Оральная микробиомная диагностика рака легких

Рак является глобальной проблемой здравоохранения, которая имеет тенденцию к увеличению заболеваемости и смертности, что препятствует увеличению продолжительности жизни. По данным Всемирной организации здравоохранения, рак легких, колоректальный рак и рак печени являются одними из наиболее частых причин смертности, связанной с раком. В Турции заболеваемость и смертность от рака легких выше, чем в среднем по миру. являются одними из факторов риска, которые могут увеличить риск рака легких. Помимо таких факторов риска, как семейный анамнез, курение, различные исследования показали, что дисбиотический микробиом полости рта может способствовать риску развития рака легких.

Микробиом полости рта является второй по разнообразию микросредой в нашем организме и связан со многими заболеваниями, включая рак легких. На сегодняшний день исследования микробиома рака легких и полости рта, как правило, включают в себя проекты, направленные на разрешение причинно-следственных связей посредством статистических различий и / или механизмов, включающих единицы микробиома.

Однако нет литературы о каком-либо исследовании, направленном на разработку диагностического метода, основанного на глубоком обучении, который фокусировался бы на микробиоме полости рта. Таким образом, предлагаемое исследование направлено на разработку метода диагностики глубокого обучения на основе микробиома для диагностики рака легких. С этой целью будет создана группа наблюдения, состоящая из 192 пациентов с раком легких, 192 пациентов с нераковыми доброкачественными заболеваниями легких и 192 здоровых людей из контрольной группы. Будут собраны образцы мазков с языка, принадлежащие этой когорте, и будет проведено секвенирование 16S рРНК. В то же время с использованием данных in silico будет создана международная когорта наблюдения численностью около 1700 человек. Все данные будут интегративно проанализированы, и с использованием методов глубокого обучения будет разработан диагностический алгоритм искусственного интеллекта, который сможет отличать больных раком легких от других заболеваний легких и здоровых людей. На заключительном этапе эффективность диагностического метода, разработанного для когорты пилотных клинических исследований из 96 человек, будет проверена с использованием схемы PROBE (проспективный сбор образцов до определения результатов и ретроспективная слепая оценка).

Исходными аспектами проекта являются предложение нового дизайна в литературе, создание экспериментального дизайна/клинического исследования и представление предложения потенциального решения, которое может оказать большое влияние на важную диагностическую проблему.

Если проект будет успешно завершен, будет разработан метод на основе искусственного интеллекта, который потенциально сможет диагностировать рак легких с помощью неинвазивных образцов микробиома полости рта. Помимо патентоспособности, если метод получит дальнейшее развитие (в среднесрочной и долгосрочной перспективе) и станет продуктом, он позволит легко проводить скрининг рака легких даже в учреждениях первичной медико-санитарной помощи с помощью простого образца мазка из ротовой полости.