- ICH GCP
- Register voor klinische proeven in de VS.
- Klinische proef NCT07435649
Onderzoek naar de Delve Detect Cerebrospinal Vocht (CSF) Metagenomische Next-generation Sequencing (mNGS) Test bij gebruik voor het initiële diagnostische onderzoek van patiënten met een vermoedelijke infectie van het centrale zenuwstelsel (CZS) (IMPACT)
Onderzoek naar de Delve Detect Cerebrospinale Vloeistof (CSF) Metagenomische Next-generation Sequencing (mNGS) Test bij gebruik voor het initiële diagnostische onderzoek van patiënten met een vermoeden van een centraal zenuwstelsel (CZS) infectie
Delve Bio, Inc. is een ontwikkelaar van nieuwe mNGS-tests met als doel bij te dragen aan de diagnose van infectieziekten bij verschillende klinische indicaties waar mogelijk geen alternatieve traditionele diagnostische methoden routinematig beschikbaar zijn. Een proof of concept voor de klinische bruikbaarheid van deze mNGS-testmethodologie is beschreven in verschillende baanbrekende publicaties.1,2,3,4 Delve Bio biedt momenteel een van deze assays aan als een laboratoriumontwikkelde test (LDT) die wordt uitgevoerd in een CLIA-gecertificeerd, CAP-geaccrediteerd laboratorium. De test heet Delve Detect CSF. Delve Detect CSF is een mNGS in vitro diagnostische test bedoeld voor de gelijktijdige detectie en differentiatie van nucleïnezuren van meerdere bacteriën, virussen, schimmels en parasieten in CSF van personen met verdenking op meningitis of encefalitis. Delve Detect CSF identificeert microbiële nucleïnezuren op een onbevooroordeelde en pathogeen-agnostische manier.
Historisch gezien, vanwege de kosten en doorlooptijden, die in de orde van 14 dagen kunnen zijn, wordt CSF mNGS-testen doorgaans gebruikt als een "test van laatste redmiddel" voor patiënten met verdenking op infectieuze meningitis en encefalitis, en wordt vaak gebruikt wanneer traditionele diagnostische methoden de oorzaak van de infectie niet kunnen identificeren. In de IMPACT-studie willen we de diagnostische en klinische bruikbaarheid van mNGS-testen onderzoeken als deze eerder wordt ingezet in het diagnostische traject van patiënten met verdenking op CNS-infectie en onbekende etiologie, in combinatie met een snellere doorlooptijd voor testresultaten in de orde van twee werkdagen vanaf ontvangst van het monster door het laboratorium. Deelnemers die voldoen aan de inclusie-/exclusiecriteria en geïnformeerde toestemming (en instemming waar van toepassing) ondergaan, worden ingeschreven in de studie, toegewezen aan de juiste subpopulatiecategorie en ondergaan CSF-testen met Delve Detect CSF naast andere SOC-testen. Naast de Delve Detect CSF-testresultaten worden bijbehorende klinische informatie en gezondheidseconomische gegevens voor de deelnemers verkregen via dossierabstractie. Klinische informatie wordt waar mogelijk geanonimiseerd, en alle verzamelde PHI zal niet individueel worden gerapporteerd als onderdeel van de beoogde analyse. De site-onderzoeker of diens gemachtigde op elke locatie zal een enquête invullen om een consensusvisie van het behandelteam te geven over hoe de beschikbaarheid van Delve Detect CSF-testresultaten in het vroege diagnostische traject de klinische besluitvorming beïnvloedde.
Analyses van de testresultaten van Delve Detect CSF en andere SOC-diagnostische methoden, naast de klinische informatie, zullen niet worden gebruikt om deelnemers te identificeren. Informatie gegenereerd door de studie wordt op zo'n manier vastgelegd dat de identiteit van de menselijke deelnemers niet gemakkelijk direct of via aan de deelnemers gekoppelde identificatoren kan worden vastgesteld, en de deelnemers zullen niet worden benaderd. De resultaten van deze studie kunnen worden gebruikt ter ondersteuning van publicaties in wetenschappelijke white papers, manuscripten, posters en/of presentaties.
Studie Overzicht
Toestand
Interventie / Behandeling
Studietype
Inschrijving (Geschat)
Fase
- Niet toepasbaar
Contacten en locaties
Studiecontact
- Naam: Steve Miller, M.D., Ph.D.
- Telefoonnummer: 844-221-7423
- E-mail: steve.miller@delve.bio
Studie Contact Back-up
- Naam: Timothy Blicharz, Ph.D.
- E-mail: tim.blicharz@delve.bio
Studie Locaties
-
-
California
-
San Francisco, California, Verenigde Staten, 94110
- Werving
- University of California at San Francisco at Zuckerberg San Francisco General
-
Contact:
- Colette Match, PhD, MPH
- Telefoonnummer: 628-206-3595
- E-mail: colette.match@ucsf.edu
-
Hoofdonderzoeker:
- Colette Match, PhD, MPH
-
-
Georgia
-
Atlanta, Georgia, Verenigde Staten, 30322
- Werving
- Emory University Hospital
-
Contact:
- Anna Piantadosi, MD, PhD
- Telefoonnummer: 404-712-9005
- E-mail: anne.piantadosi@emory.edu
-
Hoofdonderzoeker:
- Anne Piantadosi, MD, PhD
-
Onderonderzoeker:
- Rami Waked, MD
-
Onderonderzoeker:
- Colleen Kraft, MD
-
-
Maryland
-
Baltimore, Maryland, Verenigde Staten, 21201
- Nog niet aan het werven
- University of Maryland, Baltimore
-
Contact:
- Jonathan Baghdadi, MD, PhD
- Telefoonnummer: 410-706-0066
- E-mail: jbaghdadi@som.umaryland.edu
-
Hoofdonderzoeker:
- Jonathan Baghdadi, MD, PhD
-
-
Massachusetts
-
Burlington, Massachusetts, Verenigde Staten, 01805
- Werving
- Lahey Hospital & Medical Center
-
Contact:
- Joseph Burns, MD
- Telefoonnummer: 781-744-8630
- E-mail: joseph.d.burns@lahey.org
-
Hoofdonderzoeker:
- Joseph Burns, MD
-
-
Tennessee
-
Nashville, Tennessee, Verenigde Staten, 37232
- Werving
- Vanderbilt University Medical Center
-
Contact:
- Buddy Creech, MD, MPH
- Telefoonnummer: 615-343-0332
- E-mail: buddy.creech@vumc.edu
-
Hoofdonderzoeker:
- Buddy Creech, MD, MPH
-
Onderonderzoeker:
- Stephanie Rolsma, MD, PhD
-
Onderonderzoeker:
- Susan G Johnson, MSN
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
- Kind
- Volwassen
- Oudere volwassene
Accepteert gezonde vrijwilligers
Beschrijving
Inclusiecriteria:
Moet bereid en in staat zijn om geïnformeerde toestemming te verlenen of een wettelijk gemachtigde vertegenwoordiger (LAR) hebben die bereid en in staat is om geïnformeerde toestemming te verlenen voor deelname aan de studie:
a. Volwassenen van 18 jaar of ouder moeten geïnformeerde toestemming verlenen, of als ze niet in staat zijn om toestemming te geven, moet er vrijwillige geïnformeerde toestemming worden gegeven door een LAR b. Kinderen < 18 jaar moeten geïnformeerde toestemming hebben van een ouder, voogd of LAR, en: i. Als ze 7 jaar of ouder zijn, moeten ze vrijwillige instemming geven voor deelname, tenzij ze daartoe niet in staat zijn Als ze jonger dan 7 jaar zijn, moet instemming ook worden verkregen, indien mogelijk.
Personen die zich presenteren met, of zijn opgenomen of overgeplaatst met, een vermoedelijke CNS-infectie met ten minste 2 van de volgende klinische tekenen en symptomen:
- Hoofdpijn
- Fotofobie
- Nekstijfheid
- Misselijkheid/braken
- Gedocumenteerde koorts ≥ 38°C (100,4°F)
- Veranderde mentale status (gedefinieerd als verminderd of veranderd bewustzijnsniveau, lethargie of persoonlijkheidsverandering) die ≥ 24 uur duurt zonder dat er een alternatieve oorzaak is geïdentificeerd
- Gegeneraliseerde of partiële aanvallen die niet volledig toe te schrijven zijn aan een reeds bestaande aanvalsstoornis, geïdentificeerde toxisch-metabole ontregeling of alcoholonttrekking
- Afwijking van het hersenparenchym op neuroimaging die suggestief is voor een CNS-infectie, die ofwel nieuw is ten opzichte van eerdere onderzoeken of acuut lijkt te zijn ontstaan
- Abnormale beeldvorming van het ruggenmerg die suggestief is voor myelitis
Opmerking: De bovenstaande lijst met klinische tekenen en symptomen is van toepassing op niet-infant deelnemers (≥ 1 jaar oud). Zuigelingen (< 1 jaar oud) die worden verdacht van een CNS-infectie kunnen worden ingeschreven als ze zich presenteren met koorts ≥ 38°C (100,4°F) OF hypothermie < 36,5°C (97,7°F) EN ten minste 1 van de volgende klinische tekenen en symptomen:
- Uitpuilende fontanel (zachte plek)
- Lethargie of prikkelbaarheid
- Weigering om te voeden of slecht voeden
- Apneu
- Hypotonie of hypertonie
Uitsluitende deelnemerskenmerken:
- Niet in staat om toestemming (of instemming, indien van toepassing) te verkrijgen van de potentiële deelnemer of wettelijk gemachtigde vertegenwoordiger (LAR)
- Vastgestelde diagnose van niet-infectieuze etiologie die verantwoordelijk is voor symptomen van meningitis/encefalitis/myelitis, met bevestiging vóór het uitvoeren van een lumbaalpunctie (LP)
- Vastgestelde diagnose van infectieuze etiologie die verantwoordelijk is voor symptomen met microbiologische bevestiging vóór het uitvoeren van LP
Vastgestelde diagnose van infectieuze etiologie die verantwoordelijk is voor symptomen vóór het verzenden van het CSF-monster voor testen met Delve Detect CSF
Opmerking: deelnemers die al toestemming hebben gegeven en zijn ingeschreven in de studie en een positief testresultaat krijgen van SOC-testen vóór het verzenden van het CSF-monster voor testen met Delve Detect CSF, worden teruggetrokken uit de studie en uitgesloten van analyse.
Lage klinische verdenking op infectie met een van de volgende bekende diagnoses gerelateerd aan de opname van de patiënt vóór het uitvoeren van LP. Een voorgeschiedenis van deze diagnoses sluit de patiënt niet uit voor deelname:
- Trauma
- Ischemische of hemorragische beroerte, tenzij verdacht van infectieuze etiologie
- Postictale of metabole encefalopathie
- Maligniteit zonder huidige infectiesymptomen
- Demyeliniserende ziekte
Uitsluitende CSF-monsterkenmerken:
Geen bewijs van CSF-pleocytose (gedefinieerd als CSF-wittebloedceltelling (WBC) ≥ 5 cellen per µL) in de eerste verzamelde LP.
Opmerking: Uitsluitingscriterium 4 is van toepassing op deelnemers die immuuncompetent zijn of anderszins niet bekend staan met een huidige immunodeficiëntie of immuungecompromitteerde status. Personen met een huidige immunodeficiëntie of immuungecompromitteerde status (zoals gedefinieerd in Sectie 9.3) kunnen worden ingeschreven met of zonder de aanwezigheid van CSF-pleocytose en doorgaan naar de definitieve analyse.
- Onvoldoende resterend CSF-volume beschikbaar voor Delve Detect-testen (< 500 µL)
- Het resterende CSF-monster beschikbaar voor testen met Delve Detect CSF was niet de eerste diagnostische LP voor de huidige opname van de deelnemer
- Resterend CSF werd op kamertemperatuur bewaard gedurende ≥ 6 uur
- Resterend CSF werd gekoeld bewaard (2-8 °C) gedurende ≥ 7 dagen
- Resterend CSF werd bevroren bewaard (≤ -70 °C) gedurende ≥ 90 dagen
- Resterend CSF onderging meer dan een cumulatieve twee vries-dooicycli
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Primair doel: Diagnostisch
- Toewijzing: Niet-gerandomiseerd
- Interventioneel model: Opdracht voor een enkele groep
- Masker: Geen (open label)
Wapens en interventies
Deelnemersgroep / Arm |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Experimenteel: Prospectief Verzamelde Patiënten getest met Delve Detect mNGS
Deelnemers zullen worden geïdentificeerd als kandidaten voor de prospectieve inschrijvingspopulatie door clinici die de patiënten behandelen en/of laboratoriumonderzoekers die klinische tests uitvoeren op initiële monsters verkregen van patiënten via opname op de verpleegafdeling of intensive care.
Patiënten kunnen worden geïdentificeerd en ingeschreven in de studie vóór of na het uitvoeren van CSF-afname.
Na geïnformeerde toestemmings- en instemmingsprocedures, indien van toepassing, zullen deelnemers worden ingeschreven in de studie.
Na inschrijving en geïnformeerde toestemming/instemming zal 500 - 1000 µL van het CSF-monster dat is verzameld als onderdeel van de eerste lumbaalpunctie voor SOC-diagnostisch onderzoek worden verzonden voor mNGS-testing met de Delve Detect CSF-test.
Delve Detect CSF-testresultaten zullen worden verstrekt aan behandelende artsen voor klinische besluitvorming.
|
Dit cohort bestaat uit patiënten die zijn opgenomen met een vermoedelijke CNS-infectie, die de Delve Detect CSF mNGS-test zullen ondergaan op een prospectief verzameld CSF-monster.
De resultaten van de Delve Detect CSF mNGS-test worden teruggestuurd naar het behandelteam van de patiënt voor klinische besluitvorming.
|
|
Actieve vergelijker: Real-World Data Controlegroep
RWD zal worden gebruikt om een controledataset op te bouwen voor patiënten die werden gediagnosticeerd en behandeld zonder gebruik te maken van CSF mNGS.
Er zal een poging worden gedaan om de kalendertijdsperiode/duur, en de verhoudingen van geslacht, leeftijd, ziekte, etiologie (infectieus/niet-infectieus) en subpopulatiecategorieën te matchen met de prospectief ingeschreven populatie.
Het doel van de controlepopulatie is om secundaire en verkennende uitkomstvergelijkingen mogelijk te maken door gegevens te verzamelen voor patiënten die werden gediagnosticeerd en behandeld zonder gebruik te maken van CSF mNGS-testen.
|
Voor de analyse van secundaire en verkennende uitkomsten zal een controlepopulatie van patiënten die werden gediagnosticeerd en behandeld zonder gebruik van CSF mNGS-testen worden samengesteld met behulp van real-world data (RWD). De controlepopulatie zal ongeveer gelijke proporties hebben van demografische kenmerken, ziekte-ernst en subpopulatiecategorieën als de prospectieve inschrijvingspopulatie. RWD zal worden gebruikt om het potentiële effect te onderzoeken dat testen met Delve Detect CSF had op de geselecteerde uitkomsten bij de prospectief ingeschreven deelnemers door gegevens te verzamelen van patiënten die werden gediagnosticeerd en behandeld zonder gebruik van CSF mNGS-testen. Deze deelnemers zullen worden ingeschreven in de niet-mNGS controlepopulatie en hebben geanonimiseerde RWD verzameld via een vrijstelling van geïnformeerde toestemming, zoals geschikt is voor vergelijking met de prospectieve inschrijvingspopulatie. |
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Algehele Diagnostische Opbrengst
Tijdsspanne: Van Inschrijving tot 90 Dagen na Ontslag voor Elke Patiënt
|
Het primaire eindpunt van de studie is het onderzoeken van het nut van Delve Detect CSF met betrekking tot de algehele diagnostische opbrengst in vergelijking met SOC-diagnostische testen.
|
Van Inschrijving tot 90 Dagen na Ontslag voor Elke Patiënt
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Steve Miller, M.D., Ph.D., Delve Bio, Inc.
Publicaties en nuttige links
Algemene publicaties
- Wilson MR, Sample HA, Zorn KC, Arevalo S, Yu G, Neuhaus J, Federman S, Stryke D, Briggs B, Langelier C, Berger A, Douglas V, Josephson SA, Chow FC, Fulton BD, DeRisi JL, Gelfand JM, Naccache SN, Bender J, Dien Bard J, Murkey J, Carlson M, Vespa PM, Vijayan T, Allyn PR, Campeau S, Humphries RM, Klausner JD, Ganzon CD, Memar F, Ocampo NA, Zimmermann LL, Cohen SH, Polage CR, DeBiasi RL, Haller B, Dallas R, Maron G, Hayden R, Messacar K, Dominguez SR, Miller S, Chiu CY. Clinical Metagenomic Sequencing for Diagnosis of Meningitis and Encephalitis. N Engl J Med. 2019 Jun 13;380(24):2327-2340. doi: 10.1056/NEJMoa1803396.
- Wilson MR, Naccache SN, Samayoa E, Biagtan M, Bashir H, Yu G, Salamat SM, Somasekar S, Federman S, Miller S, Sokolic R, Garabedian E, Candotti F, Buckley RH, Reed KD, Meyer TL, Seroogy CM, Galloway R, Henderson SL, Gern JE, DeRisi JL, Chiu CY. Actionable diagnosis of neuroleptospirosis by next-generation sequencing. N Engl J Med. 2014 Jun 19;370(25):2408-17. doi: 10.1056/NEJMoa1401268. Epub 2014 Jun 4.
- Benoit P, Brazer N, de Lorenzi-Tognon M, Kelly E, Servellita V, Oseguera M, Nguyen J, Tang J, Omura C, Streithorst J, Hillberg M, Ingebrigtsen D, Zorn K, Wilson MR, Blicharz T, Wong AP, O'Donovan B, Murray B, Miller S, Chiu CY. Seven-year performance of a clinical metagenomic next-generation sequencing test for diagnosis of central nervous system infections. Nat Med. 2024 Dec;30(12):3522-3533. doi: 10.1038/s41591-024-03275-1. Epub 2024 Nov 12.
- Miller S, Naccache SN, Samayoa E, Messacar K, Arevalo S, Federman S, Stryke D, Pham E, Fung B, Bolosky WJ, Ingebrigtsen D, Lorizio W, Paff SM, Leake JA, Pesano R, DeBiasi R, Dominguez S, Chiu CY. Laboratory validation of a clinical metagenomic sequencing assay for pathogen detection in cerebrospinal fluid. Genome Res. 2019 May;29(5):831-842. doi: 10.1101/gr.238170.118. Epub 2019 Apr 16.
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Geschat)
Studie voltooiing (Geschat)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- CLN-GEN-PLN-004
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Beschrijving IPD-plan
Analyses van de testresultaten van de Delve Detect CSF mNGS-test en alle andere SOC-diagnostische methoden, naast de klinische informatie, zullen niet worden gebruikt om een deelnemer te identificeren. Na geïnformeerde toestemming zullen deelnemers worden geanonimiseerd door toewijzing van een uniek nummer volgens een standaardprocedure die aan elke onderzoekslocatie zal worden verstrekt. Het deelnemers-ID zal worden gebruikt in combinatie met het unieke Delve Detect CSF-ID-nummer dat op elke CSF-monsteroverdrachtsbuis staat die voor mNGS-testing voor elke deelnemer wordt gebruikt.
De resultaten van deze studie kunnen worden gebruikt ter ondersteuning van publicaties in wetenschappelijke white papers, manuscripten, posters en/of presentaties.
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .