałszywych odkryć Benjaminiego-Hochberga (<5%). Do analizy danych klinicznych do oceny zależności między zmiennymi kategorycznymi i ciągłymi zostaną wykorzystane test niezależności chi-kwadrat Pearsona (dwustronny) i współczynnik korelacji Pearsona.
Trzy lata
Zidentyfikuj dodatkowe zdarzenia genetyczne molekularnie powiązane z sygnaturą DDR-Hippo i potencjalnie popraw jej zdolność predykcyjną.
Ramy czasowe: Trzy lata

RNA i DNA zostaną wyekstrahowane z 5 µm skrawków tkanki FFPE przy użyciu zestawu AllPrep DNA/RNA FFPE (Qiagen). Biblioteki dla RNA-Seq zostaną przygotowane przy użyciu zestawu TruSeq Stranded Total RNA z początkowym etapem usuwania rybosomów (Illumina). Ukierunkowane sekwencjonowanie DNA zostanie przeprowadzone poprzez zaprojektowanie niestandardowego panelu amplikonu w DesignStudio i zastosowanie zestawu TruSeq Custom Amplicon Low Output Kit (Illumina). RNA będzie analizowane za pomocą naszego potoku w chmurze (RAP, dostępnego na stronie https://bioinformatics.cineca.it/rap/), który wykorzystuje pakiet Tuxedo Suite (Tophat, Cufflinks, Cuffdiff).

Do analizy DNA wykorzystane zostaną aplikacje dostępne w serwisie Basespace (Illumina). Sekwencjonowanie zostanie przeprowadzone na naszym urządzeniu NextSeq500

Trzy lata
Zbadaj interesujące ścieżki na głębszym poziomie, a także zidentyfikuj inne potencjalne ścieżki/funkcje wpływające na wyniki kliniczne.
Ramy czasowe: Trzy lata
Zmienne kliniczne, patologiczne i molekularne zostaną przetestowane w jednoczynnikowej analizie Coxa. Zostanie zbudowany wieloczynnikowy model proporcjonalnego hazardu Coxa dla PFS ze zmiennymi istotnymi w ocenie jednoczynnikowej i powiązanymi szacunkami podanymi jako HR i 95% CI.
Trzy lata

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)

26 października 2018

Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)

30 sierpnia 2023

Ukończenie studiów (Szacowany)

30 sierpnia 2024

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

28 marca 2023

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

11 stycznia 2024

Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)

12 stycznia 2024

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)

18 stycznia 2024

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

16 stycznia 2024

Ostatnia weryfikacja

1 stycznia 2024

Więcej informacji

Terminy związane z tym badaniem

Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)

Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?

NIEZDECYDOWANY

Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze

Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

Badania kliniczne na Rak żołądka

3
Subskrybuj