A DNS egynukleotidos polimorfizmusai mint a toxicitás előrejelzői

A petefészekrákos betegek többségét platina- és taxán-alapú kemoterápia kombinációjával kezelik. Bár a kezdeti válaszarány magas (>90%), egyes betegek súlyos mellékhatásokat tapasztalnak, amelyek a terápia leállításához vezethetnek. Mindazonáltal mind a GOG, mind a paclitaxel betegtájékoztatója tartalmaz olyan kezelési irányelveket, amelyek csökkentett adagolási rendet foglalnak magukban, ha mellékhatások lépnek fel [1, 2]. E gének genetikai különbségeinek klinikai validálása a súlyos nemkívánatos események biomarkereként lehetővé tenné a kezelőorvos számára, hogy módosítsa az adagolást, így meghosszabbítja azt az időt, ameddig a beteg a gyógyszert szedheti, miközben csökkenti a mellékhatásokat és a szükségtelen morbiditást.

A petefészekrákos betegek ellátásában mutatkozó e genetikai különbségek másik klinikai haszna annak azonosításában rejlik, hogy mely betegek nem részesülhetnek előnyben az intraperitoneális (IP) kemoterápiából vagy a dózissűrű kemoterápiából. Míg az IP kemoterápia javítja a betegek kimenetelét, a mellékhatások sokkal gyakoribbak és súlyosabbak a magas dózis miatt [3]. A betegek kezelés előtti prediktív genotípusának tesztelése befolyásolhatja az orvos azon döntését, hogy lemond az IP kemoterápiáról a standard intravénás beadás javára. A nagy dózisú kemoterápia javulást mutatott az eredményekben, de a mellékhatások számának növekedését is [4, 5]. Mindkét terápiás sémában az a képesség, hogy a betegeket a kezeléssel összefüggő toxicitási kockázatok alapján rétegezzük, nagyobb haszonhoz vezethet az IP vagy a dózissűrű terápia során, miközben minimalizálja a mellékhatásokat és a kapcsolódó egészségügyi költségeket.

Korábbi petefészekrákos vizsgálatok kimutatták, hogy az ERCC1, GST és p53 fehérjék expressziója befolyásolhatja a platina alapú terápiákra adott választ petefészekrákos betegekben [6-13]. Amikor az ezeket a fehérjéket kódoló génekben lévő SNP-ket értékelték, korrelációt állapítottak meg a platinaalapú terápiákra adott válaszként az AE-kkel [14, 15]. Az ERCC1 aktivitását befolyásoló mutációk nefrotoxicitással jártak együtt. A GST családtagok mutációi neutropeniával (GSTA1), neuropátiával (GSTM3 és GSTP1) vagy vérszegénységgel és thrombocytopeniával (GSTM3) társultak. A p53 mutációi neutropeniával társultak. Ezekben a vizsgálatokban az XPD és az XRCC1 mutációi is előre jelezték a neutropéniát ( XPD és XRCC1 is) és anémiát (csak XPD). A közelmúltban a Scottish Gynecological Clinical Trials Group által végzett tanulmány olyan SNP-ket azonosított a BCL2-ben, Aktuális verzió dátuma: 04/01/15 Előző verzió dátuma: N/A, Kezdeti verzió 6/23 oldal OPRM1 SOX10 és TRPV1, amelyek neurotoxicitást okoztak. [16]. Fel kell mérni ezeknek a biomarkereknek az egyéni és együttes értékét.

A más daganattípusokon végzett vizsgálatok áttekintése során olyan SNP-ket azonosítottak, amelyek toxicitáshoz kapcsolódnak, és amelyek petefészekrákban is alkalmazhatók. Emlőrákban a CYP2C8, CYP17A1 és ABCG1 gének SNP-i a 2+ fokozatú perifériás neuropátia fokozott kockázatával járnak a taxán alapú terápiával kezelt betegeknél. [17, 18]. A CYP17A1-ben egy másik SNP-ről (rs619824) korábban is beszámoltak arról, hogy mielóma multiplexben szenvedő betegek bortezomib-indukálta neuropátiájához kapcsolódnak, ami potenciálisan alátámasztja e fehérje szerepét a neuropátia kialakulásában [19]. Mivel ezek az SNP-k csíravonalbeli különbségek, okkal feltételezhetjük, hogy értékes biomarkerek lehetnek a petefészekrákban is. A myeloma multiplexben azt javasolták, hogy a neuropátia kockázatának kitett betegek azonosítása és szorosabb monitorozása előnyös lehet [20]. Hasonló stratégia alkalmazható petefészekrákos betegeknél a súlyos toxicitások csökkentésére, amelyek egy hatékony gyógyszer abbahagyását eredményezik.

Ezeknek a polimorfizmusoknak a QPCR-rel történő kimutatását a sejtvonalak és a tumorszövet közvetlen szekvenálása igazolta. A protokollt kutatólaboratóriumunkban teszteltük, és a CLIA által szabályozott laboratóriumunkban validálták mind a formalin fixált paraffinba ágyazott mintákra, mind a vérre. Röviden, a DNS-t spin oszlopon tisztítják, mennyiségileg meghatározzák, és egy specifikus SNP-teszttel és Master Mix-szel (Life Technologies) keverik. Az eredményeket a Life Technologies TaqMan Genotyper szoftver 1.3-as verziójában elemeztük a genotípus meghatározásához. Az SNP-ket petefészekrákos betegektől vett vérmintákban és FFPE petefészekrákos mintákban mutatták ki, hasonló gyakorisággal, mint a fent hivatkozott dokumentumokban. Más daganattípusokból származó SNP-ket mutattak ki ugyanazon petefészekrákos betegek vérmintáiban vagy FFPE petefészekrákos mintákban, valamint endometriumrákos betegek vér- és FFPE-mintáiban.