Indagine sul test Delve Detect Cerebrospinal Fluid (CSF) Metagenomic Next-generation Sequencing (mNGS) quando utilizzato per la valutazione diagnostica iniziale di pazienti con sospetta infezione del sistema nervoso centrale (CNS) (IMPACT)

Criteri di inclusione:

1. Deve essere disposto e in grado di fornire il consenso informato o avere un rappresentante legalmente autorizzato (LAR) disposto e in grado di fornire il consenso informato per la partecipazione allo studio:

   a. Gli adulti, di età pari o superiore a 18 anni, devono fornire il consenso informato o, se non in grado di fornirlo, devono avere il consenso informato volontario fornito da un LAR b. I bambini di età < 18 anni devono avere il consenso informato fornito da un genitore, tutore o LAR, e: i. Se di età pari o superiore a 7 anni, devono fornire l'assenso volontario per la partecipazione, a meno che non siano in grado di farlo Se di età inferiore a 7 anni, anche l'assenso dovrebbe essere ottenuto, se fattibile.

2. Individui che presentano, o sono stati ricoverati o trasferiti con, sospetta infezione del SNC con almeno 2 dei seguenti segni e sintomi clinici:

   1. Cefalea
   2. Fotofobia
   3. Rigidità nucale
   4. Nausea/vomito
   5. Febbre documentata ≥ 38°C (100,4°F)
   6. Stato mentale alterato (definito come diminuzione o alterazione del livello di coscienza, letargia o cambiamento della personalità) della durata di ≥ 24 h senza che sia stata identificata una causa alternativa
   7. Crisi epilettiche generalizzate o parziali non pienamente attribuibili a un disturbo epilettico preesistente, a un'alterazione tossico-metabolica identificata o all'astinenza da alcol
   8. Anormalità del parenchima cerebrale alla neuroimmagine suggestiva di infezione del SNC che sia nuova rispetto a studi precedenti o appaia acuta all'esordio
   9. Imaging anormale del midollo spinale suggestivo di mielite

Nota: L'elenco dei segni e sintomi clinici sopra riportato si applica ai partecipanti non neonati (≥ 1 anno di età). I neonati (< 1 anno di età) sospettati di infezione del SNC possono essere arruolati se presentano febbre ≥ 38°C (100,4°F) O ipotermia < 36,5°C (97,7°F) E almeno 1 dei seguenti segni e sintomi clinici:

1. Fontanella sporgente (punto morbido)
2. Letargia o irritabilità
3. Rifiuto di alimentarsi o alimentazione scarsa
4. Apnea
5. Ipotonia o Ipertonia

Caratteristiche di esclusione dei partecipanti:

1. Impossibilità di ottenere il consenso (o l'assenso, se applicabile) dal potenziale partecipante o dal rappresentante legalmente autorizzato (LAR)
2. Diagnosi accertata di eziologia non infettiva responsabile dei sintomi di meningite/encefalite/mielite, con conferma prima che venga eseguita la puntura lombare (PL)
3. Diagnosi accertata di eziologia infettiva responsabile dei sintomi con conferma microbiologica prima che venga eseguita la PL

4. Diagnosi accertata di eziologia infettiva responsabile dei sintomi prima che il campione di CSF venga inviato per il test con Delve Detect CSF

   Nota: i partecipanti già consenzienti e arruolati nello studio che ottengono un risultato positivo dal test SOC prima che il campione di CSF venga inviato per il test con Delve Detect CSF saranno ritirati dallo studio ed esclusi dall'analisi.

5. Basso sospetto clinico di infezione con una delle seguenti diagnosi note relative al ricovero del paziente prima che venga eseguita la PL. Una storia remota di queste diagnosi non esclude il paziente dall'idoneità:

   1. Trauma
   2. Ictus ischemico o emorragico a meno che non si sospetti che sia dovuto a eziologia infettiva
   3. Encefalopatia postictale o metabolica
   4. Malignità senza sintomi di infezione presenti
   5. Malattia demielinizzante

   Caratteristiche di esclusione del campione di CSF:

6. Nessuna evidenza di pleiocitosi del CSF (definita come conta dei globuli bianchi (WBC) del CSF ≥ 5 cellule per μL) nella prima PL raccolta.

   Nota: Il criterio di esclusione 4 si applica ai partecipanti che sono immunocompetenti o che non sono noti per avere un'attuale immunodeficienza o stato di immunocompromissione. Gli individui con un'attuale immunodeficienza o stato di immunocompromissione (come definito nella Sezione 9.3) possono essere arruolati con o senza la presenza di pleiocitosi del CSF e continuare fino all'analisi finale.

7. Volume residuo di CSF insufficiente disponibile per il test Delve Detect (< 500 μL)
8. Il campione residuo di CSF disponibile per il test con Delve Detect CSF non era la prima PL diagnostica per il ricovero attuale del partecipante
9. Il CSF residuo è stato conservato a temperatura ambiente per ≥ 6 ore
10. Il CSF residuo è stato conservato refrigerato (2-8 °C) per ≥ 7 giorni
11. Il CSF residuo è stato conservato congelato (≤ -70 °C) per ≥ 90 giorni
12. Il CSF residuo ha subito più di due cicli cumulativi di congelamento-scongelamento