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Prédiction pharmacologique en réseau : étude du mécanisme de la puerarine dans le traitement des tumeurs osseuses à cellules géantes

30 mars 2024 mis à jour par: Changye Zou

Traitement de la tumeur osseuse à cellules géantes avec Purerin : nouvelles connaissances issues de la pharmacologie de réseau, de l'analyse bioinformatique et de la vérification expérimentale

Basée sur une analyse pharmacologique en réseau, cette étude vise à explorer les cibles thérapeutiques potentielles et les mécanismes moléculaires de la puerarine sur les gènes des tumeurs osseuses à cellules géantes (GCTB).

Aperçu de l'étude

Statut

Complété

Les conditions

Intervention / Traitement

Description détaillée

Les gènes pathologiques du GCTB ont été découverts à partir des bases de données DisGeNET et GeneCards. Les gènes thérapeutiques de la puerarine ont été rassemblés à partir des bases de données Swiss Target Prediction, CTD, PharmMapper et TCMSP. Le logiciel Cytoscape a été utilisé avec l'algorithme MCODE pour calculer les principales cibles thérapeutiques potentielles de la puerarine contre le GCTB. Les ensembles de données RNA-seq en masse (GSE102193) ont été utilisés pour identifier l’expression différentielle de gènes thérapeutiques potentiels. Le sc RNA-seq (GSE168664) a été utilisé pour déterminer la distribution d'expression de différents groupes de cellules. Les cibles essentielles de la puerarine contre le GCTB ont subi des tests d'enrichissement de la fonction et des voies afin d'élucider les processus biologiques et les voies de signalisation. En outre, nous avons effectué une comparaison pour déterminer si les processus et voies biologiques primaires suivant le traitement par le dénosumab présentent des ressemblances avec les mécanismes potentiels d'action de la puerarine. L'amarrage moléculaire et la simulation dynamique ont été réalisés pour évaluer les interactions entre des cibles thérapeutiques potentielles sélectionnées et la puerarine. Des colorations immunohistochimiques (IHC) et immunofluorescence (IF) ont été réalisées pour identifier l'expression de marqueurs cruciaux dans les tissus humains du GCTB. Les niveaux d'expression de gènes pivots dans les cellules BMSC primaires et les cellules GCTB primaires et leur altération après un traitement à la puerarine dans les cellules GCTB primaires ont été évalués.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Réel)

145

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

  • Chine
    • Guangdong
      • Guangzhou, Guangdong, Chine, 518010
        • Churong Yan

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

  • Enfant
  • Adulte
  • Adulte plus âgé

Accepte les volontaires sains

Non

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Notre hôpital fournit un diagnostic et un traitement qui répondent aux critères d'inclusion.

La description

Critère d'intégration:

  1. Diagnostiqué comme un patient atteint d'une tumeur osseuse à cellules géantes ;
  2. Notre hôpital effectue des traitements chirurgicaux ;
  3. Avoir des informations complètes sur l'enregistrement clinique ;
  4. Conserver les spécimens chirurgicaux ou de ponction ;

Critère d'exclusion:

  1. Patients atteints d'une tumeur à cellules géantes non osseuse ;
  2. Aucun traitement chirurgical n'a été réalisé ;
  3. Enregistrement incomplet des informations cliniques ;
  4. Aucun spécimen chirurgical ou de ponction conservé.

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
Groupes d'expressions P27
12 coupes immunohistochimiques ont été notées au microscope (scores d'intensité de coloration : négatif 0 point, faible 1 point, moyen 2 points, fort 3 points ; scores de fréquence cellulaire positifs : moins de 5 % 0 point, 2-25 % 1 point, 26- 50% 2 points, 51-75% 3 points, supérieur à 75% 4 points).
Génétique: niveaux d'expression des gènes
12 coupes immunohistochimiques ont été notées au microscope (scores d'intensité de coloration : négatif 0 point, faible 1 point, moyen 2 points, fort 3 points ; scores de fréquence cellulaire positifs : moins de 5 % 0 point, 2-25 % 1 point, 26- 50% 2 points, 51-75% 3 points, supérieur à 75% 4 points).
Groupes d'expressions ESR1
12 coupes immunohistochimiques ont été notées au microscope (scores d'intensité de coloration : négatif 0 point, faible 1 point, moyen 2 points, fort 3 points ; scores de fréquence cellulaire positifs : moins de 5 % 0 point, 2-25 % 1 point, 26- 50% 2 points, 51-75% 3 points, supérieur à 75% 4 points).
Génétique: niveaux d'expression des gènes
12 coupes immunohistochimiques ont été notées au microscope (scores d'intensité de coloration : négatif 0 point, faible 1 point, moyen 2 points, fort 3 points ; scores de fréquence cellulaire positifs : moins de 5 % 0 point, 2-25 % 1 point, 26- 50% 2 points, 51-75% 3 points, supérieur à 75% 4 points).

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Niveaux d'expression P27
Délai: 2023-05-18 - 2023-08-31
12 coupes immunohistochimiques ont été notées au microscope (scores d'intensité de coloration : négatif 0 point, faible 1 point, moyen 2 points, fort 3 points ; scores de fréquence cellulaire positifs : moins de 5 % 0 point, 2-25 % 1 point, 26- 50% 2 points, 51-75% 3 points, supérieur à 75% 4 points).
2023-05-18 - 2023-08-31
Niveaux d'expression ESR1
Délai: 2023-05-18 - 2023-08-31
12 coupes immunohistochimiques ont été notées au microscope (scores d'intensité de coloration : négatif 0 point, faible 1 point, moyen 2 points, fort 3 points ; scores de fréquence cellulaire positifs : moins de 5 % 0 point, 2-25 % 1 point, 26- 50% 2 points, 51-75% 3 points, supérieur à 75% 4 points).
2023-05-18 - 2023-08-31

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Changye Zou

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Changye Zou, MD, First Affiliated Hospital, Sun Yat-Sen University

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

14 juin 2012

Achèvement primaire (Réel)

31 août 2023

Achèvement de l'étude (Réel)

31 août 2023

Dates d'inscription aux études

Première soumission

19 mars 2024

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

19 mars 2024

Première publication (Réel)

26 mars 2024

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

2 avril 2024

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

30 mars 2024

Dernière vérification

1 mars 2024

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Mots clés

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • ChangyeZou

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

OUI

Description du régime IPD

Les ensembles de données sont disponibles auprès de l'auteur correspondant (zouchy@mail.sysu.edu.cn) sur demande raisonnable après SCI en ligne.

Délai de partage IPD

SCI en ligne. Les ensembles de données sont disponibles auprès de l’auteur correspondant sur demande raisonnable.

Critères d'accès au partage IPD

Les ensembles de données sont disponibles auprès de l'auteur correspondant (zouchy@mail.sysu.edu.cn) sur demande raisonnable après SCI en ligne.

Type d'informations de prise en charge du partage d'IPD

  • PROTOCOLE D'ÉTUDE
  • SÈVE

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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