Diagnostic du microbiome oral du cancer du poumon
Développement d'une méthode de diagnostic basée sur l'intelligence artificielle basée sur le microbiome oral pour le diagnostic non invasif du cancer du poumon
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
Le cancer est un problème de santé mondial qui connaît une tendance croissante en termes de taux d'incidence et de mortalité, ce qui entrave l'augmentation de l'espérance de vie. Selon l'Organisation mondiale de la santé, les cancers du poumon, colorectal et du foie comptent parmi les causes les plus courantes de décès par cancer. En Turquie, les taux d’incidence et de mortalité du cancer du poumon sont supérieurs à la moyenne mondiale. font partie des facteurs de risque pouvant augmenter le risque de cancer du poumon. Outre les facteurs de risque tels que les antécédents familiaux et le tabagisme, différentes études ont montré que le microbiome buccal dysbiotique pouvait contribuer au risque de cancer du poumon.
Le microbiome buccal est le deuxième microenvironnement le plus diversifié de notre corps et a été associé à de nombreuses maladies, notamment le cancer du poumon. Jusqu’à présent, les études sur le cancer du poumon et le microbiome buccal ont généralement impliqué des conceptions visant à résoudre les relations de cause à effet par le biais de différences statistiques et/ou de mécanismes impliquant des unités du microbiome.
Cependant, il n'existe aucune littérature sur une étude visant à développer une méthode de diagnostic basée sur l'apprentissage profond qui se concentre sur le microbiome oral. Par conséquent, l'étude proposée vise à développer une méthode de diagnostic d'apprentissage profond basée sur le microbiome pour le diagnostic du cancer du poumon. À cette fin, une cohorte d'observation sera établie comprenant 192 patients atteints d'un cancer du poumon, 192 patients atteints d'une maladie pulmonaire bénigne non cancéreuse et 192 témoins sains. Des échantillons de langue appartenant à la cohorte seront collectés et le séquençage de l'ARNr 16S sera effectué. Parallèlement, une cohorte d'observation internationale d'environ 1 700 individus sera créée à partir de données in silico. Toutes les données seront analysées de manière intégrative et un algorithme de diagnostic d’intelligence artificielle capable de différencier les patients atteints d’un cancer du poumon des autres maladies pulmonaires et des individus en bonne santé sera développé à l’aide de méthodes d’apprentissage profond. Dans la phase finale, les performances de la méthode de diagnostic développée pour une cohorte d'essais cliniques pilotes de 96 personnes seront testées à l'aide d'une conception PRoBE (collecte prospective d'échantillons avant la vérification des résultats et évaluation rétrospective en aveugle).
Les aspects originaux du projet sont la proposition d'une conception nouvelle dans la littérature, la création d'une conception expérimentale/essai clinique et la présentation d'une proposition de solution potentielle pouvant avoir un impact élevé sur un problème de diagnostic important.
Si le projet est mené à bien, une méthode basée sur l’intelligence artificielle pouvant potentiellement diagnostiquer le cancer du poumon grâce à des échantillons non invasifs du microbiome oral sera développée. En plus de sa brevetabilité, si la méthode est développée (à moyen et long terme) pour devenir un produit, elle permettra de réaliser facilement le dépistage du cancer du poumon, même dans les établissements de soins de santé primaires, avec un simple prélèvement oral.
Type d'étude
Inscription (Estimé)
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
- Nom: Aycan Gundogdu, PhD
- Numéro de téléphone: +90 352 207 6666
- E-mail: agundogdu@erciyes.edu.tr
Lieux d'étude
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Kayseri, Turquie, 38039
- Recrutement
- Erciyes University Hospital
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Contact:
- Aycan Gundogdu, PhD
- Numéro de téléphone: +90 352 207 6666
- E-mail: agundogdu@erciyes.edu.tr
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
- Adulte
- Adulte plus âgé
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- Être âgé de 18 à 65 ans,
- Ne pas avoir de maladie pulmonaire diagnostiquée ou soupçonnée,
- Ne pas avoir de plaintes liées aux poumons et/ou aux voies respiratoires,
- Ne pas avoir de dépendance grave à l’alcool ou à d’autres substances,
- Ne pas avoir d'antécédents d'hospitalisation au cours de la dernière année,
- Ne pas avoir utilisé d'antibiotiques au cours des six derniers mois,
- Ne pas avoir utilisé de produits fabriqués pour soutenir le microbiome oral, tels que des probiotiques (pastilles, gouttes sublinguales) depuis au moins six mois,
- Ne pas être enceinte ou allaiter,
- Ne pas avoir subi d'interventions dentaires telles que traitement de canal, implants, prothèses, extraction dentaire, obturations au cours des 6 derniers mois
- Ne pas avoir de lésions d'origine immunitaire dominantes (telles que les ulcères aphteux, l'érythème polymorphe, le pemphigus), de lésions d'origine virale (telles que l'herpès, les taches de Koplik, l'herpangine), d'infections bactériennes dominantes comme l'amygdalite et/ou de traumatismes thermiques ou chimiques des muqueuses dans le bouche.
Critère d'exclusion:
- Ne pas satisfaire à l’inclusion ou refuser de participer même si tous les critères d’inclusion sont satisfaits.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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Groupe cancer du poumon
192 patients diagnostiqués avec un cancer du poumon avec les critères d'inclusion suivants :
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Pour l'évaluation diagnostique, les procédures nécessaires des protocoles standard comprenant l'anamnèse, l'examen physique, les tests de laboratoire, les méthodes d'imagerie radiologique et la biopsie tissulaire seront suivies.
La tomographie informatisée (CT) et la tomographie par émission de positons (TEP-CT) seront utilisées comme méthodes d'imagerie, tandis que la bronchoscopie par fibre optique et la médiastinoscopie vidéo-assistée seront appliquées pour le diagnostic et la stadification des tissus.
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Groupe des maladies pulmonaires bénignes
192 patients diagnostiqués avec des maladies non cancéreuses avec les critères d'inclusion suivants :
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Pour l'évaluation diagnostique, les procédures nécessaires des protocoles standard comprenant l'anamnèse, l'examen physique, les tests de laboratoire, les méthodes d'imagerie radiologique et la biopsie tissulaire seront suivies.
La tomographie informatisée (CT) et la tomographie par émission de positons (TEP-CT) seront utilisées comme méthodes d'imagerie, tandis que la bronchoscopie par fibre optique et la médiastinoscopie vidéo-assistée seront appliquées pour le diagnostic et la stadification des tissus.
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Groupe témoin sain
292 personnes sans cancer du poumon ou autre diagnostic de maladie pulmonaire avec les critères d'inclusion suivants :
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Évaluation de la précision des diagnostics
Délai: 30 mois
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La technologie de diagnostic à l'étude sera évaluée en utilisant la sensibilité, la spécificité et l'aire sous la courbe de fonctionnement du récepteur.
La validation croisée sera utilisée pour les tests et le diagnostic NCCN et le suivi des patients seront considérés comme la vérité terrain.
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30 mois
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Collaborateurs
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Estimé)
Achèvement de l'étude (Estimé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Estimé)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Estimé)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- 123R030
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
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Type d'informations de prise en charge du partage d'IPD
- RSE
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
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