아프리카계 미국인 연구(GENE-FORECAST)에서 심혈관 질환의 유전학, 환경 요인 및 사회적 결정 요인

우리의 목표는 유전자 예측 내에서 아프리카계 미국인의 조상 관련 게놈 변이의 생물학적 중요성을 정의하기 위한 커뮤니티 기반 코호트 및 새로운 게놈 과학 자원을 개발하는 것입니다: 아프리카계 미국인의 유전학, 환경 요인 및 심혈관 질환의 사회적 결정요인 공부하다. 이 리소스를 통해 우리 팀은 심혈관 질환(CVD) 부담의 인종-조상 차이가 아프리카계 미국인(AA)의 뚜렷한 게놈 변이 특성과 사회적 유전자의 노출 사이의 독특한 상호 작용의 영향을 반영한다는 작업 가설을 테스트할 수 있습니다. AA에서 CVD의 병인에 영향을 미치는 결정 요인 및 환경 요인. 구체적인 목표는 다음과 같습니다.

목표 I. 공통 또는 조상 관련 DNA 변이와 CVD 위험 요인(예: 고혈압) 및 표현형(예: 관상 동맥 석회화) 아프리카계 미국인(AA).

목표 II. AA의 건강 행동 또는 사회 환경적 요인과 CVD 위험 요인 및 표현형 간의 연관성을 조사합니다.

이 연구는 약 1800명의 자체 식별, 미국 태생, 아프리카계 미국인(AA) 남성 및 여성(21세 -65)는 수도권 Washington DC, Montgomery County(MC) 및 Prince Georges County(PG) 지역에서 향후 5-6년에 걸쳐 NIH Clinical Center에 모집될 예정입니다. 초기 참가자 모집 전략에는 다음과 같은 두 가지 접근 방식이 포함되었습니다. 1) 잘 정립된 설문 조사 그룹(Southern 연구 그룹[SRG]); 2) 해당 지역의 지역 사회 기반 지도자, 조직 및 신앙 기반 기관의 참여와 마케팅을 활용하여 참가자를 임상 센터로 모집하기 위한 지역 사회 봉사 활동. 우리는 더 이상 SRG와 계약하지 않고 임상 센터 모집을 위한 지역 사회 봉사 활동 및 마케팅에 집중하고 있습니다. SRG와의 계약은 커뮤니티 아웃리치에 비해 임상 센터 모집률이 낮기 때문에 프로토콜의 첫 2년 후에 종료되었습니다.

AA 중 CVD의 높은 부담을 감안할 때, 이 접근 방식은 정상적인 개인뿐만 아니라 CVD의 궁극적인 임상 징후 및 증상(예: 심장 마비 및 뇌졸중). 이전의 역학 연구를 기반으로 이 프로토콜은 참여자 확인 접근 방식과 대상 인구 통계학적 프로필을 제공합니다. 임상적으로 명백한 CVD(협심증, 심장마비 또는 뇌졸중의 병력)의 유병률은 샘플의 10-15% 미만일 것으로 예상됩니다. 모든 참가자는 임상 센터에서 다음을 포함하는 광범위한 평가를 받게 됩니다. 인체측정학, 혈압), 실험실 테스트(예: 지질 수치, 신장 기능), 사회적 결정 요인 프로필(예: 사회경제적 상태(SES), 인지된 스트레스, 차별, 우울증, 인지된 이웃 특성), 딥 시퀀싱 기반 오믹 분석을 위한 혈액/소변 수집(예: 전체 엑솜 시퀀싱 및 RNA-Seq), CVD 또는 CVD 표현형의 병리학적 과정의 전임상 바이오마커에 대한 테스트(예: 관상 동맥 석회화, 미세알부민뇨, 백혈구 텔로미어 또는 혈관 기능 장애). 이러한 심층 시퀀싱 노력은 CVD 표현형과 관련된 새로운 조상 관련 DNA 변이체를 생성할 것으로 예상됩니다. 그러나 CVD의 인종적 불균형을 설명하는 데 생물학적 중요성이 불분명합니다. 따라서 우리의 프로토콜에는 유전자형(예: APOL1 만성 신장 질환 위험 대립 유전자) 인간 시스템 생물학에 대한 관심 DNA 변이체의 잠재적 영향에 대한 보다 심도 있는 표현형 및 특성 규명을 위한 콜백 방문. 어떤 경우에는 프로밴드의 가족 구성원이 이러한 G2P 연구에 참여하도록 초대되어 관심 있는 이러한 추정 기능 DNA 변이체의 생물학적 중요성을 추가로 특성화할 수 있습니다.

주요 결과 변수는 잘 확립된 CVD 표현형을 포함합니다. 1) CVD 위험 요인(예: 고혈압, 이상지질혈증), 2) 전임상 CVD의 마커(즉, 관상 동맥 석회화, 심장 CT 혈관 조영술(CTA)에 의한 관상 동맥 플라크 부담, 3D 초음파에 의한 경동맥 플라크 부담, 혈관 기능 장애, 미세알부민뇨, C-반응성 단백질, 비타민 D 수치). 프로토콜은 CVD 및 관련 공변량과 관련된 노출을 평가합니다. 1) 사회적 결정 요인(예: 사회경제적 지위(SES), 인지된 스트레스, 차별, 우울증); 2) 이웃 특성과 같은 환경적 요인(건강한 라이프스타일의 공간적 특성[예: 보행 용이성]) 및 3) 행동 요인(예: 다이어트, 신체 활동). G2P 콜백 방문 프로토콜에는 다음을 포함하는 심층 표현형의 추가 측정이 포함됩니다. 1) 말초 면역 세포 표현형(예: T 세포, 단핵구 하위 집합); 2) 혈액/면역 세포 RNAseq; 3) iPSC 세포주 생성(내피; 혈관 평활근 세포) 및 심혈관 세포 시스템 생물학의 분석; 4) HDL 프로테옴 분석, 5) FDG PET/CT 및/또는 PET/MRI 스캔(혈관 염증) 6) 심초음파 검사, 7) DNA 메틸화 위치 확인을 위한 바이설파이트 시퀀싱, 8) 염색질 면역침강 후 시퀀싱(Chip-Seq) ) 히스톤 변형 부위를 식별하기 위한 것입니다. AA의 게놈 및 표현형 특성에 대한 이 다단계, 다차원 분석은 그룹 내 분산의 생물 사회적 결정 요인과 AA에서 관찰되는 CVD의 전반적인 부담 증가에 대한 이해를 향상시킬 것으로 예상됩니다.