- ICH GCP
- Rejestr badań klinicznych w USA
- Badanie kliniczne NCT07435649
Badanie testu sekwencjonowania nowej generacji metagenomowego (mNGS) płynu mózgowo-rdzeniowego Delve Detect, stosowanego w początkowym postępowaniu diagnostycznym u pacjentów z podejrzeniem zakażenia ośrodkowego układu nerwowego (OUN) (IMPACT)
Badanie testu metagenomicznego sekwencjonowania następnej generacji (mNGS) Delve Detect płynu mózgowo-rdzeniowego (CSF) stosowanego w początkowym etapie diagnostycznym u pacjentów z podejrzeniem zakażenia ośrodkowego układu nerwowego (OUN)
Delve Bio, Inc. to twórca nowatorskich testów mNGS, których celem jest wspomaganie diagnozowania chorób zakaźnych w kilku wskazaniach klinicznych, w których alternatywne, tradycyjne metody diagnostyczne mogą nie być rutynowo dostępne. Koncepcja użyteczności klinicznej tej metody testowania mNGS została opisana w kilku fundamentalnych publikacjach.1,2,3,4 Delve Bio oferuje obecnie jeden z tych testów jako test opracowany w laboratorium (LDT), wykonywany w laboratorium certyfikowanym przez CLIA i akredytowanym przez CAP. Test nazywa się Delve Detect CSF. Delve Detect CSF to in vitro diagnostyczny test mNGS przeznaczony do jednoczesnego wykrywania i różnicowania kwasów nukleinowych wielu bakterii, wirusów, grzybów i pasożytów w płynie mózgowo-rdzeniowym (CSF) u osób podejrzewanych o zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych lub mózgu. Delve Detect CSF identyfikuje mikrobiologiczny kwas nukleinowy w sposób obiektywny i niezależny od patogenu.
Historycznie, ze względu na koszt i czas realizacji, który może wynosić około 14 dni, testowanie mNGS CSF jest zazwyczaj stosowane jako "test ostatniej szansy" u pacjentów z podejrzeniem zakaźnego zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych i mózgu, i często używane, gdy tradycyjne metody diagnostyczne nie mogą zidentyfikować przyczyny zakażenia. W badaniu IMPACT staramy się zbadać diagnostyczną i kliniczną użyteczność testowania mNGS, jeśli jest ono stosowane wcześniej w diagnostyce pacjentów z podejrzeniem zakażenia OUN i nieznaną etiologią, w połączeniu z szybszym czasem realizacji wyników testów rzędu dwóch dni roboczych od otrzymania próbki przez laboratorium. Uczestnicy spełniający kryteria włączenia/wykluczenia i poddani świadomej zgodzie (oraz asentowi, jeśli dotyczy) zostaną włączeni do badania, przypisani do odpowiedniej kategorii podpopulacji i poddani testowaniu CSF za pomocą Delve Detect CSF oprócz innych testów SOC. Oprócz wyników testu Delve Detect CSF, powiązane informacje kliniczne i dane ekonomiczne dotyczące zdrowia uczestników zostaną uzyskane poprzez abstrakcję z kartotek. Informacje kliniczne zostaną anonimizowane, gdzie to możliwe, a wszelkie zbierane PHI nie będą indywidualnie raportowane jako część planowanej analizy. Badacz miejsca lub jego przedstawiciel w każdym ośrodku wypełni ankietę, aby przedstawić konsensus zespołu leczącego dotyczący tego, jak dostępność wyników testu Delve Detect CSF we wczesnej diagnostyce wpłynęła na podejmowanie decyzji klinicznych.
Analizy wyników testu Delve Detect CSF i innych diagnostycznych metod SOC, oprócz informacji klinicznych, nie będą wykorzystywane do identyfikacji żadnego uczestnika. Informacje generowane w trakcie badania będą rejestrowane w taki sposób, aby tożsamość uczestników ludzkich nie mogła być łatwo ustalona bezpośrednio ani za pomocą identyfikatorów powiązanych z uczestnikami, a uczestnicy nie będą kontaktowani. Wyniki tego badania mogą być wykorzystane do wsparcia publikacji w naukowych białych księgach, manuskryptach, plakatach i/lub prezentacjach.
Przegląd badań
Status
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Faza
- Nie dotyczy
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Steve Miller, M.D., Ph.D.
- Numer telefonu: 844-221-7423
- E-mail: steve.miller@delve.bio
Kopia zapasowa kontaktu do badania
- Nazwa: Timothy Blicharz, Ph.D.
- E-mail: tim.blicharz@delve.bio
Lokalizacje studiów
-
-
Georgia
-
Atlanta, Georgia, Stany Zjednoczone, 30322
- Emory University Hospital
-
Kontakt:
- Anna Piantadosi, MD, PhD
- Numer telefonu: 404-712-9005
- E-mail: anne.piantadosi@emory.edu
-
Główny śledczy:
- Anne Piantadosi, MD, PhD
-
Pod-śledczy:
- Rami Waked, MD
-
Pod-śledczy:
- Colleen Kraft, MD
-
-
Tennessee
-
Nashville, Tennessee, Stany Zjednoczone, 37232
- Vanderbilt University Medical Center
-
Kontakt:
- Buddy Creech, MD, MPH
- Numer telefonu: 615-343-0332
- E-mail: buddy.creech@vumc.edu
-
Główny śledczy:
- Buddy Creech, MD, MPH
-
Pod-śledczy:
- Stephanie Rolsma, MD, PhD
-
Pod-śledczy:
- Susan G Johnson, MSN
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dziecko
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Opis
Kryteria włączenia:
Musi być gotowy i zdolny do wyrażenia świadomej zgody lub mieć prawnie upoważnionego przedstawiciela (LAR) gotowego i zdolnego do wyrażenia świadomej zgody na udział w badaniu:
a. Osoby dorosłe, w wieku 18 lat lub starsze, muszą wyrazić świadomą zgodę, lub jeśli nie są w stanie wyrazić zgody, muszą mieć dobrowolną świadomą zgodę wyrażoną przez LAR b. Dzieci < 18 lat muszą mieć świadomą zgodę wyrażoną przez rodzica, opiekuna lub LAR, oraz: i. Jeśli mają 7 lat lub więcej, muszą wyrazić dobrowolną asentę na udział, chyba że nie są w stanie tego zrobić. Jeśli mają mniej niż 7 lat, asenta również powinna być uzyskana, jeśli jest to możliwe.
Osoby prezentujące lub przyjęte lub przeniesione z podejrzeniem infekcji OUN z co najmniej 2 z następujących objawów klinicznych:
- Ból głowy
- Fotofobia
- Sztywność karku
- Nudności/wymioty
- Udokumentowana gorączka ≥ 38°C (100,4°F)
- Zaburzenia stanu świadomości (zdefiniowane jako obniżony lub zmieniony poziom świadomości, letarg lub zmiana osobowości) trwające ≥ 24 h bez zidentyfikowanej alternatywnej przyczyny
- Uogólnione lub ogniskowe napady padaczkowe nie w pełni przypisywane wcześniej istniejącemu zaburzeniu napadowemu, zidentyfikowanemu zaburzeniu toksyczno-metabolicznemu lub odstawieniu alkoholu
- Nieprawidłowość miąższu mózgu w neuroobrazowaniu sugerująca infekcję OUN, która jest nowa w porównaniu z poprzednimi badaniami lub wydaje się ostra w początku
- Nieprawidłowy obraz rdzenia kręgowego sugerujący zapalenie rdzenia
Uwaga: Powyższa lista objawów klinicznych dotyczy uczestników niebędących niemowlętami (≥ 1 rok życia). Niemowlęta (< 1 rok życia) podejrzewane o infekcję OUN mogą być włączone, jeśli prezentują gorączkę ≥ 38°C (100,4°F) LUB hipotermię < 36,5°C (97,7°F) ORAZ co najmniej 1 z następujących objawów klinicznych:
- Wypukłe ciemiączko
- Letarg lub drażliwość
- Odmowa karmienia lub słabe karmienie
- Bezdech
- Hipotonia lub hipertonia
Charakterystyka uczestników wykluczająca:
- Niezdolność do uzyskania zgody (lub asenty, jeśli dotyczy) od potencjalnego uczestnika lub prawnie upoważnionego przedstawiciela (LAR)
- Ustalone rozpoznanie nieinfekcyjnej etiologii odpowiedzialnej za objawy zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych/zapalenia mózgu/zapalenia rdzenia, z potwierdzeniem przed wykonaniem nakłucia lędźwiowego (LP)
- Ustalone rozpoznanie infekcyjnej etiologii odpowiedzialnej za objawy z mikrobiologicznym potwierdzeniem przed wykonaniem LP
Ustalone rozpoznanie infekcyjnej etiologii odpowiedzialnej za objawy przed wysłaniem próbki płynu mózgowo-rdzeniowego do badania testem Delve Detect CSF
Uwaga: uczestnicy już wyrażający zgodę i włączeni do badania, którzy uzyskają pozytywny wynik testu z badania standardowego przed wysłaniem próbki płynu mózgowo-rdzeniowego do badania testem Delve Detect CSF, zostaną wycofani z badania i wykluczeni z analizy.
Niskie podejrzenie kliniczne infekcji z jednym z następujących znanych rozpoznań związanych z przyjęciem pacjenta przed wykonaniem LP. Odległa historia tych rozpoznań nie wyklucza pacjenta z kwalifikowalności:
- Uraz
- Udar niedokrwienny lub krwotoczny, chyba że podejrzewa się etiologię infekcyjną
- Encefalopatia po napadowa lub metaboliczna
- Nowotwór bez obecnych objawów infekcji
- Choroba demielinizacyjna
Charakterystyka próbki płynu mózgowo-rdzeniowego wykluczająca:
Brak dowodów na pleocytozę w płynie mózgowo-rdzeniowym (zdefiniowaną jako liczba białych krwinek (WBC) w płynie mózgowo-rdzeniowym ≥ 5 komórek na μL) w pierwszym pobranym LP.
Uwaga: Kryterium wykluczenia 4 dotyczy uczestników immunokompetentnych lub nieznanych z obecnego niedoboru odporności lub stanu immunokompromitacji. Osoby z obecnym niedoborem odporności lub stanem immunokompromitacji (zdefiniowanym w Sekcji 9.3) mogą być włączone z obecnością lub bez obecności pleocytozy w płynie mózgowo-rdzeniowym i kontynuować do ostatecznej analizy.
- Niewystarczająca pozostała objętość płynu mózgowo-rdzeniowego dostępna do badania Delve Detect (< 500 μL)
- Pozostała próbka płynu mózgowo-rdzeniowego dostępna do badania testem Delve Detect CSF nie była pierwszym diagnostycznym LP dla obecnego przyjęcia uczestnika
- Pozostały płyn mózgowo-rdzeniowy był przechowywany w temperaturze pokojowej przez ≥ 6 godzin
- Pozostały płyn mózgowo-rdzeniowy był przechowywany w lodówce (2-8 °C) przez ≥ 7 dni
- Pozostały płyn mózgowo-rdzeniowy był przechowywany zamrożony (≤ -70 °C) przez ≥ 90 dni
- Pozostały płyn mózgowo-rdzeniowy przeszedł więcej niż łącznie dwa cykle zamrażania-rozmrażania
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Główny cel: Diagnostyczny
- Przydział: Nielosowe
- Model interwencyjny: Zadanie dla jednej grupy
- Maskowanie: Brak (otwarta etykieta)
Broń i interwencje
Grupa uczestników / Arm |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Eksperymentalny: Pacjenci gromadzeni prospektywnie, testowani za pomocą Delve Detect mNGS
Uczestnicy zostaną zidentyfikowani jako kandydaci do prospektywnej populacji rekrutacyjnej przez klinicystów leczących pacjentów i/lub badaczy laboratoryjnych wykonujących badania kliniczne na początkowych próbkach pobranych od pacjentów poprzez przyjęcie do szpitala lub na OIOM.
Pacjenci mogą zostać zidentyfikowani i włączeni do badania przed lub po pobraniu płynu mózgowo-rdzeniowego.
Po procedurach świadomej zgody i asenty, w stosownych przypadkach, uczestnicy zostaną włączeni do badania.
Po włączeniu do badania i uzyskaniu świadomej zgody/asenty, 500-1000 µL próbki płynu mózgowo-rdzeniowego pobranej w ramach pierwszej punkcji lędźwiowej do standardowej diagnostyki zostanie przesłane do testowania metodą mNGS za pomocą testu Delve Detect CSF.
Wyniki testu Delve Detect CSF zostaną przekazane lekarzom prowadzącym w celu podejmowania decyzji klinicznych.
|
Ta kohorta składa się z pacjentów przyjętych z podejrzeniem infekcji OUN, którzy otrzymają test Delve Detect CSF mNGS z próbki CSF zebranej prospektywnie.
Wyniki testu Delve Detect CSF mNGS zostaną przekazane zespołowi leczącemu pacjenta w celu podjęcia decyzji klinicznych.
|
|
Aktywny komparator: Kohorta Kontrolna z Danych Rzeczywistych
Dane RWD zostaną wykorzystane do skonstruowania zbioru danych kontrolnych dla pacjentów, u których diagnozę i leczenie przeprowadzono bez użycia CSF mNGS.
Podjęta zostanie próba dopasowania okresu/czasu trwania kalendarzowego oraz proporcji płci, wieku, choroby, etiologii (zakaźnej/niezakaźnej) i kategorii subpopulacji do populacji rekrutowanej prospektywnie. Celem populacji kontrolnej jest umożliwienie porównań wyników drugorzędnych i eksploracyjnych poprzez zbieranie danych dla pacjentów, u których diagnozę i leczenie przeprowadzono bez użycia testowania CSF mNGS. |
Do analizy wtórnych i eksploracyjnych punktów końcowych, populacja kontrolna pacjentów, u których diagnozę i leczenie przeprowadzono bez użycia testu CSF mNGS, zostanie skonstruowana przy użyciu danych z rzeczywistej praktyki klinicznej (RWD). Populacja kontrolna będzie miała w przybliżeniu równe proporcje w zakresie demografii, ciężkości choroby i kategorii podpopulacji jak populacja rekrutowana prospektywnie. RWD zostanie wykorzystane do zbadania potencjalnego wpływu testowania za pomocą Delve Detect CSF na wybrane punkty końcowe u uczestników rekrutowanych prospektywnie poprzez zbieranie danych dla pacjentów, u których diagnozę i leczenie przeprowadzono bez użycia testu CSF mNGS. Uczestnicy ci zostaną włączeni do kontrolnej populacji bez mNGS, a ich zanonimizowane RWD zostanie zebrane na podstawie odstępstwa od świadomej zgody, zgodnie z potrzebami porównania z populacją rekrutowaną prospektywnie. |
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Ogólna wydajność diagnostyczna
Ramy czasowe: Od rekrutacji do 90 dni po wypisie dla każdego pacjenta
|
Głównym celem badania jest ocena przydatności testu Delve Detect CSF w porównaniu do ogólnej wydajności diagnostycznej w stosunku do standardowego badania diagnostycznego SOC.
|
Od rekrutacji do 90 dni po wypisie dla każdego pacjenta
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Śledczy
- Główny śledczy: Steve Miller, M.D., Ph.D., Delve Bio, Inc.
Publikacje i pomocne linki
Publikacje ogólne
- Wilson MR, Sample HA, Zorn KC, Arevalo S, Yu G, Neuhaus J, Federman S, Stryke D, Briggs B, Langelier C, Berger A, Douglas V, Josephson SA, Chow FC, Fulton BD, DeRisi JL, Gelfand JM, Naccache SN, Bender J, Dien Bard J, Murkey J, Carlson M, Vespa PM, Vijayan T, Allyn PR, Campeau S, Humphries RM, Klausner JD, Ganzon CD, Memar F, Ocampo NA, Zimmermann LL, Cohen SH, Polage CR, DeBiasi RL, Haller B, Dallas R, Maron G, Hayden R, Messacar K, Dominguez SR, Miller S, Chiu CY. Clinical Metagenomic Sequencing for Diagnosis of Meningitis and Encephalitis. N Engl J Med. 2019 Jun 13;380(24):2327-2340. doi: 10.1056/NEJMoa1803396.
- Benoit P, Brazer N, de Lorenzi-Tognon M, Kelly E, Servellita V, Oseguera M, Nguyen J, Tang J, Omura C, Streithorst J, Hillberg M, Ingebrigtsen D, Zorn K, Wilson MR, Blicharz T, Wong AP, O'Donovan B, Murray B, Miller S, Chiu CY. Seven-year performance of a clinical metagenomic next-generation sequencing test for diagnosis of central nervous system infections. Nat Med. 2024 Dec;30(12):3522-3533. doi: 10.1038/s41591-024-03275-1. Epub 2024 Nov 12.
- Miller S, Naccache SN, Samayoa E, Messacar K, Arevalo S, Federman S, Stryke D, Pham E, Fung B, Bolosky WJ, Ingebrigtsen D, Lorizio W, Paff SM, Leake JA, Pesano R, DeBiasi R, Dominguez S, Chiu CY. Laboratory validation of a clinical metagenomic sequencing assay for pathogen detection in cerebrospinal fluid. Genome Res. 2019 May;29(5):831-842. doi: 10.1101/gr.238170.118. Epub 2019 Apr 16.
- Wilson MR,Naccache SN,Samayoa E,Biagtan M,Bashir H,Yu G,Salamat SM,Somasekar S,Federman S,Miller S,Sokolic R,Garabedian E,Candotti F,Buckley RH,Reed KD,Meyer TL,Seroogy CM,Galloway R,Henderson SL,Gern JE,DeRisi JL,Chiu CY
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Szacowany)
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
Ukończenie studiów (Szacowany)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- CLN-GEN-PLN-004
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Opis planu IPD
Analiza wyników testu Delve Detect CSF mNGS oraz wszelkich innych standardowych metod diagnostycznych, wraz z informacjami klinicznymi, nie zostanie wykorzystana do identyfikacji żadnego uczestnika. Po uzyskaniu świadomej zgody, uczestnicy zostaną zanonimizowani poprzez przypisanie unikalnego numeru zgodnie ze standardową procedurą, która zostanie przekazana każdemu ośrodkowi badawczemu. Identyfikator uczestnika będzie używany w połączeniu z unikalnym numerem ID Delve Detect CSF, umieszczonym na każdej probówce do transferu płynu mózgowo-rdzeniowego wykorzystywanej do testów mNGS dla każdego uczestnika.
Wyniki tego badania mogą zostać wykorzystane do wsparcia publikacji w formie białych ksiąg naukowych, manuskryptów, plakatów i/lub prezentacji.
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .
Badania kliniczne na Test mNGS płynu mózgowo-rdzeniowego Delve Detect
-
Adaptive BiotechnologiesZakończony
-
Covenant Health, USRekrutacyjnyChoroba Alzheimera | Demencja Alzheimera | Encefalopatia | Delirium Stan splątania | Zaburzenia poznawczeStany Zjednoczone
-
Naval Medical Research CenterNieznany
-
Adaptive BiotechnologiesCovanceZakończonyZakażenie SARS-CoV-2 | Choroba koronawirusowa (COVID-19)Stany Zjednoczone
-
Million Marker Wellness, Inc.ZakończonyNarażenie środowiskowe | Ankieta | Wiedza o zdrowiu | Substancje chemiczne zaburzające gospodarkę hormonalną | Ekspozycja na ftalany | Bisfenol AStany Zjednoczone
-
University of Alabama at BirminghamCenters for Disease Control and Prevention; Centre for Infectious Disease Research...ZakończonyZakażenia wirusem HIV | HIVZambia
-
Dragonfly Research, LLCZakończonyProcesy patologiczne | Choroby Układu Nerwowego | Choroby układu odpornościowego | Stwardnienie rozsiane | Demielinizacyjne choroby autoimmunologiczne, OUN | Choroby Autoimmunologiczne Układu Nerwowego | Choroby demielinizacyjne | Choroby AutoimmunologiczneStany Zjednoczone
-
IRCCS Sacro Cuore Don Calabria di NegrarWorld Health Organization; Universidad Central del Ecuador; CECOMET (Centro de...ZakończonyWęgorczyca | Zakażenie Strongyloides StercoralisEkwador
-
University of Kansas Medical CenterEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development...ZakończonyZakażenia wirusem HIVStany Zjednoczone, Kenia
-
Bio-ker S.r.l.Cross Research S.A.; Nerviano Medical Sciences; AAI Deutschland GmbH & Co. KG; Gife...Zakończony