중추신경계(CNS) 감염이 의심되는 환자의 초기 진단 검사에 사용될 때 Delve Detect 뇌척수액(CSF) 메타지노믹 차세대 염기서열 분석(mNGS) 검사의 조사 (IMPACT)
의심되는 중추신경계(CNS) 감염 환자의 초기 진단 검사에 사용되는 Delve Detect 뇌척수액(CSF) 메타지놈 차세대 염기서열 분석(mNGS) 검사의 조사
Delve Bio, Inc.는 전통적인 진단 방법이 일상적으로 이용 가능하지 않은 여러 임상 적응증에서 감염성 질환의 진단을 돕기 위한 목표로 새로운 mNGS 검사를 개발하는 기업입니다. 이 mNGS 검사 방법론의 임상적 유용성에 대한 개념 증명은 여러 선구적인 논문에서 설명되었습니다.1,2,3,4 Delve Bio는 현재 이러한 검사 중 하나를 CLIA 인증, CAP 인정 시험실에서 수행되는 실험실 개발 검사(LDT)로 제공하고 있습니다. 이 검사는 Delve Detect CSF라고 합니다. Delve Detect CSF는 수막염 또는 뇌염이 의심되는 개인의 뇌척수액(CSF)에서 여러 세균, 바이러스, 곰팡이 및 기생충의 핵산을 동시에 검출 및 구별하기 위한 mNGS 체외 진단 검사입니다. Delve Detect CSF는 편향되지 않고 병원체에 구애받지 않는 방식으로 미생물 핵산을 식별합니다.
역사적으로, 비용과 약 14일 정도 소요되는 결과 회신 시간으로 인해 CSF mNGS 검사는 일반적으로 감염성 수막염 및 뇌염이 의심되는 환자에게 '마지막 수단 검사'로 사용되며, 전통적인 진단 방법이 감염 원인을 식별할 수 없을 때 종종 사용됩니다. IMPACT 연구에서는 중추 신경계 감염 및 원인 불명이 의심되는 환자의 진단 평가에서 mNGS 검사를 더 빠른 결과 회신 시간(시험실이 샘플을 접수한 후 영업일 기준 약 2일)과 함께 더 일찍 사용할 경우의 진단 및 임상적 유용성을 조사하고자 합니다. 포함/제외 기준을 충족하고 동의서(및 해당되는 경우 동의)를 받은 참가자는 연구에 등록되어 적절한 하위 집단 범주에 배정되며, 다른 표준 치료(SOC) 검사 외에 Delve Detect CSF를 통한 CSF 검사를 받게 됩니다. Delve Detect CSF 검사 결과 외에도, 참가자와 관련된 임상 정보 및 건강 경제학 데이터는 차트 추출을 통해 획득됩니다. 임상 정보는 가능한 한 비식별화되며, 수집되는 모든 개인 건강 정보(PHI)는 의도된 분석의 일부로 개별적으로 보고되지 않습니다. 각 현장의 현장 조사관 또는 그 대리인은 조기 진단 평가에서 Delve Detect CSF 검사 결과의 가용성이 임상적 의사 결정에 어떻게 영향을 미쳤는지에 대한 치료팀의 합의된 견해를 제공하기 위해 설문 조사를 완료할 것입니다.
Delve Detect CSF 및 기타 SOC 진단 방법의 검사 결과와 임상 정보에 대한 분석은 어떤 참가자를 식별하는 데 사용되지 않습니다. 연구를 통해 생성된 정보는 인간 참가자의 신원이 직접적으로 또는 참가자와 연결된 식별자를 통해 쉽게 확인될 수 없는 방식으로 기록되며, 참가자에게 연락하지 않습니다. 이 연구의 결과는 과학적 백서, 원고, 포스터 및/또는 발표를 지원하는 데 사용될 수 있습니다.
연구 개요
연구 유형
등록 (추정된)
단계
- 해당 없음
연락처 및 위치
연구 연락처
- 이름: Steve Miller, M.D., Ph.D.
- 전화번호: 844-221-7423
- 이메일: steve.miller@delve.bio
연구 연락처 백업
- 이름: Timothy Blicharz, Ph.D.
- 이메일: tim.blicharz@delve.bio
연구 장소
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Georgia
-
Atlanta, Georgia, 미국, 30322
- Emory University Hospital
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연락하다:
- Anna Piantadosi, MD, PhD
- 전화번호: 404-712-9005
- 이메일: anne.piantadosi@emory.edu
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수석 연구원:
- Anne Piantadosi, MD, PhD
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부수사관:
- Rami Waked, MD
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부수사관:
- Colleen Kraft, MD
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Tennessee
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Nashville, Tennessee, 미국, 37232
- Vanderbilt University Medical Center
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연락하다:
- Buddy Creech, MD, MPH
- 전화번호: 615-343-0332
- 이메일: buddy.creech@vumc.edu
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수석 연구원:
- Buddy Creech, MD, MPH
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부수사관:
- Stephanie Rolsma, MD, PhD
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부수사관:
- Susan G Johnson, MSN
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 어린이
- 성인
- 고령자
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
설명
포함 기준:
연구 참여에 대한 동의를 제공할 의사와 능력이 있어야 하거나, 법정 대리인이 연구 참여에 대한 동의를 제공할 의사와 능력이 있어야 합니다:
a. 성인(18세 이상)은 동의를 제공해야 하며, 동의를 제공할 수 없는 경우 법정 대리인이 자발적 동의를 제공해야 합니다. b. 18세 미만 아동의 경우 부모, 보호자 또는 법정 대리인의 동의가 필요하며: i. 7세 이상인 경우 참여에 대한 자발적 동의를 제공해야 하며(제공할 수 없는 경우 제외), 7세 미만인 경우 가능한 경우 동의도 얻어야 합니다.
다음 임상 징후 및 증상 중 최소 2가지 이상을 보이며 중추신경계 감염이 의심되는 개인:
- 두통
- 광선공포증
- 목 뻣뻣함
- 메스꺼움/구토
- 기록된 발열 ≥ 38°C (100.4°F)
- 대체 원인이 확인되지 않은 상태로 ≥ 24시간 지속되는 의식 상태 변화(의식 저하 또는 변화, 무기력증 또는 성격 변화로 정의)
- 기존 간질 장애, 확인된 독성-대사 장애 또는 알코올 금단으로 완전히 설명되지 않는 전신 또는 부분 발작
- 이전 연구와 비교하여 새로운 것이거나 급성 발병으로 보이는 중추신경계 감염을 시사하는 신경영상에서의 뇌 실질 이상
- 척수염을 시사하는 이상한 척수 영상
참고: 위의 임상 징후 및 증상 목록은 비영아 참가자(≥ 1세)에 적용됩니다. 중추신경계 감염이 의심되는 영아(< 1세)는 발열 ≥ 38°C (100.4°F) 또는 저체온증 < 36.5°C (97.7°F)와 다음 임상 징후 및 증상 중 최소 1가지 이상을 보이는 경우 등록될 수 있습니다:
- 불룩한 천문(연한 부분)
- 무기력 또는 과민성
- 수유 거부 또는 수유 불량
- 무호흡
- 저긴장 또는 과긴장
제외되는 참가자 특성:
- 잠재적 참가자 또는 법정 대리인으로부터 동의(또는 해당하는 경우 동의)를 얻을 수 없음
- 수막염/뇌염/척수염 증상의 원인이 되는 비감염성 병인이 확립되어, 요추천자 수행 전에 확인됨
- 증상의 원인이 되는 감염성 병인이 확립되어, 요추천자 수행 전에 미생물학적 확인이 이루어짐
Delve Detect CSF 검사를 위해 뇌척수액 샘플을 보내기 전에 증상의 원인이 되는 감염성 병인이 확립됨
참고: 이미 연구에 동의하고 등록된 참가자가 뇌척수액 샘플을 Delve Detect CSF 검사를 위해 보내기 전에 표준 치료 검사에서 양성 결과를 얻은 경우 연구에서 철회되고 분석에서 제외됩니다.
요추천자 수행 전에 환자 입원과 관련된 다음 알려진 진단 중 하나에 대한 감염 가능성이 낮은 경우. 이러한 진단의 과거력은 환자의 적격성에서 제외되지 않습니다:
- 외상
- 감염성 병인으로 의심되지 않는 경우의 허혈성 또는 출혈성 뇌졸중
- 발작 후 또는 대사성 뇌병증
- 현재 감염 증상이 없는 악성 종양
- 탈수초성 질환
제외되는 뇌척수액 샘플 특성:
첫 번째 요추천자에서 수집된 뇌척수액에서 뇌척수액 세포증가증(뇌척수액 백혈구 수 ≥ 5개/μL로 정의)의 증거가 없음.
참고: 제외 기준 4는 면역능력이 있거나 현재 면역결핍 또는 면역저하 상태를 알지 못하는 참가자에게 적용됩니다. 현재 면역결핍 또는 면역저하 상태(9.3절에 정의된 대로)를 가진 개인은 뇌척수액 세포증가증 유무와 관계없이 등록되어 최종 분석까지 진행될 수 있습니다.
- Delve Detect 검사를 위한 충분한 잔여 뇌척수액 부피가 없음 (< 500 μL)
- Delve Detect CSF 검사를 위해 사용 가능한 잔여 뇌척수액 샘플이 참가자의 현재 입원에 대한 첫 번째 진단적 요추천자가 아님
- 잔여 뇌척수액이 상온에서 ≥ 6시간 보관됨
- 잔여 뇌척수액이 냉장(2-8°C)에서 ≥ 7일 보관됨
- 잔여 뇌척수액이 냉동(≤ -70°C)에서 ≥ 90일 보관됨
- 잔여 뇌척수액이 누적 두 번 이상의 동결-해동 주기를 경험함
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
- 주 목적: 특수 증상
- 할당: 무작위화되지 않음
- 중재 모델: 단일 그룹 할당
- 마스킹: 없음(오픈 라벨)
무기와 개입
참가자 그룹 / 팔 |
개입 / 치료 |
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실험적: Delve Detect mNGS로 검사된 전향적으로 수집된 환자
참가자는 환자를 치료하는 임상의 및/또는 입원 또는 중환자실 입실을 통해 환자로부터 얻은 초기 샘플에 대해 임상 검사를 수행하는 실험실 연구원에 의해 전향적 등록 대상군 후보로 식별됩니다.
환자는 뇌척수액 채집이 수행되기 전 또는 후에 연구에 식별 및 등록될 수 있습니다.
적용 가능한 경우, 정보에 입각한 동의 및 동의 절차에 이어 참가자는 연구에 등록됩니다.
등록 및 정보에 입각한 동의/동의 후, SOC 진단 검사를 위한 첫 번째 요추천자 시 수집된 500-1000μL의 뇌척수액 샘플이 Delve Detect CSF 검사를 통한 mNGS 검사를 위해 전송됩니다.
Delve Detect CSF 검사 결과는 임상 의사 결정을 위해 치료 의사에게 제공됩니다.
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이 코호트는 중추신경계 감염이 의심되어 입원한 환자들로 구성되며, 이들은 전향적으로 수집된 뇌척수액 검체를 통해 Delve Detect CSF mNGS 검사를 받게 됩니다.
Delve Detect CSF mNGS 검사 결과는 환자의 치료팀에게 반환되어 임상적 의사 결정에 활용됩니다.
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활성 비교기: 현실 세계 데이터 통제 코호트
RWD는 CSF mNGS를 사용하지 않고 진단 및 치료를 받은 환자들의 대조군 데이터셋을 구성하는 데 사용될 것입니다.
전향적 등록 인구의 달력 기간/기간, 성별, 연령, 질병, 병인(감염성/비감염성) 및 하위 집단 범주의 비율을 일치시키려는 시도가 이루어질 것입니다.
대조군 인구의 의도는 CSF mNGS 검사를 사용하지 않고 진단 및 치료를 받은 환자들의 데이터를 수집함으로써 2차 및 탐색적 결과 비교를 가능하게 하는 것입니다.
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2차 및 탐색적 결과 분석을 위해, 실제 데이터(RWD)를 사용하여 CSF mNGS 검사 없이 진단 및 치료를 받은 환자들로 구성된 대조군을 구축할 것입니다. 대조군은 전향적 등록 인구와 인구통계학적 특성, 질병 중증도 및 하위 집단 범주의 비율이 대략 동일할 것입니다. CSF mNGS 검사 없이 진단 및 치료를 받은 환자들의 데이터를 수집함으로써, Delve Detect CSF 검사가 전향적으로 등록된 참가자들의 선택된 결과에 미칠 수 있는 잠재적 영향을 조사하기 위해 RWD가 사용될 것입니다. 이러한 참가자들은 비-mNGS 대조군에 등록되며, 전향적 등록 인구와의 비교에 적합한 동의 면제를 통해 비식별화된 RWD가 수집될 것입니다. |
연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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전체 진단 수율
기간: 각 환자별로 등록부터 퇴원 후 90일까지
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본 연구의 주요 종료점은 SOC 진단 검사와 비교하여 전반적인 진단 수율에 대한 Delve Detect CSF의 유용성을 조사하는 것입니다.
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각 환자별로 등록부터 퇴원 후 90일까지
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공동 작업자 및 조사자
스폰서
수사관
- 수석 연구원: Steve Miller, M.D., Ph.D., Delve Bio, Inc.
간행물 및 유용한 링크
일반 간행물
- Wilson MR, Sample HA, Zorn KC, Arevalo S, Yu G, Neuhaus J, Federman S, Stryke D, Briggs B, Langelier C, Berger A, Douglas V, Josephson SA, Chow FC, Fulton BD, DeRisi JL, Gelfand JM, Naccache SN, Bender J, Dien Bard J, Murkey J, Carlson M, Vespa PM, Vijayan T, Allyn PR, Campeau S, Humphries RM, Klausner JD, Ganzon CD, Memar F, Ocampo NA, Zimmermann LL, Cohen SH, Polage CR, DeBiasi RL, Haller B, Dallas R, Maron G, Hayden R, Messacar K, Dominguez SR, Miller S, Chiu CY. Clinical Metagenomic Sequencing for Diagnosis of Meningitis and Encephalitis. N Engl J Med. 2019 Jun 13;380(24):2327-2340. doi: 10.1056/NEJMoa1803396.
- Benoit P, Brazer N, de Lorenzi-Tognon M, Kelly E, Servellita V, Oseguera M, Nguyen J, Tang J, Omura C, Streithorst J, Hillberg M, Ingebrigtsen D, Zorn K, Wilson MR, Blicharz T, Wong AP, O'Donovan B, Murray B, Miller S, Chiu CY. Seven-year performance of a clinical metagenomic next-generation sequencing test for diagnosis of central nervous system infections. Nat Med. 2024 Dec;30(12):3522-3533. doi: 10.1038/s41591-024-03275-1. Epub 2024 Nov 12.
- Miller S, Naccache SN, Samayoa E, Messacar K, Arevalo S, Federman S, Stryke D, Pham E, Fung B, Bolosky WJ, Ingebrigtsen D, Lorizio W, Paff SM, Leake JA, Pesano R, DeBiasi R, Dominguez S, Chiu CY. Laboratory validation of a clinical metagenomic sequencing assay for pathogen detection in cerebrospinal fluid. Genome Res. 2019 May;29(5):831-842. doi: 10.1101/gr.238170.118. Epub 2019 Apr 16.
- Wilson MR,Naccache SN,Samayoa E,Biagtan M,Bashir H,Yu G,Salamat SM,Somasekar S,Federman S,Miller S,Sokolic R,Garabedian E,Candotti F,Buckley RH,Reed KD,Meyer TL,Seroogy CM,Galloway R,Henderson SL,Gern JE,DeRisi JL,Chiu CY
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (추정된)
기본 완료 (추정된)
연구 완료 (추정된)
연구 등록 날짜
최초 제출
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처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
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마지막으로 확인됨
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
기타 연구 ID 번호
- CLN-GEN-PLN-004
개별 참가자 데이터(IPD) 계획
개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?
IPD 계획 설명
임상 정보 외에도 Delve Detect CSF mNGS 검사 및 기타 SOC 진단 방법의 검사 결과 분석은 참가자를 식별하는 데 사용되지 않습니다. 정보에 입각한 동의 후, 참가자는 각 연구 현장에 제공될 표준 절차에 따라 고유 번호를 할당받아 비식별화됩니다. 참가자 ID는 각 참가자의 mNGS 검사에 사용된 각 CSF 검체 전달 튜브에 포함된 고유한 Delve Detect CSF ID 번호와 함께 사용됩니다.
본 연구의 결과는 과학적 백서, 원고, 포스터 및/또는 발표물 출판을 지원하는 데 사용될 수 있습니다.
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