Сетевой фармакологический прогноз: исследование механизма действия пуэрина при лечении гигантоклеточных опухолей костей
30 марта 2024 г. обновлено: Changye Zou
Лечение гигантоклеточной опухоли кости пурерином: новые идеи сетевой фармакологии, биоинформатического анализа и экспериментальной проверки
Это исследование, основанное на сетевом фармакологическом анализе, направлено на изучение потенциальных терапевтических мишеней и молекулярных механизмов действия пуэрина на гены гигантоклеточной опухоли кости (GCTB).
Обзор исследования
Статус
Завершенный
Условия
Вмешательство/лечение
Подробное описание
Патологические гены GCTB были обнаружены в базах данных DisGeNET и GeneCards.
Терапевтические гены пуэрарина были собраны из баз данных Swiss Target Prediction, CTD, PharmMapper и TCMSP.
Программное обеспечение Cytoscape использовалось с алгоритмом MCODE для расчета ключевых потенциальных терапевтических целей пуэрарина против GCTB.
Массовые наборы данных секвенирования РНК (GSE102193) использовались для идентификации дифференциальной экспрессии потенциальных терапевтических генов.
sc RNA-seq (GSE168664) использовали для определения распределения экспрессии в различных кластерах клеток.
Основные мишени пуэрина против GCTB прошли анализы обогащения функций и путей для выяснения биологических процессов и сигнальных путей.
Кроме того, мы провели сравнение, чтобы определить, имеют ли первичные биологические процессы и пути после лечения деносумабом сходство с потенциальными механизмами действия пуэрина.
Молекулярный докинг и динамическое моделирование были проведены для оценки взаимодействия между выбранными потенциальными терапевтическими мишенями и пуэрарином.
Иммуногистохимическое (ИГХ) и иммунофлуоресцентное (ИФ) окрашивание проводили для выявления экспрессии важнейших маркеров в ткани GCTB человека.
Были оценены уровни экспрессии основных генов в первичных клетках BMSC и первичных клетках GCTB, а также их изменения после обработки пуэрарином в первичных клетках GCTB.
Тип исследования
Наблюдательный
Регистрация (Действительный)
145
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Места учебы
-
-
Guangdong
-
Guangzhou, Guangdong, Китай, 518010
- Churong Yan
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Ребенок
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Нет
Метод выборки
Невероятностная выборка
Исследуемая популяция
Наша больница обеспечивает диагностику и лечение, соответствующее критериям включения.
Описание
Критерии включения:
- Поставлен диагноз: больной гигантоклеточной опухолью кости;
- В нашей больнице проводится хирургическое лечение;
- Наличие полной информации о клинической регистрации;
- Сохраните хирургические или пункционные образцы;
Критерий исключения:
- Пациенты с некостными гигантоклеточными опухолями;
- Хирургическое лечение не проводилось;
- Неполная регистрация клинической информации;
- Хирургических и пункционных образцов не сохранилось.
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Группы экспрессии P27
Под микроскопом оценивали 12 иммуногистохимических срезов (оценки интенсивности окрашивания: отрицательное 0 баллов, слабое 1 балл, среднее 2 балла, сильное 3 балла; положительные оценки частоты клеток: менее 5% 0 баллов, 2-25% 1 балл, 26- 50% 2 балла, 51-75% 3 балла, более 75% 4 балла).
|
Под микроскопом оценивали 12 иммуногистохимических срезов (оценки интенсивности окрашивания: отрицательное 0 баллов, слабое 1 балл, среднее 2 балла, сильное 3 балла; положительные оценки частоты клеток: менее 5% 0 баллов, 2-25% 1 балл, 26- 50% 2 балла, 51-75% 3 балла, более 75% 4 балла).
|
|
Группы экспрессии ESR1
Под микроскопом оценивали 12 иммуногистохимических срезов (оценки интенсивности окрашивания: отрицательное 0 баллов, слабое 1 балл, среднее 2 балла, сильное 3 балла; положительные оценки частоты клеток: менее 5% 0 баллов, 2-25% 1 балл, 26- 50% 2 балла, 51-75% 3 балла, более 75% 4 балла).
|
Под микроскопом оценивали 12 иммуногистохимических срезов (оценки интенсивности окрашивания: отрицательное 0 баллов, слабое 1 балл, среднее 2 балла, сильное 3 балла; положительные оценки частоты клеток: менее 5% 0 баллов, 2-25% 1 балл, 26- 50% 2 балла, 51-75% 3 балла, более 75% 4 балла).
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Уровни экспрессии P27
Временное ограничение: 18 мая 2023 г. - 31 августа 2023 г.
|
Под микроскопом оценивали 12 иммуногистохимических срезов (оценки интенсивности окрашивания: отрицательное 0 баллов, слабое 1 балл, среднее 2 балла, сильное 3 балла; положительные оценки частоты клеток: менее 5% 0 баллов, 2-25% 1 балл, 26- 50% 2 балла, 51-75% 3 балла, более 75% 4 балла).
|
18 мая 2023 г. - 31 августа 2023 г.
|
|
Уровни экспрессии ESR1
Временное ограничение: 18 мая 2023 г. - 31 августа 2023 г.
|
Под микроскопом оценивали 12 иммуногистохимических срезов (оценки интенсивности окрашивания: отрицательное 0 баллов, слабое 1 балл, среднее 2 балла, сильное 3 балла; положительные оценки частоты клеток: менее 5% 0 баллов, 2-25% 1 балл, 26- 50% 2 балла, 51-75% 3 балла, более 75% 4 балла).
|
18 мая 2023 г. - 31 августа 2023 г.
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: Changye Zou, MD, First Affiliated Hospital, Sun Yat-Sen University
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
14 июня 2012 г.
Первичное завершение (Действительный)
31 августа 2023 г.
Завершение исследования (Действительный)
31 августа 2023 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
19 марта 2024 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
19 марта 2024 г.
Первый опубликованный (Действительный)
26 марта 2024 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
2 апреля 2024 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
30 марта 2024 г.
Последняя проверка
1 марта 2024 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- ChangyeZou
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
ДА
Описание плана IPD
Наборы данных можно получить у соответствующего автора (zouchy@mail.sysu.edu.cn) по обоснованному запросу после онлайн-трансляции SCI.
Сроки обмена IPD
СКИ онлайн.
Наборы данных доступны у соответствующего автора по обоснованному запросу.
Критерии совместного доступа к IPD
Наборы данных можно получить у соответствующего автора (zouchy@mail.sysu.edu.cn) по обоснованному запросу после онлайн-трансляции SCI.
Совместное использование IPD Поддерживающий тип информации
- STUDY_PROTOCOL
- САП
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Нет
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Нет
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .