Roll av gallsyror och mikrobiota i Clostridioides Difficile-infektion vid ulcerös kolit (ABRICO)

Ulcerös kolit (UC) är en kronisk inflammatorisk tarmsjukdom (IBD) som kännetecknas av kronisk inflammation i tjocktarmen. Kliniska symtom inkluderar blodig diarré i samband med buksmärtor, fekal inkontinens, brådska och tenesmus. Ungefär 15-20 % av patienterna utvecklar UC under barndomen eller tonåren, med en ihållande global ökning av incidensen av IBD, särskilt pediatriska former. Även om det finns många likheter mellan UC som debuterar i vuxen och i barndomen, tycks pediatriskt debuterande UC vara mer allvarlig och omfattande med snabbare spridning av sjukdomen som leder till hög sjuklighet, allvarligare akuta uppblossningar och mer frekvent användning av intravenösa kortikosteroider. Hittills finns det ingen medicinsk behandling som kan bota sjukdomen utan endast behandlingar som förkortar varaktigheten av skov eller förebygger dem.

En obalans i sammansättningen av tarmmikrobiotan som kallas "dysbios" har visats vid IBD. Denna dysbios kännetecknas av en stark instabilitet hos mikrobiotan över tid, och en minskning av mångfalden och särskilt en minskning av bakterier som tillhör Firmicutes och Bacteroidetes phyla med en ökning av Proteobacteria och Actinobacteria. På senare tid har en UC-specifik dysbios beskrivits inklusive en minskning av butyratproducerande bakterier, i synnerhet Faecalibacterium prausnitzii och Roseburia hominis.

Det har också visat sig att om vuxna patienter med UC i flare-up och remission har liknande totala fekala gallsyror, har de en lägre andel fekala sekundära syror jämfört med friska kontrollpersoner.

Patienter med UC har en ökad risk för Clostridioides difficile-infektion (CDI) och komplikationer från CDI (koletomi, dödsfall) samt en högre risk för CDI-recidiv. Clostridioides difficile är en strikt anaerob bakterie, som representerar den främsta orsaken till post-antibiotisk diarré.

Hypotesen för projektet är att tarmmikrobiota dysbios hos patienter med UC förändrar gallsyraprofilen och metabolitprofilen och kan främja C difficile-infektion hos dessa patienter utan några andra riskfaktorer såsom antibiotika. För att bekräfta denna hypotes föreslår undersökningsgruppen att man studerar mikrobiota, gallsyraprofiler och mikrobiella metaboliter i avföringen hos 40 pediatriska UC-patienter med en uppblossande sjukdom med (n=20) eller utan (n=20) ) en samtidig CDI och att jämföra dem med friska barn (n=20) och UC-barn med klinisk remission (n=20). Gallsyror kommer att bestämmas genom högpresterande vätskekromatografi i kombination med tandemmasspektrometridetektion, de kortkedjiga fettsyrorna och tryptofanderivaten härledda från TRP och AGCC kommer att bestämmas av GC-MS eller LC-MS och mikrobiotan med MiSeq-tekniken.

Utredningsgruppen hoppas kunna identifiera gallsyraprofiler som predisponerar för CDI och att korrelera dem med mikrobiotaavvikelser. Detta kommer att göra det möjligt att bättre förstå de faktorer som är associerade med CDI men också att identifiera biomarkörer för infektion och kanske skyddande bakteriestammar. På lång sikt hoppas utredningsgruppen hitta nya terapeutiska perspektiv genom att tillhandahålla bakterier av intresse för att transformera gallsyror och skydda mot Clostridioides difficile.