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Diagnóstico del microbioma oral del cáncer de pulmón

14 de febrero de 2024 actualizado por: Aycan Gundogdu, TC Erciyes University

Desarrollo de un método de diagnóstico basado en inteligencia artificial basado en microbioma oral para el diagnóstico no invasivo del cáncer de pulmón

El estudio tiene como objetivo desarrollar un método de diagnóstico del cáncer de pulmón basado en el aprendizaje profundo utilizando el microbioma oral. Este enfoque innovador implica establecer una cohorte de observación de 576 personas, incluidos pacientes con cáncer de pulmón, pacientes con enfermedades pulmonares benignas no cancerosas y controles sanos, para recolectar muestras de hisopos de lengua para la secuenciación del ARNr 16S. Además, se formará una cohorte internacional de aproximadamente 1700 personas utilizando datos in silico. El proyecto utilizará métodos de aprendizaje profundo para analizar todos los datos de forma integradora y desarrollar un algoritmo de diagnóstico de IA capaz de distinguir a los pacientes con cáncer de pulmón de otros. El rendimiento del método de diagnóstico se probará en un ensayo clínico piloto con 96 personas utilizando un diseño PRoBE. Dirigido por expertos en cirugía torácica, microbiología molecular y bioinformática, el proyecto abarca más de 30 meses y tiene como objetivo crear un método de detección de cáncer de pulmón no invasivo y de fácil acceso que podría conducir a importantes avances en el diagnóstico y a posibles empresas derivadas en el campo. de biopsia líquida/diagnóstico molecular.

Descripción general del estudio

Descripción detallada

El cáncer es un problema de salud mundial que presenta una tendencia creciente en términos de incidencia y mortalidad, lo que dificulta el aumento de la esperanza de vida. Según la Organización Mundial de la Salud, los cánceres de pulmón, colorrectal y de hígado se encuentran entre las causas más comunes de muertes relacionadas con el cáncer. En Turquía, las tasas de incidencia y mortalidad del cáncer de pulmón son más altas que el promedio mundial. se encuentran entre los factores de riesgo que pueden aumentar el riesgo de cáncer de pulmón. Además de los factores de riesgo como los antecedentes familiares y el tabaquismo, diferentes estudios han demostrado que el microbioma oral disbiótico puede contribuir al riesgo de cáncer de pulmón.

El microbioma oral es el segundo microambiente más diverso de nuestro cuerpo y se ha asociado con muchas enfermedades, incluido el cáncer de pulmón. Los estudios hasta la fecha sobre el microbioma oral y el cáncer de pulmón generalmente han involucrado diseños destinados a resolver relaciones de causa y efecto a través de diferencias estadísticas y/o mecanismos que involucran unidades de microbioma.

Sin embargo, no existe literatura sobre ningún estudio destinado a desarrollar un método de diagnóstico basado en aprendizaje profundo que se centre en el microbioma oral. Por lo tanto, el estudio propuesto tiene como objetivo desarrollar un método de diagnóstico de aprendizaje profundo basado en microbioma para el diagnóstico de cáncer de pulmón. Para ello, se establecerá una cohorte de observación formada por 192 pacientes con cáncer de pulmón, 192 pacientes con enfermedades pulmonares benignas no cancerosas y 192 controles sanos. Se recolectarán muestras de hisopos de lengua pertenecientes a la cohorte y se realizará la secuenciación del ARNr 16S. Al mismo tiempo, se creará una cohorte de observación internacional de aproximadamente 1700 individuos utilizando datos in silico. Todos los datos se analizarán de forma integral y se desarrollará un algoritmo de diagnóstico de inteligencia artificial que pueda diferenciar a los pacientes con cáncer de pulmón de otras enfermedades pulmonares y de individuos sanos utilizando métodos de aprendizaje profundo. En la etapa final, se probará el rendimiento del método de diagnóstico desarrollado para una cohorte de ensayo clínico piloto de 96 personas utilizando un diseño PRoBE (recolección prospectiva de muestras antes de la determinación de resultados y evaluación retrospectiva ciega).

Los aspectos originales del proyecto son la propuesta de un diseño novedoso en la literatura, la creación de un diseño experimental/ensayo clínico y la presentación de una propuesta de solución potencial que pueda tener un alto impacto en un problema diagnóstico importante.

Si el proyecto se completa con éxito, se desarrollará un método basado en inteligencia artificial que potencialmente puede diagnosticar el cáncer de pulmón a través de muestras de microbioma oral no invasivas. Además de su patentabilidad, si el método se desarrolla más (a medio y largo plazo) hasta convertirlo en un producto, permitirá realizar fácilmente la detección del cáncer de pulmón incluso en instituciones de atención primaria de salud con una simple muestra de hisopo oral.

Tipo de estudio

De observación

Inscripción (Estimado)

676

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Estudio Contacto

Ubicaciones de estudio

      • Kayseri, Pavo, 38039
        • Reclutamiento
        • Erciyes University Hospital
        • Contacto:

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

  • Adulto
  • Adulto Mayor

Acepta Voluntarios Saludables

Sí

Método de muestreo

Muestra no probabilística

Población de estudio

La población consta de un grupo de 192 pacientes con cáncer de pulmón, un grupo de 192 pacientes con enfermedades pulmonares benignas no relacionadas con el cáncer de pulmón y 292 controles sanos. Cada subgrupo está emparejado por género y edad.

Descripción

Criterios de inclusión:

  • Tener entre 18 y 65 años,
  • No tener enfermedad pulmonar diagnosticada o sospecha de la misma,
  • No tener afecciones relacionadas con los pulmones y/o las vías respiratorias,
  • No tener dependencia severa del alcohol o sustancias,
  • No tener antecedentes de hospitalización en el último año,
  • No haber utilizado antibióticos en los últimos seis meses,
  • No haber utilizado productos fabricados para apoyar el microbioma bucal, como probióticos (pastillas, gotas sublinguales) durante al menos los últimos seis meses,
  • No estar embarazada ni amamantando,
  • No haberse sometido a procedimientos dentales como tratamiento de conducto, implantes, prótesis, extracciones dentales, empastes en los últimos 6 meses.
  • No presentar lesiones de origen inmunológico dominante (como úlceras aftosas, eritema multiforme, pénfigo), lesiones de origen viral (como herpes, manchas de Koplik, herpangina), infecciones bacterianas dominantes como amigdalitis y/o traumatismos mucosos térmicos o químicos en la boca.

Criterio de exclusión:

  • No satisfacer la inclusión o negarse a participar aunque se cumplan todos los criterios de inclusión.

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

Cohortes e Intervenciones

Grupo / Cohorte
Intervención / Tratamiento
Grupo de cáncer de pulmón

192 pacientes diagnosticados de cáncer de pulmón con los siguientes criterios de inclusión:

  • Tener entre 18 y 65 años,
  • No haber sido diagnosticado ni tratado previamente por cáncer de pulmón,
  • No haber recibido ningún tratamiento contra el cáncer en los últimos 2 años,
  • No haber sido operado en los últimos dos años,
  • No tener antecedentes de hospitalización en el último año,
  • No haber utilizado antibióticos en los últimos seis meses,
  • No haber utilizado productos fabricados para apoyar el microbioma bucal, como probióticos (pastillas, gotas sublinguales) durante al menos los últimos seis meses,
  • No estar embarazada, no amamantar,
  • No haber sido sometido a procedimientos odontológicos como tratamiento de conducto, implantes, prótesis, extracciones, empastes en los últimos 6 meses, No presentar lesiones de origen inmunológico dominante, lesiones de origen viral, infecciones bacterianas dominantes como amigdalitis y/o térmicas o químicas. Traumatismos mucosos en la boca.
Para la evaluación diagnóstica se seguirán los procedimientos necesarios de los protocolos estándar consistentes en anamnesis, examen físico, pruebas de laboratorio, métodos de imagen radiológica y biopsia de tejido. La tomografía computarizada (TC) y la tomografía por emisión de positrones-tomografía computarizada (PET-CT) se utilizarán como métodos de obtención de imágenes, mientras que la broncoscopia de fibra óptica y la mediastinoscopia asistida por video se aplicarán para el diagnóstico y la estadificación de los tejidos.
Grupo de enfermedades pulmonares benignas

192 pacientes diagnosticados de enfermedades no oncológicas con los siguientes criterios de inclusión:

  • Tener entre 18 y 65 años,
  • Haber visitado nuestra clínica con quejas relacionadas con los pulmones y/o las vías respiratorias,
  • No haber sido diagnosticado con cáncer de pulmón después de la evaluación clínica,
  • No haber recibido ningún tratamiento contra el cáncer en los últimos 2 años,
  • No haber sido operado en los últimos dos años,
  • No tener antecedentes de hospitalización en el último año,
  • No haber utilizado antibióticos en los últimos seis meses,
  • No haber utilizado productos fabricados para apoyar el microbioma bucal, como probióticos, durante al menos los últimos seis meses,
  • No estar embarazada ni amamantando,
  • No haberse sometido a procedimientos odontológicos como tratamiento de conducto, implantes, prótesis, extracciones dentales, empastes en los últimos 6 meses,
  • No presentar lesiones de origen inmunológico dominante, lesiones de origen viral, infecciones bacterianas dominantes como amigdalitis y/o traumatismos térmicos o químicos de las mucosas de la boca.
Para la evaluación diagnóstica se seguirán los procedimientos necesarios de los protocolos estándar consistentes en anamnesis, examen físico, pruebas de laboratorio, métodos de imagen radiológica y biopsia de tejido. La tomografía computarizada (TC) y la tomografía por emisión de positrones-tomografía computarizada (PET-CT) se utilizarán como métodos de obtención de imágenes, mientras que la broncoscopia de fibra óptica y la mediastinoscopia asistida por video se aplicarán para el diagnóstico y la estadificación de los tejidos.
Grupo de control sano

292 individuos sin diagnóstico de cáncer de pulmón u otra enfermedad pulmonar con los siguientes criterios de inclusión:

  • Tener entre 18 y 65 años,
  • No tener enfermedad pulmonar diagnosticada o sospecha de la misma,
  • No tener afecciones relacionadas con los pulmones y/o las vías respiratorias,
  • No tener dependencia severa del alcohol o sustancias,
  • No tener antecedentes de hospitalización en el último año,
  • No haber utilizado antibióticos en los últimos seis meses,
  • No haber utilizado productos fabricados para apoyar el microbioma bucal, como probióticos (pastillas, gotas sublinguales) durante al menos los últimos seis meses,
  • No estar embarazada ni amamantando,
  • No haberse sometido a procedimientos odontológicos como tratamiento de conducto, implantes, prótesis, extracciones dentales, empastes en los últimos 6 meses,
  • No presentar lesiones de origen inmunológico dominante, lesiones de origen viral, infecciones bacterianas dominantes como amigdalitis y/o traumatismos térmicos o químicos de las mucosas de la boca.

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Evaluación de la precisión del diagnóstico.
Periodo de tiempo: 30 meses
La tecnología de diagnóstico bajo investigación se evaluará mediante sensibilidad, especificidad y área bajo la curva operativa del receptor. Se utilizará validación cruzada para las pruebas y el diagnóstico de NCCN, y los seguimientos de los pacientes se considerarán la verdad fundamental.
30 meses

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Actual)

15 de noviembre de 2023

Finalización primaria (Estimado)

15 de febrero de 2025

Finalización del estudio (Estimado)

15 de mayo de 2026

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

14 de febrero de 2024

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

14 de febrero de 2024

Publicado por primera vez (Estimado)

21 de febrero de 2024

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Estimado)

21 de febrero de 2024

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

14 de febrero de 2024

Última verificación

1 de febrero de 2024

Más información

Términos relacionados con este estudio

Plan de datos de participantes individuales (IPD)

¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?

SÍ

Tipo de información de apoyo para compartir IPD

  • RSC

Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio

Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.

No

Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.

No

Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .

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