Verspreide biobanken voor zeldzame ziekten: een model voor monster-/gegevensverzameling met duurzame en gedeelde criteria (SATELLITES)

Specifiek doel 1. Oprichting van de Verspreide RD Biobank. Het doel van ons project is om de Scattered RD-biobank te creëren als een netwerk van nieuwe, toegewijde en reeds bestaande biobanken om de schaarste aan biologische RD-monsters te overwinnen en materiaal van hoge kwaliteit beschikbaar te maken voor toekomstige collaboratieve studies in nationale en internationale samenwerking. Het netwerk zal voornamelijk biobanken omvatten die zich richten op cardiovasculaire en neurologische ziekten. Het zal worden georganiseerd volgens een bidirectioneel Hub&Spoke-model waarin elke RD-biobank fungeert als een gecentraliseerde hub voor monsters en gegevens verzameld van RD-patiënten die verwijzen naar zijn eigen instelling/centrum en als een spreekpunt voor de andere RD-biobanken van het netwerk. Elke biobank zal dienen als knooppunt voor het verzamelen van monsters/gegevens van ZD-patiënten die verwijzen naar andere ZD-referentiecentra verspreid over het grondgebied en die niet beschikken over een georganiseerde biobank volgens de moderne definitie van biobank. Deze aanpak bevordert de verbinding van verschillende biobanken die geografisch verspreid zijn over het land en zal de migratie van patiënten naar de biobank van belangen voorkomen. Er zullen twee belangrijke hubs worden gedefinieerd: de Northern Hub waarnaar de RD-biobanken en RD-referentiecentra van Noord-Italië zullen verwijzen; en de Zuidelijke Hub waarnaar de RD-biobanken en RD-referentiecentra van Midden- en Zuid-Italië zullen verwijzen. Er zal een inventariscatalogus voor biomonsters worden gemaakt en de beschrijving van alle procedures die voor deze collecties worden gebruikt (SOP's, monstergerelateerde gegevens, ethische en juridische documenten) zal aan elk monster en elke gegevens worden gerelateerd.

Specifieke doelstelling 2. Harmonisatie, Standaardisatie en Netwerkbeheer. Volgens ISO 20387, die de algemene vereisten voor biobanking illustreert, zullen Standard Operating Procedures (SOP's) worden gedefinieerd om de consistentie en standaardisatie van de praktijk (verzameling, voorbereiding, opslag en distributie van biologisch materiaal en gerelateerde informatie en gegevens) in elk afzonderlijk proces te garanderen. biobank. De biologische monsters van RD-patiënten verzameld in de Scattered RD Biobank zullen worden verkregen volgens de specifieke SOP's die zijn gegenereerd voor de verzameling van RD-biologische monsters die geschikt zijn voor Omics-benaderingen. Er zullen SOP's worden gegenereerd voor elke fase van het pre-analytische proces, van verzameling tot opslag en meer, voor het delen van monsters. De oprichting van de Scattered RD Biobank als biobanknetwerk vereist een rigoureus Kwaliteitsmanagementsysteem (QMS) dat nodig is om variaties tussen laboratoria en intercentra te minimaliseren en de kwaliteit van het monster dat in de samenwerkingsprojecten wordt gedistribueerd te garanderen. Het QMS omvat: (1) Kwaliteitsborging om alle stadia van het biobankproces te standaardiseren, (2) Kwaliteitscontroles (QC) op monsters om het monsterbeheerproces te valideren, om reproduceerbare kwaliteit en de betrouwbaarheid van de opslagprocedures te garanderen en de stabiliteit van de monsters in de tijd. QC zal worden uitgevoerd op zowel de historische als nieuwe collecties biologische RD-monsters om het succes van het experiment en de betrouwbare interpretatie van de resultaten te maximaliseren. Monsterkwaliteitscontrole levert waardevolle informatie op om vroegtijdig preventieve of corrigerende maatregelen te nemen, waardoor kosten worden bespaard en het risico op experimentele fouten wordt verkleind. De meest geschikte hulpmiddelen (markers en testen) die kunnen worden gebruikt om pre-analytische variaties voor zowel vloeibare als vaste weefselmonsters te beoordelen, zullen worden gedefinieerd voor een betere standaardisatie tussen de RD-biobanklaboratoria. Gegevens over biologische monsters en klinische informatie die met de monsters correspondeert, zullen worden verzameld met behulp van een gemeenschappelijke database. Het doel zal zijn om de communicatieregels tussen zeldzame ziekten-biobanken te harmoniseren en te standaardiseren op het niveau van informatie over de donor en om de locatie en toegang van monsters te vergemakkelijken. Om deze problemen aan te pakken zal er volgens MIABIS een communicatieprotocol worden ontworpen voor de minimale informatie die nodig is om samenwerkingen tussen biobanken tot stand te brengen en de uitwisseling van biologische monsters mogelijk te maken. Om de harmonisatie van de verschillende biobanken in het netwerk te vergemakkelijken, zullen ook gemeenschappelijke regelgeving en fundamentele ethische en juridische documenten worden uitgewerkt. Bovendien zal er een website van het biobanknetwerk worden gecreëerd om de zichtbaarheid van de tool te vergroten en alle uitgewerkte documenten te delen. De website zal een "virtuele biobank" bevatten, een online catalogus van biologische specimens die in de biobanken zijn opgeslagen. De virtuele biobank zal onderzoekers snel en efficiënt helpen biospecimens te vinden die zich in verschillende biobanken bevinden en zal het transparant delen van biobronnen bevorderen om nationale en internationale samenwerkingen te vergemakkelijken. Specifiek doel 3. Upgrade van RD-biobanken en creatie van nieuwe RD-biobanken. De reeds bestaande RD-biobanken in het netwerk zullen worden geïmplementeerd in termen van het aantal verzamelde monsters en de organisatie van de monsterverzamelingen volgens de gemeenschappelijke SOP's. Alle monsters worden gekoppeld aan relevante persoonlijke en gezondheidsinformatie, waaronder medische dossiers, familiegeschiedenis en levensstijl. Ze zullen verder worden gekarakteriseerd door middel van analyse van genoomgegevens en het fenotype zal regelmatig worden bijgewerkt via vervolgbezoeken. Er zullen nieuwe biobanken worden opgezet en gewijd aan biologisch materiaal en bijbehorende gegevens afkomstig van proefpersonen die drager zijn van mutaties in de ziekte van Huntington (ZvH), het Marfansyndroom (MS), erfelijk angio-oedeem (HAE) en aangeboren hartziekten (CHD). De ZvH is een zeldzame genetische neurodegeneratieve aandoening die vandaag de dag 1 op de 10.000 mensen in Europa treft. De ziekte treft meer dan 6.000 mensen in Italië en ongeveer 40.000 mensen lopen het risico om op latere leeftijd symptomen te ontwikkelen. Hoewel de aandoening goed bestudeerd en gekarakteriseerd is, moet er nog veel onderzocht worden op het gebied van de diversiteit van de symptomen bij patiënten, zelfs binnen dezelfde familie. In dit opzicht worden het Center for Rare Diseases van IRCCS Neuromed en de Untà Ricerca e Cura Huntington e Malattie Rare van IRCCS CSS beide erkend als referentiecentra voor de ziekte op nationaal en internationaal niveau. LIRH Foundation is een Europese ZvH-netwerksite die verbonden is met ZvH-familieorganisaties in het hele land. De samenwerking garandeert de verzameling van klinische gegevens die zullen worden gestratificeerd op basis van het ziektestadium en de herkomst van monsters uit heel Italië. MS is een zeldzame genetische aandoening die bij ongeveer 1 op de 5.000 mensen voorkomt en wordt veroorzaakt door een mutatie in een gen genaamd FBN1. MS tast het bindweefsel aan, maar beschadigt de bloedvaten, het hart, de ogen, de huid, de longen en de botten van de heupen, wervelkolom, voeten en ribbenkast. Sommige complicaties van MS kunnen zeer ernstig zijn, zoals een aneurysma (uitstulping) van de aorta. HAE is een zeldzame, genetische ziekte die wordt gekenmerkt door onvoorspelbare, terugkerende episodes van zwelling van de huid en slijmvliezen, meestal veroorzaakt door een tekort aan C1-remmers. De prevalentie van HAE wordt geschat op ongeveer 1 op de 50.000 mensen wereldwijd. IRCCS Policlinico San Donato is lid van het ERN Guard Heart-netwerk, lid van ITACA (Italiaans netwerk voor erfelijk en verworven angio-oedeem) en het hoofdkantoor van het Cardio Vascular Genetics Centre. De oprichting van speciale biobanken zal een innovatief en waardevol instrument zijn voor het onderzoeken van genotype-fenotype-correlaties en moleculaire mechanismen die ten grondslag liggen aan zo'n grote variabiliteit. De oprichting van deze nieuwe RD-biobanken zal een aanzienlijke impact hebben op de nationale en internationale concurrentiekracht van het Italiaanse biomedische onderzoek. Het voordeel van het creëren van dit soort biobanken zal resulteren in de mogelijkheid om in de loop van de tijd meerdere biologische monsters te verzamelen tijdens de ziekteprogressie voor elk afzonderlijk onderwerp. De functie van de Scattered RD Biobank als onderzoeksbron roept vragen op over de processen en praktijken voor werving, participatie en betrokkenheid. De rol van biobankdeelnemers is vaak passief na de initiële inschrijving en monsterverzameling. Om de transparantie te verbeteren en de betrouwbaarheid van de biobanken van het netwerk aan te tonen, zullen de deelnemers echter actief betrokken worden na de initiële face-to-face dialoog, in de richting van meer interactieve dialogen met de onderzoeksteams. Door biobanking als een dienst voor patiënten te beschouwen, zal een samenwerking tussen RD-biobanken van het netwerk en patiëntenorganisaties worden gedefinieerd, waarbij speciale bijeenkomsten, rondetafelgesprekken en focusgroepen worden gepromoot. Een sterke samenwerking tussen RD-biobanken en patiëntenorganisaties zal ook van cruciaal belang zijn om de integratie te bereiken van monstergegevens die zijn opgeslagen in biobanken en klinische gegevens die zijn opgeslagen in registers of klinische databases.

WP1. Naaf- en spaakmodel. De Scattered RD-biobank zal worden gecreëerd als een netwerk van reeds bestaande en nieuwe specifieke biobanken, voornamelijk gericht op cardiovasculaire en neurologische ziekten, volgens een bidirectioneel Hub&Spoke-model. Het model zal twee belangrijke hubs omvatten, de Northern Hub en de Southern Hub, die al ervaring hebben met het opzetten van biobanknetwerken. De doelstellingen van deze belangrijkste hubs zijn: 1. Het coördineren van de oprichting van de verspreide RD-biobank door de standaardisatie en harmonisatie van alle procedures van het biobankingproces.

Standard Operating Procedures (SOP's) voor verzameling, verwerking en opslag, kwaliteitscontrolebeheer, Ethical Legal Social Issue (ELSI) en uniformiteit in bestuur zullen worden gegenereerd omdat biobanken als één enkele entiteit zullen optreden. 2. Het beheren en faciliteren van de verbinding van verschillende biobanken en RD-referentiecentra, geografisch verspreid over het land. Er zullen periodiek virtuele en in aanwezigheidsbijeenkomsten worden georganiseerd tussen de vertegenwoordigers van de biobanken en van de RD Referentiecentra. 3. Referentiebiobanken zijn voor RD-referentiecentra verspreid over het grondgebied die niet over de faciliteiten beschikken om monsters en gegevens te verzamelen voor onderzoeksstudies, of voor RD-referentiecentra die al monsters en gegevens hebben verzameld maar niet over een modern gedefinieerde biobank beschikken en deel willen uitmaken van de Scattered RD biobank.

OU1 zal de referentiebiobank zijn van RD-referentiecentra van Noord-Italië en OU3 van RD-referentiecentra van Midden- en Zuid-Italië. 4. Het coördineren van de creatie van een Biospecimen Inventory Catalogus van monsters/gegevensverzamelingen die al aanwezig zijn in de biobanken van het netwerk. Er zal een vragenlijst worden opgesteld en gedeeld onder de eenheden die aan dit project deelnemen, en onder de nieuwe biobanken of RD-referentiecentra die deel willen uitmaken van het netwerk. De vragen hebben zowel betrekking op informatie over de infrastructuur en faciliteiten van de biobanken van de instelling waar de collectie wordt opgeslagen als op de historische monsters/gegevensverzamelingen (SOP's ontwikkeld en gebruikt voor de verzameling, verwerking en opslag, het type monsters en de bijbehorende verzamelde gegevens, het aantal betrokken patiënten, gebruikte ethische en juridische documenten, beleid inzake kwaliteitsborging). Bovendien zal het bidirectionele model ervoor zorgen dat elke eenheid een gecentraliseerd knooppunt zal zijn voor historische en nieuwe collecties van ZD-patiënten die verwijzen naar zijn eigen instelling/centrum, en ook een spreekbuis zal zijn voor het netwerk. Elke eenheid zal nieuwe biologische monsters en bijbehorende gegevens van patiënten met zeldzame ziekten en syndromen verzamelen en opslaan, in overeenstemming met de SOP's en het uitgewerkte beleid. Elke eenheid is verantwoordelijk voor zijn eigen monsters/gegevensverzameling en beheert deze in overeenstemming met het netwerkbeheer.

WP2. Kwaliteitshandboek: i) procedures voor monsterverwerking (bijv. aliquoting, opslag en kwaliteitscontrole), benodigdheden, apparatuur, instrumenten, reagentia en labels; ii) procedures voor het verkrijgen van geïnformeerde toestemming en het intrekken van toestemming van deelnemers; iii) beheerbeleid, inclusief toegangscontrole, back-upsystemen, klinische annotatie, documentonderhoud en archivering; iv) procedures voor het delen en ontvangen van monsters, inclusief methoden en apparatuur; v) procedures voor kostendekking; vi) organisatorische vereisten (governance).

WP2.1 SOP's voor de biobankingworkflow volgens officiële richtlijnen: 1. pre-analytische omstandigheden (verzameling, initiële verwerking, voorlopige cryopreservatie van derivaten, langetermijnopslag, testen) bepaald voor elk type monsters en derivaten; 2. selectie van het type primaire verzamelcontainer (antistollingsmiddel, conserveermiddel) en QR-gecodeerde cryobuisjes; 3. bepaling van het aantal en het volume van de monstermonsters; 4. procedures voor de distributie van monsters via gecertificeerde transportbedrijven.

WP2.2. Bestuur met de steun van een jurist op het gebied van gegevensbescherming, expert op het gebied van het beheer van juridische biobanken: 1. toegangsbeleid voor monsters om onderzoekers een eenvoudig en transparant mechanisme te bieden voor het verkrijgen van toegang tot en het delen van monsters; 2. Stuurgroep (PI's, managers van biobanken en RD Referentiecentra, vertegenwoordiger van de patiëntenorganisatie) zal alle verzoeken om monsters en gerelateerde gegevens beoordelen en goedkeuring, afwijzing of uitstel voorstellen; 3. Material Data Transfer Agreement (MDTA) om: i) de voorwaarden te regelen waaronder de monsters/gegevens kunnen worden gebruikt; ii) schets het type monsters/gegevens dat moet worden overgedragen, het doel van de overdracht en alle beperkingen of verplichtingen met betrekking tot het gebruik van de monsters en gegevens; 4. ELSI-kwesties om biobankdonoren en hun persoonlijke gegevens te beschermen: i) het creëren van een geïnformeerde toestemming volgens de EU AVG om de donoren voldoende informatie te bieden over de voordelen/risico's van monsterbiobanking, om hen de mogelijkheid te geven de toestemming in te trekken, om hen te verzekeren dat hun monsters en gegevens worden beschermd tegen misbruik, veilig worden opgeslagen en gebruikt voor onderzoek. WP2.3. QMS: 1. Kwaliteit gegarandeerd door het Kwaliteitshandboek, door de definitie van alle non-conformiteiten van primaire monsters of afgeleide monsters (bijv. hemolytisch of lipemisch bloed, aanwezigheid van stolsels) en door de traceerbaarheid van monsters en gerelateerde informatie; 2. Kwaliteitscontrole op monsters om de kwaliteit van monsters objectief te beoordelen en het monsterbeheerproces te valideren wordt gegarandeerd door: i) absolute beoordeling van de kwaliteit van monsters; ii) geschiktheidstest. QC-analyses op nieuwe en historische monsters zullen worden gecentraliseerd om consistentie in processen te garanderen, tools en best practices te delen en enige autonomie aan de kwaliteitsinspanningen op te leggen en om een ​​sterk kwaliteitssysteem te bieden. WP3. Gecentraliseerde database om het beheer van monsters verzameld in elke biobank te verbeteren, op basis van een integratie tussen de databasesoftware van elke biobank en de gecentraliseerde databasesoftware. Een minimale dataset ontworpen volgens Minimum Information About Biobank data Sharing (MIABIS) zal het volgende definiëren: i) de biobank waar de monsters worden opgeslagen; ii) de monsterverzameling; iii) details over monsters (bijv. monstertype, opslagtemperatuur, anatomische locatie); iv) monsterdonor (bijv. geboortedatum, geslacht); v) gebeurtenis gerelateerd aan monster of donor (bijv. leeftijd bij bemonstering, ziekte-ontologie, ziektediagnose). WP4. Website om de zichtbaarheid van de biobanken te vergroten en om alle documenten te delen: i) openbare ruimte toegankelijk voor alle burgers met algemene netwerkinformatie en contacten, nieuws, georganiseerde evenementen, studieresultaten; ii) catalogus van biologisch materiaal dat is opgeslagen om onderzoekers van andere instellingen te helpen interessante monsters te vinden; iii) login gereserveerd gebied dat alleen toegankelijk is voor vertegenwoordigers van elke biobank van het netwerk. De creatie ervan zal worden uitgevoerd door een bureau gespecialiseerd in webdesign en ontwikkeling van biobankwebsites.

WP5. Historische collecties zullen worden hermodelleerd en gereorganiseerd volgens de activiteiten die in dit project worden beschreven om de Biospecimen Inventory Catalog te creëren, ontworpen om een ​​lijst te bieden van alle biospecimens en bijbehorende gegevens die al in de biobanken zijn opgeslagen. Bovendien zullen RD-biobanken het aantal van hun monsters en gerelateerde gegevens implementeren door nieuwe monsters/gegevens te verzamelen volgens de verspreide RD Biobank SOP's die zijn gegenereerd en gedeeld met de partners.

WP5.1. Gebaseerd op de ervaring van reeds bestaande Italiaanse RD-biobanknetwerken, zal de verspreide RD-biobank de actieve deelname van patiëntenorganisaties aan de oprichting van dit biobanknetwerk bevorderen, aangezien het een fundamentele dienst voor patiënten zal vertegenwoordigen. Er zullen speciale bijeenkomsten en rondetafelgesprekken worden georganiseerd met deelname van biobankiers, onderzoekers, vertegenwoordigers van de zeldzame patiëntenorganisaties, patiënten en familieleden, om de gegenereerde biobankdocumenten over beleid en procedures, inclusief die met betrekking tot ELSI-kwesties, te bespreken en te delen. Bovendien zullen er bijeenkomsten worden georganiseerd met deskundigen op het gebied van verschillende biobankaspecten (zorgprofessionals, bio-ethici, DPO-advocaten) om te discussiëren over ethische en juridische onderwerpen met betrekking tot privacy, geïnformeerde toestemming, intrekking van toestemming, toegang tot monsters en gegevens, teruggave van resultaten en nevenbevindingen en waar de patiënten en hun familieleden de kans krijgen om hun mening, behoeften en verwachtingen te uiten. Er zullen ook focusgroepen worden georganiseerd met deskundige bemiddelaars om de meningen, kennis, percepties en zorgen van deelnemers met betrekking tot biobanking te onderzoeken.

GEGEVENSVERZAMELING EN BEHEER. De minimale dataset met standaardattributen definieert biobank- en biologische monsterinformatie (bijv. de biobank waar de monsters zijn opgeslagen, de monsterverzameling, het monstertype, de opslagtemperatuur, de anatomische locatie) en donorinformatie (bijv. geboortedatum, geslacht, leeftijd bij bemonstering, ziekte-ontologie, ziektediagnose). Alle gegevens worden vastgelegd in de databasesoftware die al in de Units aanwezig is. In elk RD Referentiecentrum zal de gegevensverzameling plaatsvinden onder toezicht van de Biobank Manager en van de PI, die de verantwoordelijkheid zal hebben om de gegevensbeveiliging en privacy te beschermen in overeenstemming met het institutionele beleid. Alle donoren en gerelateerde monsters/gegevens worden gepseudonimiseerd met een alfanumerieke code. De minimale dataset van elke biobank zal naar een gecentraliseerd databasesysteem stromen, gebaseerd op een integratie tussen de databasesoftware van elke biobank en de gecentraliseerde databasesoftware. Deze integratie zal gebaseerd zijn op gegevensblootstelling via API-rust op een TLS-gecodeerd protocol. Vanwege de duur van het project zal deze integratie worden geïmplementeerd voor de vier eenheden die aan dit project deelnemen, om de architectuur te bouwen en te testen die in toekomstige projecten naar alle biobanken zou kunnen worden uitgebreid. Wat de eerdere collecties betreft, zullen de gegevens opnieuw worden georganiseerd op basis van de minimaal gegenereerde dataset.

BIOLOGISCHE MONSTERS. Nieuwe biologische monsters zullen worden verzameld, verwerkt, opgeslagen en gedeeld volgens de SOP's. De soorten monsters die worden verzameld, zijn afhankelijk van de onderzoeksprojecten (volbloed en derivaten, FFPE of bevroren weefsels).

Monsters zullen worden verdeeld in een bepaald volume en aantal aliquots en opgeslagen in de biobankpartners. Wat de historische collectie betreft, zal er een inventariscatalogus voor biospecimens worden gemaakt en zal de beschrijving van alle procedures die voor de collectie worden gebruikt (SOP's, monstergerelateerde gegevens, ethische en juridische documenten) worden gerelateerd aan elk monster en elke gegevens.

VOORBEELDKWALITEITSCONTROLES. 1. Absolute beoordeling van de kwaliteit van monsters. Bloedmonsterderivaten: aanwezigheid van hemoglobine in plasma of serum, aanwezigheid van cellen of celresten in plasma of serum, aanwezigheid van bloedplaatjes in plasma zonder bloedplaatjes, cytofluorimetrische analyse van de PBMC. Weefsels: histologische analyse van met weefsel gekleurde objectglaasjes om de weefselarchitectuur, celmorfologie en scherpte te verifiëren. Nucleïnezuurmonsters: de zuiverheid wordt berekend uit de verhouding van de absorptie gemeten door een spectrofotometer, bijgedragen door het nucleïnezuur, tot de absorptie van de verontreinigingen. Typische vereisten voor A260/A280-verhoudingen zijn 1,8¿2,2; A260/A280 van zuiver DNA is ~1,8, en A260/A280 van zuiver RNA is ~2. DNA/RNA-integriteit wordt geëvalueerd door middel van capillaire elektroforesetechnieken en weergegeven door DNA/RNA-integriteitsnummer DIN/RIN (waarbij 1 wijst op sterk afgebroken DNA/ RNA en 10 staat voor zeer intact DNA/RNA). 2. Geschiktheidstest. Analyse van specifieke markers uitgevoerd op de partij onderzoeksmonsters om de geschiktheid voor het doel van de monsters te beoordelen, aangezien een monster van voldoende hoge kwaliteit kan zijn voor één type analyse (bijvoorbeeld antilichaamanalyse), maar niet voor andere soorten analyses. analyses (bijvoorbeeld metabolietenanalyse). Kwaliteitscontrole van monsters zal worden uitgevoerd op zowel historische als nieuwe collecties op willekeurig geselecteerde monsters en als de kwaliteit niet aan de vooraf gedefinieerde criteria voldoet, zullen corrigerende maatregelen worden uitgevoerd voordat wordt verdergegaan met het biobanken, om een ​​robuust en reproduceerbaar proces te garanderen. Wat de historische collecties betreft, zal het effect van vries-dooicycli en van verschillende omstandigheden voorafgaand aan de opslag worden beoordeeld en zullen monsters die niet aan de kwaliteitscontrolenormen voldoen, niet worden opgenomen. Er zullen intrabiobank QC-monsters worden uitgevoerd om de QM van de afzonderlijke biobankmonsters te verifiëren, waarbij de verschillen tussen afzonderlijke onderzoeken op hetzelfde type monster worden beoordeeld, en interbiobank QC-monsters zullen worden uitgevoerd om de QM van elke biobank te verifiëren en de verschillen tussen de individuele biobanken te beoordelen. biobanken van de Scattered RD Biobank.

STATISTISCH PLAN. In dit project worden monsters en gegevens verzameld om te worden opgeslagen in de Scattered RD Biobank. Er zullen geen biologische analyses op monsters worden uitgevoerd en er zullen geen systematisch onderzoek, interpretatie en synthese van verzamelde klinische gegevens worden uitgevoerd om zinvolle conclusies te trekken. Er zal een beschrijvende statistische analyse van de gegevens worden uitgevoerd om het biobankingproces te monitoren. Beschrijvende statistische analyse zal worden uitgedrukt in termen van gemiddelde (standaarddeviatie) of mediaan (bereik, interkwartielbereik) voor continue variabelen en als absolute en relatieve frequenties voor categorische variabelen. Vergelijkingen tussen twee onafhankelijke groepen zullen worden gemaakt door middel van een ongepaarde T-test of een Wilcoxon-som rangschik de test indien van toepassing.

Inferentiële procedures (testen van hypothesen en betrouwbaarheidsintervallen) en regressiemodellen zullen ook op de juiste manier worden toegepast, afhankelijk van het doel van elke specifieke analyse. Kwaliteitscontrole. Een steekproefomvang van 325 uit een batch van 2000 maakt het mogelijk om 5% van het risico op het afwijzen van een monster en 5% van het risico op het accepteren van een niet-conform monster te evalueren, gebaseerd op een aanvaardbaar kwaliteitsniveau van 5% en een beperkend kwaliteitsniveau van 2%. Het acceptatiegrensnummer is 8.

VERWACHTE RESULTATEN. 1. Oprichting van de Verspreide RD Biobank door i) harmonisatie en standaardisatie van het biobankingproces van de biobanken van het netwerk; ii) de realisatie van het Kwaliteitshandboek van de Scatterd RD Biobank met daarin SOP’s voor het verzamelen, voorbereiden, opslaan en distribueren van het biologische materiaal/gegevens, gemeenschappelijke regelgeving en fundamentele ethische en juridische documenten (bijv. geïnformeerde toestemming, MDTA) en het kwaliteitsmanagementsysteem; iii) de creatie van een gecentraliseerde database met een minimale dataset. 2. Ontwikkeling van systemen voor kwaliteitscontrole (QC) op biologische monsters om de creatie van collecties van hoge kwaliteit te garanderen. QC-systemen omvatten specifieke tests en analyses die moeten worden uitgevoerd op biologische monsters en de definitie van grenswaarden voor acceptatie in de Scattered RD Biobank van historische of nieuwe collecties. 3. Creëren van een inventaris van biospecimens Catalogus van monsters/gegevens verzameld door de afzonderlijke biobanken vóór de oprichting van het netwerk dat een beter beheer en valorisatie van historische collecties mogelijk maakt. Dit leidt tot een verhoging van de benuttingsgraad van de verzamelde monsters/gegevens en tot een vermindering van de volumes opgeslagen monsters. De biobanken van het netwerk zullen selectiever zijn wat betreft wat ze opslaan, wat zal helpen bij de overgang van een biobankmodel gebaseerd op voornamelijk retrospectieve monsters van vooraf gedefinieerde specimens naar een meer prospectieve, door onderzoekers aangestuurde collectie om de kosten van dubbele collecties te verlagen. 4. Vergroot de zichtbaarheid van biobanken door een website van het netwerk te creëren om het delen van verzamelde monsters/gegevens te verbeteren en om de toegang van biobanken en RD-referentiecentra tot nationale en internationale onderzoeksprojecten te vergemakkelijken. Op de website kunnen potentiële belanghebbenden de ¿virtuele biobank¿ van de Scattered RD Biobank vinden met de catalogus van de biologische specimens van het netwerk.

5. Totstandkoming van de samenwerking tussen Patiëntenorganisaties en de Verspreide RD Biobank dankzij formele overeenkomst. De effectieve samenwerking tussen patiënten en de wetenschappelijke gemeenschap is essentieel voor het vergroten van het bewustzijn en vertrouwen, evenals voor het delen van doelstellingen en inspanningen ter ondersteuning van onderzoek op het gebied van zeldzame ziekten. 6. Identificeer en neem deze op in de verspreide RD Biobank maken nog geen deel uit van een netwerk en zijn op zichzelf staande collecties zonder beleid voor het grensoverschrijdend delen van monsters of specifieke workflows die zijn geïmplementeerd om de kwaliteit van het biologische monster en de bijbehorende verzamelde gegevens te garanderen. Be part of Scattered RD Biobank zal deze biobanken helpen evolueren van een biobank gericht op het aantal verzamelde monsters naar een biobank gericht op de kwaliteit van biospecimens en gegevens.

RISICOANALYSE. Deze tweejarige onderzoekssubsidie ​​zal de kosten dekken van de oprichting van de Scatterd RD Biobank en van het opstarten van infrastructuren. De Scattered RD Biobank is echter een langetermijnproject dat longitudinale economische duurzaamheid nodig heeft. De biobankpartners van dit netwerk bevinden zich binnen wetenschappelijke instellingen, die de financiële dekking van basisactiviteiten garanderen, zoals het onderhoud van apparatuur, onderhoud en energierekeningen, b.v. voor elektriciteit en gassen, die grotendeels worden verbruikt door de vriessystemen. De economische duurzaamheid van de Scatterd RD Biobank zou echter een knelpunt kunnen zijn vanwege de onderhoudskosten. Beheersoplossingen voor de duurzaamheid van het netwerk op lange termijn zouden de volgende moeten zijn: i) toegang tot nationale en internationale financieringsmechanismen voor subsidies voor RD-projecten; ii) het introduceren van kostendekkingsprocedures voor het verkrijgen, opslaan en hanteren van monsters. De kosten voor het verwerven, verkrijgen, verwerken, opslaan en conserveren van biospecimen vertegenwoordigen een aanzienlijk deel van de totale kosten van een biobank; (iii) het vergroten van het aantal gedistribueerde monsters.

De snelheid waarmee monsters worden opgeslagen mag niet sneller groeien dan de bezettingsgraad; iv) samenwerken met meerdere soorten belanghebbenden, zoals patiëntenverenigingen en donoren, ziekenhuizen en artsen, onderzoekers, het openbaar bestuur en liefdadigheidsinstellingen; v) het verbeteren van het inzicht in de voordelen van biobanken voor de economie en de samenleving, aangezien biobanken een centrale rol spelen bij het verbeteren van de diagnose van patiënten en de therapeutische zorg en daarmee het vergroten van publieke en private financiering.

De ontwikkeling van de Scattered RD Biobank is niet triviaal vanwege de heterogeniteit van de biobanken/RD Referentiecentra in monsters en gegevensverzameling. Er moeten geharmoniseerde richtlijnen worden opgesteld om historische en nieuwe monster-/gegevensverzamelingen te organiseren op het gebied van biobankingprocedures, gegevensbescherming, het delen van monsters/gegevens en databases. Databasesoftware, zoals biobankinformatiebeheersystemen (BIMS), geharmoniseerde diensten en gemeenschappelijke ontologieën (MIABIS) moeten worden gebruikt om interoperabiliteit van gegevens en monsterverzamelingen mogelijk te maken. De kwaliteit van biobanken is in belangrijke mate afhankelijk van het werk van het adequaat opgeleide personeel, dat verantwoordelijk is voor de ontvangst, verwerking en opslag van biomonsters en gerelateerde gegevens. Het biobankpersoneel moet een consistente monsterkwaliteit garanderen die fundamenteel is voor het succes van de enkele biobank en dus van het netwerk. Het werven van personeel voor een project van deze omvang is van cruciaal belang om het volledige potentieel te benutten, vooral voor biobanken die nieuw personeel nodig hebben. Voor het welslagen van het netwerkproject moet er worden gezorgd voor een geharmoniseerde opleiding voor technisch personeel, aangezien het verwaarlozen van de opleidingsmaatregelen voor werknemers de volksgezondheid kan schaden en het risico met zich meebrengt dat de reputatie van de biobanken en de gastinstelling wordt geschaad. Nieuw personeel zal op passende wijze worden opgeleid voordat ze volledig worden geïntegreerd in de werkomgeving, waarbij ze leren over teamwerk, personeelsveiligheid, patiëntprivacy, kwaliteit van monsters en best practices in de vorm van zorgvuldig geïmplementeerde SOP's.

Harmonisatie speelt een sleutelrol bij het opzetten van een biobanknetwerk, maar er moeten nog veel ethische en juridische problemen worden opgelost. Deskundigen op het gebied van ethische en wettelijke kaders en nationale wetgeving zullen worden uitgenodigd om deel te nemen aan het hele ontwikkelingsproces van biobanknetwerken, om bescherming van donoren te bieden en passend gebruik van hun monsters te garanderen.