Infektioner i kønsorganerne, det vaginale mikrobiom og graviditetsalderen ved fødslen blandt gravide kvinder i Sydafrika

Baggrund: Premature fødselskomplikationer er den hyppigste dødsårsag hos børn under 5 år. I Sydafrika er forekomsten af ​​både kønsvejsinfektioner og ugunstige graviditetsresultater høj. Denne undersøgelse tager en holistisk tilgang, der undersøger både tilstedeværelsen og mængden af ​​flere mikroorganismer i nedre kønsorganer, herunder vaginal mikrobiota, under graviditet og deres sammenhænge med svangerskabsalderen ved fødslen. Specifikke mål er at udforske: (1) sammenhængen mellem tilstedeværelsen af ​​specifikke mikroorganismer i den nedre genitale kanal og svangerskabsalder ved fødslen (primært resultat), såvel som sekundære uønskede graviditetsudfald; (2) sammenhængen mellem kvantificeret belastning af vaginale og seksuelt overførte mikroorganismer og gestationsalder ved fødslen (primært resultat) samt sekundære uønskede graviditetsresultater; og (3) de kombinationer af mikroorganismer, der er stærkest forbundet med tidligere gestationsalder ved fødslen.

Metoder: Dette prospektive lukkede kohortestudie følger kvinder indskrevet under graviditeten indtil efter de har født. Dette kohortestudie er en del af et større projekt, kaldet Philani Ndiphile (som betyder 'vær sund, og jeg vil være sund' i isiXhosa).

En uddannet studiefeltarbejder kontrollerer for berettigelse og opnår skriftligt informeret samtykke. En undersøgelsessygeplejerske udfører en abdominal ultralyd for at estimere svangerskabsalderen og bekræfte berettigelsen.

Ved indskrivningsbesøget og et opfølgningsbesøg ved 30-34 uger indsamler en undersøgelsessygeplejerske vaginale prøver til: test på stedet for Chlamydia trachomatis og Neisseria gonorrhoeae (med antibiotikabehandling, hvis positiv); og offsite test for: Nugent scoring; påvisning og kvantificering af Mycoplasma genitalium, M. hominis, Ureaplasma. parvum, U. Urealyticum, Trichomonas vaginalis, Candida spp. og 16S rRNA amplikon sekventering til vaginal mikrobiota analyser.

Ved et postnatalt besøg, 3-6 dage efter fødslen, indsamler en undersøgelsessygeplejerske information om fødslens resultat.

Statistiske analyser omfatter:

Mål 1. a) univariable og multivariable regressionsanalyser for sammenhænge mellem specifikke mikroorganismer og gestationsalder ved fødslen. b) kompositoriske multivariable analysemetoder til at analysere individuelle taxoners relative overflod og blandede effektmodeller for at vurdere sammenhænge mellem graviditetsudfald og vaginal mikrobiotadiversitet, vaginale mikrobiotatyper og absolut overflod af foruddefinerede bakteriegrupper.

Mål 2. Udvikling af et 'vaginalt inflammationsindeks' baseret på kvantificering af den vaginale mikrobiota og deres inflammatoriske potentiale. Dette vaginale inflammationsindeks vil blive analyseret som en fast effekt i blandede effekter modeller med graviditetsudfald.

Mål 3. Klassifikations- og regressionstræanalyser for at undersøge den kombination af mikroorganismer, der bedst forudsiger tidligere gestationsalder ved fødslen.