Infecties van de geslachtsorganen, het vaginale microbioom en de zwangerschapsduur bij de geboorte bij zwangere vrouwen in Zuid-Afrika

Achtergrond: Complicaties bij vroeggeboorte zijn de meest voorkomende doodsoorzaak bij kinderen jonger dan 5 jaar. In Zuid-Afrika is de prevalentie van zowel infecties van de geslachtsorganen als ongunstige zwangerschapsresultaten hoog. Deze studie hanteert een holistische benadering, waarbij zowel de aanwezigheid als de hoeveelheid van meerdere micro-organismen in de lagere geslachtsorganen, waaronder de vaginale microbiota, tijdens de zwangerschap worden onderzocht, en hun associaties met de zwangerschapsduur bij de geboorte. Specifieke doelstellingen zijn het onderzoeken van: (1) het verband tussen de aanwezigheid van specifieke micro-organismen in het lagere geslachtsorgaan en de zwangerschapsduur bij de geboorte (primaire uitkomst), evenals secundaire ongunstige zwangerschapsresultaten; (2) het verband tussen de gekwantificeerde belasting van vaginale en seksueel overdraagbare micro-organismen en de zwangerschapsduur bij de geboorte (primaire uitkomst), evenals secundaire ongunstige zwangerschapsresultaten; en (3) de combinaties van micro-organismen die het sterkst geassocieerd zijn met een eerdere zwangerschapsduur bij de geboorte.

Methode: Deze prospectieve gesloten cohortstudie volgt vrouwen die deelnamen tijdens de zwangerschap tot na de bevalling. Deze cohortstudie maakt deel uit van een groter project, genaamd Philani Ndiphile (wat 'wees gezond en ik zal gezond zijn' betekent in isiXhosa).

Een getrainde veldwerker controleert of u in aanmerking komt en verkrijgt schriftelijke geïnformeerde toestemming. Een onderzoeksverpleegkundige voert een echografie van de buik uit om de zwangerschapsduur te schatten en de geschiktheid te bevestigen.

Tijdens het inschrijvingsbezoek en een vervolgbezoek na 30-34 weken verzamelt een onderzoeksverpleegkundige vaginale monsters voor: testen ter plaatse op Chlamydia trachomatis en Neisseria gonorrhoeae (met antibioticabehandeling indien positief); en offsite testen voor: Nugent-scores; detectie en kwantificering van Mycoplasma genitalium, M. hominis, Ureaplasma. parvum, U. Urealyticum, Trichomonas vaginalis, Candida spp. en 16S rRNA-ampliconsequencing voor vaginale microbiota-analyses.

Tijdens een postnataal bezoek, 3-6 dagen na de bevalling, verzamelt een onderzoeksverpleegkundige informatie over de uitkomst van de bevalling.

Statistische analyses omvatten:

Doelstelling 1. a) univariabele en multivariabele regressieanalyses voor associaties tussen specifieke micro-organismen en de zwangerschapsduur bij de geboorte. b) compositorische multivariabele analysemethoden om de relatieve hoeveelheden van individuele taxonen te analyseren en modellen met gemengde effecten om de associaties tussen zwangerschapsuitkomsten en de diversiteit van de vaginale microbiota, typen vaginale microbiota en absolute hoeveelheden van vooraf gedefinieerde bacteriegroepen te beoordelen.

Doelstelling 2. Ontwikkeling van een 'vaginale ontstekingsindex', gebaseerd op kwantificering van de vaginale microbiota en hun ontstekingspotentieel. Deze vaginale ontstekingsindex zal worden geanalyseerd als een vast effect in modellen met gemengde effecten met zwangerschapsuitkomsten.

Doelstelling 3. Classificatie- en regressieboomanalyses om de combinatie van micro-organismen te onderzoeken die de vroegere zwangerschapsduur bij de geboorte het beste voorspelt.