- ICH GCP
- USA klinikai vizsgálatok nyilvántartása
- Klinikai vizsgálat NCT07435649
A Delve Detect Cerebrospinalis Folyadék (CSF) Metagenomikus Második Generációs Szekvenálás (mNGS) Teszt Vizsgálata Központi Idegrendszeri (CNS) Fertőzés Gyanújával Rendelkező Betegek Kezdeti Diagnosztikai Munkafolyamatában Való Alkalmazása Során (IMPACT)
A Delve Detect Cerebrospinalis Folyadék (CSF) Metagenomikus Második Generációs Szekvenálási (mNGS) Teszt Vizsgálata, amikor a Központi Idegrendszeri (CNS) Fertőzés Gyanújával Kórházba Kerülő Betegek Kezdeti Diagnosztikai Munkafolyamatában Használják
A Delve Bio, Inc. egy új mNGS-tesztek fejlesztője, amelyek célja, hogy segítsenek a fertőző betegségek diagnosztizálásában számos klinikai indikációban, ahol alternatív hagyományos diagnosztikai módszerek nem állnak rendelkezésre rutinszerűen. Az mNGS tesztelési módszertan klinikai hasznosságának koncepcióját igazoló tanulmányok számos jelentős publikációban kerültek leírásra.1,2,3,4 A Delve Bio jelenleg az egyik ilyen tesztet kínálja laboratóriumi fejlesztésű teszt (LDT) formájában, amelyet egy CLIA-tanúsítvánnyal és CAP-akkreditációval rendelkező laboratóriumban végeznek. A teszt neve Delve Detect CSF. A Delve Detect CSF egy mNGS in vitro diagnosztikai teszt, amelyet a meningitis vagy encephalitis gyanújával érintett személyek CSF-jében található több baktérium, vírus, gomba és parazita nukleinsavainak egyidejű észlelésére és megkülönböztetésére szánnak. A Delve Detect CSF a mikrobiológiai nukleinsavakat elfogulatlan és patogén-agnosztikus módon azonosítja.
Korábban a költségei és a 14 napos nagyságrendű eredmény-átfutási ideje miatt a CSF mNGS tesztelést általában „utolsó lehetőségként” alkalmazzák a fertőző meningitis és encephalitis gyanújával érintett betegeknél, és gyakran akkor használják, amikor a hagyományos diagnosztikai módszerek nem tudják azonosítani a fertőzés okát. Az IMPACT Tanulmányban azt kívánjuk vizsgálni, hogy az mNGS tesztelésnek milyen diagnosztikai és klinikai haszna van, ha a gyanús CNS-fertőzéssel és ismeretlen etiológiával rendelkező betegek diagnosztikai munkafolyamatában korábban alkalmazzák, valamint ha a laboratórium általi mintavételtől számított két munkanapon belül gyorsabb eredmény-átfutási idővel párosul. A bevonási/kizárási kritériumoknak megfelelő és tájékoztatott beleegyezést (és szükség esetén hozzájárulást) nyújtó résztvevőket bevonják a tanulmányba, a megfelelő alpopulációs kategóriába sorolják, és a Delve Detect CSF tesztelés mellett más szokásos ellátás (SOC) teszteléseket is végeznek. A Delve Detect CSF teszt eredményei mellett a résztvevőkkel kapcsolatos klinikai információk és egészség-gazdasági adatok is beszerezhetők lesznek a kartonok áttekintésével. A klinikai információkat ahol lehetséges, anonimizálják, és a gyűjtött személyes egészségügyi információk (PHI) nem kerülnek egyedi jelentésként az elemzés részeként. A helyszíni vizsgáló vagy kijelölt képviselője minden helyszínen kitölt egy kérdőívet, hogy a kezelőcsapat konszenzusos véleményét megadja arról, hogy a Delve Detect CSF teszt eredményeinek korai diagnosztikai munkafolyamatban történő rendelkezésre állása hogyan befolyásolta a klinikai döntéshozatalt.
A Delve Detect CSF és más SOC diagnosztikai módszerek teszt eredményeinek elemzése, valamint a klinikai információk nem kerülnek felhasználásra egyetlen résztvevő azonosítására sem. A tanulmány során generált információkat úgy rögzítik, hogy az emberi résztvevők személyazonossága nem állapítható meg könnyen közvetlenül vagy a résztvevőkhöz kapcsolt azonosítók alapján, és a résztvevőkkel nem lépnek kapcsolatba. A tanulmány eredményei felhasználhatók tudományos fehér könyvek, kéziratok, poszterek és/vagy előadások publikálásának támogatására.
A tanulmány áttekintése
Állapot
Körülmények
Beavatkozás / kezelés
Tanulmány típusa
Beiratkozás (Becsült)
Fázis
- Nem alkalmazható
Kapcsolatok és helyek
Tanulmányi kapcsolat
- Név: Steve Miller, M.D., Ph.D.
- Telefonszám: 844-221-7423
- E-mail: steve.miller@delve.bio
Tanulmányozza a kapcsolattartók biztonsági mentését
- Név: Timothy Blicharz, Ph.D.
- E-mail: tim.blicharz@delve.bio
Tanulmányi helyek
-
-
California
-
San Francisco, California, Egyesült Államok, 94110
- Toborzás
- University of California at San Francisco at Zuckerberg San Francisco General
-
Kapcsolatba lépni:
- Colette Match, PhD, MPH
- Telefonszám: 628-206-3595
- E-mail: colette.match@ucsf.edu
-
Kutatásvezető:
- Colette Match, PhD, MPH
-
-
Georgia
-
Atlanta, Georgia, Egyesült Államok, 30322
- Toborzás
- Emory University Hospital
-
Kapcsolatba lépni:
- Anna Piantadosi, MD, PhD
- Telefonszám: 404-712-9005
- E-mail: anne.piantadosi@emory.edu
-
Kutatásvezető:
- Anne Piantadosi, MD, PhD
-
Alkutató:
- Rami Waked, MD
-
Alkutató:
- Colleen Kraft, MD
-
-
Maryland
-
Baltimore, Maryland, Egyesült Államok, 21201
- Még nincs toborzás
- University of Maryland, Baltimore
-
Kapcsolatba lépni:
- Jonathan Baghdadi, MD, PhD
- Telefonszám: 410-706-0066
- E-mail: jbaghdadi@som.umaryland.edu
-
Kutatásvezető:
- Jonathan Baghdadi, MD, PhD
-
-
Massachusetts
-
Burlington, Massachusetts, Egyesült Államok, 01805
- Toborzás
- Lahey Hospital & Medical Center
-
Kapcsolatba lépni:
- Joseph Burns, MD
- Telefonszám: 781-744-8630
- E-mail: joseph.d.burns@lahey.org
-
Kutatásvezető:
- Joseph Burns, MD
-
-
Tennessee
-
Nashville, Tennessee, Egyesült Államok, 37232
- Toborzás
- Vanderbilt University Medical Center
-
Kapcsolatba lépni:
- Buddy Creech, MD, MPH
- Telefonszám: 615-343-0332
- E-mail: buddy.creech@vumc.edu
-
Kutatásvezető:
- Buddy Creech, MD, MPH
-
Alkutató:
- Stephanie Rolsma, MD, PhD
-
Alkutató:
- Susan G Johnson, MSN
-
-
Részvételi kritériumok
Jogosultsági kritériumok
Tanulmányozható életkorok
- Gyermek
- Felnőtt
- Idősebb felnőtt
Egészséges önkénteseket fogad
Leírás
Bevonási kritériumok:
Hajlandónak és képesnek kell lennie tájékoztatott beleegyezés nyújtására, vagy legyen törvényes képviselője (LAR), aki hajlandó és képes tájékoztatott beleegyezést nyújtani a vizsgálatban való részvételhez:
a. A felnőtteknek, 18 éves vagy idősebbnek, tájékoztatott beleegyezést kell nyújtaniuk, vagy ha nem képesek beleegyezést nyújtani, törvényes képviselőjüknek kell önkéntes tájékoztatott beleegyezést nyújtania b. A 18 év alatti gyermekeknek szülő, gondviselő vagy törvényes képviselő (LAR) által nyújtott tájékoztatott beleegyezésre van szükségük, és: i. Ha 7 éves vagy idősebb, önkéntes beleegyezést kell nyújtania a részvételhez, kivéve ha erre nem képes Ha 7 évnél fiatalabb, ha lehetséges, szintén szerezni kell beleegyezést.
Azon egyének, akik gyanús központi idegrendszeri (CNS) fertőzéssel jelentkeznek, vagy fel vannak véve/áthelyezve, legalább 2 a következő klinikai tünetek és jelek közül:
- Fejfájás
- Fényérzékenység
- Nyaki merevség
- Hányinger/hányás
- Dokumentált láz ≥ 38°C (100.4°F)
- Megváltozott mentális állapot (amely csökkent vagy megváltozott eszméleti szintet, letargiát vagy személyiségváltozást jelent) ≥ 24 órán át tartóan, alternatív ok nélkül
- Általános vagy részleges rohamok, amelyek nem tulajdoníthatók teljes mértékben már meglévő rohamzavarnak, azonosított toxikus-metabolikus eltérésnek vagy alkoholmegvonásnak
- Agyparenchyma rendellenessége neuroképeken, amely CNS fertőzést sejtet, és vagy új a korábbi vizsgálatokhoz képest, vagy akut kezdődésűnek tűnik
- Gerincvelő-képalkotás rendellenessége, amely myelitist sejtet
Megjegyzés: A fenti klinikai tünetek és jelek listája a nem csecsemő résztvevőkre (≥ 1 éves) vonatkozik. A csecsemők (< 1 éves), akiknél CNS fertőzés gyanúja merül fel, regisztrálhatók, ha láz ≥ 38°C (100.4°F) VAGY hipotermia < 36.5°C (97.7°F) ÉS legalább 1 a következő klinikai tünetek és jelek közül mutatkozik:
- Kidomborodó fontanella (lágy folt)
- Letargia vagy ingerlékenység
- Etetés megtagadása vagy rossz táplálkozás
- Apnoe
- Hypotónia vagy hypertonia
Kizáró résztvevői jellemzők:
- Nem nyerhető ki beleegyezés (vagy beleegyezés, ha alkalmazható) a lehetséges résztvevőtől vagy törvényes képviselőtől (LAR)
- Megállapított diagnózis nem fertőző etiológiáról, amely a meningitis/encephalitis/myelitis tüneteiért felelős, megerősítéssel a lumbálpunkció (LP) elvégzése előtt
- Megállapított diagnózis fertőző etiológiáról, amely a tünetekért felelős, mikrobiológiai megerősítéssel a LP elvégzése előtt
Megállapított diagnózis fertőző etiológiáról, amely a tünetekért felelős, a CSF minta Delve Detect CSF-re történő elküldése előtt
Megjegyzés: a már beleegyezett és regisztrált résztvevők, akik pozitív teszt eredményt kapnak a szokásos ellátás (SOC) tesztelésből a CSF minta Delve Detect CSF-re történő elküldése előtt, visszavonják a vizsgálatból és kizárják az elemzésből.
Alacsony klinikai gyanú fertőzésre az alábbi ismert diagnózisok egyikével kapcsolatban a beteg felvételekor, a LP elvégzése előtt. A diagnózisok távoli előzménye nem zárja ki a beteget a jogosultságból:
- Trauma
- Iszkémiás vagy hemorrhagiás stroke, kivéve ha fertőző etiológiára gyanakodnak
- Posztiktális vagy metabolikus encephalopathia
- Malignitás jelenlegi fertőzési tünetek nélkül
- Demyelinizáló betegség
Kizáró CSF minta jellemzők:
Nincs bizonyíték CSF pleocytosisra (definíció szerint CSF fehérvérsejt-szám (WBC) ≥ 5 sejt/μL) az első gyűjtött LP-ben.
Megjegyzés: A 4. kizárási kritérium az immunokompetens vagy egyébként nem ismert jelenlegi immunhiányos vagy immunhiányos állapotú résztvevőkre vonatkozik. A jelenlegi immunhiányos vagy immunhiányos állapotú egyének (a 9.3. szakaszban meghatározott módon) regisztrálhatók CSF pleocytosis jelenlétével vagy anélkül, és folytathatják a végső elemzésig.
- Elégtelen maradék CSF térfogat áll rendelkezésre Delve Detect teszteléshez (< 500 μL)
- A Delve Detect CSF-re tesztelésre rendelkezésre álló maradék CSF minta nem volt a résztvevő jelenlegi felvételének első diagnosztikai LP-je
- A maradék CSF szobahőmérsékleten tárolva volt ≥ 6 órán át
- A maradék CSF hűtve (2-8 °C) tárolva volt ≥ 7 napon át
- A maradék CSF fagyasztva (≤ -70 °C) tárolva volt ≥ 90 napon át
- A maradék CSF több mint kumulatív két fagyasztás-olvadás cikluson ment keresztül
Tanulási terv
Hogyan készül a tanulmány?
Tervezési részletek
- Elsődleges cél: Diagnosztikai
- Kiosztás: Nem véletlenszerű
- Beavatkozó modell: Egyetlen csoportos hozzárendelés
- Maszkolás: Nincs (Open Label)
Fegyverek és beavatkozások
Résztvevő csoport / kar |
Beavatkozás / kezelés |
|---|---|
|
Kísérleti: Prospektív módon gyűjtött betegek, akiket Delve Detect mNGS-vel teszteltek
A résztvevőket a potenciális felvételi populáció jelöltjeiként a betegeket kezelő klinikusok és/vagy a betegektől a kórházi vagy intenzív osztályos felvétel során nyert kezdeti mintákon klinikai vizsgálatot végző laboratóriumi kutatók azonosítják.
A betegeket az előtt vagy után is azonosíthatják és bevonhatják a vizsgálatba, hogy a CSF-gyűjtés megtörtént.
A tájékoztatott beleegyezési és hozzájárulási eljárások után, amennyiben alkalmazható, a résztvevőket bevonják a vizsgálatba.
A bevonás és a tájékoztatott beleegyezés/hozzájárulás után, az első LP során a szokásos diagnosztikai munkafolyamat részeként gyűjtött 500-1000 µL CSF-mintát a Delve Detect CSF tesztel mNGS vizsgálatra küldik.
A Delve Detect CSF teszt eredményeit a kezelő orvosok kapják meg a klinikai döntéshozatal érdekében.
|
Ez a kohorsz azokból a betegekből áll, akiket gyanús központi idegrendszeri fertőzéssel vettek fel, és akik a Delve Detect CSF mNGS tesztet kapják egy előre gyűjtött CSF mintából.
A Delve Detect CSF mNGS teszt eredményei a beteg kezelő csapatához kerülnek vissza a klinikai döntéshozatal érdekében.
|
|
Aktív összehasonlító: Valós Világ Adatok Kontroll Kohorsz
Az RWD-t a kontroll adathalmaz létrehozásához használják azoknál a betegeknél, akiket CSF mNGS használata nélkül diagnosztizáltak és kezeltek.
Megkíséreljük megfeleltetni a naptári időszakot/időtartamot, valamint a nem, életkor, betegség, etiológia (fertőző/nem fertőző) és alpopulációs kategóriák arányait a prospektív bevonási populációnak.
A kontroll populáció szándéka a másodlagos és feltáró eredmények összehasonlításának lehetővé tétele azáltal, hogy adatokat gyűjtünk azokról a betegekről, akiket CSF mNGS tesztelés használata nélkül diagnosztizáltak és kezeltek.
|
A másodlagos és feltáró eredmények elemzéséhez a CSF mNGS tesztelés használata nélkül diagnosztizált és kezelt betegek kontroll populációját fogják felépíteni valós világbeli adatok (RWD) felhasználásával. A kontroll populáció demográfiai összetételében, betegség súlyosságában és alpopulációs kategóriáiban megközelítőleg egyenlő arányokkal fog rendelkezni, mint a prospektív felvételi populáció. A valós világbeli adatokat arra használják majd, hogy megvizsgálják a Delve Detect CSF tesztelés potenciális hatását a kiválasztott eredményekre a prospektíven felvett résztvevők esetében, azáltal, hogy adatokat gyűjtenek olyan betegekről, akiket CSF mNGS tesztelés használata nélkül diagnosztizáltak és kezeltek. Ezek a résztvevők a nem-mNGS kontroll populációba kerülnek felvételre, és de-identifikált valós világbeli adataikat a tájékoztatott beleegyezés elengedésével gyűjtik, ahogyan az a prospektív felvételi populációval való összehasonlításhoz megfelelő. |
Mit mér a tanulmány?
Elsődleges eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
Összdiagnosztikai hozam
Időkeret: A beiratkozástól a kilépést követő 90 napig minden beteg esetében
|
A vizsgálat elsődleges végpontja a Delve Detect CSF hasznosságának vizsgálata az összes diagnosztikai hozam szempontjából az SOC diagnosztikai teszteléssel összehasonlítva.
|
A beiratkozástól a kilépést követő 90 napig minden beteg esetében
|
Együttműködők és nyomozók
Szponzor
Nyomozók
- Kutatásvezető: Steve Miller, M.D., Ph.D., Delve Bio, Inc.
Publikációk és hasznos linkek
Általános kiadványok
- Wilson MR, Sample HA, Zorn KC, Arevalo S, Yu G, Neuhaus J, Federman S, Stryke D, Briggs B, Langelier C, Berger A, Douglas V, Josephson SA, Chow FC, Fulton BD, DeRisi JL, Gelfand JM, Naccache SN, Bender J, Dien Bard J, Murkey J, Carlson M, Vespa PM, Vijayan T, Allyn PR, Campeau S, Humphries RM, Klausner JD, Ganzon CD, Memar F, Ocampo NA, Zimmermann LL, Cohen SH, Polage CR, DeBiasi RL, Haller B, Dallas R, Maron G, Hayden R, Messacar K, Dominguez SR, Miller S, Chiu CY. Clinical Metagenomic Sequencing for Diagnosis of Meningitis and Encephalitis. N Engl J Med. 2019 Jun 13;380(24):2327-2340. doi: 10.1056/NEJMoa1803396.
- Wilson MR, Naccache SN, Samayoa E, Biagtan M, Bashir H, Yu G, Salamat SM, Somasekar S, Federman S, Miller S, Sokolic R, Garabedian E, Candotti F, Buckley RH, Reed KD, Meyer TL, Seroogy CM, Galloway R, Henderson SL, Gern JE, DeRisi JL, Chiu CY. Actionable diagnosis of neuroleptospirosis by next-generation sequencing. N Engl J Med. 2014 Jun 19;370(25):2408-17. doi: 10.1056/NEJMoa1401268. Epub 2014 Jun 4.
- Benoit P, Brazer N, de Lorenzi-Tognon M, Kelly E, Servellita V, Oseguera M, Nguyen J, Tang J, Omura C, Streithorst J, Hillberg M, Ingebrigtsen D, Zorn K, Wilson MR, Blicharz T, Wong AP, O'Donovan B, Murray B, Miller S, Chiu CY. Seven-year performance of a clinical metagenomic next-generation sequencing test for diagnosis of central nervous system infections. Nat Med. 2024 Dec;30(12):3522-3533. doi: 10.1038/s41591-024-03275-1. Epub 2024 Nov 12.
- Miller S, Naccache SN, Samayoa E, Messacar K, Arevalo S, Federman S, Stryke D, Pham E, Fung B, Bolosky WJ, Ingebrigtsen D, Lorizio W, Paff SM, Leake JA, Pesano R, DeBiasi R, Dominguez S, Chiu CY. Laboratory validation of a clinical metagenomic sequencing assay for pathogen detection in cerebrospinal fluid. Genome Res. 2019 May;29(5):831-842. doi: 10.1101/gr.238170.118. Epub 2019 Apr 16.
Tanulmányi rekorddátumok
Tanulmány főbb dátumok
Tanulmány kezdete (Tényleges)
Elsődleges befejezés (Becsült)
A tanulmány befejezése (Becsült)
Tanulmányi regisztráció dátumai
Először benyújtva
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Első közzététel (Tényleges)
Tanulmányi rekordok frissítései
Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Utolsó ellenőrzés
Több információ
A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések
További vonatkozó MeSH feltételek
Egyéb vizsgálati azonosító számok
- CLN-GEN-PLN-004
Terv az egyéni résztvevői adatokhoz (IPD)
Tervezi megosztani az egyéni résztvevői adatokat (IPD)?
IPD terv leírása
A Delve Detect CSF mNGS teszt eredményeinek és minden más SOC diagnosztikai módszer elemzése, valamint a klinikai információk nem lesznek felhasználva bármely résztvevő azonosítására. A tájékoztatott beleegyezés után a résztvevők anonimizálásra kerülnek egy egyedi szám hozzárendelésével egy szabványos eljárás szerint, amely minden vizsgálati helyszínre biztosítva lesz. A résztvevő azonosítója a Delve Detect CSF egyedi azonosító számával együtt lesz használva, amely minden egyes résztvevő mNGS tesztelésére használt CSF mintát tartalmazó transzfercsövön szerepel.
E tanulmány eredményei felhasználhatók tudományos fehér könyvek, kéziratok, poszterek és/vagy előadások publikálásának támogatására.
Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok
Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz
Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz
Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .