Zakażenia dróg rodnych, mikrobiom pochwy i wiek ciążowy w chwili urodzenia wśród kobiet w ciąży w Republice Południowej Afryki

Wstęp: Powikłania porodu przedwczesnego są najczęstszą przyczyną zgonów dzieci poniżej 5. roku życia. W Republice Południowej Afryki częstość występowania zarówno infekcji dróg rodnych, jak i powikłań ciąży jest wysoka. W tym badaniu przyjęto podejście holistyczne, badając zarówno obecność, jak i liczbę wielu mikroorganizmów dolnych dróg rodnych, w tym mikroflorę pochwy, podczas ciąży i ich związek z wiekiem ciążowym w chwili urodzenia. Cele szczegółowe obejmują zbadanie: (1) związku między obecnością określonych mikroorganizmów dolnych dróg rodnych a wiekiem ciążowym w chwili urodzenia (pierwotny wynik), a także wtórnymi niekorzystnymi skutkami ciąży; (2) związek między ilościowym obciążeniem mikroorganizmami przenoszonymi przez pochwę i drogą płciową a wiekiem ciążowym w chwili urodzenia (pierwotny wynik), a także wtórnymi niekorzystnymi skutkami ciąży; oraz (3) kombinacje mikroorganizmów, które są najsilniej powiązane z wcześniejszym wiekiem ciążowym w chwili urodzenia.

Metody: To prospektywne, zamknięte badanie kohortowe obejmuje kobiety uczestniczące w ciąży aż do porodu. To badanie kohortowe jest częścią większego projektu o nazwie Philani Ndiphile (co w języku isiXhosa oznacza „bądź zdrowy, a ja będę zdrowy”).

Przeszkolony pracownik terenowy sprawdza, czy kwalifikuje się do udziału w badaniu i uzyskuje pisemną świadomą zgodę. Pielęgniarka prowadząca badanie wykonuje USG jamy brzusznej w celu oszacowania wieku ciążowego i potwierdzenia kwalifikowalności.

Podczas wizyty rekrutacyjnej i wizyty kontrolnej po 30–34 tygodniach pielęgniarka badawcza pobiera wycinki z pochwy w celu: wykonania na miejscu badania na obecność Chlamydia trachomatis i Neisseria gonorrhoeae (z leczeniem antybiotykami, jeśli wynik pozytywny); oraz testy poza siedzibą firmy w zakresie: punktacji Nugent; wykrywanie i oznaczanie ilościowe Mycoplasma genitalium, M. hominis, Ureaplasma. parvum, U. Urealyticum, Trichomonas pochwy, Candida spp. oraz sekwencjonowanie amplikonu 16S rRNA do analiz mikroflory pochwy.

Podczas wizyty poporodowej, 3–6 dni po porodzie, pielęgniarka badawcza zbiera informacje na temat przebiegu porodu.

Analizy statystyczne obejmują:

Cel 1. a) analizy regresji jedno- i wieloczynnikowej pod kątem powiązań między określonymi mikroorganizmami a wiekiem ciążowym w chwili urodzenia. b) metody analizy składu wielu zmiennych w celu analizy względnej liczebności poszczególnych taksonów i modeli efektów mieszanych w celu oceny powiązań między wynikiem ciąży a różnorodnością mikroflory pochwy, typami mikroflory pochwy i bezwzględną liczebnością wcześniej określonych grup bakterii.

Cel 2. Opracowanie „wskaźnika stanu zapalnego pochwy” w oparciu o ilościową ocenę mikroflory pochwy i jej potencjału zapalnego. Ten wskaźnik zapalenia pochwy będzie analizowany jako stały efekt w modelach z efektami mieszanymi z wynikami ciąży.

Cel 3. Analiza drzewa klasyfikacyjnego i regresyjnego w celu zbadania kombinacji mikroorganizmów, która najlepiej pozwala przewidzieć wcześniejszy wiek ciążowy w chwili urodzenia.