Infeksjoner i kjønnsorganene, det vaginale mikrobiomet og svangerskapsalder ved fødsel blant gravide kvinner i Sør-Afrika

Bakgrunn: Premature fødselskomplikasjoner er den vanligste dødsårsaken hos barn under 5 år. I Sør-Afrika er forekomsten av både kjønnsorganinfeksjoner og ugunstige graviditetsutfall høy. Denne studien tar en helhetlig tilnærming, og undersøker både tilstedeværelsen og mengden av flere mikroorganismer i nedre kjønnsorganer, inkludert vaginal mikrobiota, i svangerskapet og deres assosiasjoner til svangerskapsalderen ved fødselen. Spesifikke mål er å utforske: (1) sammenhengen mellom tilstedeværelsen av spesifikke mikroorganismer i nedre kjønnsorganer og svangerskapsalder ved fødselen (primært utfall), så vel som sekundære uønskede graviditetsutfall; (2) sammenhengen mellom kvantifisert belastning av vaginale og seksuelt overførbare mikroorganismer og svangerskapsalder ved fødsel (primært utfall) så vel som sekundære uønskede graviditetsutfall; og (3) kombinasjonene av mikroorganismer som er sterkest assosiert med tidligere svangerskapsalder ved fødselen.

Metoder: Denne prospektive lukkede kohortstudien følger kvinner påmeldt under svangerskapet til etter at de har født. Denne kohortstudien er en del av et større prosjekt, kalt Philani Ndiphile (som betyr 'vær sunn og jeg vil være sunn' i isiXhosa).

En utdannet studiefeltarbeider sjekker for kvalifisering og innhenter skriftlig informert samtykke. En studiesykepleier utfører en abdominal ultralyd for å estimere svangerskapsalderen og bekrefte kvalifisering.

Ved innskrivningsbesøket og et oppfølgingsbesøk ved 30-34 uker, samler en studiesykepleier vaginale prøver for: testing på stedet for Chlamydia trachomatis og Neisseria gonorrhoeae (med antibiotikabehandling hvis positiv); og offsite testing for: Nugent scoring; påvisning og kvantifisering av Mycoplasma genitalium, M. hominis, Ureaplasma. parvum, U. Urealyticum, Trichomonas vaginalis, Candida spp. og 16S rRNA amplikon sekvensering for vaginal mikrobiota analyser.

Ved et fødselsbesøk, 3-6 dager etter fødsel, samler en studiesykepleier informasjon om fødselsutfallet.

Statistiske analyser inkluderer:

Mål 1. a) univariable og multivariable regresjonsanalyser for assosiasjoner mellom spesifikke mikroorganismer og svangerskapsalder ved fødsel. b) komposisjonelle multivariable analysemetoder for å analysere individuelle taksoners relative forekomster og blandede effekter-modeller for å vurdere assosiasjoner mellom graviditetsutfall og vaginal mikrobiotadiversitet, vaginale mikrobiotatyper og absolutte forekomster av forhåndsdefinerte bakteriegrupper.

Mål 2. Utvikling av en "vaginal betennelsesindeks", basert på kvantifisering av vaginal mikrobiota og deres betennelsespotensial. Denne vaginale betennelsesindeksen vil bli analysert som en fast effekt i blandede effekter modeller med graviditetsutfall.

Mål 3. Klassifikasjons- og regresjonstreanalyser for å undersøke kombinasjonen av mikroorganismer som best predikerer tidligere svangerskapsalder ved fødsel.