Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Идентификация прогностических биомаркеров прогрессирования инвазивной плоскоклеточной карциномы

9 октября 2025 г. обновлено: Dennis Wigle, Mayo Clinic
В исследовании будет использоваться как ретроспективный, так и проспективный сбор данных от пациентов, которые уже прошли бронхоскопию и резекцию легкого или которым предстоит бронхоскопия и резекция легкого по поводу плоскоклеточного рака. Исследователи планируют проспективно собрать 5 бронхоскопических биопсий, 10 мл крови и одну опухоль и соседние нормальные образцы от 200 подходящих пациентов, которые соответствуют критериям исследования.

Обзор исследования

Статус

Прекращено

Условия

Вмешательство/лечение

Подробное описание

В исследовании будет использоваться как ретроспективный, так и проспективный сбор данных от пациентов, которые уже прошли бронхоскопию и резекцию легкого или будут иметь бронхоскопию и резекцию легкого по поводу плоскоклеточного рака. Исследователи планируют проспективно собрать 5 бронхоскопических биопсий, 10 мл крови и одну опухоль и соседние нормальные образцы от 200 подходящих пациентов, которые соответствуют критериям исследования. Если пациент уже прошел бронхоскопию и дал согласие на хранение образцов для исследования в клинике Майо в Рочестере, мы предоставим им доступ для исследования, если таковые имеются. В противном случае, если пациент уже перенес операцию и ткань не была сохранена для исследования, исследователи дадут согласие пациентам на использование их клинических образцов для исследования. Затем исследователи будут извлекать ДНК из срезов тканей и крови и использовать специальную панель для секвенирования 23 генов-факторов рака со значительными мутациями в плоскоклеточной карциноме, которую они разработали для поиска прогностических биомаркеров. ДНК будет использоваться в реакции ПЦР для создания ампликонов для подготовки библиотеки с использованием протокола подготовки библиотеки Illumina Nextera XT и целевого секвенирования на секвенаторе Illumina Hiseq. Чтения будут сопоставлены с HG19 с помощью выравнивателя BWA и обнаружения вариантов, выполненного с помощью аналитических инструментов Agilent SureCall и GATK.

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Действительный)

22

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Места учебы

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

18 лет и старше (Взрослый, Пожилой взрослый)

Принимает здоровых добровольцев

Нет

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

Пациенты торакальной хирургии клиники Майо

Описание

Критерии включения:

  • известная или подозреваемая плоскоклеточная карцинома легкого
  • возможность дать согласие
  • мог уже пройти бронхоскопию или хирургическую резекцию с сохраненной тканью в клинике Майо в Рочестере
  • будет проходить бронхоскопию и хирургическую резекцию в клинике Майо в Рочестере

Критерий исключения:

  • не могу дать согласие
  • беременная

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

  • Наблюдательные модели: Только для случая
  • Временные перспективы: Перспективный

Когорты и вмешательства

Группа / когорта
Вмешательство/лечение
Коллекция тканей
Мы планируем проспективно собрать 5 бронхоскопических биопсий, 3 мл крови и одну опухоль и соседние нормальные образцы от 200 подходящих пациентов, которые соответствуют критериям исследования. Если пациент уже прошел бронхоскопию и у него есть образцы, которые ранее были собраны и сохранены для исследований в клинике Майо, мы будем использовать эти образцы.
Генетический: Экстракция ДНК
Затем мы извлечем ДНК из срезов тканей и крови и используем специальную панель для секвенирования 23 генов-драйверов рака со значительными мутациями при плоскоклеточной карциноме, которую мы разработали для поиска прогностических биомаркеров. ДНК будет использоваться в реакции ПЦР для создания ампликонов для подготовки библиотеки с использованием протокола подготовки библиотеки Illumina Nextera XT и целевого секвенирования на секвенаторе Illumina Hiseq. Чтения будут сопоставлены с HG19 с помощью выравнивателя BWA и обнаружения вариантов, выполненного с помощью аналитических инструментов Agilent SureCall и GATK.

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Количество и типы повторяющихся геномных изменений, оцениваемых настраиваемой панелью целевого секвенирования.
Временное ограничение: 2 года
Целью данного исследования является выявление и характеристика рецидивирующих геномных изменений, обнаруженных при инвазивной плоскоклеточной карциноме, которые присутствуют в эпителиальных тканях-предшественниках дыхательных путей, но отсутствуют в нормальных тканях, исследованных в образцах, взятых во время процедуры на легких.
2 года

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

Mayo Clinic

Следователи

  • Главный следователь: Dennis Wigle, MD, PhD, Mayo Clinic

Публикации и полезные ссылки

Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.

Полезные ссылки

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Действительный)

8 апреля 2015 г.

Первичное завершение (Действительный)

23 апреля 2020 г.

Завершение исследования (Действительный)

23 апреля 2020 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

10 сентября 2015 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

11 сентября 2015 г.

Первый опубликованный (Оцененный)

15 сентября 2015 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Оцененный)

14 октября 2025 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

9 октября 2025 г.

Последняя проверка

1 октября 2025 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Дополнительные соответствующие термины MeSH

Другие идентификационные номера исследования

  • 15-000548

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

продукт, произведенный в США и экспортированный из США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Подписаться