Rollen til gallesyrer og mikrobiota i Clostridioides Difficile-infeksjon ved ulcerøs kolitt (ABRICO)

Ulcerøs kolitt (UC) er en kronisk inflammatorisk tarmsykdom (IBD) preget av kronisk betennelse i tykktarmen. Kliniske symptomer inkluderer blodig diaré assosiert med magesmerter, fekal inkontinens, haster og tenesmus. Omtrent 15-20 % av pasientene utvikler UC i barne- eller ungdomsårene, med en vedvarende global økning i forekomsten av IBD, spesielt pediatriske former. Mens det er mange likheter mellom voksen- og barndomsdebut UC, ser pediatrisk debuterende UC ut til å være mer alvorlig og omfattende med raskere spredning av sykdommen som fører til høy sykelighet, mer alvorlige akutte oppbluss og hyppigere bruk av intravenøse kortikosteroider. Til dags dato finnes det ingen medisinsk behandling som kan kurere sykdommen, men kun behandlinger som forkorter varigheten av tilbakefall eller forhindrer dem.

En ubalanse i sammensetningen av tarmmikrobiotaen kalt "dysbiose" er påvist ved IBD. Denne dysbiosen er preget av en sterk ustabilitet av mikrobiota over tid, og en reduksjon av mangfold og spesielt en reduksjon i bakterier som tilhører Firmicutes og Bacteroidetes phyla med en økning i Proteobacteria og Actinobacteria. Mer nylig har en UC-spesifikk dysbiose blitt beskrevet inkludert en reduksjon i butyratproduserende bakterier, spesielt Faecalibacterium prausnitzii og Roseburia hominis.

Det er også vist at dersom voksne pasienter med UC i oppblussing og remisjon har tilsvarende totale fekale gallesyrer, har de en lavere andel fekale sekundære syrer sammenlignet med friske kontrollpersoner.

Pasienter med UC har økt risiko for Clostridioides difficile-infeksjon (CDI) og komplikasjoner fra CDI (koletomi, dødsfall) samt høyere risiko for CDI-residiv. Clostridioides difficile er en streng anaerob bakterie, som representerer hovedårsaken til post-antibiotisk diaré.

Hypotesen for prosjektet er at tarmmikrobiota dysbiose hos pasienter med UC endrer gallesyreprofilen og metabolittprofilen og kan fremme C difficile-infeksjon hos disse pasientene uten andre risikofaktorer som antibiotika. For å bekrefte denne hypotesen foreslår undersøkelsesteamet å studere mikrobiota, gallesyreprofiler og mikrobielle metabolitter i avføringen til 40 pediatriske UC-pasienter med oppblussing av sykdommen med (n=20) eller uten (n=20) ) en samtidig CDI og å sammenligne dem med friske barn (n=20) og UC-barn med klinisk remisjon (n=20). Gallesyrer vil bli bestemt ved høyytelses væskekromatografi kombinert med tandem massespektrometri deteksjon, de kortkjedede fettsyrene og tryptofanderivatene avledet fra TRP og AGCC vil bli bestemt av GC-MS eller LC-MS og mikrobiotaen ved MiSeq-teknikken.

Undersøkelsesteamet håper å identifisere gallesyreprofiler som disponerer for CDI og å korrelere dem med mikrobiota-avvik. Dette vil gjøre det mulig å bedre forstå faktorene forbundet med CDI, men også å identifisere biomarkører for infeksjon og kanskje beskyttende bakteriestammer. På lang sikt håper etterforskningsteamet å finne nye terapeutiske perspektiver ved å gi bakterier av interesse for å transformere gallesyrer og beskytte mot Clostridioides difficile.