Galdesyrers og mikrobiotas rolle i Clostridioides Difficile-infektion ved colitis ulcerosa (ABRICO)

Colitis ulcerosa (UC) er en kronisk inflammatorisk tarmsygdom (IBD) karakteriseret ved kronisk betændelse i tyktarmen. Kliniske symptomer omfatter blodig diarré forbundet med mavesmerter, fækal inkontinens, haster og tenesmus. Cirka 15-20% af patienterne udvikler UC i barndommen eller ungdommen, med en vedvarende global stigning i forekomsten af ​​IBD, især pædiatriske former. Mens der er mange ligheder mellem voksen- og barndomsdebuterende UC, synes pædiatrisk debuterende UC at være mere alvorlig og omfattende med hurtigere spredning af sygdommen, hvilket fører til høj morbiditet, mere alvorlige akutte opblussen og hyppigere brug af intravenøse kortikosteroider. Til dato er der ingen medicinsk behandling, der kan helbrede sygdommen, men kun behandlinger, der forkorter varigheden af ​​tilbagefald eller forebygger dem.

En ubalance i sammensætningen af ​​tarmmikrobiotaen kaldet "dysbiose" er blevet påvist ved IBD. Denne dysbiose er karakteriseret ved en stærk ustabilitet af mikrobiotaen over tid og en reduktion af diversitet og især en reduktion af bakterier, der tilhører Firmicutes og Bacteroidetes phyla med en stigning i Proteobacteria og Actinobacteria. For nylig er en UC-specifik dysbiose blevet beskrevet, herunder et fald i butyrat-producerende bakterier, især Faecalibacterium prausnitzii og Roseburia hominis.

Det har også vist sig, at hvis voksne patienter med UC i opblussen og remission har tilsvarende totale fækale galdesyrer, har de en lavere andel af fækale sekundære syrer sammenlignet med raske kontrolpersoner.

Patienter med UC har en øget risiko for Clostridioides difficile-infektion (CDI) og komplikationer fra CDI (coletomi, dødsfald) samt en højere risiko for CDI-gentagelser. Clostridioides difficile er en streng anaerob bakterie, som repræsenterer hovedårsagen til post-antibiotisk diarré.

Projektets hypotese er, at tarmmikrobiota dysbiose hos patienter med UC ændrer galdesyreprofilen og metabolitprofilen og kan fremme C difficile-infektion hos disse patienter uden andre risikofaktorer såsom antibiotika. For at bekræfte denne hypotese foreslår undersøgelsesteamet at studere mikrobiota, galdesyreprofiler og mikrobielle metabolitter i afføringen hos 40 pædiatriske UC-patienter med en opblussen af ​​deres sygdom med (n=20) eller uden (n=20) ) en samtidig CDI og at sammenligne dem med raske børn (n=20) og UC-børn med klinisk remission (n=20). Galdesyrer vil blive bestemt ved højtydende væskekromatografi koblet med tandem massespektrometri detektion, de kortkædede fedtsyrer og tryptophanderivater afledt af TRP og AGCC vil blive bestemt af GC-MS eller LC-MS og mikrobiotaen ved MiSeq-teknikken.

Undersøgelsesholdet håber at identificere galdesyreprofiler, der disponerer for CDI, og at korrelere dem med mikrobiota-abnormiteter. Dette vil gøre det muligt bedre at forstå de faktorer, der er forbundet med CDI, men også at identificere biomarkører for infektion og måske beskyttende bakteriestammer. På lang sigt håber undersøgelsesholdet at finde nye terapeutiske perspektiver ved at give bakterier af interesse til at transformere galdesyrer og beskytte mod Clostridioides difficile.