- ICH GCP
- Реестр клинических исследований США
- Клиническое испытание NCT07435649
Исследование теста Delve Detect для метагеномного секвенирования следующего поколения (mNGS) спинномозговой жидкости (CSF) при использовании для первоначальной диагностической оценки пациентов с подозрением на инфекцию центральной нервной системы (ЦНС) (IMPACT)
Исследование теста Delve Detect для метагеномного секвенирования следующего поколения (mNGS) спинномозговой жидкости (CSF), используемого при первоначальной диагностической оценке пациентов с подозрением на инфекцию центральной нервной системы (ЦНС)
Delve Bio, Inc. является разработчиком новых тестов mNGS с целью помощи в диагностике инфекционных заболеваний при нескольких клинических показаниях, для которых могут быть недоступны альтернативные традиционные диагностические методы. Доказательство клинической полезности этой методологии тестирования mNGS было описано в нескольких основополагающих публикациях.1,2,3,4 В настоящее время Delve Bio предлагает один из этих анализов в качестве лабораторно-разработанного теста (LDT), выполняемого в лаборатории, сертифицированной CLIA и аккредитованной CAP. Тест называется Delve Detect CSF. Delve Detect CSF — это mNGS in vitro диагностический тест, предназначенный для одновременного обнаружения и дифференциации нуклеиновых кислот множества бактерий, вирусов, грибов и паразитов в ЦСЖ у лиц с подозрением на менингит или энцефалит. Delve Detect CSF идентифицирует микробную нуклеиновую кислоту беспристрастным и патоген-агностическим образом.
Исторически, из-за своей стоимости и сроков выполнения, которые могут составлять порядка 14 дней, тестирование ЦСЖ mNGS обычно применяется как "тест последней инстанции" для пациентов с подозрением на инфекционный менингит и энцефалит и часто используется, когда традиционные диагностические методы не могут определить причину инфекции. В исследовании IMPACT мы стремимся изучить диагностическую и клиническую полезность тестирования mNGS, если оно применяется раньше в диагностическом обследовании пациентов с подозрением на ЦНС-инфекцию и неизвестной этиологией в сочетании с более быстрыми сроками получения результатов теста порядка двух рабочих дней с момента получения образца лабораторией. Участники, которые соответствуют критериям включения/исключения и проходят информированное согласие (и согласие, если применимо), будут включены в исследование, отнесены к соответствующей подгруппе и получат тестирование ЦСЖ с помощью Delve Detect CSF в дополнение к другим тестам SOC. В дополнение к результатам теста Delve Detect CSF, связанная клиническая информация и данные по экономике здравоохранения для участников будут получены путем извлечения из медицинских карт. Клиническая информация будет обезличена, где это возможно, и любая собираемая PHI не будет индивидуально отчитываться в рамках запланированного анализа. Следователь на месте или его уполномоченный представитель на каждом участке заполнит опрос, чтобы предоставить консенсусное мнение лечащей команды о том, как доступность результатов теста Delve Detect CSF на раннем этапе диагностического обследования повлияла на принятие клинических решений.
Анализы результатов теста Delve Detect CSF и других диагностических методов SOC, в дополнение к клинической информации, не будут использоваться для идентификации какого-либо участника. Информация, полученная в ходе исследования, будет записана таким образом, что личность участников-людей не может быть легко установлена напрямую или через идентификаторы, связанные с участниками, и с участниками не будут связываться. Результаты этого исследования могут быть использованы для поддержки публикаций в научных технических документах, рукописях, постерах и/или презентациях.
Обзор исследования
Статус
Вмешательство/лечение
Тип исследования
Регистрация (Оцененный)
Фаза
- Непригодный
Контакты и местонахождение
Контакты исследования
- Имя: Steve Miller, M.D., Ph.D.
- Номер телефона: 844-221-7423
- Электронная почта: steve.miller@delve.bio
Учебное резервное копирование контактов
- Имя: Timothy Blicharz, Ph.D.
- Электронная почта: tim.blicharz@delve.bio
Места учебы
-
-
California
-
San Francisco, California, Соединенные Штаты, 94110
- Рекрутинг
- University of California at San Francisco at Zuckerberg San Francisco General
-
Контакт:
- Colette Match, PhD, MPH
- Номер телефона: 628-206-3595
- Электронная почта: colette.match@ucsf.edu
-
Главный следователь:
- Colette Match, PhD, MPH
-
-
Georgia
-
Atlanta, Georgia, Соединенные Штаты, 30322
- Рекрутинг
- Emory University Hospital
-
Контакт:
- Anna Piantadosi, MD, PhD
- Номер телефона: 404-712-9005
- Электронная почта: anne.piantadosi@emory.edu
-
Главный следователь:
- Anne Piantadosi, MD, PhD
-
Младший исследователь:
- Rami Waked, MD
-
Младший исследователь:
- Colleen Kraft, MD
-
-
Maryland
-
Baltimore, Maryland, Соединенные Штаты, 21201
- Еще не набирают
- University of Maryland, Baltimore
-
Контакт:
- Jonathan Baghdadi, MD, PhD
- Номер телефона: 410-706-0066
- Электронная почта: jbaghdadi@som.umaryland.edu
-
Главный следователь:
- Jonathan Baghdadi, MD, PhD
-
-
Massachusetts
-
Burlington, Massachusetts, Соединенные Штаты, 01805
- Рекрутинг
- Lahey Hospital & Medical Center
-
Контакт:
- Joseph Burns, MD
- Номер телефона: 781-744-8630
- Электронная почта: joseph.d.burns@lahey.org
-
Главный следователь:
- Joseph Burns, MD
-
-
Tennessee
-
Nashville, Tennessee, Соединенные Штаты, 37232
- Рекрутинг
- Vanderbilt University Medical Center
-
Контакт:
- Buddy Creech, MD, MPH
- Номер телефона: 615-343-0332
- Электронная почта: buddy.creech@vumc.edu
-
Главный следователь:
- Buddy Creech, MD, MPH
-
Младший исследователь:
- Stephanie Rolsma, MD, PhD
-
Младший исследователь:
- Susan G Johnson, MSN
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Ребенок
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Описание
Критерии включения:
Должен быть готов и способен дать информированное согласие или иметь законного представителя (ЛП), готового и способного дать информированное согласие на участие в исследовании:
a. Взрослые в возрасте 18 лет и старше должны дать информированное согласие, а если не могут дать согласие, должно быть получено добровольное информированное согласие от ЛП. b. Дети младше 18 лет должны иметь информированное согласие, данное родителем, опекуном или ЛП, и: i. Если возраст 7 лет и старше, должны дать добровольное согласие на участие, если не могут этого сделать. Если возраст менее 7 лет, согласие также должно быть получено, если это возможно.
Лица с подозрением на инфекцию ЦНС при поступлении или переводе, имеющие как минимум 2 из следующих клинических признаков и симптомов:
- Головная боль
- Светобоязнь
- Ригидность затылочных мышц
- Тошнота/рвота
- Зафиксированная лихорадка ≥ 38°C (100.4°F)
- Изменение психического статуса (определяется как снижение или изменение уровня сознания, летаргия или изменение личности), продолжающееся ≥ 24 ч без выявления альтернативной причины
- Генерализованные или парциальные судороги, не полностью обусловленные ранее существовавшим судорожным расстройством, выявленным токсико-метаболическим нарушением или отменой алкоголя
- Аномалия паренхимы головного мозга на нейровизуализации, указывающая на инфекцию ЦНС, которая либо новая по сравнению с предыдущими исследованиями, либо имеет острое начало
- Аномалия визуализации спинного мозга, указывающая на миелит
Примечание: Вышеуказанный список клинических признаков и симптомов применяется к участникам, не являющимся младенцами (≥ 1 года). Младенцы (младше 1 года) с подозрением на инфекцию ЦНС могут быть включены, если у них наблюдается лихорадка ≥ 38°C (100.4°F) ИЛИ гипотермия < 36.5°C (97.7°F) И как минимум 1 из следующих клинических признаков и симптомов:
- Выбухание родничка (мягкое место)
- Летаргия или раздражительность
- Отказ от кормления или плохое кормление
- Апноэ
- Гипотония или гипертония
Исключающие характеристики участников:
- Невозможность получения согласия (или согласия, если применимо) от потенциального участника или законного представителя (ЛП)
- Установленный диагноз неинфекционной этиологии, ответственной за симптомы менингита/энцефалита/миелита, с подтверждением до проведения люмбальной пункции (ЛП)
- Установленный диагноз инфекционной этиологии, ответственной за симптомы, с микробиологическим подтверждением до проведения ЛП
Установленный диагноз инфекционной этиологии, ответственной за симптомы, до отправки образца СМЖ на тестирование с помощью Delve Detect CSF
Примечание: участники, уже давшие согласие и включенные в исследование, которые получают положительный результат теста SOC до отправки образца СМЖ на тестирование с помощью Delve Detect CSF, будут исключены из исследования и анализа.
Низкая клиническая подозрительность на инфекцию при наличии одного из следующих известных диагнозов, связанных с госпитализацией пациента, до проведения ЛП. Отдаленный анамнез этих диагнозов не исключает пациента из участия:
- Травма
- Ишемический или геморрагический инсульт, если не подозревается инфекционная этиология
- Постиктальная или метаболическая энцефалопатия
- Злокачественное новообразование без текущих симптомов инфекции
- Демиелинизирующее заболевание
Исключающие характеристики образца СМЖ:
Отсутствие признаков плеоцитоза СМЖ (определяется как количество лейкоцитов (ЛК) в СМЖ ≥ 5 клеток на мкл) в первой собранной ЛП.
Примечание: Критерий исключения 4 применяется к участникам, которые иммунокомпетентны или у которых неизвестно наличие текущего иммунодефицита или иммунокомпрометированного статуса. Лица с текущим иммунодефицитом или иммунокомпрометированным статусом (как определено в Разделе 9.3) могут быть включены независимо от наличия плеоцитоза СМЖ и продолжены до окончательного анализа.
- Недостаточный остаточный объем СМЖ для тестирования Delve Detect (< 500 мкл)
- Остаточный образец СМЖ, доступный для тестирования с помощью Delve Detect CSF, не был первой диагностической ЛП для текущей госпитализации участника
- Остаточная СМЖ хранилась при комнатной температуре ≥ 6 часов
- Остаточная СМЖ хранилась в охлажденном состоянии (2-8 °C) ≥ 7 дней
- Остаточная СМЖ хранилась в замороженном состоянии (≤ -70 °C) ≥ 90 дней
- Остаточная СМЖ подвергалась более чем двум кумулятивным циклам замораживания-оттаивания
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Основная цель: Диагностика
- Распределение: Нерандомизированный
- Интервенционная модель: Одногрупповое задание
- Маскировка: Нет (открытая этикетка)
Оружие и интервенции
Группа участников / Армия |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Экспериментальный: Пациенты, проспективно включенные в исследование, протестированные с помощью Delve Detect mNGS
Кандидаты для проспективной популяции включения будут определены клиницистами, которые лечат пациентов, и/или лабораторными исследователями, выполняющими клинические тесты на первоначальных образцах, полученных от пациентов при поступлении в стационар или ОРИТ.
Пациенты могут быть идентифицированы и включены в исследование до или после проведения сбора ЦСЖ.
После процедур информированного согласия и согласия (если применимо) участники будут включены в исследование.
После включения и получения информированного согласия/согласия, 500–1000 мкл образца ЦСЖ, собранного в рамках первой люмбальной пункции для стандартного диагностического обследования, будут отправлены на тестирование mNGS с помощью теста Delve Detect CSF.
Результаты теста Delve Detect CSF будут предоставлены лечащим врачам для принятия клинических решений.
|
Эта когорта состоит из пациентов, поступивших с подозрением на инфекцию ЦНС, которым будет проведено тестирование Delve Detect CSF mNGS с использованием проспективно собранного образца спинномозговой жидкости.
Результаты теста Delve Detect CSF mNGS будут переданы лечащей бригаде пациента для принятия клинических решений.
|
|
Активный компаратор: Контрольная когорта на основе данных реальной клинической практики
RWD будет использоваться для формирования контрольного набора данных для пациентов, у которых диагноз был установлен и лечение проводилось без использования CSF mNGS.
Будет предпринята попытка сопоставить календарный период/продолжительность, а также пропорции по полу, возрасту, заболеванию, этиологии (инфекционной/неинфекционной) и категориям субпопуляций с проспективной популяцией включения.
Целью контрольной популяции является обеспечение возможности сравнения вторичных и исследовательских исходов путем сбора данных для пациентов, у которых диагноз был установлен и лечение проводилось без использования тестирования CSF mNGS.
|
Для анализа вторичных и исследовательских конечных точек будет сформирована контрольная популяция пациентов, у которых диагноз был установлен и лечение проводилось без использования тестирования CSF mNGS, с использованием данных реальной клинической практики (RWD). Контрольная популяция будет иметь примерно равные пропорции демографических характеристик, степени тяжести заболевания и категорий подгрупп по сравнению с популяцией проспективного набора. RWD будет использоваться для изучения потенциального влияния тестирования Delve Detect CSF на выбранные конечные точки у участников проспективного набора путем сбора данных о пациентах, у которых диагноз был установлен и лечение проводилось без использования тестирования CSF mNGS. Эти участники будут включены в контрольную популяцию без mNGS, и их обезличенные RWD будут собраны с освобождением от информированного согласия, что является приемлемым для сравнения с популяцией проспективного набора. |
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Общая диагностическая эффективность
Временное ограничение: От момента включения в исследование до 90 дней после выписки для каждого пациента
|
Основной конечной точкой исследования является изучение полезности Delve Detect CSF в отношении общей диагностической эффективности по сравнению с диагностическим тестированием SOC.
|
От момента включения в исследование до 90 дней после выписки для каждого пациента
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: Steve Miller, M.D., Ph.D., Delve Bio, Inc.
Публикации и полезные ссылки
Общие публикации
- Wilson MR, Sample HA, Zorn KC, Arevalo S, Yu G, Neuhaus J, Federman S, Stryke D, Briggs B, Langelier C, Berger A, Douglas V, Josephson SA, Chow FC, Fulton BD, DeRisi JL, Gelfand JM, Naccache SN, Bender J, Dien Bard J, Murkey J, Carlson M, Vespa PM, Vijayan T, Allyn PR, Campeau S, Humphries RM, Klausner JD, Ganzon CD, Memar F, Ocampo NA, Zimmermann LL, Cohen SH, Polage CR, DeBiasi RL, Haller B, Dallas R, Maron G, Hayden R, Messacar K, Dominguez SR, Miller S, Chiu CY. Clinical Metagenomic Sequencing for Diagnosis of Meningitis and Encephalitis. N Engl J Med. 2019 Jun 13;380(24):2327-2340. doi: 10.1056/NEJMoa1803396.
- Wilson MR, Naccache SN, Samayoa E, Biagtan M, Bashir H, Yu G, Salamat SM, Somasekar S, Federman S, Miller S, Sokolic R, Garabedian E, Candotti F, Buckley RH, Reed KD, Meyer TL, Seroogy CM, Galloway R, Henderson SL, Gern JE, DeRisi JL, Chiu CY. Actionable diagnosis of neuroleptospirosis by next-generation sequencing. N Engl J Med. 2014 Jun 19;370(25):2408-17. doi: 10.1056/NEJMoa1401268. Epub 2014 Jun 4.
- Benoit P, Brazer N, de Lorenzi-Tognon M, Kelly E, Servellita V, Oseguera M, Nguyen J, Tang J, Omura C, Streithorst J, Hillberg M, Ingebrigtsen D, Zorn K, Wilson MR, Blicharz T, Wong AP, O'Donovan B, Murray B, Miller S, Chiu CY. Seven-year performance of a clinical metagenomic next-generation sequencing test for diagnosis of central nervous system infections. Nat Med. 2024 Dec;30(12):3522-3533. doi: 10.1038/s41591-024-03275-1. Epub 2024 Nov 12.
- Miller S, Naccache SN, Samayoa E, Messacar K, Arevalo S, Federman S, Stryke D, Pham E, Fung B, Bolosky WJ, Ingebrigtsen D, Lorizio W, Paff SM, Leake JA, Pesano R, DeBiasi R, Dominguez S, Chiu CY. Laboratory validation of a clinical metagenomic sequencing assay for pathogen detection in cerebrospinal fluid. Genome Res. 2019 May;29(5):831-842. doi: 10.1101/gr.238170.118. Epub 2019 Apr 16.
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Оцененный)
Завершение исследования (Оцененный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- CLN-GEN-PLN-004
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Описание плана IPD
Анализ результатов теста Delve Detect CSF mNGS и любых других методов диагностики SOC, в дополнение к клинической информации, не будет использоваться для идентификации какого-либо участника. После получения информированного согласия участники будут обезличены путем присвоения уникального номера в соответствии со стандартной процедурой, которая будет предоставлена каждому исследовательскому центру. Идентификатор участника будет использоваться вместе с уникальным номером Delve Detect CSF ID, указанным на каждой пробирке для переноса образцов СМЖ, используемой для тестирования mNGS для каждого участника.
Результаты этого исследования могут быть использованы для поддержки публикаций в научных технических документах, рукописях, постерах и/или презентациях.
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .