Investigação do Teste de Sequenciação Metagenómica de Nova Geração (mNGS) Delve Detect de Líquido Cefalorraquidiano (LCR) Quando Utilizado para o Estudo Diagnóstico Inicial de Doentes com Suspeita de Infeção do Sistema Nervoso Central (SNC) (IMPACT)
Investigação do teste de sequenciação metagenómica de próxima geração (mNGS) Delve Detect do líquido cefalorraquidiano (LCR) quando utilizado para o estudo diagnóstico inicial de doentes com suspeita de infeção do sistema nervoso central (SNC)
A Delve Bio, Inc. é uma desenvolvedora de novos testes mNGS com o objetivo de auxiliar no diagnóstico de doenças infecciosas em várias indicações clínicas que podem não ter métodos de diagnóstico tradicionais alternativos disponíveis de rotina. Uma prova de conceito para a utilidade clínica desta metodologia de teste mNGS foi descrita em várias publicações seminais.1,2,3,4 A Delve Bio está atualmente a oferecer um destes ensaios como um teste desenvolvido em laboratório (LDT) realizado num laboratório certificado CLIA e acreditado CAP. O teste chama-se Delve Detect CSF. O Delve Detect CSF é um teste de diagnóstico in vitro mNGS destinado à deteção e diferenciação simultânea de ácidos nucleicos de múltiplas bactérias, vírus, fungos e parasitas no líquido cefalorraquidiano (LCR) de indivíduos suspeitos de meningite ou encefalite. O Delve Detect CSF identifica ácido nucleico microbiano de forma imparcial e independente do agente patogénico.
Historicamente, devido ao seu custo e tempos de resposta, que podem ser da ordem de 14 dias, o teste mNGS de LCR é tipicamente utilizado como um "teste de último recurso" para doentes com suspeita de meningite infecciosa e encefalite, e é frequentemente usado quando os métodos de diagnóstico tradicionais não conseguem identificar a causa da infeção. No Estudo IMPACT, procuramos investigar a utilidade diagnóstica e clínica do teste mNGS se for utilizado mais cedo no estudo diagnóstico de doentes com suspeita de infeção do SNC e etiologia desconhecida, em conjunto com um tempo de resposta mais rápido para os resultados do teste, da ordem de dois dias úteis após a receção da amostra pelo laboratório. Os participantes que cumprirem os critérios de inclusão/exclusão e realizarem consentimento informado (e assentimento, se aplicável) serão inscritos no estudo, atribuídos à categoria de subpopulação apropriada e submetidos ao teste de LCR com Delve Detect CSF, além de outros testes de SOC. Além dos resultados do teste Delve Detect CSF, as informações clínicas associadas e os dados de economia da saúde dos participantes serão obtidos através da extração de registos. As informações clínicas serão desidentificadas sempre que possível, e qualquer PHI recolhido não será individualmente relatado como parte da análise pretendida. O investigador do local ou seu representante em cada local completará um inquérito para fornecer uma visão consensual da equipa de tratamento sobre como a disponibilidade dos resultados do teste Delve Detect CSF no estudo diagnóstico precoce afetou a tomada de decisões clínicas.
As análises dos resultados do teste do Delve Detect CSF e de outros métodos de diagnóstico SOC, além das informações clínicas, não serão utilizadas para identificar qualquer participante. As informações geradas através do estudo serão registadas de tal forma que a identidade dos participantes humanos não possa ser facilmente determinada diretamente ou através de identificadores ligados aos participantes, e os participantes não serão contactados. Os resultados deste estudo poderão ser utilizados para suportar publicações em white papers científicos, manuscritos, posters e/ou apresentações.
Visão geral do estudo
Status
Condições
Intervenção / Tratamento
Tipo de estudo
Inscrição (Estimado)
Estágio
- Não aplicável
Contactos e Locais
Contato de estudo
- Nome: Steve Miller, M.D., Ph.D.
- Número de telefone: 844-221-7423
- E-mail: steve.miller@delve.bio
Estude backup de contato
- Nome: Timothy Blicharz, Ph.D.
- E-mail: tim.blicharz@delve.bio
Locais de estudo
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Georgia
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Atlanta, Georgia, Estados Unidos, 30322
- Emory University Hospital
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Contato:
- Anna Piantadosi, MD, PhD
- Número de telefone: 404-712-9005
- E-mail: anne.piantadosi@emory.edu
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Investigador principal:
- Anne Piantadosi, MD, PhD
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Subinvestigador:
- Rami Waked, MD
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Subinvestigador:
- Colleen Kraft, MD
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Tennessee
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Nashville, Tennessee, Estados Unidos, 37232
- Vanderbilt University Medical Center
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Contato:
- Buddy Creech, MD, MPH
- Número de telefone: 615-343-0332
- E-mail: buddy.creech@vumc.edu
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Investigador principal:
- Buddy Creech, MD, MPH
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Subinvestigador:
- Stephanie Rolsma, MD, PhD
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Subinvestigador:
- Susan G Johnson, MSN
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Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
- Filho
- Adulto
- Adulto mais velho
Aceita Voluntários Saudáveis
Descrição
Critérios de Inclusão:
Deve estar disposto e ser capaz de fornecer consentimento informado ou ter um representante legalmente autorizado (RLA) disposto e capaz de fornecer consentimento informado para participação no estudo:
a. Adultos, com 18 anos de idade ou mais, devem fornecer consentimento informado, ou se incapazes de fornecer consentimento, devem ter consentimento informado voluntário fornecido por um RLA b. Crianças < 18 anos de idade devem ter consentimento informado fornecido por um progenitor, tutor ou RLA, e: i. Se tiverem 7 anos de idade ou mais, devem fornecer assentimento voluntário para participação, a menos que sejam incapazes de o fazer Se tiverem menos de 7 anos de idade, o assentimento também deve ser obtido, se viável.
Indivíduos que se apresentem, ou sejam admitidos ou transferidos, com suspeita de infeção do SNC com pelo menos 2 dos seguintes sinais e sintomas clínicos:
- Cefaleia
- Fotofobia
- Rigidez de nuca
- Náuseas/vómitos
- Febre documentada ≥ 38°C (100,4°F)
- Estado mental alterado (definido como nível de consciência diminuído ou alterado, letargia ou alteração de personalidade) com duração ≥ 24 h sem causa alternativa identificada
- Crises generalizadas ou parciais não totalmente atribuíveis a um distúrbio convulsivo pré-existente, desvio tóxico-metabólico identificado ou síndrome de abstinência alcoólica
- Anormalidade do parênquima cerebral na neuroimagem sugestiva de infeção do SNC que seja nova em relação a estudos anteriores ou pareça de início agudo
- Imagem anormal da medula espinhal sugestiva de mielite
Nota: A lista de sinais e sintomas clínicos acima aplica-se a participantes não lactentes (≥ 1 ano de idade). Lactentes (< 1 ano de idade) com suspeita de infeção do SNC podem ser inscritos se apresentarem febre ≥ 38°C (100,4°F) OU hipotermia < 36,5°C (97,7°F) E pelo menos 1 dos seguintes sinais e sintomas clínicos:
- Fontanela abaulada (moleirinha)
- Letargia ou irritabilidade
- Recusa em alimentar-se ou alimentação deficiente
- Apneia
- Hipotonia ou Hipertonia
Características de exclusão dos participantes:
- Incapacidade de obter consentimento (ou assentimento, conforme aplicável) do participante potencial ou representante legalmente autorizado (RLA)
- Diagnóstico estabelecido de etiologia não infeciosa responsável pelos sintomas de meningite/encefalite/mielite, com confirmação antes da realização da punção lombar (PL)
- Diagnóstico estabelecido de etiologia infeciosa responsável pelos sintomas com confirmação microbiológica antes da realização da PL
Diagnóstico estabelecido de etiologia infeciosa responsável pelos sintomas antes da amostra de LCR ser enviada para teste com Delve Detect CSF
Nota: participantes já consentidos e inscritos no estudo que obtenham um resultado positivo no teste SOC antes da amostra de LCR ser enviada para teste com Delve Detect CSF serão retirados do estudo e excluídos da análise.
Baixa suspeita clínica de infeção com um dos seguintes diagnósticos conhecidos relacionados com a admissão do paciente antes da realização da PL. História remota destes diagnósticos não exclui o paciente da elegibilidade:
- Trauma
- Acidente vascular cerebral isquémico ou hemorrágico, a menos que se suspeite ser devido a etiologia infeciosa
- Encefalopatia pós-ictal ou metabólica
- Malignidade sem sintomas de infeção presentes
- Doença desmielinizante
Características de exclusão da amostra de LCR:
Ausência de evidência de pleiocitose no LCR (definida como contagem de glóbulos brancos (GB) no LCR ≥ 5 células por μL) na primeira PL recolhida.
Nota: O critério de exclusão 4 aplica-se a participantes que são imunocompetentes ou que não tenham conhecimento de ter um estado atual de imunodeficiência ou imunocomprometido. Indivíduos com um estado atual de imunodeficiência ou imunocomprometido (conforme definido na Secção 9.3) podem ser inscritos com ou sem presença de pleiocitose no LCR e continuar para análise final.
- Volume residual de LCR insuficiente disponível para teste Delve Detect (< 500 μL)
- A amostra residual de LCR disponível para teste com Delve Detect CSF não foi a primeira PL diagnóstica para a admissão atual do participante
- LCR residual foi armazenado à temperatura ambiente por ≥ 6 horas
- LCR residual foi armazenado refrigerado (2-8°C) por ≥ 7 dias
- LCR residual foi armazenado congelado (≤ -70°C) por ≥ 90 dias
- LCR residual sofreu mais de dois ciclos cumulativos de congelação-descongelação
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
- Finalidade Principal: Diagnóstico
- Alocação: Não randomizado
- Modelo Intervencional: Atribuição de grupo único
- Mascaramento: Nenhum (rótulo aberto)
Armas e Intervenções
Grupo de Participantes / Braço |
Intervenção / Tratamento |
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Experimental: Pacientes Recolhidos Prospectivamente testados com Delve Detect mNGS
Os participantes serão identificados como candidatos para a população de recrutamento prospetivo por clínicos que estão a tratar os doentes e/ou investigadores de laboratório que realizam testes clínicos em amostras iniciais obtidas dos doentes através de admissão hospitalar ou na UCI.
Os doentes podem ser identificados e recrutados para o estudo antes ou após a realização da recolha de LCR.
Após os procedimentos de consentimento informado e de assentimento, conforme aplicável, os participantes serão recrutados para o estudo.
Após o recrutamento e o consentimento/assentimento informado, 500 - 1000 µL de amostra de LCR recolhida como parte da primeira punção lombar para a avaliação diagnóstica de SOC serão enviados para testes mNGS com o teste Delve Detect CSF.
Os resultados do teste Delve Detect CSF serão fornecidos aos médicos tratantes para tomada de decisão clínica.
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Esta coorte consiste em doentes admitidos com suspeita de infeção do SNC, que irão receber o teste Delve Detect CSF mNGS a partir de uma amostra de LCR colhida prospectivamente.
Os resultados do Teste Delve Detect CSF mNGS serão devolvidos à equipa de tratamento do doente para tomada de decisões clínicas.
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Comparador Ativo: Cohorte de Controle de Dados do Mundo Real
Os RWD serão utilizados para construir um conjunto de dados de controlo para doentes que foram diagnosticados e tratados sem o uso de CSF mNGS.
Será feita uma tentativa de corresponder o período/duração do tempo calendário, e as proporções de sexo, idade, doença, etiologia (infecciosa/não infecciosa) e categorias de subpopulação da população de inscrição prospetiva.
O objetivo da população de controlo é permitir comparações secundárias e exploratórias de resultados através da recolha de dados para doentes que foram diagnosticados e tratados sem o uso de teste CSF mNGS.
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Para a análise dos resultados secundários e exploratórios, uma população de controlo de doentes que foram diagnosticados e tratados sem o uso de testes CSF mNGS será construída usando dados do mundo real (RWD). A população de controlo terá proporções aproximadamente iguais de demografia, gravidade da doença e categorias de subpopulação em relação à população de inscrição prospetiva. Os RWD serão usados para examinar o efeito potencial que o teste com Delve Detect CSF teve nos resultados selecionados com os participantes inscritos prospetivamente, recolhendo dados para doentes que foram diagnosticados e tratados sem o uso de testes CSF mNGS. Estes participantes serão inscritos na população de controlo não-mNGS e terão dados RWD anonimizados recolhidos através de uma isenção de consentimento informado, conforme apropriado para comparação com a população de inscrição prospetiva. |
O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Rendimento Diagnóstico Global
Prazo: Desde a Inscrição até 90 Dias Após a Alta para Cada Paciente
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O objetivo primário do estudo é investigar a utilidade do Delve Detect CSF em relação ao rendimento diagnóstico global comparativamente ao teste diagnóstico SOC.
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Desde a Inscrição até 90 Dias Após a Alta para Cada Paciente
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Investigadores
- Investigador principal: Steve Miller, M.D., Ph.D., Delve Bio, Inc.
Publicações e links úteis
Publicações Gerais
- Wilson MR, Sample HA, Zorn KC, Arevalo S, Yu G, Neuhaus J, Federman S, Stryke D, Briggs B, Langelier C, Berger A, Douglas V, Josephson SA, Chow FC, Fulton BD, DeRisi JL, Gelfand JM, Naccache SN, Bender J, Dien Bard J, Murkey J, Carlson M, Vespa PM, Vijayan T, Allyn PR, Campeau S, Humphries RM, Klausner JD, Ganzon CD, Memar F, Ocampo NA, Zimmermann LL, Cohen SH, Polage CR, DeBiasi RL, Haller B, Dallas R, Maron G, Hayden R, Messacar K, Dominguez SR, Miller S, Chiu CY. Clinical Metagenomic Sequencing for Diagnosis of Meningitis and Encephalitis. N Engl J Med. 2019 Jun 13;380(24):2327-2340. doi: 10.1056/NEJMoa1803396.
- Benoit P, Brazer N, de Lorenzi-Tognon M, Kelly E, Servellita V, Oseguera M, Nguyen J, Tang J, Omura C, Streithorst J, Hillberg M, Ingebrigtsen D, Zorn K, Wilson MR, Blicharz T, Wong AP, O'Donovan B, Murray B, Miller S, Chiu CY. Seven-year performance of a clinical metagenomic next-generation sequencing test for diagnosis of central nervous system infections. Nat Med. 2024 Dec;30(12):3522-3533. doi: 10.1038/s41591-024-03275-1. Epub 2024 Nov 12.
- Miller S, Naccache SN, Samayoa E, Messacar K, Arevalo S, Federman S, Stryke D, Pham E, Fung B, Bolosky WJ, Ingebrigtsen D, Lorizio W, Paff SM, Leake JA, Pesano R, DeBiasi R, Dominguez S, Chiu CY. Laboratory validation of a clinical metagenomic sequencing assay for pathogen detection in cerebrospinal fluid. Genome Res. 2019 May;29(5):831-842. doi: 10.1101/gr.238170.118. Epub 2019 Apr 16.
- Wilson MR,Naccache SN,Samayoa E,Biagtan M,Bashir H,Yu G,Salamat SM,Somasekar S,Federman S,Miller S,Sokolic R,Garabedian E,Candotti F,Buckley RH,Reed KD,Meyer TL,Seroogy CM,Galloway R,Henderson SL,Gern JE,DeRisi JL,Chiu CY
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Estimado)
Conclusão Primária (Estimado)
Conclusão do estudo (Estimado)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- CLN-GEN-PLN-004
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
Descrição do plano IPD
As análises dos resultados dos testes do Delve Detect CSF mNGS Test e de quaisquer outros métodos de diagnóstico SOC, além da informação clínica, não serão utilizadas para identificar qualquer participante. Após consentimento informado, os participantes serão desidentificados através da atribuição de um número único de acordo com um procedimento padrão que será fornecido a cada local de investigação. O ID do participante será utilizado em conjunto com o número único do Delve Detect CSF ID incluído em cada tubo de transferência de amostra de LCR utilizado para o teste mNGS de cada participante.
Os resultados deste estudo poderão ser utilizados para apoiar publicações em white papers científicos, manuscritos, posters e/ou apresentações.
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
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