Approches omiques des troubles neurodéveloppementaux
21 mars 2024 mis à jour par: IRCCS Eugenio Medea
Approches omiques pour caractériser les conséquences fonctionnelles et phénotypiques de variantes génomiques structurelles rares dans les troubles du développement neurologique et les anomalies congénitales
pour combler le fossé entre la structure moléculaire du CNV et l'effet sur le phénotype, en considérant les NDD comme des maladies complexes, car elles sont une conséquence du déséquilibre de plusieurs gènes sensibles au dosage, nous pourrions essayer de les aborder à travers différentes investigations --omiques (génomique, épigénomique, transcriptomique) selon le domaine émergent de la médecine des réseaux.
Cette approche holistique peut fournir des informations précieuses sur la compréhension des mécanismes moléculaires particuliers et des interactions moléculaires insoupçonnées qui contribuent à la pathogenèse de la maladie et éventuellement ouvrir la voie à la découverte de nouvelles stratégies médicamenteuses qui, même si elles ne guérissent pas, le patient peuvent améliorer ses performances et ses interactions sociales.
Aperçu de l'étude
Statut
Complété
Les conditions
Intervention / Traitement
Type d'étude
Interventionnel
Inscription (Réel)
22
Phase
- N'est pas applicable
Contacts et emplacements
Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.
Lieux d'étude
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LC
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Bosisio Parini, LC, Italie, 23842
- Scientific Institute IRCCS Eugenio Medea
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Critères de participation
Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
- Enfant
- Adulte
Accepte les volontaires sains
Non
La description
Critère d'intégration:
Patients atteints de troubles du développement neurologique porteurs d'un réarrangement génomique identifié par analyse par micropuce chromosomique (CMA)
Critère d'exclusion:
N / A
Plan d'étude
Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Objectif principal: Diagnostique
- Répartition: N / A
- Modèle interventionnel: Affectation à un seul groupe
- Masquage: Aucun (étiquette ouverte)
Armes et Interventions
Groupe de participants / Bras |
Intervention / Traitement |
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Expérimental: Séquençage du génome entier (WGS) et analyse du transcriptome
étudier par analyse WGS le génome de patients sélectionnés avec une caractérisation clinique détaillée. Le WGS sera également effectué sur l'ADN du parent à l'origine du CNV pour rechercher d'éventuelles signatures génomiques prédisposant au réarrangement détecté chez son fils/sa fille. étudier les profils d'expression de variants structurels par analyse du transcriptome |
À la lumière des incohérences entre la CNV et le résultat phénotypique, nous nous attendons à ce que l'analyse WGS révèle qu'une partie de ces CNV a une structure plus complexe que celle démêlée par CMA et FISH.
Nous émettons l'hypothèse que la CNV devrait refléter une configuration perturbée du repliement du génome à plusieurs niveaux hiérarchiques de l'organisation de la chromatine, telle qu'une perturbation des limites des TAD.
Pour étudier cet aspect, nous prévoyons d'examiner les profils d'expression de lignées de cellules B lymphoblastoïdes (LBL) immortalisées dérivées de témoins et de patients normaux.
Nous nous attendons à trouver un sous-ensemble de gènes régulés à la baisse ou à la hausse situés à l'intérieur de la région réarrangée, ce qui pourrait à son tour modifier l'expression d'autres gènes, conduisant éventuellement à une perturbation des voies liées à la maladie.
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Nombre de variantes structurelles pathogènes probables
Délai: une fois au recrutement
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Nombre de variantes structurelles pathogènes probables découvertes par séquençage du génome entier et analyse du transcriptome.
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une fois au recrutement
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Nombre de patients pour lesquels une corrélation génotype-phénotype est trouvée
Délai: une fois au recrutement
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Nombre de patients pour lesquels une corrélation génotype-phénotype est trouvée sur la base des résultats du séquençage du génome entier et de l'analyse du transcriptome.
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une fois au recrutement
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Collaborateurs et enquêteurs
C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.
Parrainer
Dates d'enregistrement des études
Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
5 mai 2021
Achèvement primaire (Réel)
28 juillet 2023
Achèvement de l'étude (Réel)
31 décembre 2023
Dates d'inscription aux études
Première soumission
21 mars 2024
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
21 mars 2024
Première publication (Réel)
29 mars 2024
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
29 mars 2024
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
21 mars 2024
Dernière vérification
1 mars 2024
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- 1001 (Registro Nacional Estudios Clinicos (RNEC))
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?
NON
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Non
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
Non
produit fabriqué et exporté des États-Unis.
Non
Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .