Инфекции половых путей, вагинальный микробиом и гестационный возраст при рождении среди беременных женщин в Южной Африке

Введение: Осложнения преждевременных родов являются наиболее частой причиной смерти детей в возрасте до 5 лет. В Южной Африке высока распространенность как инфекций половых путей, так и неблагоприятных исходов беременности. В этом исследовании используется целостный подход, изучающий как наличие, так и количество множественных микроорганизмов нижних отделов половых путей, включая вагинальную микробиоту, во время беременности, а также их связь с гестационным возрастом при рождении. Конкретные цели заключаются в изучении: (1) связи между наличием специфических микроорганизмов нижних половых путей и гестационным возрастом при рождении (первичный исход), а также вторичными неблагоприятными исходами беременности; (2) связь между количественной нагрузкой вагинальных и венерических микроорганизмов и гестационным возрастом при рождении (первичный исход), а также вторичными неблагоприятными исходами беременности; и (3) комбинации микроорганизмов, которые наиболее тесно связаны с более ранним гестационным возрастом при рождении.

Методы: В этом проспективном закрытом когортном исследовании наблюдаются женщины, включенные в него во время беременности и до родов. Это групповое исследование является частью более крупного проекта под названием Philani Ndiphile (что на языке исихоса означает «будь здоров, и я буду здоров»).

Обученный полевой исследовательский работник проверяет соответствие критериям участия и получает письменное информированное согласие. Медсестра-исследователь проводит УЗИ брюшной полости, чтобы оценить срок беременности и подтвердить право на участие.

Во время регистрационного визита и последующего визита через 30–34 недели медсестра-исследователь собирает вагинальные образцы для: тестирования на месте на Chlamydia trachomatis и Neisseria gonorrhoeae (с лечением антибиотиками в случае положительного результата); и выездное тестирование для: оценки Ньюджента; обнаружение и количественное определение Mycoplasmaogenicium, M. hominis, Ureaplasma. parvum, U. Urealyticum, Trichomonas vaginalis, Candida spp. и секвенирование ампликона 16S рРНК для анализа вагинальной микробиоты.

На послеродовом приеме через 3-6 дней после родов медсестра-исследователь собирает информацию об исходе родов.

Статистический анализ включает в себя:

Цель 1. а) одновариантный и многовариантный регрессионный анализ связей между конкретными микроорганизмами и гестационным возрастом при рождении. б) методы композиционного многовариантного анализа для анализа относительной численности отдельных таксонов и модели смешанных эффектов для оценки связи между исходом беременности и разнообразием вагинальной микробиоты, типами вагинальной микробиоты и абсолютной численностью заранее определенных групп бактерий.

Цель 2. Разработка «индекса вагинального воспаления», основанного на количественном определении вагинальной микробиоты и ее воспалительного потенциала. Этот индекс вагинального воспаления будет анализироваться как фиксированный эффект в моделях смешанных эффектов с исходами беременности.

Цель 3. Классификация и регрессионный древовидный анализ для изучения комбинации микроорганизмов, которая лучше всего прогнозирует более ранний гестационный возраст при рождении.