Verstreute Biobanken für seltene Krankheiten: ein Modell der Proben-/Datensammlung mit nachhaltigen und gemeinsamen Kriterien (SATELLITES)

Konkretes Ziel 1. Einrichtung der Scattered RD Biobank. Ziel unseres Projekts ist es, die Scattered RD-Biobank als Netzwerk neuartiger dedizierter und bereits bestehender Biobanken zu schaffen, um den Mangel an biologischen RD-Proben zu überwinden und hochwertiges Material für zukünftige Verbundstudien in nationaler und internationaler Zusammenarbeit verfügbar zu machen. Das Netzwerk wird hauptsächlich Biobanken umfassen, die sich auf kardiovaskuläre und neurologische SE konzentrieren. Es wird nach einem bidirektionalen Hub&Spoke-Modell organisiert, bei dem jede RD-Biobank als zentrale Drehscheibe für Proben und Daten von SE-Patienten dient, die sich an ihre eigene Institution/ihr eigenes Zentrum wenden, und als Spoke für die anderen RD-Biobanken des Netzwerks fungiert. Jede Biobank dient als Drehscheibe für die Proben-/Datensammlung von SE-Patienten, die sich an andere über das gesamte Gebiet verstreute SE-Referenzzentren wenden und über keine organisierte Biobank gemäß der modernen Definition einer Biobank verfügen. Dieser Ansatz wird die Verbindung verschiedener Biobanken, die geografisch über das ganze Land verteilt sind, begünstigen und die Migration von Patienten in Richtung der Biobank ihrer Interessen verhindern. Es werden zwei Hauptzentren definiert: das nördliche Zentrum, auf das sich die RD-Biobanken und RD-Referenzzentren Norditaliens beziehen werden; und der Southern Hub, auf den sich die RD-Biobanken und RD-Referenzzentren in Mittel- und Süditalien beziehen werden. Es wird ein Bioproben-Inventarkatalog erstellt und die Beschreibung aller für diese Sammlungen verwendeten Verfahren (SOPs, probenbezogene Daten, ethische und rechtliche Dokumente) wird auf jede Probe und jede Daten bezogen.

Spezifisches Ziel 2. Harmonisierung, Standardisierung und Netzwerk-Governance. Gemäß ISO 20387, die die allgemeinen Anforderungen für Biobanking veranschaulicht, werden Standardarbeitsanweisungen (SOPs) definiert, um die Konsistenz und Standardisierung der Praxis (Sammlung, Vorbereitung, Lagerung und Verteilung von biologischem Material sowie zugehöriger Informationen und Daten) in jedem einzelnen sicherzustellen Biobank. Die in der Scattered RD Biobank gesammelten biologischen Proben von RD-Patienten werden gemäß den spezifischen SOPs gewonnen, die für die Sammlung biologischer RD-Proben erstellt wurden, die für Omics-Ansätze geeignet sind. Für alle Phasen des voranalytischen Prozesses von der Sammlung bis zur Lagerung und mehr für die gemeinsame Nutzung von Proben werden SOPs erstellt. Die Schaffung der Scattered RD Biobank als Biobank-Netzwerk erfordert ein strenges Qualitätsmanagementsystem (QMS), das notwendig ist, um Unterschiede zwischen Laboren und Zentren zu minimieren und die Qualität der in den Verbundprojekten zu verteilenden Proben zu gewährleisten. Das QMS umfasst: (1) Qualitätssicherung zur Standardisierung aller Phasen des Biobanking-Prozesses, (2) Qualitätskontrollen (QC) an Proben zur Validierung des Probenverwaltungsprozesses, zur Gewährleistung reproduzierbarer Qualität und zur Zuverlässigkeit der Lagerungsverfahren und die Stabilität der Proben im Laufe der Zeit. Die Qualitätskontrolle wird sowohl an den historischen als auch an den neuen Sammlungen biologischer RD-Proben durchgeführt, um den Versuchserfolg und die zuverlässige Interpretation der Ergebnisse zu maximieren. Die Proben-QC liefert wertvolle Informationen, um frühzeitig vorbeugende oder korrigierende Maßnahmen zu ergreifen, Kosten zu sparen und das Risiko experimenteller Fehler zu verringern. Für eine bessere Standardisierung zwischen RD-Biobanklaboren werden die am besten geeigneten Werkzeuge (Marker und Assays) definiert, die zur Bewertung voranalytischer Variationen sowohl für flüssige als auch für feste Gewebeproben verwendet werden können. Daten zu biologischen Proben und klinische Informationen zu den Proben werden mithilfe einer gemeinsamen Datenbank gesammelt. Ziel ist es, die Kommunikationsregeln zwischen RD-Biobanken auf der Ebene der Informationen über den Spender zu harmonisieren und zu standardisieren sowie den Standort und den Zugang zur Probe zu erleichtern. Um diese Probleme anzugehen, wird ein Kommunikationsprotokoll gemäß MIABIS entwickelt, das die Mindestinformationen enthält, die zur Initiierung von Kooperationen zwischen Biobanken und zur Ermöglichung des Austauschs biologischer Proben erforderlich sind. Um die Harmonisierung der verschiedenen Biobanken im Netzwerk zu erleichtern, werden außerdem gemeinsame Vorschriften sowie grundlegende ethische und rechtliche Dokumente erarbeitet. Darüber hinaus wird eine Website des Biobank-Netzwerks erstellt, um die Sichtbarkeit des Tools zu erhöhen und alle erarbeiteten Dokumente zu teilen. Die Website wird eine „virtuelle Biobank“ umfassen, einen Online-Katalog der in den Biobanken gespeicherten biologischen Proben. Die virtuelle Biobank wird Forschern schnell und effizient dabei helfen, Bioproben zu finden, die sich in verschiedenen Biobanken befinden, und die transparente gemeinsame Nutzung von Bioressourcen fördern, um nationale und internationale Kooperationen zu erleichtern. Spezifisches Ziel: 3. Modernisierung von RD-Biobanken und Schaffung neuartiger RD-Biobanken. Die bereits bestehenden RD-Biobanken im Netzwerk werden hinsichtlich der Anzahl der gesammelten Proben und der Organisation der Probensammlungen gemäß den gemeinsamen SOPs implementiert. Alle Proben werden mit relevanten persönlichen und gesundheitlichen Informationen verknüpft, einschließlich Gesundheitsakten, Familiengeschichte und Lebensstil. Sie werden durch Genomdatenanalyse weiter charakterisiert und der Phänotyp regelmäßig durch Nachuntersuchungen aktualisiert. Es werden neuartige Biobanken eingerichtet, die sich dem biologischen Material und den damit verbundenen Daten von Personen widmen, die Mutationen der Huntington-Krankheit (HD), des Marfan-Syndroms (MS), des hereditären Angioödems (HAE) und der angeborenen Herzkrankheiten (KHK) tragen. Die Huntington-Krankheit ist eine seltene genetische neurodegenerative Erkrankung, von der heute einer von über 10.000 Menschen in Europa betroffen ist. In Italien sind mehr als 6.000 Menschen von der Krankheit betroffen, und etwa 40.000 Menschen gelten als „gefährdet“, später im Leben Symptome zu entwickeln. Obwohl die Störung gut untersucht und charakterisiert ist, muss noch viel über die Vielfalt der Symptome bei Patienten selbst innerhalb derselben Familie untersucht werden. In diesem Zusammenhang sind das Zentrum für seltene Krankheiten des IRCCS Neuromed und das Untà Ricerca e Cura Huntington e Malattie Rare des IRCCS CSS beide als Referenzzentren für die Krankheit auf nationaler und internationaler Ebene anerkannt. Die LIRH Foundation ist ein europäisches HD-Netzwerk, das mit Huntington-Familienorganisationen im ganzen Land verbunden ist. Durch die Zusammenarbeit wird die Sammlung klinischer Daten gewährleistet, die nach Krankheitsstadium und Herkunft der Proben aus ganz Italien geschichtet werden. MS ist eine seltene genetische Erkrankung, die bei etwa 1 von 5.000 Menschen auftritt und durch eine Mutation in einem Gen namens FBN1 verursacht wird. MS beeinträchtigt das Bindegewebe, schädigt jedoch die Blutgefäße, das Herz, die Augen, die Haut, die Lunge sowie die Knochen der Hüften, der Wirbelsäule, der Füße und des Brustkorbs. Einige MS-Komplikationen können sehr schwerwiegend sein, wie zum Beispiel ein Aneurysma (Ausbuchtung) der Aorta. HAE ist eine seltene genetische Erkrankung, die durch unvorhersehbare, wiederkehrende Episoden von Haut- und Schleimhautschwellungen gekennzeichnet ist, die am häufigsten durch einen C1-Inhibitor-Mangel verursacht werden. Die Prävalenz von HAE wird auf etwa 1 von 50.000 Menschen weltweit geschätzt. IRCCS Policlinico San Donato ist Mitglied des ERN Guard Heart-Netzwerks, Mitglied von ITACA (Italienisches Netzwerk für hereditäre und erworbene Angioödeme) und Sitz des Cardio Vascular Genetics Centre. Die Einrichtung spezieller Biobanken wird ein innovatives und wertvolles Instrument zur Erforschung von Genotyp-Phänotyp-Korrelationen und molekularen Mechanismen sein, die einer so großen Variabilität zugrunde liegen. Die Einrichtung dieser neuartigen RD-Biobanken wird erhebliche Auswirkungen auf die nationale und internationale Wettbewerbsfähigkeit der italienischen biomedizinischen Forschung haben. Der Vorteil der Einrichtung dieser Art von Biobanken besteht darin, dass für jeden einzelnen Probanden im Laufe der Zeit während des Krankheitsverlaufs mehrere biologische Proben gesammelt werden können. Die Funktion der Scattered RD Biobank als Forschungsressource stellt die Prozesse und Praktiken für Rekrutierung, Teilnahme und Engagement in Frage. Die Rolle der Biobank-Teilnehmer ist nach der ersten Registrierung und Probenentnahme oft passiv. Um jedoch die Transparenz zu verbessern und die Vertrauenswürdigkeit der Biobanken des Netzwerks zu demonstrieren, werden die Teilnehmer über das anfängliche persönliche Gespräch hinaus aktiv in interaktivere Dialoge mit den Forschungsteams eingebunden. Da Biobanking als Dienstleistung für Patienten betrachtet wird, wird eine Zusammenarbeit zwischen RD-Biobanken des Netzwerks und Patientenorganisationen definiert, die spezielle Treffen, runde Tische und Fokusgruppen fördern. Eine enge Zusammenarbeit zwischen RD-Biobanken und Patientenorganisationen wird auch von entscheidender Bedeutung sein, um die Integration von in Biobanken gespeicherten Probendaten und in Registern oder klinischen Datenbanken gespeicherten klinischen Daten zu erreichen.

WP1. Hub&Spoke-Modell. Die Scattered RD-Biobank wird nach einem bidirektionalen Hub&Spoke-Modell als Netzwerk bestehender und neuer dedizierter Biobanken geschaffen, die sich hauptsächlich auf kardiovaskuläre und neurologische RDs konzentrieren. Das Modell wird zwei Hauptzentren umfassen, den Northern Hub und den Southern Hub, die bereits Erfahrung im Aufbau von Biobank-Netzwerken haben. Die Ziele dieser Hauptzentren werden sein: 1. Koordinierung der Erstellung der Scattered RD-Biobank durch Standardisierung und Harmonisierung aller Verfahren des Biobanking-Prozesses.

Es werden Standardarbeitsanweisungen (SOPs) für Sammlung, Verarbeitung und Lagerung, Qualitätskontrollmanagement, Ethical Legal Social Issue (ELSI) und eine einheitliche Governance geschaffen, da Biobanken als eine Einheit agieren. 2. Verwaltung und Erleichterung der Verbindung verschiedener Biobanken und RD-Referenzzentren, die geografisch über das ganze Land verteilt sind. In regelmäßigen Abständen werden virtuelle und Präsenztreffen zwischen den Vertretern der Biobanken und der RD-Referenzzentren organisiert. 3. Als Referenzbiobanken für über das gesamte Gebiet verstreute RD-Referenzzentren zu fungieren, die nicht über die Möglichkeit verfügen, Proben und Daten für Forschungsstudien zu sammeln, oder für RD-Referenzzentren, die bereits Proben und Daten gesammelt haben, aber nicht über eine moderne, definierte Biobank verfügen möchten Teil der Scattered RD-Biobank sein.

OU1 wird die Referenzbiobank der RD-Referenzzentren in Norditalien und OU3 der RD-Referenzzentren in Mittel- und Süditalien sein. 4. Koordinierung der Erstellung eines Bioproben-Inventarkatalogs für Proben/Datensammlungen, die bereits in den Biobanken des Netzwerks vorhanden sind. Es wird ein Fragebogen erstellt und an die an diesem Projekt teilnehmenden Einheiten sowie an die neuen Biobanken oder RD-Referenzzentren weitergegeben, die Teil des Netzwerks werden möchten. Die Fragen beziehen sich sowohl auf Informationen zu den Biobank-Infrastrukturen und -Einrichtungen der Institution, in der die Sammlung gelagert wird, als auch auf die historischen Proben/Datensammlungen (SOPs, die für die Sammlung, Verarbeitung und Lagerung entwickelt und verwendet werden, Art der Proben und der damit verbundenen gesammelten Daten, Anzahl der Proben). beteiligte Patienten, verwendete ethische und rechtliche Dokumente, Qualitätssicherungsrichtlinien). Darüber hinaus sieht das bidirektionale Modell vor, dass jede Einheit ein zentraler Knotenpunkt für historische und neue Sammlungen von SE-Patienten ist, die sich an ihre eigene Einrichtung/ihr eigenes Zentrum wenden, und außerdem als Sprecher des Netzwerks fungiert. Jede Einheit sammelt und speichert neue biologische Proben und zugehörige Daten von Patienten mit seltenen Krankheiten und Syndromen gemäß den SOPs und den ausgearbeiteten Richtlinien. Jede Einheit ist für ihre eigene Proben-/Datensammlung verantwortlich und verwaltet diese gemäß der Netzwerk-Governance.

WP2. Qualitätshandbuch: i) Verfahren zur Probenverarbeitung (z. B. Aliquotierung, Lagerung und Qualitätskontrolle), Verbrauchsmaterialien, Ausrüstung, Instrumente, Reagenzien und Etiketten; ii) Verfahren zur Einholung der Einwilligung nach Aufklärung und zum Widerruf der Einwilligung der Teilnehmer; iii) Verwaltungsrichtlinien, einschließlich Zugangskontrolle, Backup-Systeme, klinische Anmerkungen, Dokumentenpflege und Archivierung; iv) Verfahren zum Teilen und Empfangen von Proben, einschließlich Methoden und Ausrüstung; v) Verfahren zur Kostenerstattung; vi) organisatorische Anforderungen (Governance).

WP2.1 SOPs für den Biobanking-Workflow gemäß offiziellen Richtlinien: 1. präanalytische Bedingungen (Sammlung, Erstverarbeitung, vorläufige Kryokonservierung von Derivaten, Langzeitlagerung, Tests), die für jede Art von Proben und Derivaten festgelegt werden; 2. Auswahl des Typs des primären Sammelbehälters (Antikoagulans, Konservierungsmittel) und der QR-codierten Kryoröhrchen; 3. Bestimmung der Anzahl und des Volumens der Probenaliquots; 4. Verfahren zur Verteilung der Proben durch zertifizierte Transportunternehmen.

WP2.2. Governance mit Unterstützung eines Datenschutzanwalts, der sich mit der rechtlichen Verwaltung von Biobanken befasst: 1. Probenzugriffsrichtlinie, um Forschern einen einfachen und transparenten Mechanismus für den Zugriff auf und die gemeinsame Nutzung von Proben zu bieten; 2. Der Lenkungsausschuss (PIs, Manager von Biobanken und RD-Referenzzentren, Vertreter von Patientenorganisationen) prüft alle Anfragen nach Proben und zugehörigen Daten und schlägt eine Genehmigung, Ablehnung oder einen Aufschub vor. 3. Material Data Transfer Agreement (MDTA), um: i) die Bedingungen zu regeln, unter denen die Proben/Daten verwendet werden können; ii) die Art der zu übertragenden Proben/Daten, den Zweck der Übertragung sowie alle Einschränkungen oder Verpflichtungen im Zusammenhang mit der Verwendung der Proben und Daten darlegen; 4. ELSI-Fragen zum Schutz von Biobank-Spendern und ihrer personenbezogenen Daten: i) Erstellung einer Einverständniserklärung gemäß der EU-DSGVO, um den Spendern ausreichende Informationen über Vorteile/Risiken des Proben-Biobankings anzubieten und ihnen die Möglichkeit zu geben, die Einwilligung zu widerrufen, um ihnen zu versichern, dass ihre Proben und Daten vor Missbrauch geschützt, sicher aufbewahrt und für Forschungszwecke verwendet werden. WP2.3. QMS: 1. Qualitätssicherung garantiert durch das Qualitätshandbuch, durch die Definition aller Nichtkonformitäten von Primärproben oder Derivaten (z. B. hämolytisches oder lipämisches Blut, Vorhandensein von Blutgerinnseln) und durch die Rückverfolgbarkeit der Probe und zugehöriger Informationen; 2. Die Qualitätskontrolle von Proben zur objektiven Beurteilung der Probenqualität und zur Validierung des Probenverwaltungsprozesses wird gewährleistet durch: i) absolute Bewertung der Probenqualität; ii) Eignungstest. QC-Analysen an neuen und historischen Proben werden zentralisiert, um die Konsistenz der Prozesse sicherzustellen, Tools und Best Practices auszutauschen, den Qualitätsbemühungen eine gewisse Autonomie zu verleihen und ein starkes Qualitätssystem bereitzustellen. WP3. Zentralisierte Datenbank zur Verbesserung der Verwaltung der in jeder Biobank gesammelten Proben, basierend auf einer Integration zwischen jeder Biobank-Datenbanksoftware und der zentralisierten Datenbanksoftware. Ein Mindestdatensatz, der gemäß Minimum Information About Biobank Data Sharing (MIABIS) erstellt wurde, definiert: i) die Biobank, in der die Proben gelagert werden; ii) die Probensammlung; iii) Einzelheiten zu Proben (z. B. Probentyp, Lagertemperatur, anatomische Lage); iv) Probenspender (z. B. Geburtsdatum, Geschlecht); v) Ereignis im Zusammenhang mit der Probe oder dem Spender (z. B. Alter bei Probenahme, Krankheitsontologie, Krankheitsdiagnose). WP4. Website zur Erhöhung der Sichtbarkeit der Biobanken und zur gemeinsamen Nutzung aller Dokumente: i) öffentlicher Bereich, der allen Bürgern zugänglich ist und allgemeine Netzwerkinformationen und Kontakte, Neuigkeiten, organisierte Veranstaltungen und Studienergebnisse enthält; ii) Katalog des gespeicherten biologischen Materials, um Forschern anderer Institutionen bei der Suche nach interessierenden Proben zu helfen; iii) Ein reservierter Login-Bereich, der nur Vertretern jeder Biobank des Netzwerks zugänglich ist. Die Erstellung wird von einer Agentur durchgeführt, die auf Webdesign und die Entwicklung von Biobank-Websites spezialisiert ist.

WP5. Historische Sammlungen werden gemäß den in diesem Projekt beschriebenen Aktivitäten umgestaltet und neu organisiert, um den Bioproben-Inventarkatalog zu erstellen, der eine Liste aller Bioproben und zugehörigen Daten bereitstellen soll, die bereits in den Biobanken gespeichert sind. Darüber hinaus werden RD-Biobanken die Anzahl ihrer Proben und die damit verbundenen Daten implementieren und neue Proben/Daten gemäß den Scattered RD Biobank SOPs sammeln, die generiert und mit den Partnern geteilt werden.

WP5.1. Basierend auf den Erfahrungen bereits bestehender italienischer RD-Biobank-Netzwerke wird die Scattered RD-Biobank die aktive Beteiligung von Patientenorganisationen am Aufbau dieses Biobank-Netzwerks fördern, da es einen grundlegenden Dienst für Patienten darstellen wird. Es werden spezielle Treffen und Rundtischgespräche unter Beteiligung von Biobankern, Forschern, Vertretern von SE-Patientenorganisationen, Patienten und Angehörigen organisiert, um die erstellten Biobankdokumente zu Richtlinien und Verfahren, einschließlich solcher zu ELSI-Themen, zu diskutieren und auszutauschen. Darüber hinaus werden Treffen mit Experten verschiedener Biobanking-Aspekte (medizinische Fachkräfte, Bioethiker, DPO-Anwälte) organisiert, um ethische und rechtliche Themen wie Datenschutz, Einwilligung nach Aufklärung, Widerruf der Einwilligung, Proben- und Datenzugriff, Rückgabe von Ergebnissen und Zufallsbefunden usw. zu diskutieren Hier haben die Patienten und ihre Angehörigen die Möglichkeit, ihre Meinungen, Bedürfnisse und Erwartungen zu äußern. Darüber hinaus werden Fokusgruppen mit erfahrenen Mediatoren organisiert, um die Meinungen, Kenntnisse, Wahrnehmungen und Bedenken der Teilnehmer in Bezug auf Biobanking zu untersuchen.

DATENERFASSUNG UND -VERWALTUNG. Der Mindestdatensatz an Standardattributen definiert Biobank- und biologische Probeninformationen (z. B. die Biobank, in der die Proben gelagert werden, Probensammlung, Probentyp, Lagertemperatur, anatomische Stelle) und Spenderinformationen (z. B. Geburtsdatum, Geschlecht, Alter bei der Probenahme, Krankheitsontologie, Krankheitsdiagnose). Alle Daten werden in der Datenbanksoftware aufgezeichnet, die bereits in den Einheiten vorhanden ist. In jedem RD-Referenzzentrum wird die Datenerfassung unter der Aufsicht des Biobank-Managers und des PI durchgeführt, die für den Schutz der Datensicherheit und des Datenschutzes gemäß den institutionellen Richtlinien verantwortlich sind. Alle Spender und zugehörigen Proben/Daten werden mit einem alphanumerischen Code pseudonymisiert. Der Mindestdatensatz jeder Biobank wird an ein zentralisiertes Datenbanksystem weitergeleitet, das auf einer Integration zwischen jeder Biobank-Datenbanksoftware und der zentralisierten Datenbanksoftware basiert. Diese Integration basiert auf der Datenfreigabe über API und basiert auf einem TLS-verschlüsselten Protokoll. Aufgrund der Projektdauer wird diese Integration für die vier an diesem Projekt beteiligten Einheiten implementiert, um die Architektur aufzubauen und zu testen, die in zukünftigen Projekten auf alle Biobanken ausgeweitet werden könnte. In Bezug auf die vorherigen Sammlungen werden die Daten entsprechend dem generierten Mindestdatensatz neu organisiert.

BIOLOGISCHE PROBEN. Neue biologische Proben werden gemäß den SOPs gesammelt, verarbeitet, gelagert und weitergegeben. Die Art der gesammelten Proben hängt von den Forschungsprojekten ab (Vollblut und Derivate, FFPE oder gefrorenes Gewebe).

Die Proben werden in ein definiertes Volumen und eine definierte Anzahl von Aliquots aufgeteilt und bei den Biobank-Partnern gelagert. Bezüglich der historischen Sammlung wird ein Bioproben-Inventarkatalog erstellt und die Beschreibung aller für die Sammlung verwendeten Verfahren (SOPs, probenbezogene Daten, ethische und rechtliche Dokumente) wird auf jede Probe und jede Daten bezogen.

BEISPIELQUALITÄTSKONTROLLEN. 1. Absolute Beurteilung der Qualität von Proben. Blutprobenderivate: Vorhandensein von Hämoglobin im Plasma oder Serum, Vorhandensein von Zellen oder Zelltrümmern im Plasma oder Serum, Vorhandensein von Blutplättchen im Plasma ohne Blutplättchen, zytofluorimetrische Analyse der PBMC. Gewebe: Histologische Analyse von mit Gewebe gefärbten Objektträgern zur Überprüfung der Gewebearchitektur, Zellmorphologie und Schärfe. Nukleinsäureproben: Die Reinheit wird aus dem Verhältnis der mit einem Spektrophotometer gemessenen Absorption der Nukleinsäure zur Absorption der Verunreinigungen berechnet. Typische Anforderungen für A260/A280-Verhältnisse sind 1,8 bis 2,2; A260/A280 von reiner DNA beträgt ~1,8 und A260/A280 von reiner RNA beträgt ~2. Die DNA/RNA-Integrität wird durch Kapillarelektrophoresetechniken bewertet und durch die DNA/RNA-Integritätszahl DIN/RIN dargestellt (wobei 1 stark abgebaute DNA/DNA anzeigt). RNA und 10 steht für hochintakte DNA/RNA). 2. Eignungstest. Analyse spezifischer Marker, die an der Charge der Studienproben durchgeführt wird, um die Eignung der Proben für ihren Zweck zu beurteilen, da eine Probe für eine Art von Analyse (z. B. Antikörperanalyse) von ausreichend hoher Qualität sein kann, für andere Arten jedoch nicht Analysen (z. B. Metabolitenanalyse). Die Qualitätskontrolle der Proben wird sowohl bei historischen als auch bei neuen Proben zufällig ausgewählter Proben durchgeführt. Wenn die Qualität die vordefinierten Kriterien nicht erfüllt, werden Korrekturmaßnahmen durchgeführt, bevor mit dem Biobanking fortgefahren wird, um einen robusten und reproduzierbaren Prozess sicherzustellen. Was die historischen Sammlungen betrifft, so werden die Auswirkungen von Gefrier-Tau-Zyklen und unterschiedlichen Handhabungsbedingungen vor der Lagerung bewertet und Proben, die die Qualitätskontrollstandards nicht erfüllen, werden nicht berücksichtigt. Es werden Intra-Biobank-QC-Proben durchgeführt, um das QM der einzelnen Biobank-Proben zu überprüfen und Unterschiede zwischen separaten Studien zum gleichen Probentyp zu bewerten. Außerdem werden Interbiobank-QC-Proben durchgeführt, um das QM jeder Biobank zu überprüfen und Unterschiede zwischen den einzelnen Personen zu bewerten Biobanken der Scattered RD Biobank.

STATISTISCHER PLAN. In diesem Projekt werden Proben und Daten gesammelt, die in der Scattered RD Biobank gespeichert werden. An den Proben werden keine biologischen Analysen durchgeführt und es werden keine systematischen Untersuchungen, Interpretationen und Synthesen der gesammelten klinischen Daten durchgeführt, um aussagekräftige Schlussfolgerungen zu ziehen. Zur Überwachung des Biobanking-Prozesses wird eine deskriptive statistische Analyse der Daten durchgeführt. Die deskriptive statistische Analyse wird als Mittelwert (Standardabweichung) oder Median (Bereich, Interquartilbereich) für kontinuierliche Variablen und als absolute und relative Häufigkeit für kategoriale Variablen ausgedrückt. Vergleiche zwischen zwei unabhängigen Gruppen werden durch einen ungepaarten T-Test oder eine Wilcoxon-Summe durchgeführt Rangtest ggf.

Inferenzverfahren (Hypothesentests und Konfidenzintervalle) und Regressionsmodelle werden je nach Zweck der jeweiligen spezifischen Analyse ebenfalls ordnungsgemäß angewendet. Qualitätskontrolle. Eine Stichprobengröße von 325 aus einer Charge von 2000 ermöglicht die Bewertung von 5 % des Risikos einer Ablehnung der Probe und von 5 % des Risikos der Annahme einer nicht konformen Probe, basierend auf einem akzeptablen Qualitätsniveau von 5 % und einem Grenzqualitätsniveau von 2 %. Die Annahmeschlusszahl ist 8.

ERWARTETE ERGEBNISSE. 1. Einrichtung der Scattered RD Biobank durch i) Harmonisierung und Standardisierung des Biobanking-Prozesses der Biobanken des Netzwerks; ii) die Erstellung des Qualitätshandbuchs der Scatterd RD Biobank, das SOPs für die Sammlung, Vorbereitung, Lagerung und Verteilung des biologischen Materials/der biologischen Daten, gemeinsame Vorschriften und grundlegende ethische und rechtliche Dokumente (z. B. Einwilligung nach Aufklärung (MDTA) und das Qualitätsmanagementsystem; iii) die Schaffung einer zentralen Datenbank mit einem Mindestdatensatz. 2. Entwicklung von Qualitätskontrollsystemen (QC) für biologische Proben, um die Erstellung hochwertiger Sammlungen sicherzustellen. QC-Systeme umfassen spezifische Tests und Analysen, die an biologischen Proben durchgeführt werden, und die Definition von Grenzwerten für die Aufnahme historischer oder neuer Sammlungen in die Scattered RD Biobank. 3. Erstellung eines Bioproben-Inventarkatalogs mit Proben/Daten, die von den einzelnen Biobanken vor der Einrichtung des Netzwerks gesammelt wurden, was eine bessere Verwaltung und Aufwertung historischer Sammlungen ermöglicht. Dies führt zu einer Erhöhung der Nutzungsraten der gesammelten Proben/Daten und einer Verringerung der gelagerten Probenmengen. Die Biobanken des Netzwerks werden bei der Speicherung ihrer Daten selektiver vorgehen und so den Übergang von einem Biobankmodell, das überwiegend auf retrospektiven Proben vordefinierter Proben basiert, zu einer prospektiveren, von Forschern gesteuerten Sammlung unterstützen, um die Kosten für doppelte Sammlungen zu senken. 4. Erhöhen Sie die Sichtbarkeit von Biobanken durch die Schaffung einer Website des Netzwerks, um den Austausch gesammelter Proben/Daten zu verbessern und den Zugang von Biobanken und RD-Referenzzentren zu nationalen und internationalen Forschungsprojekten zu erleichtern. Auf der Website finden potenzielle Stakeholder die „virtuelle Biobank“ der Scattered RD Biobank mit dem Katalog der biologischen Proben des Netzwerks.

5. Etablierung der Zusammenarbeit zwischen Patientenorganisationen und der Scattered RD Biobank dank formeller Vereinbarung. Die effektive Zusammenarbeit zwischen Patienten und der wissenschaftlichen Gemeinschaft ist für die Stärkung des Bewusstseins und des Vertrauens sowie für die gemeinsame Nutzung von Zielen und Bemühungen zur Unterstützung der Forschung zu RD von entscheidender Bedeutung Sie sind noch nicht Teil eines Netzwerks und stellen eigenständige Sammlungen dar, ohne dass eine Richtlinie für den grenzüberschreitenden Austausch von Proben oder spezifische Arbeitsabläufe implementiert sind, um die Qualität der biologischen Probe und der damit verbundenen gesammelten Daten zu gewährleisten. Werden Sie Teil der Scattered RD Biobank und helfen Sie diesen Biobanken, sich von einer Biobank, die sich auf die Anzahl der gesammelten Proben konzentriert, zu einer Biobank zu entwickeln, die sich auf die Qualität von Bioproben und Daten konzentriert.

RISIKOANALYSEN. Dieses zweijährige Forschungsstipendium wird die Kosten für den Aufbau der Scatterd RD Biobank und den Aufbau von Infrastrukturen decken. Allerdings ist die Scattered RD Biobank ein langfristiges Projekt, das eine langfristige wirtschaftliche Nachhaltigkeit erfordert. Die Biobanken-Partner dieses Netzwerks befinden sich in wissenschaftlichen Einrichtungen, die die finanzielle Deckung grundlegender Aktivitäten wie der Wartung von Geräten und der Stromrechnungen, z. für Strom und Gase, die größtenteils von den Gefrieranlagen verbraucht werden. Allerdings könnte die wirtschaftliche Nachhaltigkeit der Scatterd RD Biobank aufgrund der Wartungskosten einen Engpass darstellen. Managementlösungen für die langfristige Nachhaltigkeit des Netzwerks sollten sein: i) Zugang zu nationalen und internationalen Finanzierungsmechanismen für RD-Projektzuschüsse; ii) Kostendeckungsverfahren für die Probengewinnung, -lagerung und -handhabung einzuführen. Tatsächlich machen die Kosten für den Erwerb, die Beschaffung, die Verarbeitung, die Lagerung und die Konservierung von Bioproben einen erheblichen Teil der Gesamtkosten einer Biobank aus; (iii) die Anzahl der verteilten Proben zu erhöhen.

Die Rate der Probenspeicherung sollte nicht schneller wachsen als die Nutzungsrate; iv) mit verschiedenen Arten von Interessengruppen zusammenzuarbeiten, wie etwa Patientenverbänden und Spendern, Krankenhäusern und Ärzten, Forschern, der öffentlichen Verwaltung und Wohltätigkeitsorganisationen; v) Verbesserung des Verständnisses für den Nutzen von Biobanken für Wirtschaft und Gesellschaft, da Biobanken eine zentrale Rolle bei der Verbesserung der Patientendiagnose und der therapeutischen Versorgung und damit der Verbesserung öffentlicher und privater Mittel spielen.

Die Entwicklung einer verstreuten RD-Biobank ist aufgrund der Heterogenität der Biobanken/RD-Referenzzentren bei Proben und Datenerfassung nicht trivial. Es sollten harmonisierte Richtlinien erstellt werden, um historische und neue Proben-/Datensammlungen im Hinblick auf Biobankverfahren, Datenschutz, Proben-/Datenaustausch und Datenbanken zu organisieren. Datenbanksoftware wie Biobank-Informationsmanagementsysteme (BIMS), harmonisierte Dienste und gemeinsame Ontologien (MIABIS) sollten verwendet werden, um die Interoperabilität von Daten und Probensammlungen zu ermöglichen. Die Qualität von Biobanken hängt maßgeblich von der Arbeit des entsprechend geschulten Personals ab, das für die Aufnahme, Verarbeitung und Speicherung von Bioproben und zugehörigen Daten verantwortlich ist. Das Biobankpersonal muss eine gleichbleibende Probenqualität gewährleisten, die für den Erfolg der einzelnen Biobank und damit des Netzwerks von grundlegender Bedeutung ist. Die Rekrutierung von Personal für ein Projekt dieser Dimension ist von entscheidender Bedeutung, um das volle Potenzial auszuschöpfen, insbesondere für Biobanken, die die Rekrutierung von neuem Personal benötigen. Für den Erfolg des Netzwerkprojekts sollte eine einheitliche Schulung des technischen Personals bereitgestellt werden, da die Vernachlässigung der Schulungsmaßnahmen der Mitarbeiter die öffentliche Gesundheit schädigen kann und das Risiko einer Reputationsschädigung der Biobanken und der Gastinstitution birgt. Neue Mitarbeiter werden entsprechend geschult, bevor sie vollständig in das Arbeitsumfeld integriert werden und lernen in Form sorgfältig umgesetzter SOPs etwas über Teamarbeit, Personalsicherheit, Patientenschutz, Probenqualität und Best Practices.

Beim Aufbau eines Biobank-Netzwerks kommt der Harmonisierung eine Schlüsselrolle zu, allerdings müssen noch viele ethische und rechtliche Probleme gelöst werden. Experten für ethische und rechtliche Rahmenbedingungen sowie nationale Gesetzgebung werden eingeladen, sich am gesamten Prozess der Entwicklung von Biobank-Netzwerken zu beteiligen, um den Schutz der Spender zu gewährleisten und eine angemessene Verwendung ihrer Proben sicherzustellen.