Identificatie van prognostische biomarkers voor progressie van invasief plaveiselcelcarcinoom
9 oktober 2025 bijgewerkt door: Dennis Wigle, Mayo Clinic
De studie zal gebruik maken van zowel retrospectieve als prospectieve gegevensverzameling van patiënten die al een bronchoscopie en longresectie hebben ondergaan of een bronchoscopie en longresectie zullen ondergaan voor plaveiselcelcarcinoom.
De onderzoekers zijn van plan om prospectief 5 bronchoscopische biopsieën, 10 ml bloed en één tumor en aangrenzende normale monsters te verzamelen van 200 gekwalificeerde patiënten die aan de studiecriteria voldoen.
Studie Overzicht
Toestand
Beëindigd
Conditie
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
De studie zal gebruik maken van zowel retrospectieve als prospectieve gegevensverzameling van patiënten die al een bronchoscopie en longresectie hebben ondergaan of een bronchoscopie en longresectie zullen ondergaan voor plaveiselcelcarcinoom.
De onderzoekers zijn van plan om prospectief 5 bronchoscopische biopsieën, 10 ml bloed en één tumor en aangrenzende normale monsters te verzamelen van 200 gekwalificeerde patiënten die aan de studiecriteria voldoen.
Als een patiënt al een bronchoscopie heeft gehad en ermee heeft ingestemd dat er monsters worden opgeslagen voor onderzoek in de Mayo Clinic Rochester, zullen we deze gebruiken voor de onderzoeksstudie, indien beschikbaar.
Anders, als de patiënt al een operatie heeft ondergaan en er geen weefsel is opgeslagen voor onderzoek, zullen de onderzoekers de patiënten toestemming geven om hun klinische monsters te gebruiken voor de onderzoeksstudie.
De onderzoekers zullen vervolgens DNA extraheren uit weefselsecties en bloed en een op maat gemaakt sequencing-panel gebruiken van 23 kankeraandrijvende genen met significante mutaties in plaveiselcelcarcinoom die ze hebben ontwikkeld om de prognostische biomarkers te vinden.
Het DNA zal worden gebruikt in een PCR-reactie om amplicons te genereren voor bibliotheekvoorbereiding met behulp van het Illumina Nextera XT-bibliotheekvoorbereidingsprotocol en gerichte sequencing op de Illumina Hiseq-sequencer.
De uitlezingen worden uitgelijnd met de HG19 met behulp van BWA-aligners en variantdetectie wordt uitgevoerd met Agilent SureCall en GATK-analysetools.
Studietype
Observationeel
Inschrijving (Werkelijk)
22
Contacten en locaties
In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.
Studie Locaties
-
-
Minnesota
-
Rochester, Minnesota, Verenigde Staten, 55905
- Mayo Clinic in Rochester
-
-
Deelname Criteria
Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
18 jaar en ouder (Volwassen, Oudere volwassene)
Accepteert gezonde vrijwilligers
Nee
Bemonsteringsmethode
Niet-waarschijnlijkheidssteekproef
Studie Bevolking
Mayo Clinic Thoracale Chirurgie Patiënten
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- bekend of vermoed plaveiselcelcarcinoom van de long
- toestemming kunnen geven
- had al een bronchoscopie of chirurgische resectie kunnen ondergaan met weefsel dat was bewaard in de Mayo Clinic Rochester
- zal een bronchoscopie ondergaan en een chirurgische resectie ondergaan in de Mayo Clinic Rochester
Uitsluitingscriteria:
- geen toestemming kunnen geven
- zwanger
Studie plan
Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Observatiemodellen: Case-Alleen
- Tijdsperspectieven: Prospectief
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Weefsel collectie
We zijn van plan om prospectief 5 bronchoscopische biopsieën, 3 ml bloed en één tumor en aangrenzende normale monsters te verzamelen van 200 gekwalificeerde patiënten die voldoen aan de studiecriteria.
Als een patiënt al een bronchoscopie heeft gehad en monsters beschikbaar heeft die eerder zijn verzameld en opgeslagen voor onderzoek in de Mayo Clinic, zullen we die monsters gebruiken.
|
Vervolgens zullen we DNA extraheren uit weefselsecties en bloed en een op maat gemaakt, gericht sequencing-panel gebruiken van 23 kankeraandrijvende genen met significante mutaties in plaveiselcelcarcinoom dat we hebben ontwikkeld om de prognostische biomarkers te vinden.
Het DNA zal worden gebruikt in een PCR-reactie om amplicons te genereren voor bibliotheekvoorbereiding met behulp van het Illumina Nextera XT-bibliotheekvoorbereidingsprotocol en gerichte sequencing op de Illumina Hiseq-sequencer.
De uitlezingen worden uitgelijnd met de HG19 met behulp van BWA-aligners en variantdetectie wordt uitgevoerd met Agilent SureCall en GATK-analysetools.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Aantal en soorten terugkerende genomische veranderingen geëvalueerd door een op maat gemaakt sequencing-panel.
Tijdsspanne: 2 jaar
|
Het doel van deze studie is het identificeren en karakteriseren van recidiverende genomische veranderingen die worden aangetroffen in invasief plaveiselcelcarcinoom die aanwezig zijn in de epitheelweefsels van de voorloperluchtweg, maar afwezig zijn in normale weefsels die zijn onderzocht op monsters die zijn genomen tijdens een longprocedure.
|
2 jaar
|
Medewerkers en onderzoekers
Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.
Sponsor
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Dennis Wigle, MD, PhD, Mayo Clinic
Publicaties en nuttige links
De persoon die verantwoordelijk is voor het invoeren van informatie over het onderzoek stelt deze publicaties vrijwillig ter beschikking. Dit kan gaan over alles wat met het onderzoek te maken heeft.
Nuttige links
Studie record data
Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
8 april 2015
Primaire voltooiing (Werkelijk)
23 april 2020
Studie voltooiing (Werkelijk)
23 april 2020
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
10 september 2015
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
11 september 2015
Eerst geplaatst (Geschat)
15 september 2015
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Geschat)
14 oktober 2025
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
9 oktober 2025
Laatst geverifieerd
1 oktober 2025
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- 15-000548
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Nee
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Nee
product vervaardigd in en geëxporteerd uit de V.S.
Nee
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .