Elszórt ritka betegségek biobankjai: a minta-/adatgyűjtés modellje fenntartható és megosztott kritériumokkal (SATELLITES)

Konkrét cél 1. Szórt RD Biobank létrehozása. Projektünk célja a Scattered RD biobank létrehozása egy új dedikált és már létező biobank hálózataként annak érdekében, hogy leküzdjük a RD biológiai mintahiányt, és magas színvonalú anyagokat tegyünk elérhetővé a jövőbeni, nemzeti és nemzetközi együttműködésben végzett együttműködési vizsgálatokhoz. A hálózat főként a szív- és érrendszeri és neurológiai betegségekre összpontosító biobankokat fog magában foglalni. Egy kétirányú Hub&Spoke modell szerint szervezik meg, amelyben minden RD biobank központosított központként szolgál a saját intézményükre/központjukra hivatkozó RD betegektől gyűjtött minták és adatok számára, valamint a hálózat többi RD biobankja számára. Mindegyik biobank központként fog szolgálni az olyan RD-betegek minta-/adatgyűjtésének központjaként, akik a területen szétszórtan más RD referenciaközpontokhoz fordulnak, és amelyek nem rendelkeznek a biobank modern definíciója szerint szervezett biobankkal. Ez a megközelítés kedvez az országon belül földrajzilag elterjedt különböző biobankok összekapcsolásának, és elkerüli a betegek migrációját az érdekek biobankja felé. Két fő csomópont kerül meghatározásra: az északi csomópont, amelyre az észak-olaszországi RD biobankok és RD referenciaközpontok hivatkoznak; valamint a déli csomópont, amelyre a közép- és dél-olaszországi RD biobankok és RD referenciaközpontok hivatkozni fognak. Létrejön egy Biospecimen Inventory katalógus, és az ezekhez a gyűjtésekhez használt összes eljárás leírása (SOP-k, mintához kapcsolódó adatok, etikai és jogi dokumentumok) minden mintához és adathoz kapcsolódik.

Konkrét cél 2. Harmonizáció, szabványosítás és hálózatirányítás. Az ISO 20387 szabvány szerint, amely a biobanki tevékenység általános követelményeit szemlélteti, szabványos működési eljárásokat (SOP) határoznak meg a gyakorlat (a biológiai anyagok, valamint a kapcsolódó információk és adatok gyűjtése, előkészítése, tárolása és elosztása) egységességének és szabványosításának biztosítása érdekében. biobank. A Scattered RD Biobankban gyűjtött RD betegek biológiai mintáit az Omics megközelítésekhez alkalmas RD biológiai minták gyűjtéséhez generált specifikus SOP-ok alapján nyerik. SOP-ok készülnek az analitikai folyamat minden szakaszára vonatkozóan, a begyűjtéstől a tárolásig, illetve a minták megosztásához. A Scattered RD Biobank biobank hálózatként való létrehozásához szigorú minőségirányítási rendszerre (QMS) van szükség, amely a laboratóriumok és a központok közötti eltérések minimalizálásához és az együttműködési projektekben kiosztandó minta minőségének garantálásához szükséges. A minőségbiztosítási rendszer a következőket tartalmazza: (1) Minőségbiztosítás a biobanki folyamat minden szakaszának szabványosítására, (2) Minőségellenőrzés (QC) a mintákon a mintakezelési folyamat validálása, a reprodukálható minőség és a tárolási eljárások megbízhatóságának biztosítása érdekében, valamint a minták időbeli stabilitása. Minőségellenőrzést végeznek mind a történelmi, mind az új RD biológiai minták gyűjteményein a kísérlet sikerének maximalizálása és az eredmények megbízható értelmezése érdekében. A minta minőségellenőrzése értékes információkat ad a megelőző vagy korrekciós intézkedések korai megtételéhez, így költséget takaríthat meg és csökkenti a kísérleti hibák kockázatát. Meghatározzák a legmegfelelőbb eszközöket (markerek és tesztek), amelyek felhasználhatók mind a folyékony, mind a szilárd szövetből származó minták analitikai eltéréseinek értékelésére a RD biobank laboratóriumai közötti jobb szabványosítás érdekében. A biológiai minták adatait és a mintáknak megfelelő klinikai információkat egy közös adatbázis segítségével gyűjtik össze. A cél a RD biobankok közötti kommunikáció szabályainak harmonizálása és szabványosítása a donorral kapcsolatos információk szintjén, valamint a minták helyének és hozzáférésének megkönnyítése. E problémák megoldása érdekében a MIABIS szerinti kommunikációs protokollt terveznek a biobankok közötti együttműködés kezdeményezéséhez és a biológiai minták cseréjéhez szükséges minimális információkhoz. A hálózat különböző biobankjainak harmonizációja érdekében közös szabályozások, valamint alapvető etikai és jogi dokumentumok is kidolgozásra kerülnek. Sőt, az eszköz láthatóságának növelése és az összes kidolgozott dokumentum megosztása érdekében a biobank hálózat honlapja is elkészül. A weboldal tartalmazni fog egy "virtuális biobankot", a biobankban tárolt biológiai minták online katalógusát. A virtuális biobank gyorsan és hatékonyan segíti a kutatókat a különböző biobankban található biominták megtalálásában, valamint elősegíti a bioerőforrások átlátható megosztását a nemzeti és nemzetközi együttműködések elősegítése érdekében. Konkrét cél 3. RD biobank korszerűsítése és újszerű RD biobankok létrehozása. A hálózatban már meglévő RD biobankokat a mintagyűjtés és a mintagyűjtések közös SOP-k szerinti szervezése tekintetében valósítják meg. Minden mintát összekapcsolnak a releváns személyes és egészségügyi információkkal, beleértve az egészségügyi feljegyzéseket, a családtörténetet és az életmódot. A genom adatok elemzésével és a fenotípus rendszeres frissítésével további jellemezni fogják őket. Új biobankokat hoznak létre és szentelnek a Huntington-kór (HD) mutációit, Marfan-szindrómát (MS), örökletes angioödémát (HAE) és veleszületett szívbetegségeket (CHD) hordozó alanyoktól származó biológiai anyagoknak és kapcsolódó adatoknak. A HD egy ritka genetikai neurodegeneratív állapot, amely ma Európában több mint 10 000 emberből egyet érint. A betegség Olaszországban több mint 6000 embert érint, és körülbelül 40 000 embert tekintenek „veszélyeztetettnek”, hogy későbbi életükben tüneteket okozzanak. Noha a rendellenességet jól tanulmányozták és jellemezték, még az azonos családon belüli betegek tüneteinek sokféleségét illetően még sok a vizsgálnivaló. E tekintetben az IRCCS Neuromed Ritka Betegségek Központja és az Untà Ricerca e Cura Huntington e Malattie Ritka IRCCS CSS a betegség nemzeti és nemzetközi szintű referenciaközpontjaként egyaránt elismert. A LIRH Foundation egy európai HD-hálózati oldal, amely a HD-családdal foglalkozó szervezetekkel áll kapcsolatban országszerte. Együttműködése garantálni fogja a klinikai adatok gyűjtését, amelyek a betegség stádiuma és az egész Olaszországból származó minták származása szerint rétegződnek. Az SM egy ritka genetikai állapot, amely 5000 emberből körülbelül 1-nél fordul elő, és az FBN1 nevű gén mutációja okozza. Az SM a kötőszövetet érinti, de károsítja az ereket, a szívet, a szemet, a bőrt, a tüdőt, valamint a csípő, a gerinc, a lábfej és a bordaív csontjait. Az SM egyes szövődményei nagyon súlyosak lehetnek, például az aorta aneurizma (dudor). A HAE egy ritka, genetikai eredetű betegség, amelyet a bőr- és nyálkahártya-duzzanat előre nem látható, visszatérő epizódjai jellemeznek, amelyeket leggyakrabban C1-inhibitor hiány okoz. A HAE prevalenciája világszerte 50 000 emberből körülbelül 1. Az IRCCS Policlinico San Donato tagja az ERN Guard Heart hálózatának, tagja az ITACA-nak (Olaszország örökletes és szerzett angioödéma hálózatának), valamint a Cardio Vascular Genetics Centre központjának. A dedikált biobankok létrehozása innovatív és értékes eszköz lesz a genotípus-fenotípus összefüggések és az ilyen nagy változatosság hátterében álló molekuláris mechanizmusok feltárására. Ezen újszerű RD biobankok létrehozása jelentős hatással lesz az olasz orvosbiológiai kutatás hazai és nemzetközi versenyképességére. Az ilyen típusú biobankok létrehozásának előnye, hogy lehetőség nyílik több biológiai minta gyűjtésére a betegség progressziója során minden egyes alany esetében. A Scattered RD Biobank mint kutatási erőforrás funkciója megkérdőjelezi a toborzás, a részvétel és a bevonódás folyamatait és gyakorlatait. A biobankban résztvevők szerepe gyakran passzív a kezdeti beiratkozás és mintavétel után. Az átláthatóság javítása és a hálózat biobankjainak megbízhatóságának bizonyítása érdekében azonban a résztvevők a kezdeti személyes beszélgetésen túl aktívan részt vesznek a kutatócsoportokkal folytatott interaktívabb párbeszédben. Tekintettel a biobank szolgáltatásra, mint a betegek számára nyújtott szolgáltatásra, a hálózat RD biobankjai és a Betegszervezetek közötti együttműködést célzott találkozók, kerekasztal-beszélgetések és fókuszcsoportok előmozdítása érdekében határozzák meg. A RD biobankok és a betegszervezetek közötti szoros együttműködés szintén kulcsfontosságú lesz a biobankokban tárolt mintaadatok és a regiszterekben vagy klinikai adatbázisokban tárolt klinikai adatok integrálása érdekében.

WP1. Hub&Spoke modell. A Scattered RD biobank a már meglévő és új dedikált biobank hálózataként jön létre, amely elsősorban a szív- és érrendszeri és neurológiai RD-kre összpontosít, a kétirányú Hub&Spoke modell szerint. A modell két fő központot tartalmaz majd, a Northern Hub-ot és a Southern Hub-ot, amelyek már rendelkeznek tapasztalattal a biobank-hálózatok kialakításában. E főbb központok céljai a következők lesznek: 1. A Scattered RD biobank létrehozásának koordinálása a biobanki folyamat összes eljárásának szabványosításával és harmonizációjával.

Szabványos működési eljárások (SOP) jönnek létre a gyűjtésre, feldolgozásra és tárolásra, a minőség-ellenőrzés menedzsmentjére, az Ethical Legal Social Issue-ra (ELSI) és az irányítás egységességére, mivel a biobankok egyetlen egységként fognak működni. 2. Az országon belül földrajzilag elterjedt különböző biobankok és RD Referencia Központok összekapcsolásának menedzselése és elősegítése. A biobankok és a RD Referencia Központok képviselői között rendszeres időközönként virtuális és jelenléti találkozókra kerül sor. 3. Referencia biobankként szolgálni a területen szétszórtan található RD Referencia Központok számára, amelyek nem rendelkeznek minta- és adatgyűjtési lehetőséggel kutatási vizsgálatokhoz, vagy olyan RD Referencia Központok számára, amelyek már gyűjtöttek mintákat és adatokat, de nem rendelkeznek modern, meghatározott biobankkal, szeretnének részesei lenni a Scattered RD biobanknak.

Az OU1 az észak-olaszországi RD Referenciaközpontok, az OU3 pedig a közép- és dél-olaszországi RD Referenciaközpontok referencia biobankja lesz. 4. A hálózat biobankjaiban már meglévő minták/adatgyűjtemények Biospecimen Inventory Katalógusának létrehozásának koordinálása. Kérdőívet készítenek, amelyet megosztanak a projektben részt vevő egységek, valamint az új biobankok vagy RD Referencia Központok között, amelyek részt kívánnak venni a hálózatban. A kérdések a gyűjteményt tároló intézmény biobanki infrastruktúrájára és létesítményeire, valamint a történeti mintákra/adatgyűjtésekre (a gyűjtésre, feldolgozásra és tárolásra kifejlesztett és használt szabványos működési eljárások, a minták típusa és a gyűjtött kapcsolódó adatok, a gyűjtött adatok száma, érintett betegek, a felhasznált etikai és jogi dokumentumok, minőségbiztosítási szabályzatok). Ezen túlmenően a kétirányú modell azt tervezi, hogy minden egység a saját intézményükre/központjukra hivatkozó RD-betegek történelmi és új gyűjteményeinek központosított központja lesz, és egyben a hálózat képviselője is lesz. Minden osztály új biológiai mintákat és kapcsolódó adatokat fog gyűjteni és tárolni a RD-s és szindrómás betegekről az SOP-knak és a kidolgozott szabályzatoknak megfelelően. Minden egység felelős a saját mintáiért/adatgyűjtéséért, és a hálózatirányításnak megfelelően kezeli azokat.

WP2. Minőségi kézikönyv: i) a minták feldolgozásának eljárásai (pl. alikvot felosztás, tárolás és minőségellenőrzés), kellékek, berendezések, műszerek, reagensek és címkék; ii. a résztvevők tájékozott hozzájárulásának megszerzésére és a hozzájárulás visszavonására vonatkozó eljárások; iii. kezelési szabályzatok, beleértve a hozzáférés-szabályozást, biztonsági mentési rendszereket, klinikai megjegyzéseket, dokumentumok karbantartását és archiválását; iv. a minták megosztására és fogadására vonatkozó eljárások, beleértve a módszereket és berendezéseket; v) költségtérítési eljárások; vi) szervezeti követelmények (irányítás).

WP2.1 SOP-ok a biobanki munkafolyamathoz a hatósági irányelvek szerint: 1. az egyes minták és származékok típusaira meghatározott előzetes analitikai feltételek (gyűjtés, kezdeti feldolgozás, származékok ideiglenes mélyhűtése, hosszú távú tárolás, tesztelés); 2. az elsődleges gyűjtőedény típusának kiválasztása (alvadásgátló, tartósítószer) és QR-kódos kriocsövek; 3. a minta alikvot részek számának és térfogatának meghatározása; 4. a minták minősített szállítótársaságok segítségével történő elosztására vonatkozó eljárások.

WP2.2. Irányítás adatvédelmi jogász szakértő támogatásával a legális biobank-kezelésben: 1. minta-hozzáférési politika, amely egyszerű és átlátható mechanizmust biztosít a kutatóknak a minták elérésére és megosztására; 2. Az Irányító Bizottság (PI-k, biobank és RD Referenciaközpont vezetői, betegszervezet képviselője) felülvizsgálja az összes minta- és kapcsolódó adatigénylést, és javaslatot tesz jóváhagyásra, elutasításra vagy halasztásra; 3. Anyagadat-átadási megállapodás (MDTA): i) szabályozza a minták/adatok felhasználásának feltételeit; ii) felvázolja a továbbítandó minták/adatok típusát, az átvitel célját, a minták és adatok felhasználásával kapcsolatos valamennyi korlátozást vagy kötelezettséget; 4. A biobank-donorok és személyes adataik védelmét szolgáló ELSI-kérdések: i) az EU GDPR szerinti Tájékoztatott Hozzájárulás megalkotása annak érdekében, hogy az adományozók elegendő információt nyújtsanak a minta biobank-kezelés előnyeiről/kockázatairól, lehetővé téve számukra a hozzájárulás visszavonását, hogy biztosítsák őket, hogy mintáikat és adataikat védik a visszaélésekkel szemben, biztonságosan tárolják és kutatási célokra használják fel. WP2.3. QMS: 1. Minőségbiztosítás, amelyet a Minőségügyi Kézikönyv, az elsődleges minták vagy származékok (pl. hemolitikus vagy lipémiás vér, vérrögök jelenléte), valamint a minta és a kapcsolódó információk nyomon követhetősége; 2. A minták minőségi ellenőrzése a minták minőségének objektív értékelése és a mintakezelési folyamat validálása érdekében a következők révén garantált: i. a minták minőségének abszolút értékelése; ii) alkalmassági vizsgálat. Az új és korábbi mintákon végzett minőségellenőrzési elemzések központosítva lesznek a folyamatok következetességének biztosítása, az eszközök és a legjobb gyakorlatok megosztása, valamint a minőségi erőfeszítések autonómiájának biztosítása, valamint az erős minőségbiztosítási rendszer biztosítása érdekében. WP3. Központi adatbázis az egyes biobankban gyűjtött minták adminisztrációjának javítására az egyes biobanki adatbázis-szoftverek és a központi adatbázis-szoftverek közötti integráció alapján. A Minimum Information About Biobank Data Sharing (MIABIS) szerint kialakított minimális adatkészlet meghatározza: i) a biobankot, ahol a mintákat tárolják; ii. a mintagyűjtés; iii) a minták részletei (pl. minta típusa, tárolási hőmérséklet, anatómiai hely); iv) mintaadó (pl. születési dátum, nem); v) mintával vagy donorral kapcsolatos esemény (pl. életkor a mintavételkor, betegségontológia, betegségdiagnózis). WP4. Weboldal a biobankok láthatóságának növelésére és az összes dokumentum megosztására: i) minden állampolgár számára elérhető nyilvános terület, amely általános hálózati információkat és elérhetőségeket, híreket, szervezett eseményeket, tanulmányi eredményeket tartalmaz; ii) a tárolt biológiai anyagok katalógusa, hogy segítse a másik intézmény vizsgálóit az érdeklődésre számot tartó minták megtalálásában; iii) bejelentkezési fenntartott terület, amelyhez csak a hálózat egyes biobankjainak képviselői férhetnek hozzá. Létrehozását egy webdizájnra és biobanki weboldalak fejlesztésére szakosodott ügynökség végzi majd.

WP5. A történeti gyűjteményeket a projektben leírt tevékenységeknek megfelelően átalakítják és átszervezik annak érdekében, hogy létrejöjjön a Biospecimen Inventory Katalógus, amely a biobankban már tárolt összes biominta és kapcsolódó adat listáját tartalmazza. Ezen túlmenően, a RD biobankok a mintáik számát és a kapcsolódó adataikat megvalósítják, új mintákat/adatokat gyűjtve a generált és a partnerekkel megosztott szétszórt RD Biobank SOP-k szerint.

WP5.1. A Scattered RD Biobank a már meglévő olasz RD biobank hálózatok tapasztalatai alapján elősegíti a Betegszervezetek aktív részvételét ennek a biobank-hálózatnak a létrehozásában, hiszen alapvető szolgáltatást jelent majd a betegek számára. Dedikált találkozókat és kerekasztal-beszélgetéseket szerveznek biobankárok, kutatók, RD betegszervezetek képviselői, betegek és hozzátartozók részvételével annak érdekében, hogy megvitassák és megosszák a biobank-dokumentumokat, amelyek az irányelvekről és eljárásokról készültek, beleértve az ELSI-kérdéseket is. Ezen túlmenően több biobanki vonatkozású szakértőkkel (egészségügyi szakemberek, bioetikusok, adatvédelmi tisztviselők jogászai) is találkozókat szerveznek, hogy megvitassák a magánélet védelmét, a tájékozott hozzájárulást, a hozzájárulás visszavonását, a mintákhoz és az adatokhoz való hozzáférést, az eredmények visszaküldését és a véletlenszerű megállapításokat, valamint az etikai és jogi témákat. ahol a betegek és hozzátartozóik lehetőséget kapnak véleményük, szükségleteik és elvárásaik kifejezésére. Fókuszcsoportokat is szerveznek szakértő mediátorokkal, hogy feltárják a résztvevők véleményét, tudását, felfogását és aggodalmait a biobankkal kapcsolatban.

ADATGYŰJTÉS ÉS KEZELÉS. A szabványos attribútumok minimális adatkészlete határozza meg a biobankkal és a biológiai mintákkal kapcsolatos információkat (például a biobankot, ahol a mintákat tárolják, a mintagyűjtést, a minta típusát, a tárolási hőmérsékletet, anatómiai helyet) és a donor információkat (pl. születési dátum, nem, életkor a mintavételkor, betegségontológia, betegség diagnózis). Minden adat az egységekben már meglévő adatbázisszoftverben kerül rögzítésre. Minden egyes RD Referencia Központban az adatgyűjtés a Biobank Manager és a PI felügyelete alatt történik, akik felelősek az adatbiztonság és a magánélet védelméért az intézményi szabályzatnak megfelelően. Az összes donort és a kapcsolódó mintát/adatot alfanumerikus kóddal álnéven látják el. Az egyes biobankok minimális adatkészlete egy központi adatbázis-rendszerbe áramlik, amely az egyes biobanki adatbázis-szoftverek és a központi adatbázis-szoftverek közötti integráción alapul. Ez az integráció az API TLS titkosított protokollon keresztüli adatszolgáltatáson alapul. A projekt időtartama miatt ezt az integrációt a projektben részt vevő négy egységben hajtják végre annak érdekében, hogy kiépítsék és teszteljék azt az architektúrát, amely a jövőbeni projektekben az összes biobankra kiterjeszthető. A korábbi gyűjtések esetében az adatok a minimálisan generált adatsor szerint kerülnek átrendezésre.

BIOLÓGIAI MINTÁK. Az új biológiai minták gyűjtése, feldolgozása, tárolása és megosztása az SOP-k szerint történik. A begyűjtött minták típusai a kutatási projektektől függenek (teljes vér és származékai, FFPE vagy fagyasztott szövetek).

A mintákat meghatározott térfogatú és számú alikvotokra osztják, és a biobank-partnerekben tárolják. A történeti gyűjtéssel kapcsolatban Biospecimen Inventory Katalógus készül, és a gyűjtéshez használt összes eljárás leírása (SOP, mintához kapcsolódó adatok, etikai és jogi dokumentumok) minden mintához és adathoz kapcsolódik.

MINTA MINŐSÉGELLENŐRZÉSEK. 1. A minták minőségének abszolút értékelése. Vérminta származékok: hemoglobin jelenléte a plazmában vagy szérumban, sejtek vagy sejttörmelék jelenléte a plazmában vagy szérumban, vérlemezke jelenléte a plazma thrombocyta mentesben, a PBMC citofluorimetriás analízise. Szövetek: szövetfestett tárgylemezek szövettani elemzése a szövetszerkezet, a sejtmorfológia és az élesség ellenőrzésére. Nukleinsavminták: a tisztaságot a spektrofotométerrel mért abszorbancia nukleinsav és a szennyező anyagok abszorbanciájának arányából számítják ki. Az A260/A280 arányok jellemző követelményei 1,8¿2,2; A tiszta DNS A260/A280 értéke ~1,8, a tiszta RNS A260/A280 értéke pedig ~2. A DNS/RNS integritását kapilláris elektroforézis technikákkal értékeljük, és a DNS/RNS integritási szám DIN/RIN képviseli (ahol az 1 erősen lebomlott DNS/ Az RNS és a 10 nagyon ép DNS/RNS). 2. Alkalmassági vizsgálat. A vizsgálati minták kötegén végzett specifikus markerek analízise a minták rendeltetésszerűségének felmérése érdekében, mivel egy minta elég jó minőségű lehet egy típusú elemzéshez (pl. antitest-analízis), de más típusú vizsgálatokhoz nem. elemzések (pl. metabolit elemzés). A minták minőségellenőrzése mind a múltbeli, mind az új gyűjtéseken, véletlenszerűen kiválasztott mintákon történik, és ha a minőség nem felelt meg az előre meghatározott kritériumoknak, akkor a biobankolás folytatása előtt korrekciós intézkedéseket hajtanak végre a robusztus és reprodukálható folyamat biztosítása érdekében. Ami a történelmi gyűjteményeket illeti, a fagyasztás-olvadás ciklusok és a különböző tárolás előtti kezelési feltételek hatását értékeljük, és a minőség-ellenőrzési előírásoknak nem megfelelő mintákat nem veszik figyelembe. Biobankon belüli minőségellenőrzési mintákat végeznek az egyes biobanki minták minőségi minőségének ellenőrzésére, az azonos típusú mintákon végzett különböző vizsgálatok közötti különbségek értékelésére, és biobank közötti minőségellenőrzési mintákat az egyes biobankok minőségi minőségének ellenőrzésére és az egyének közötti különbségek felmérésére. a Scattered RD Biobank biobankjai.

STATISZTIKAI TERV. Ebben a projektben mintákat és adatokat gyűjtenek, amelyeket a Scattered RD Biobankban tárolnak. A mintákon nem végeznek biológiai elemzéseket, és nem végzik el az összegyűjtött klinikai adatok szisztematikus vizsgálatát, értelmezését és szintézisét, hogy értelmes következtetéseket vonjanak le. Az adatok leíró statisztikai elemzésére kerül sor a biobanki folyamat nyomon követése érdekében. A leíró statisztikai elemzést a folytonos változók átlagában (szórás) vagy mediánban (tartomány, interkvartilis tartomány), a kategorikus változók abszolút és relatív gyakoriságában fejezzük ki. Két független csoport összehasonlítása párosítatlan T-próbával vagy Wilcoxon-összeggel történik rangpróba értelemszerűen.

A következtetési eljárásokat (hipotézisvizsgálat és konfidenciaintervallumok) és a regressziós modelleket is megfelelően alkalmazzák az egyes elemzések céljától függően. Minőségellenőrzés. A 2000-es tételből származó 325 mintaméret lehetővé teszi a minta elutasításának 5%-ának és a nem megfelelő minta elfogadásának 5%-os kockázatának értékelését az elfogadható 5%-os minőségi szint és a 2%-os korlátozó minőségi szint alapján. Az átvételi határérték 8.

VÁRHATÓ EREDMÉNYEK. 1. Szórt RD Biobank létrehozása i) a hálózat biobankjainak biobanki folyamatának harmonizálásával és szabványosításával; ii) a Scatterd RD Biobank Minőségügyi Kézikönyvének megvalósítása, amely tartalmazza a biológiai anyagok/adatok gyűjtésére, előkészítésére, tárolására és terjesztésére vonatkozó SOP-okat, közös előírásokat és alapvető etikai és jogi dokumentumokat (pl. tájékoztatáson alapuló beleegyezés, MDTA) és a minőségirányítási rendszer; iii) egy minimális adatkészlettel rendelkező központosított adatbázis létrehozása. 2. Minőségellenőrzési (QC) rendszerek fejlesztése biológiai mintákon a minőségi gyűjtemények létrehozása érdekében. A minőségellenőrzési rendszerek tartalmazzák a biológiai mintákon elvégzendő speciális teszteket és elemzéseket, valamint a küszöbértékek meghatározását a történelmi vagy új gyűjtemények Scattered RD Biobank-ban való elfogadásához. 3. Biospecimen Inventory Katalógus létrehozása az egyes biobankok által gyűjtött mintákból/adatokból a hálózat létrehozása előtt, amely lehetővé teszi a történeti gyűjtemények jobb kezelését és valorizálását. Ez az összegyűjtött minták/adatok felhasználási arányának növekedéséhez és a tárolt minták mennyiségének csökkenéséhez vezet. A hálózat biobankjai szelektívebbek lesznek a tárolt adatok tekintetében, elősegítve az átmenetet a többnyire előre meghatározott minták retrospektív mintáin alapuló biobanki modellről egy leendőbb, kutató által vezérelt gyűjteményre, hogy csökkentsék a párhuzamos gyűjtések költségeit. 4. Növelje a biobankok láthatóságát, létrehozva a hálózat weboldalát a minták/adatok megosztásának javítása, valamint a biobankok és a RD Referencia Központok nemzeti és nemzetközi kutatási projektekhez való hozzáférésének megkönnyítése érdekében. A honlapon a potenciális érintettek megtalálhatják a Scattered RD Biobank ¿virtuális biobankját¿ a hálózat biológiai mintáinak katalógusával.

5. A Betegszervezetek és a Scattered RD Biobank közötti együttműködés kialakítása formális megállapodásnak köszönhetően. A betegek és a tudományos közösség közötti hatékony együttműködés elengedhetetlen a tudatosság és a bizalom növeléséhez, valamint a 6. ritka betegségekkel kapcsolatos kutatás támogatására irányuló célok és erőfeszítések megosztásához. Azonosítsa és vonja be a szétszórt RD Biobankba azokat a kis biobankokat, amelyek még nem részei egyetlen hálózatnak sem, és önálló gyűjtemények, amelyek nem szabályozzák a minták határokon átnyúló megosztását vagy a biológiai minta és a kapcsolódó adatok minőségének garantálása érdekében meghatározott munkafolyamatokat. összegyűjtötték. A Scattered RD Biobank részese lesz ezeknek a biobanknak, hogy a begyűjtött minták számát figyelembe vevő biobankból a biominták és adatok minőségére összpontosító biobankká fejlődjenek.

KOCKÁZATELEMZÉSEK. Ez a kétéves kutatási támogatás fedezi a Scatterd RD Biobank létrehozásának és az infrastruktúrák beindításának költségeit. A Scattered RD Biobank azonban egy hosszú távú projekt, amely longitudinális gazdasági fenntarthatóságot igényel. A hálózat biobanki partnerei tudományos intézményeken belül helyezkednek el, amelyek biztosítják az alaptevékenységek anyagi fedezetét, így a berendezések karbantartását és a közüzemi számlákat, pl. villamos energia és gáz esetében, amelyeket nagyrészt a fagyasztórendszerek fogyasztanak el. A Scatterd RD Biobank gazdasági fenntarthatósága azonban szűk keresztmetszetet jelenthet a fenntartási költségek miatt. A hálózat hosszú távú fenntarthatóságát biztosító vezetői megoldások a következők: i. hozzáférés nemzeti és nemzetközi finanszírozási mechanizmusokhoz a vidékfejlesztési projektek támogatására; ii. költségmegtérülési eljárások bevezetése a mintavételhez, tároláshoz és kezeléshez. Valójában a biominta beszerzésének, beszerzésének, feldolgozási tárolásának és megőrzésének költségei a biobank összes kiadásának jelentős részét teszik ki; iii. a kiosztott minták számának növelése.

A minták tárolásának aránya nem nőhet gyorsabban, mint a felhasználási arány; iv. kapcsolatba lépni többféle érdekelt féllel, például betegszövetségekkel és donorokkal, kórházakkal és klinikusokkal, kutatókkal, közigazgatással és jótékonysági szervezetekkel; v. a biobank gazdaság és társadalom számára nyújtott előnyeinek jobb megértése, mivel a biobankok központi szerepet játszanak a betegek diagnózisának és terápiás ellátásának javításában, és ezáltal az állami és magánfinanszírozás növelésében.

A Scattered RD Biobank fejlesztése nem triviális a biobankok/RD Referencia Központok heterogenitása miatt a mintákban és az adatgyűjtésben. Harmonizált iránymutatásokat kell kidolgozni a történelmi és új minta-/adatgyűjtések szervezésére a biobanki eljárások, az adatvédelem, a minta-/adatmegosztás és az adatbázisok tekintetében. Adatbázisszoftvereket, például biobanki információkezelő rendszereket (BIMS), harmonizált szolgáltatásokat és közös ontológiákat (MIABIS) kell használni az adatok és mintagyűjtemények interoperabilitásának lehetővé tétele érdekében. A biobankok minősége jelentősen függ a megfelelően képzett személyzet munkájától, akik a biominták és a kapcsolódó adatok fogadásáért, feldolgozásáért és tárolásáért felelősek. A biobank személyzetének állandó mintaminőséget kell garantálnia az egyetlen biobank és így a hálózat sikeréhez. A személyzet toborzása egy ilyen dimenziójú projekthez kulcsfontosságú a potenciál teljes kiaknázásához, különösen azon biobankok esetében, amelyeknek új személyzetet kell toborozniuk. A hálózati projekt sikere érdekében harmonizált képzést kell biztosítani a műszaki személyzet számára, mivel az alkalmazottak képzési intézkedéseinek figyelmen kívül hagyása károsíthatja a közegészséget, és a biobankok és a fogadó intézmény hírnevének károsodásának kockázatával járhat. Az új alkalmazottak megfelelő képzésben részesülnek, mielőtt teljesen beilleszkednének a munkakörnyezetbe, és gondosan végrehajtott SOP-ok formájában megismerkednének a csapatmunkával, a személyzet biztonságával, a betegek magánéletével, a minták minőségével és a legjobb gyakorlatokkal.

A harmonizáció kulcsszerepe van a biobank-hálózat kialakításában, de számos etikai és jogi probléma megoldásra szorul. Az etikai és jogi keretekkel, valamint a nemzeti jogszabályokkal foglalkozó szakértőket felkérik, hogy vegyenek részt a biobank-hálózatok fejlesztésének teljes folyamatában, biztosítsák a donorok védelmét és biztosítsák mintáik megfelelő felhasználását.