- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk utprøving NCT07435649
Undersøkelse av Delve Detect Cerebrospinalvæske (CSF) Metagenomisk Neste-generasjons sekvensering (mNGS) test når den brukes i den innledende diagnostiske utredningen av pasienter med mistenkt sentralnervesystem (CNS) infeksjon (IMPACT)
Undersøkelse av Delve Detect Cerebrospinalvæske (CSF) Metagenomisk Neste-generasjons sekvensering (mNGS) test når den brukes til den første diagnostiske utredningen av pasienter med mistenkt sentralnervesystem (CNS) infeksjon
Delve Bio, Inc. er en utvikler av nye mNGS-tester med målet å bidra til diagnostisering av infeksjonssykdommer i flere kliniske indikasjoner som kanskje ikke har alternative tradisjonelle diagnostiske metoder rutinemessig tilgjengelig. En proof of concept for den kliniske nytten av denne mNGS-testmetodologien er beskrevet i flere grunnleggende publikasjoner.1,2,3,4 Delve Bio tilbyr for tiden en av disse analysene som en laboratorieutviklet test (LDT) utført i et CLIA-sertifisert, CAP-akkreditert laboratorium. Testen heter Delve Detect CSF. Delve Detect CSF er en mNGS in vitro-diagnostisk test beregnet for samtidig påvisning og differensiering av nukleinsyrer fra flere bakterier, virus, sopp og parasitter i CSF fra personer mistenkt for meningitt eller encefalitt. Delve Detect CSF identifiserer mikrobielt nukleinsyre på en upartisk og patogen-agnostisk måte.
Historisk sett, på grunn av kostnadene og svarstidene, som kan være i størrelsesorden 14 dager, blir CSF mNGS-testing typisk brukt som en "test av siste utvei" for pasienter med mistenkt infeksiøs meningitt og encefalitt, og brukes ofte når tradisjonelle diagnostiske metoder ikke kan identifisere årsaken til infeksjonen. I IMPACT-studien søker vi å undersøke den diagnostiske og kliniske nytten av mNGS-testing hvis den brukes tidligere i den diagnostiske utredningen av pasienter med mistenkt CNS-infeksjon og ukjent etiologi i sammenheng med en raskere svarstid for testresultater i størrelsesorden to virkedager fra prøvemottak av laboratoriet. Deltakere som oppfyller inklusjons-/eksklusjonskriteriene og gjennomgår informert samtykke (og assent etter behov) vil bli inkludert i studien, tildelt riktig underpopulasjonskategori og få CSF-testing med Delve Detect CSF i tillegg til annen SOC-testing. I tillegg til Delve Detect CSF-testresultatene vil tilhørende klinisk informasjon og helseøkonomiske data for deltakerne bli innhentet gjennom journaluttrekk. Klinisk informasjon vil bli de-identifisert der det er mulig, og enhver PHI som samles inn vil ikke rapporteres individuelt som en del av den planlagte analysen. Stedets hovedforsker eller deres utpegede ved hvert sted vil fullføre en undersøkelse for å gi et konsensussyn fra behandlingsteamet om hvordan tilgjengeligheten av Delve Detect CSF-testresultater i tidlig diagnostisk utredning påvirket klinisk beslutningstaking.
Analyser av testresultatene fra Delve Detect CSF og andre SOC-diagnostiske metoder, i tillegg til den kliniske informasjonen, vil ikke bli brukt til å identifisere noen deltaker. Informasjon generert gjennom studien vil bli registrert på en slik måte at identiteten til de menneskelige deltakerne ikke lett kan fastslås direkte eller gjennom identifikatorer knyttet til deltakerne, og deltakerne vil ikke bli kontaktet. Resultatene fra denne studien kan bli brukt til å støtte publikasjoner i vitenskapelige white papers, manuskripter, plakater og/eller presentasjoner.
Studieoversikt
Status
Forhold
Intervensjon / Behandling
Studietype
Registrering (Antatt)
Fase
- Ikke aktuelt
Kontakter og plasseringer
Studiekontakt
- Navn: Steve Miller, M.D., Ph.D.
- Telefonnummer: 844-221-7423
- E-post: steve.miller@delve.bio
Studer Kontakt Backup
- Navn: Timothy Blicharz, Ph.D.
- E-post: tim.blicharz@delve.bio
Studiesteder
-
-
California
-
San Francisco, California, Forente stater, 94110
- Har ikke rekruttert ennå
- University of California at San Francisco at Zuckerberg San Francisco General
-
Ta kontakt med:
- Colette Match, PhD, MPH
- Telefonnummer: 628-206-3595
- E-post: colette.match@ucsf.edu
-
Hovedetterforsker:
- Colette Match, PhD, MPH
-
-
Georgia
-
Atlanta, Georgia, Forente stater, 30322
- Rekruttering
- Emory University Hospital
-
Ta kontakt med:
- Anna Piantadosi, MD, PhD
- Telefonnummer: 404-712-9005
- E-post: anne.piantadosi@emory.edu
-
Hovedetterforsker:
- Anne Piantadosi, MD, PhD
-
Underetterforsker:
- Rami Waked, MD
-
Underetterforsker:
- Colleen Kraft, MD
-
-
Tennessee
-
Nashville, Tennessee, Forente stater, 37232
- Har ikke rekruttert ennå
- Vanderbilt University Medical Center
-
Ta kontakt med:
- Buddy Creech, MD, MPH
- Telefonnummer: 615-343-0332
- E-post: buddy.creech@vumc.edu
-
Hovedetterforsker:
- Buddy Creech, MD, MPH
-
Underetterforsker:
- Stephanie Rolsma, MD, PhD
-
Underetterforsker:
- Susan G Johnson, MSN
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Barn
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
Må være villig og i stand til å gi informert samtykke eller ha en juridisk autorisert representant (LAR) som er villig og i stand til å gi informert samtykke for deltakelse i studien:
a. Voksne, 18 år eller eldre, må gi informert samtykke, eller hvis de ikke er i stand til å gi samtykke, må frivillig informert samtykke gis av en LAR b. Barn < 18 år må ha informert samtykke gitt av en forelder, verge eller LAR, og: i. Hvis 7 år eller eldre, må gi frivillig assent for deltakelse, med mindre de ikke er i stand til å gjøre det Hvis under 7 år, bør assent også innhentes, hvis mulig.
Personer som presenterer med, eller er innlagt eller overført med, mistenkt CNS-infeksjon med minst 2 av følgende kliniske tegn og symptomer:
- Hodepine
- Fotofobi
- Nakkestivhet
- Kvalme/oppkast
- Dokumentert feber ≥ 38°C (100,4°F)
- Endret mental status (definert som redusert eller endret bevissthetsnivå, lethargi eller personlighetsendring) som varer ≥ 24 timer uten identifisert alternativ årsak
- Generalisert eller partiell anfall ikke fullstendig tilskrives en forhåndseksisterende anfallslidelse, identifisert toksisk-metabolsk forstyrrelse eller alkoholabstinens
- Abnormalitet av hjerneparenkym på nevrobildedannelse som tyder på CNS-infeksjon som enten er ny fra tidligere studier eller virker akutt i debut
- Abnormal ryggmargsbilde som tyder på myelitt
Merk: Listen over kliniske tegn og symptomer ovenfor gjelder for ikke-spedbarnsdeltakere (≥ 1 år). Spedbarn (< 1 år) som mistenkes for CNS-infeksjon kan inkluderes hvis de presenterer med feber ≥ 38°C (100,4°F) ELLER hypotermi < 36,5°C (97,7°F) OG minst 1 av følgende kliniske tegn og symptomer:
- Utsvulmet fontanell (myk flekk)
- Lethargi eller irritabilitet
- Nekter å spise eller dårlig spising
- Apné
- Hypotoni eller Hypertoni
Ekskluderende deltakerkarakteristikker:
- Ikke i stand til å innhente samtykke (eller assent, etter behov) fra potensiell deltaker eller juridisk autorisert representant (LAR)
- Etablert diagnose av ikke-infeksiøs etiologi ansvarlig for symptomer på meningitt/encefalitt/myelitt, med bekreftelse før lumbalpunksjon (LP) utføres
- Etablert diagnose av infeksiøs etiologi ansvarlig for symptomer med mikrobiologisk bekreftelse før LP utføres
Etablert diagnose av infeksiøs etiologi ansvarlig for symptomer før CSF-prøve sendes for testing med Delve Detect CSF
Merk: deltakere som allerede har gitt samtykke og er inkludert i studien som får et positivt testresultat fra SOC-testing før CSF-prøven sendes for testing med Delve Detect CSF vil bli trukket fra studien og ekskludert fra analyse.
Lav klinisk mistanke for infeksjon med en av følgende kjente diagnoser relatert til pasientinnleggelsen før LP utføres. Fjern historikk med disse diagnosene ekskluderer ikke pasienten fra kvalifikasjon:
- Traume
- Ischemisk eller hemoragisk slag med mindre mistenkt å skyldes infeksiøs etiologi
- Postiktal eller metabolsk encefalopati
- Malignitet uten nåværende infeksjonssymptomer
- Demyeliniserende sykdom
Ekskluderende CSF-prøvekarakteristikker:
Ingen bevis på CSF-pleocytose (definert som CSF hvite blodcelleantall (WBC) ≥ 5 celler per µL) i første LP samlet inn.
Merk: Eksklusjonskriterium 4 gjelder deltakere som er immunkompetente eller ellers ikke kjent for å ha en nåværende immundefekt eller immunsvekkelse. Personer med en nåværende immundefekt eller immunsvekkelse (som definert i seksjon 9.3) kan inkluderes med eller uten tilstedeværelse av CSF-pleocytose og fortsette til endelig analyse.
- Utilstrekkelig gjenværende CSF-volum tilgjengelig for Delve Detect-testing (< 500 µL)
- Den gjenværende CSF-prøven tilgjengelig for testing med Delve Detect CSF var ikke den første diagnostiske LP for deltakerens nåværende innleggelse
- Gjenværende CSF ble lagret ved romtemperatur i ≥ 6 timer
- Gjenværende CSF ble lagret nedkjølt (2-8 °C) i ≥ 7 dager
- Gjenværende CSF ble lagret frossen (≤ -70 °C) i ≥ 90 dager
- Gjenværende CSF opplevde mer enn en kumulativ to frys-tining-sykluser
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Primært formål: Diagnostisk
- Tildeling: Ikke-randomisert
- Intervensjonsmodell: Enkeltgruppeoppdrag
- Masking: Ingen (Open Label)
Våpen og intervensjoner
Deltakergruppe / Arm |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Eksperimentell: Prospektivt innsamlede pasienter testet med Delve Detect mNGS
Deltakere vil bli identifisert som kandidater for den prospektive inkluderingspopulasjonen av klinikere som behandler pasientene og/eller laboratorieundersøkere som utfører klinisk testing på innledende prøver innhentet fra pasientene gjennom innleggelse på sykehus eller intensivavdeling.
Pasienter kan bli identifisert og inkludert i studien før eller etter at CSF-prøvetaking er utført.
Etter informert samtykke og samtykkeprosedyrer, der aktuelt, vil deltakerne bli inkludert i studien.
Etter inkludering og informert samtykke/samtykke, vil 500 - 1000 µL av CSF-prøven samlet som en del av den første lumbalpunksjonen for standard diagnostisk utredning bli sendt for mNGS-testing med Delve Detect CSF-testen.
Delve Detect CSF-testresultater vil bli gitt til behandlende leger for klinisk beslutningstaking.
|
Denne kohorten består av pasienter innlagt med mistenkt CNS-infeksjon, som vil motta Delve Detect CSF mNGS-testing fra en prospektivt innsamlet CSF-prøve.
Resultatene av Delve Detect CSF mNGS-testen vil bli returnert til pasientens behandlingsteam for klinisk beslutningstaking.
|
|
Aktiv komparator: Kontrollkohort med virkelighetsbaserte data
RWD vil bli brukt til å konstruere et kontroll-datasett for pasienter som ble diagnostisert og behandlet uten bruk av CSF mNGS.
Et forsøk vil bli gjort for å matche kalendertidsperiode/varighet, og andeler av kjønn, alder, sykdom, etiologi (infeksiøs/ikke-infeksiøs), og subpopulasjonskategorier som den prospektive innrulleringpopulasjonen.
Intensjonen med kontrollpopulasjonen er å muliggjøre sekundære og utforskende resultatsammenligninger ved å samle inn data for pasienter som ble diagnostisert og behandlet uten bruk av CSF mNGS-testing.
|
For analysen av sekundære og utforskende utfall, vil en kontrollpopulasjon av pasienter som ble diagnostisert og behandlet uten bruk av CSF mNGS-testing bli konstruert ved hjelp av reelle data (RWD). Kontrollpopulasjonen vil ha omtrent like andeler av demografi, sykdommens alvorlighetsgrad og underpopulasjonskategorier som den prospektive inkluderingspopulasjonen. RWD vil bli brukt for å undersøke den potensielle effekten som testing med Delve Detect CSF hadde på de valgte utfallene med de prospektivt inkluderte deltakerne ved å samle inn data for pasienter som ble diagnostisert og behandlet uten bruk av CSF mNGS-testing. Disse deltakerne vil bli inkludert i den ikke-mNGS-kontrollpopulasjonen og ha de-identifiserte RWD samlet inn gjennom fritak fra informert samtykke etter behov for sammenligning med den prospektive inkluderingspopulasjonen. |
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Samlet diagnostisk utbytte
Tidsramme: Fra påmelding til 90 dager etter utskrivelse for hver pasient
|
Studiens primære endepunkt er å undersøke nytten av Delve Detect CSF med hensyn til den totale diagnostiske utbyttet sammenlignet med standard diagnostisk testing (SOC).
|
Fra påmelding til 90 dager etter utskrivelse for hver pasient
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Sponsor
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Steve Miller, M.D., Ph.D., Delve Bio, Inc.
Publikasjoner og nyttige lenker
Generelle publikasjoner
- Wilson MR, Sample HA, Zorn KC, Arevalo S, Yu G, Neuhaus J, Federman S, Stryke D, Briggs B, Langelier C, Berger A, Douglas V, Josephson SA, Chow FC, Fulton BD, DeRisi JL, Gelfand JM, Naccache SN, Bender J, Dien Bard J, Murkey J, Carlson M, Vespa PM, Vijayan T, Allyn PR, Campeau S, Humphries RM, Klausner JD, Ganzon CD, Memar F, Ocampo NA, Zimmermann LL, Cohen SH, Polage CR, DeBiasi RL, Haller B, Dallas R, Maron G, Hayden R, Messacar K, Dominguez SR, Miller S, Chiu CY. Clinical Metagenomic Sequencing for Diagnosis of Meningitis and Encephalitis. N Engl J Med. 2019 Jun 13;380(24):2327-2340. doi: 10.1056/NEJMoa1803396.
- Wilson MR, Naccache SN, Samayoa E, Biagtan M, Bashir H, Yu G, Salamat SM, Somasekar S, Federman S, Miller S, Sokolic R, Garabedian E, Candotti F, Buckley RH, Reed KD, Meyer TL, Seroogy CM, Galloway R, Henderson SL, Gern JE, DeRisi JL, Chiu CY. Actionable diagnosis of neuroleptospirosis by next-generation sequencing. N Engl J Med. 2014 Jun 19;370(25):2408-17. doi: 10.1056/NEJMoa1401268. Epub 2014 Jun 4.
- Benoit P, Brazer N, de Lorenzi-Tognon M, Kelly E, Servellita V, Oseguera M, Nguyen J, Tang J, Omura C, Streithorst J, Hillberg M, Ingebrigtsen D, Zorn K, Wilson MR, Blicharz T, Wong AP, O'Donovan B, Murray B, Miller S, Chiu CY. Seven-year performance of a clinical metagenomic next-generation sequencing test for diagnosis of central nervous system infections. Nat Med. 2024 Dec;30(12):3522-3533. doi: 10.1038/s41591-024-03275-1. Epub 2024 Nov 12.
- Miller S, Naccache SN, Samayoa E, Messacar K, Arevalo S, Federman S, Stryke D, Pham E, Fung B, Bolosky WJ, Ingebrigtsen D, Lorizio W, Paff SM, Leake JA, Pesano R, DeBiasi R, Dominguez S, Chiu CY. Laboratory validation of a clinical metagenomic sequencing assay for pathogen detection in cerebrospinal fluid. Genome Res. 2019 May;29(5):831-842. doi: 10.1101/gr.238170.118. Epub 2019 Apr 16.
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Primær fullføring (Antatt)
Studiet fullført (Antatt)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- CLN-GEN-PLN-004
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
IPD-planbeskrivelse
Analyser av testresultatene fra Delve Detect CSF mNGS-testen og andre standard diagnostiske metoder, i tillegg til klinisk informasjon, vil ikke bli brukt til å identifisere noen deltaker.
Etter informert samtykke vil deltakere bli anonymisert ved tildeling av et unikt nummer i henhold til en standardprosedyre som vil bli gitt til hvert forskningssted.
Deltaker-ID-en vil bli brukt sammen med det unike Delve Detect CSF ID-nummeret som er inkludert på hver CSF-prøveoverføringsrør som brukes til mNGS-testing for hver deltaker.
Resultatene fra denne studien kan bli brukt til å støtte publikasjoner i vitenskapelige hvitebøker, manuskripter, plakater og/eller presentasjoner.
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .
Kliniske studier på Infeksjon i sentralnervesystemet
-
Jianfeng XieRekrutteringCLABSI - Central Line Associated Bloodstream InfectionKina
-
Assiut UniversityHar ikke rekruttert ennåCLABSI - Central Line Associated Bloodstream Infection | Perifert innsatt sentralkateter | Navlestrengende venøs kateter
-
University of MalayaTeleflexFullførtCLABSI - Central Line Associated Bloodstream InfectionMalaysia
-
Johns Hopkins UniversityAvsluttetCLABSI - Central Line Associated Bloodstream InfectionForente stater
-
University of CologneFullførtCLABSI - Central Line Associated Bloodstream Infection | Kateterrelatert blodstrømsinfeksjonTyskland
-
Princess Anna Mazowiecka Hospital, Warsaw, PolandNutricia FoundationAktiv, ikke rekrutterendeVekstsvikt | CLABSI - Central Line Associated Bloodstream InfectionPolen
-
Medical University of ViennaFullførtDigital teknologi | CLABSI - Central Line Associated Bloodstream Infection | CRBSI - Kateterrelatert blodstrømsinfeksjonØsterrike
-
Duke UniversityHar ikke rekruttert ennåTilfredshet, pasient | Fallskade | Venøs tromboembolisme (VTE) | Lengden på oppholdet | CLABSI - Central Line Associated Bloodstream Infection | Sykepleiere | Kateterassosiert urinveisinfeksjon | Gjenopptakelsesrater | Sykehus skaffet seg trykkskadeForente stater
-
Fudan UniversityShanghai Zhongshan Hospital; Huashan Hospital; Shengjing Hospital; Children... og andre samarbeidspartnereRekrutteringKvalitets forbedring | Sentralt venekateter-assosiert blodbaneinfeksjon | CLABSI - Central Line Associated Bloodstream Infection | Sentralt venekateterrelatert blodbaneinfeksjon | Sentrallinjeinfeksjon | CRBSI - Kateterrelatert blodstrømsinfeksjon | Evidensbasert sykepleierpraksisKina
-
Hospital de Clinicas de Porto AlegreHospital Moinhos de Vento; Irmandade Santa Casa de Misericórdia de Porto...RekrutteringDyp venetrombose | Okklusjon | Utløst kateter | CLABSI - Central Line Associated Bloodstream Infection | Kateterruptur | Kateter (annet); KomplikasjonerBrasil
Kliniske studier på Delve Detect CSF mNGS Test
-
Xuanwu Hospital, BeijingHar ikke rekruttert ennåEncefalitt | Meningitt | Infeksjon av sentralnervesystemet (CNS).Kina
-
University of Alabama at BirminghamCenters for Disease Control and Prevention; Centre for Infectious Disease...FullførtHIV-infeksjoner | HivZambia
-
Ohio State UniversityFullførtInflammatoriske markører | FettinntakForente stater
-
University of CataniaHannover Medical SchoolRekrutteringMultippel sklerose | HørselsforstyrrelserItalia
-
Ludwig-Maximilians - University of MunichFullførtAlzheimers sykdom | Kortikobasalt syndrom
-
Bio-ker S.r.l.Cross Research S.A.; Nerviano Medical Sciences; AAI Deutschland GmbH & Co... og andre samarbeidspartnereFullført
-
Massachusetts General HospitalBayer; Dana-Farber Cancer Institute; Beth Israel Deaconess Medical Center; Brigham...AvsluttetLymfom, B-celle | Lymfom, Non-Hodgkin | Lymfom, diffusForente stater
-
M.D. Anderson Cancer CenterBayer Healthcare Pharmaceuticals, Inc./Bayer Schering PharmaFullførtLymfom | Leukemi | Lymfoide maligniteter | Lidelse relatert til transplantasjon | Transplantasjon, stamcelleForente stater
-
M.D. Anderson Cancer CenterNational Cancer Institute (NCI); BayerFullført