Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Oral mikrobiom diagnostik av lungcancer

14 februari 2024 uppdaterad av: Aycan Gundogdu, TC Erciyes University

Utveckla en artificiell intelligens-baserad diagnostisk metod baserad på oral mikrobiom för icke-invasiv diagnos av lungcancer

Studien syftar till att utveckla en djupinlärningsbaserad diagnostisk metod för lungcancer med hjälp av det orala mikrobiomet. Detta innovativa tillvägagångssätt involverar att etablera en observationskohort av 576 individer, inklusive lungcancerpatienter, icke-cancerösa godartade lungsjukdomspatienter och friska kontroller, för att samla in tungprover för 16S rRNA-sekvensering. Dessutom kommer en internationell kohort på cirka 1700 individer att bildas med hjälp av in silico-data. Projektet kommer att använda metoder för djupinlärning för att analysera all data integrativt och utveckla en AI-diagnostisk algoritm som kan skilja lungcancerpatienter från andra. Den diagnostiska metodens prestanda kommer att testas i en klinisk pilotprövning med 96 individer med en PROBE-design. Projektet, som leds av experter inom bröstkirurgi, molekylär mikrobiologi och bioinformatik, sträcker sig över 30 månader och syftar till att skapa en icke-invasiv, lättillgänglig lungcancerscreeningsmetod som kan leda till betydande diagnostiska framsteg och potentiella spin-off-företag inom området av flytande biopsi/molekylär diagnos.

Studieöversikt

Status

Rekrytering

Betingelser

Detaljerad beskrivning

Cancer är en global hälsofråga som är på en ökande trend när det gäller incidens och dödlighet, vilket hindrar ökningen av förväntad livslängd. Enligt Världshälsoorganisationen är lung-, kolorektal- och levercancer bland de vanligaste orsakerna till cancerrelaterade dödsfall. I Turkiet är incidensen och dödligheten av lungcancer högre än världsgenomsnittet. är bland de riskfaktorer som kan öka risken för lungcancer. Förutom riskfaktorer som familjehistoria, rökning, har olika studier visat att dysbiotisk oral mikrobiom kan bidra till risken för lungcancer.

Den orala mikrobiomet är den näst mest mångsidiga mikromiljön i vår kropp och har associerats med många sjukdomar, inklusive lungcancer. Studier hittills på lungcancer-oral mikrobiom har i allmänhet involverat design som syftar till att lösa orsak-och-verkan-samband genom statistiska skillnader och/eller mekanismer som involverar mikrobiomeenheter.

Det finns dock ingen litteratur om någon studie som syftar till att utveckla en djupinlärningsbaserad diagnostisk metod som fokuserar på den orala mikrobiomen. Den föreslagna studien syftar därför till att utveckla en mikrobiombaserad diagnostisk metod för djupinlärning för diagnostik av lungcancer. För detta ändamål kommer en observationskohort att upprättas bestående av 192 lungcancerpatienter, 192 icke-cancerösa godartade lungsjukdomspatienter och 192 friska kontroller. Tungprover som tillhör kohorten kommer att samlas in och 16S rRNA-sekvensering kommer att utföras. Samtidigt kommer en internationell observationskohort på cirka 1700 individer att skapas med hjälp av in silico-data. All data kommer att analyseras integrativt och en artificiell intelligens diagnostisk algoritm som kan skilja lungcancerpatienter från andra lungsjukdomar och friska individer kommer att utvecklas med hjälp av metoder för djupinlärning. I det sista skedet kommer prestandan för den diagnostiska metoden som utvecklats för en kohort för en klinisk pilotstudie på 96 individer att testas med en PROBE-design (prospektiv provsamling före utvärdering och retrospektiv blindad utvärdering).

De ursprungliga aspekterna av projektet är förslaget till en ny design i litteraturen, skapandet av en experimentell design/klinisk prövning och presentationen av ett potentiellt lösningsförslag som kan ha stor inverkan på ett viktigt diagnostiskt problem.

Om projektet slutförs framgångsrikt kommer en artificiell intelligensbaserad metod som potentiellt kan diagnostisera lungcancer genom icke-invasiva orala mikrobiomprover att utvecklas. Utöver patenterbarheten, om metoden vidareutvecklas (på medellång till lång sikt) till en produkt, kommer den att göra det möjligt att enkelt utföra lungcancerscreening även på primärvårdsinstitutioner med ett enkelt oralt pinnprov.

Studietyp

Observationell

Inskrivning (Beräknad)

676

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studiekontakt

Studieorter

      • Kayseri, Kalkon, 38039
        • Rekrytering
        • Erciyes University Hospital
        • Kontakt:

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

  • Vuxen
  • Äldre vuxen

Tar emot friska volontärer

Ja

Testmetod

Icke-sannolikhetsprov

Studera befolkning

Populationen består av en lungcancergrupp på 192 patienter, en benign lungsjukdomsgrupp som inte är lungcancer på 192 patienter och 292 friska kontroller. Varje undergrupp är köns- och åldersmatchad.

Beskrivning

Inklusionskriterier:

  • Att vara mellan 18 och 65 år,
  • att inte ha en diagnostiserad lungsjukdom eller misstanke om detta,
  • att inte ha besvär relaterade till lungor och/eller luftvägar,
  • att inte ha alkohol eller allvarligt missbruk,
  • Inte haft en sjukhusvistelse under det senaste året,
  • inte ha använt antibiotika under de senaste sex månaderna,
  • Att inte ha använt produkter tillverkade för att stödja den orala mikrobiomet, såsom probiotika (pastiller, sublinguala droppar) under minst de senaste sex månaderna,
  • Att inte vara gravid eller ammande,
  • Att inte ha genomgått tandingrepp såsom rotbehandling, implantat, proteser, tandutdragning, fyllningar under de senaste 6 månaderna
  • Att inte ha dominerande skador från immunförsvaret (som aftösa sår, erythema multiforme, pemphigus), skador med viralt ursprung (som herpes, Koplik-fläckar, herpangina), dominerande bakterieinfektioner som tonsillit och/eller termiska eller kemiska slemhinnetrauma i mun.

Exklusions kriterier:

  • Att inte tillfredsställa inkludering eller avböja att delta trots att alla inklusionskriterier är uppfyllda.

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

Kohorter och interventioner

Grupp / Kohort
Intervention / Behandling
Lungcancergrupp

192 patienter diagnostiserade med lungcancer med följande inklusionskriterier:

  • Att vara mellan 18 och 65 år,
  • inte tidigare diagnostiserats med och behandlats för lungcancer,
  • inte ha fått någon cancerbehandling under de senaste 2 åren,
  • inte har opererats under de senaste två åren,
  • Inte haft en sjukhusvistelse under det senaste året,
  • inte ha använt antibiotika under de senaste sex månaderna,
  • Att inte ha använt produkter tillverkade för att stödja den orala mikrobiomet, såsom probiotika (pastiller, sublinguala droppar) under minst de senaste sex månaderna,
  • Att inte vara gravid, inte amma,
  • Att inte ha genomgått tandingrepp som rotbehandling, implantat, proteser, tandutdragning, fyllningar under de senaste 6 månaderna, inte haft dominerande immunförändringar, lesioner med viralt ursprung, dominerande bakterieinfektioner som tonsillit och/eller termiska eller kemiska slemhinnetrauma i munnen.
För diagnostisk utvärdering kommer de nödvändiga procedurerna från standardprotokollen bestående av anamnes, fysisk undersökning, laboratorietester, radiologiska avbildningsmetoder och vävnadsbiopsi att följas. Datortomografi (CT) och Positron Emission Tomography-Computed Tomography (PET-CT) kommer att användas som avbildningsmetoder, medan fiberoptisk bronkoskopi och videoassisterad mediastinoskopi kommer att användas för vävnadsdiagnostik och stadieindelning.
Godartad lungsjukdom grupp

192 patienter diagnostiserade med icke-cancersjukdomar med följande inklusionskriterier:

  • Att vara mellan 18 och 65 år,
  • Att ha besökt vår klinik med besvär relaterade till lungor och/eller luftvägar,
  • Att inte ha fått diagnosen lungcancer efter klinisk utvärdering,
  • inte ha fått någon cancerbehandling under de senaste 2 åren,
  • inte har opererats under de senaste två åren,
  • Inte haft en sjukhusvistelse under det senaste året,
  • inte ha använt antibiotika under de senaste sex månaderna,
  • Att inte ha använt produkter tillverkade för att stödja den orala mikrobiomet, såsom probiotika under minst de senaste sex månaderna,
  • Att inte vara gravid eller ammande,
  • Att inte ha genomgått tandingrepp såsom rotbehandling, implantat, proteser, tandutdragning, fyllningar under de senaste 6 månaderna,
  • Att inte ha dominerande immunförändringar, lesioner med viralt ursprung, dominerande bakteriella infektioner som tonsillit och/eller termiska eller kemiska slemhinnetrauma i munnen.
För diagnostisk utvärdering kommer de nödvändiga procedurerna från standardprotokollen bestående av anamnes, fysisk undersökning, laboratorietester, radiologiska avbildningsmetoder och vävnadsbiopsi att följas. Datortomografi (CT) och Positron Emission Tomography-Computed Tomography (PET-CT) kommer att användas som avbildningsmetoder, medan fiberoptisk bronkoskopi och videoassisterad mediastinoskopi kommer att användas för vävnadsdiagnostik och stadieindelning.
Frisk kontrollgrupp

292 individer utan lungcancer eller annan lungsjukdomsdiagnos med följande inklusionskriterier:

  • Att vara mellan 18 och 65 år,
  • att inte ha en diagnostiserad lungsjukdom eller misstanke om detta,
  • att inte ha besvär relaterade till lungor och/eller luftvägar,
  • att inte ha alkohol eller allvarligt missbruk,
  • Inte haft en sjukhusvistelse under det senaste året,
  • inte ha använt antibiotika under de senaste sex månaderna,
  • Att inte ha använt produkter tillverkade för att stödja den orala mikrobiomet, såsom probiotika (pastiller, sublinguala droppar) under minst de senaste sex månaderna,
  • Att inte vara gravid eller ammande,
  • Att inte ha genomgått tandingrepp såsom rotbehandling, implantat, proteser, tandutdragning, fyllningar under de senaste 6 månaderna,
  • Att inte ha dominerande immunförändringar, lesioner med viralt ursprung, dominerande bakteriella infektioner som tonsillit och/eller termiska eller kemiska slemhinnetrauma i munnen.

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Diagnostisk noggrannhetsbedömning
Tidsram: 30 månader
Diagnostisk teknologi som undersöks kommer att utvärderas med hjälp av sensitivitet, specificitet, area under mottagarens driftkurva. Korsvalidering kommer att användas för testning och NCCN-diagnos och patientuppföljningar kommer att betraktas som grundsanningen.
30 månader

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

15 november 2023

Primärt slutförande (Beräknad)

15 februari 2025

Avslutad studie (Beräknad)

15 maj 2026

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

14 februari 2024

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

14 februari 2024

Första postat (Beräknad)

21 februari 2024

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Beräknad)

21 februari 2024

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

14 februari 2024

Senast verifierad

1 februari 2024

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Plan för individuella deltagardata (IPD)

Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?

JA

IPD-delning som stöder informationstyp

  • CSR

Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument

Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt

Nej

Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt

Nej

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Prenumerera