DNA Single Nucleotide Polymorphisms als voorspellers van toxiciteit

De meeste patiënten met eierstokkanker worden behandeld met een combinatie van op platina en taxaan gebaseerde chemotherapie. Hoewel de initiële responspercentages hoog zijn (>90%), ervaren sommige patiënten ernstige bijwerkingen die kunnen leiden tot stopzetting van de therapie. Zowel GOG als de bijsluiter van paclitaxel bevatten echter behandelingsrichtlijnen die een verlaagd doseringsregime inhouden als bijwerkingen optreden [1, 2]. De klinische validatie van de genetische verschillen in deze genen als biomarkers voor ernstige bijwerkingen zou de behandelend arts in staat stellen de dosering te wijzigen, waardoor de tijd dat een patiënt het geneesmiddel kan blijven gebruiken wordt verlengd terwijl bijwerkingen en onnodige morbiditeit worden verminderd.

Een ander klinisch nut van deze genetische verschillen in de zorg voor eierstokkankerpatiënten is de identificatie van welke patiënten mogelijk geen baat hebben bij intraperitoneale (IP) chemotherapie of dosisdichte chemotherapie. Hoewel is aangetoond dat IP-chemotherapie de uitkomst van de patiënt verbetert, zijn de bijwerkingen veel frequenter en ernstiger vanwege de hoge dosis [3]. Het testen van de patiënten voorafgaand aan de behandeling op voorspellende genotypen kan een rol spelen bij de beslissing van een arts om af te zien van IP-chemotherapie ten gunste van standaard intraveneuze toediening. Dosisdichte chemotherapie heeft verbeteringen in uitkomst laten zien, maar ook enkele toename van bijwerkingen [4, 5]. In beide therapieregimes kan het vermogen om patiënten te stratificeren op basis van de risico's van toxiciteit die aan de behandeling zijn verbonden, leiden tot een groter voordeel van IP of dosisdichte therapie terwijl de bijwerkingen en de bijbehorende gezondheidszorgkosten worden geminimaliseerd.

Eerdere studies bij eierstokkanker hebben aangetoond dat expressie van de eiwitten ERCC1, GST en p53 de respons op op platina gebaseerde therapieën bij patiënten met eierstokkanker kan beïnvloeden [6-13]. Toen SNP's in de genen die coderen voor deze eiwitten werden geëvalueerd, werd een correlatie gemaakt met AE's als reactie op op platina gebaseerde therapieën [14, 15]. Mutaties die de activiteit van ERCC1 beïnvloedden, werden in verband gebracht met nefrotoxiciteit. Mutaties in GST-familieleden werden in verband gebracht met neutropenie (GSTA1), neuropathie (GSTM3 en GSTP1) of anemie en trombocytopenie (GSTM3). Mutaties in p53 werden in verband gebracht met neutropenie. In deze onderzoeken bleken mutaties in XPD en XRCC1 ook voorspellend te zijn voor neutropenie (zowel XPD als XRCC1) en anemie (alleen XPD). Meer recent identificeerde een studie uitgevoerd door de Scottish Gynecological Clinical Trials Group SNP's in BCL2, Huidige versie Datum: 01/04/15 Vorige versie Datum: Nvt, Eerste versie Pagina 6 van 23 OPRM1 SOX10 en TRPV1 die geassocieerd waren met neurotoxiciteit [16]. Zowel de individuele als de gecombineerde waarde van deze biomarkers moet worden beoordeeld.

Bij het beoordelen van onderzoeken die bij andere tumortypen zijn uitgevoerd, zijn SNP's geïdentificeerd die geassocieerd zijn met toxiciteiten die ook van toepassing kunnen zijn bij eierstokkanker. Bij borstkanker zijn SNP's in de genen CYP2C8, CYP17A1 en ABCG1 in verband gebracht met een verhoogd risico op graad 2+ perifere neuropathie bij patiënten die worden behandeld met op taxaan gebaseerde therapieën. [17, 18]. Er is ook eerder gemeld dat een andere SNP in CYP17A1 (rs619824) geassocieerd is met door bortezomib geïnduceerde neuropathie bij patiënten met multipel myeloom, wat mogelijk de rol van dit eiwit bij het ontstaan ​​van neuropathie ondersteunt [19]. Aangezien deze SNP's kiembaanverschillen zijn, is er reden om aan te nemen dat ze ook waardevolle biomarkers kunnen zijn bij eierstokkanker. Bij multipel myeloom is gesuggereerd dat identificatie en nauwlettender toezicht van patiënten die risico lopen op neuropathie gunstig zou kunnen zijn [20]. Een vergelijkbare strategie zou kunnen worden gebruikt bij patiënten met eierstokkanker om ernstige toxiciteiten te verminderen die resulteren in stopzetting van een effectief medicijn.

De detectie van deze polymorfismen door QPCR is bevestigd door directe sequentiebepaling van cellijnen en tumorweefsel. Het protocol is getest in ons onderzoekslaboratorium en is gevalideerd in ons door CLIA gereguleerde laboratorium voor zowel in formaline gefixeerde in paraffine ingebedde monsters als bloed. Kortom, DNA wordt gezuiverd over een spinkolom, gekwantificeerd en gemengd met een specifieke SNP-assay en Master Mix (Life Technologies). De resultaten werden geanalyseerd in de Life Technologies TaqMan Genotyper-softwareversie 1.3 om het genotype te bepalen. De SNP's werden gedetecteerd in bloedmonsters die waren verzameld van eierstokkankerpatiënten en FFPE-monsters van eierstokkanker met vergelijkbare frequenties als gerapporteerd in de artikelen waarnaar hierboven wordt verwezen. SNP's van andere tumortypen werden gedetecteerd in dezelfde bloedmonsters van patiënten met eierstokkanker of FFPE-monsters van eierstokkanker, evenals in bloed- en FFPE-monsters van patiënten met endometriumkanker.