Rôle des acides biliaires et du microbiote dans l'infection à Clostridioides difficile dans la colite ulcéreuse (ABRICO)

La colite ulcéreuse (CU) est une maladie inflammatoire chronique de l'intestin (MII) caractérisée par une inflammation chronique du côlon. Les symptômes cliniques comprennent une diarrhée sanglante associée à des douleurs abdominales, une incontinence fécale, une impériosité et un ténesme. Environ 15 à 20 % des patients développent une CU pendant l'enfance ou l'adolescence, avec une augmentation mondiale soutenue de l'incidence des MII, en particulier des formes pédiatriques. Bien qu'il existe de nombreuses similitudes entre la CU à l'âge adulte et chez l'enfant, la CU à l'apparition de l'enfant semble être plus grave et plus étendue, avec une propagation plus rapide de la maladie entraînant une morbidité élevée, des poussées aiguës plus graves et une utilisation plus fréquente de corticostéroïdes intraveineux. À ce jour, il n’existe aucun traitement médical permettant de guérir la maladie mais seulement des traitements permettant de raccourcir la durée des rechutes ou de les prévenir.

Un déséquilibre dans la composition du microbiote intestinal nommé « dysbiose » a été mis en évidence dans les MICI. Cette dysbiose se caractérise par une forte instabilité du microbiote dans le temps, et une réduction de la diversité et particulièrement une réduction des bactéries appartenant aux phyla Firmicutes et Bacteroidetes avec une augmentation des Protéobactéries et Actinobactéries. Plus récemment, une dysbiose spécifique de la RCH a été décrite incluant une diminution des bactéries productrices de butyrate, notamment Faecalibacterium prausnitzii, et Roseburia hominis.

Il a également été démontré que si les patients adultes atteints de CU en poussée et en rémission ont des acides biliaires fécaux totaux similaires, ils ont une proportion d'acides secondaires fécaux plus faible que les sujets témoins sains.

Les patients atteints de CU présentent un risque accru d'infection à Clostridioides difficile (ICD) et de complications liées à l'ICD (colétomie, décès) ainsi qu'un risque plus élevé de récidive d'ICD. Clostridioides difficile est une bactérie anaérobie stricte, qui représente la principale cause de diarrhée post-antibiotique.

L'hypothèse du projet est que la dysbiose du microbiote intestinal chez les patients atteints de CU modifie le profil des acides biliaires et le profil des métabolites et pourrait favoriser l'infection à C difficile chez ces patients sans aucun autre facteur de risque tel que les antibiotiques. Pour confirmer cette hypothèse, l'équipe d'investigation propose d'étudier le microbiote, les profils d'acides biliaires et les métabolites microbiens dans les selles de 40 patients atteints de CU pédiatrique avec une poussée de leur maladie avec (n=20) ou sans (n=20). ) une ICD concomitante et de les comparer à des enfants en bonne santé (n = 20) et à des enfants atteints de CU en rémission clinique (n = 20). Les acides biliaires seront déterminés par chromatographie liquide haute performance couplée à une détection par spectrométrie de masse tandem, les acides gras à chaîne courte et les dérivés du tryptophane dérivés du TRP et de l'AGCC seront déterminés par GC-MS ou LC-MS et le microbiote par la technique MiSeq.

L’équipe d’investigation espère identifier les profils d’acides biliaires prédisposant à l’ICD et les corréler avec des anomalies du microbiote. Cela permettra de mieux comprendre les facteurs associés aux IDC mais également d'identifier des biomarqueurs d'infection et peut-être des souches bactériennes protectrices. A terme, l'équipe d'investigation espère trouver de nouvelles perspectives thérapeutiques en fournissant des bactéries d'intérêt pour transformer les acides biliaires et protéger contre Clostridioides difficile.