Tutkimus Delve Detect aivokalvontesteistä (CSF) metagenomisen uuden sukupolven sekvensoinnin (mNGS) testistä, kun sitä käytetään alustavassa diagnostisessa tutkimuksessa potilaille, joilla epäillään keskushermoston (CNS) infektiota (IMPACT)
Tutkimus Delve Detect aivo-selkäydinnesteen (CSF) metagenomisen uuden sukupolven sekvensointitestin (mNGS) käytöstä alkuperäisessä diagnoosiprosessissa potilaille, joilla on epäily keskushermoston (CNS) infektiosta
Delve Bio, Inc. on uusien mNGS-testien kehittäjä, jonka tavoitteena on auttaa tartuntatautien diagnosoinnissa useissa kliinisissä indikaatioissa, joissa vaihtoehtoisia perinteisiä diagnostisia menetelmiä ei välttämättä ole säännöllisesti saatavilla. Tämän mNGS-testausmenetelmän kliinisen hyödyn käsitteellinen todistus on kuvattu useissa merkittävissä julkaisuissa.1,2,3,4 Delve Bio tarjoaa tällä hetkellä yhtä näistä analyyseistä laboratoriokehitteisenä testinä (LDT), joka suoritetaan CLIA-sertifioidussa, CAP-akkredioidussa laboratoriossa. Testiä kutsutaan nimellä Delve Detect CSF. Delve Detect CSF on mNGS in vitro -diagnostinen testi, joka on tarkoitettu useiden bakteerien, virusten, sienten ja loisten nukleiinihappojen samanaikaiseen havaitsemiseen ja erotteluun aivokalvonnesteestä (CSF) henkilöiltä, joilla epäillään aivokalvontulehdusta tai aivotulehdusta. Delve Detect CSF tunnistaa mikrobien nukleiinihappoa puolueettomalla ja patogeeni-agnostisella tavalla.
Historiallisesti kustannustensa ja käsittelyaikansa vuoksi, joka voi olla luokkaa 14 päivää, CSF-mNGS-testaus on tyypillisesti käytössä "viimeisenä keinona" potilaille, joilla epäillään tartuntaperäistä aivokalvontulehdusta ja aivotulehdusta, ja sitä käytetään usein, kun perinteiset diagnostiset menetelmät eivät pysty tunnistamaan infektion syytä. IMPACT-tutkimuksessa pyrimme tutkimaan mNGS-testauksen diagnostista ja kliinistä hyötyä, jos sitä käytetään aiemmin potilaiden, joilla epäillään keskushermoston infektiota ja tuntematonta etiologiaa, diagnostisessa arvioinnissa yhdessä nopeamman tulosten saantiajan kanssa, joka on luokkaa kaksi arkipäivää näytteen vastaanottamisesta laboratoriossa. Osallistujat, jotka täyttävät sisällytys-/poissulkemiskriteerit ja antavat tietoon perustuvan suostumuksen (ja tarvittaessa hyväksynnän), otetaan mukaan tutkimukseen, jaetaan sopivaan alaryhmäkategoriaan ja heille suoritetaan CSF-testaus Delve Detect CSF:llä muiden SOC-testien lisäksi. Delve Detect CSF -testitulosten lisäksi osallistujien liittyvät kliiniset tiedot ja terveystaloudelliset tiedot kerätään kartta-analyysin kautta. Kliinistä tietoa anonymisoidaan mahdollisuuksien mukaan, eikä kerättyjä henkilötietoja raportoida yksittäin osana suunniteltua analyysiä. Jokaisen tutkimuspaikan tutkimusjohtaja tai heidän edustajansa täyttää kyselyn antaakseen hoitotiimin konsensusnäkemyksen siitä, miten Delve Detect CSF -testitulosten saatavuus varhaisessa diagnostisessa arvioinnissa vaikutti kliiniseen päätöksentekoon.
Delve Detect CSF:n ja muiden SOC-diagnostisten menetelmien testitulosten analyysejä sekä kliinistä tietoa ei käytetä minkään osallistujan tunnistamiseen. Tutkimuksen kautta tuotettua tietoa tallennetaan siten, että ihmisosallistujien henkilöllisyyttä ei voi helposti selvittää suoraan tai osallistujiin liitettyjen tunnisteiden kautta, eikä osallistujia oteta yhteyttä. Tämän tutkimuksen tuloksia voidaan käyttää tieteellisten valkoisten kirjojen, käsikirjoitusten, postereiden ja/tai esitysten julkaisujen tukemiseen.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Interventio / Hoito
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Vaihe
- Ei sovellettavissa
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Steve Miller, M.D., Ph.D.
- Puhelinnumero: 844-221-7423
- Sähköposti: steve.miller@delve.bio
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Timothy Blicharz, Ph.D.
- Sähköposti: tim.blicharz@delve.bio
Opiskelupaikat
-
-
Georgia
-
Atlanta, Georgia, Yhdysvallat, 30322
- Emory University Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Anna Piantadosi, MD, PhD
- Puhelinnumero: 404-712-9005
- Sähköposti: anne.piantadosi@emory.edu
-
Päätutkija:
- Anne Piantadosi, MD, PhD
-
Alatutkija:
- Rami Waked, MD
-
Alatutkija:
- Colleen Kraft, MD
-
-
Tennessee
-
Nashville, Tennessee, Yhdysvallat, 37232
- Vanderbilt University Medical Center
-
Ottaa yhteyttä:
- Buddy Creech, MD, MPH
- Puhelinnumero: 615-343-0332
- Sähköposti: buddy.creech@vumc.edu
-
Päätutkija:
- Buddy Creech, MD, MPH
-
Alatutkija:
- Stephanie Rolsma, MD, PhD
-
Alatutkija:
- Susan G Johnson, MSN
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Kuvaus
Osallistumiskriteerit:
On oltava halukas ja kykenevä antamaan tietoon perustuva suostumus tai hänellä on oltava laillisesti valtuutettu edustaja (LAR), joka on halukas ja kykenevä antamaan tietoon perustuvan suostumuksen osallistumisesta tutkimukseen:
a. Aikuisten, 18-vuotiaiden ja sitä vanhempien, on annettava tietoon perustuva suostumus, tai jos he eivät kykene antamaan suostumusta, LAR:n on annettava vapaaehtoinen tietoon perustuva suostumus b. Alle 18-vuotiaiden lasten on saavuttava tietoon perustuva suostumus vanhemmalta, huoltajalta tai LAR:lta, ja: i. Jos ikä on 7 vuotta tai enemmän, on annettava vapaaehtoinen suostumus osallistumiseen, ellei siihen kykene Jos ikä on alle 7 vuotta, suostumus on myös pyydettävä, mikäli se on mahdollista.
Yksilöt, joilla esiintyy tai jotka on otettu tai siirretty sairaalaan epäiltynä keskushermoston infektio vähintään kahdella seuraavista kliinisistä merkeistä ja oireista:
- Päänsärky
- Valonarkuus
- Niskan jäykkyys
- Pahoinvointi/oksentelu
- Dokumentoitu kuume ≥ 38°C (100.4°F)
- Muuttunut mielentila (määritelty alentuneena tai muuttuneena tietoisuustasona, väsymyksenä tai persoonallisuuden muutoksena) kestäen ≥ 24 tuntia ilman vaihtoehtoista syytä
- Yleistyneet tai osittaiset kohtaukset, joita ei voida täysin selittää aiemmalla kohtaushäiriöllä, tunnistetulla toksis-metabolisella häiriöllä tai alkoholin vieroitusoireyhtymällä
- Aivokudoksen poikkeavuus neurokuvauksessa, joka viittaa keskushermoston infektioon ja joka on joko uusi aiempiin tutkimuksiin verrattuna tai vaikuttaa akuutin alkavan
- Poikkeava selkäydinkanavan kuvantaminen, joka viittaa myelitiisiin
Huomio: Yllä oleva kliinisten merkkien ja oireiden luettelo koskee ei-vauvaikäisiä osallistujia (≥ 1 vuotta). Vauvat (< 1 vuotta), joilla epäillään keskushermoston infektiota, voidaan ottaa mukaan, jos heillä esiintyy kuume ≥ 38°C (100.4°F) TAI alilämpö < 36.5°C (97.7°F) JA vähintään yksi seuraavista kliinisistä merkeistä ja oireista:
- Pullistuva fontanelli (pehmeä kohta)
- Väsymys tai ärtyneisyys
- Kieltäytyminen syömästä tai huono syöminen
- Apopnea
- Hypotonia tai hypertonia
Poissulkevat osallistujien ominaisuudet:
- Mahdollisen osallistujan tai laillisesti valtuutetun edustajan (LAR) suostumuksen (tai suostumuksen, mikäli sovellettavaa) saaminen ei onnistu
- Vahvistettu diagnoosi ei-infektiivisestä etiologiasta, joka aiheuttaa aivokalvontulehduksen/aivojen tulehduksen/myelitiin oireita, vahvistettuna ennen lumbaalipunktiota (LP)
- Vahvistettu diagnoosi infektioetiologiasta, joka aiheuttaa oireita, mikrobiologisesti vahvistettuna ennen LP:tä
Vahvistettu diagnoosi infektioetiologiasta, joka aiheuttaa oireita, ennen kuin CSF-näyte lähetetään Delve Detect CSF -testaukseen
Huomio: osallistujat, jotka on jo suostumuksella otettu mukaan tutkimukseen ja jotka saavat positiivisen tuloksen SOC-testauksesta ennen kuin CSF-näyte lähetetään Delve Detect CSF -testaukseen, vedetään pois tutkimuksesta ja suljetaan analyysistä.
Matala kliininen epäily infektiosta, jossa on yksi seuraavista potilaan sairaalahoitoa koskevista tunnetuista diagnooseista ennen LP:tä. Kaukaisella historiolla olevat nämä diagnoosit eivät sulje potilasta kelpoisuudesta:
- Trauma
- Iskeeminen tai verenvuotoa aiheuttanut aivohalvaus, ellei sitä epäillä johtuvan infektiivisestä etiologiasta
- Postiktalinen tai metaboliinen enkefalopatia
- Pahanlaatuinen kasvain ilman nykyisiä infektio-oireita
- Demyelinisoiva sairaus
Poissulkevat CSF-näytteen ominaisuudet:
Ei todisteita CSF-pleosytoosista (määritelty CSF-valkosolujen lukumääräksi (WBC) ≥ 5 solua µL:ää kohti) ensimmäisessä kerätyssä LP:ssä.
Huomio: Poissulkukriteeri 4 koskee osallistujia, jotka ovat immunokompetentteja tai joilla ei muuten tiedetä olevan nykyistä immunopuutosta tai immunokompromisoitunutta tilaa. Yksilöt, joilla on nykyinen immunopuutos tai immunokompromisoitunut tila (kuten määritelty kohdassa 9.3), voidaan ottaa mukaan ilman tai CSF-pleosytoosin läsnä ollessa ja he jatkavat lopulliseen analyysiin.
- Riittämätön jäljellä oleva CSF-tilavuus Delve Detect -testaukseen (< 500 µL)
- Jäljellä oleva CSF-näyte, joka on saatavilla Delve Detect CSF -testaukseen, ei ollut osallistujan nykyisen sairaalahoidon ensimmäinen diagnostinen LP
- Jäljelle jäänyt CSF-näyte säilytettiin huoneenlämmössä ≥ 6 tuntia
- Jäljelle jäänyt CSF-näyte säilytettiin jääkaapissa (2-8 °C) ≥ 7 päivää
- Jäljelle jäänyt CSF-näyte säilytettiin jäädytettynä (≤ -70 °C) ≥ 90 päivää
- Jäljelle jäänyt CSF-näyte koki enemmän kuin kaksi kertaa yhteensä jäätymis-sulamissyklejä
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Ensisijainen käyttötarkoitus: Diagnostiikka
- Jako: Ei satunnaistettu
- Inventiomalli: Yksittäinen ryhmätehtävä
- Naamiointi: Ei mitään (avoin tarra)
Aseet ja interventiot
Osallistujaryhmä / Arm |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Kokeellinen: Prospektiivisesti Kerättyjen Potilaiden Testaus Delve Detect mNGS:llä
Osallistujat tunnistetaan ehdokkaiksi tulevaa rekrytointipopulaatiota varten kliinikoilla, jotka hoitavat potilaita ja/tai laboratoriotutkijoilla, jotka suorittavat kliinisiä testejä potilailta saaduista alkuperäisnäytteistä sairaalahoidon tai tehohoidon kautta.
Potilaita voidaan tunnistaa ja rekrytoida tutkimukseen ennen tai jälkeen aivoveden (CSF) keräämisen.
Tietoiseen suostumukseen ja hyväksymiseen liittyvien menettelyjen jälkeen osallistujat rekrytoidaan tutkimukseen.
Rekrytoinnin ja tietoisen suostumuksen/hyväksymisen jälkeen 500 - 1000 µL aivovedenäytettä, joka kerätään osana ensimmäistä lumbaalipunktiota (LP) vakiintuneen diagnostiikan toteuttamiseksi, lähetetään mNGS-testaukseen Delve Detect CSF -testillä.
Delve Detect CSF -testin tulokset toimitetaan hoitaville lääkäreille kliinistä päätöksentekoa varten.
|
Tämä kohortti koostuu potilaista, jotka on otettu hoitoon epäillyn keskushermostoinfektion vuoksi ja jotka saavat Delve Detect CSF mNGS-testin näytteestä, joka on kerätty prospektiivisesti.
Delve Detect CSF mNGS-testin tulokset toimitetaan potilaan hoitotiimille kliinistä päätöksentekoa varten.
|
|
Active Comparator: Todellisen maailman tietojen kontrollikohortti
RWD:llä luodaan kontrolliaineisto potilaille, joita diagnosoitiin ja hoidettiin ilman CSF mNGS:n käyttöä.
Pyritään vastaamaan kalenterin aikajaksoa/kestoa sekä sukupuolen, iän, taudin, etiologian (infektiivinen/ei-infektiivinen) ja alaryhmien osuuksia ennakoivasti rekrytoituun väestöön nähden.
Kontrolliväestön tarkoituksena on mahdollistaa toissijaisten ja tutkivien lopputulosten vertailut keräämällä tietoja potilaille, joita diagnosoitiin ja hoidettiin ilman CSF mNGS-testiä.
|
Sekundaarisia ja tutkivia lopputuloksia analysoitaessa rakennetaan todellisiin käytäntötietoihin (RWD) perustuva vertailuryhmä potilaista, joilla on diagnosoitu ja hoidettu ilman CSF mNGS -testausta käyttöä. Vertailuryhmän demografiset tekijät, sairauden vakavuus ja alaryhmäluokat ovat suunnilleen yhtä suuret kuin prospektiivisessa rekrytointipopulaatiossa. RWD-tietoja käytetään tutkimaan Delve Detect CSF -testauksen mahdollista vaikutusta valittuihin lopputuloksiin prospektiivisesti rekrytoitujen osallistujien keskuudessa keräämällä tietoja potilaille, joilla on diagnosoitu ja hoidettu ilman CSF mNGS -testausta. Nämä osallistujat rekrytoidaan ei-mNGS -vertailuryhmään, ja heiltä kerätään anonymisoituja RWD-tietoja ilman tietoa perustuvan suostumuksen antamista sopivin osin vertailua varten prospektiiviseen rekrytointipopulaatioon. |
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Kokonaisdiagnostinen saanto
Aikaikkuna: Potilaskohtaisesti ilmoittautumisesta 90 päivään kotiutumisen jälkeen
|
Tutkimuksen ensisijainen päätepiste on tutkia Delve Detect CSF:n hyödyllisyyttä kokonaisdiagnostisen saannon suhteen verrattuna SOC-diagnostisiin testauksiin.
|
Potilaskohtaisesti ilmoittautumisesta 90 päivään kotiutumisen jälkeen
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Tutkijat
- Päätutkija: Steve Miller, M.D., Ph.D., Delve Bio, Inc.
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Wilson MR, Sample HA, Zorn KC, Arevalo S, Yu G, Neuhaus J, Federman S, Stryke D, Briggs B, Langelier C, Berger A, Douglas V, Josephson SA, Chow FC, Fulton BD, DeRisi JL, Gelfand JM, Naccache SN, Bender J, Dien Bard J, Murkey J, Carlson M, Vespa PM, Vijayan T, Allyn PR, Campeau S, Humphries RM, Klausner JD, Ganzon CD, Memar F, Ocampo NA, Zimmermann LL, Cohen SH, Polage CR, DeBiasi RL, Haller B, Dallas R, Maron G, Hayden R, Messacar K, Dominguez SR, Miller S, Chiu CY. Clinical Metagenomic Sequencing for Diagnosis of Meningitis and Encephalitis. N Engl J Med. 2019 Jun 13;380(24):2327-2340. doi: 10.1056/NEJMoa1803396.
- Benoit P, Brazer N, de Lorenzi-Tognon M, Kelly E, Servellita V, Oseguera M, Nguyen J, Tang J, Omura C, Streithorst J, Hillberg M, Ingebrigtsen D, Zorn K, Wilson MR, Blicharz T, Wong AP, O'Donovan B, Murray B, Miller S, Chiu CY. Seven-year performance of a clinical metagenomic next-generation sequencing test for diagnosis of central nervous system infections. Nat Med. 2024 Dec;30(12):3522-3533. doi: 10.1038/s41591-024-03275-1. Epub 2024 Nov 12.
- Miller S, Naccache SN, Samayoa E, Messacar K, Arevalo S, Federman S, Stryke D, Pham E, Fung B, Bolosky WJ, Ingebrigtsen D, Lorizio W, Paff SM, Leake JA, Pesano R, DeBiasi R, Dominguez S, Chiu CY. Laboratory validation of a clinical metagenomic sequencing assay for pathogen detection in cerebrospinal fluid. Genome Res. 2019 May;29(5):831-842. doi: 10.1101/gr.238170.118. Epub 2019 Apr 16.
- Wilson MR,Naccache SN,Samayoa E,Biagtan M,Bashir H,Yu G,Salamat SM,Somasekar S,Federman S,Miller S,Sokolic R,Garabedian E,Candotti F,Buckley RH,Reed KD,Meyer TL,Seroogy CM,Galloway R,Henderson SL,Gern JE,DeRisi JL,Chiu CY
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Arvioitu)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- CLN-GEN-PLN-004
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
Testitulosten analysointia Delve Detect CSF mNGS -testistä ja muista yleisesti hyväksytyistä diagnostisista menetelmistä sekä kliinistä tietoa ei käytetä minkään osallistujan tunnistamiseen. Tietoiseen suostumukseen perustuen osallistujat anonymisoidaan määrittämällä heille yksilöllinen numero standardoidun menettelyn mukaisesti, joka toimitetaan jokaiselle tutkimuspaikalle. Osallistujan tunnusta käytetään yhdessä yksilöllisen Delve Detect CSF -tunnusnumeron kanssa, joka on merkitty jokaiselle mNGS-testaukseen käytetylle CSF-näytteen siirtoputkelle kullekin osallistujalle.
Tämän tutkimuksen tuloksia voidaan käyttää tieteellisten valkoisten papereiden, käsikirjoitusten, postereiden ja/tai esitysten julkaisemisen tukemiseen.
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset Delve Detect CSF mNGS-testi
-
University of Alabama at BirminghamCenters for Disease Control and Prevention; Centre for Infectious Disease...Valmis