Biomarkører i blod- og benmargsprøver fra pasienter med akutt lymfatisk leukemi

MÅL:

• For å utføre høyoppløselig, genomomfattende profilering av endringer i DNA-kopinummer og tap av heterozygositet i prøver fra voksne pasienter med akutt lymfatisk leukemi (ALL) oppnådd ved diagnose.
• For å utføre kandidatgenresekvensering av diagnostiske ALLE prøver.
• Å undersøke korrelasjon av genetiske endringer med utfall.
• Å undersøke korrelasjonen mellom mikroarray multi-gen og multi-exon ekspresjonssignaturer med spesifikke endringer og utfall.
• For å forstå genetiske hendelser som bidrar til dannelse, utvikling og tilbakefall av voksen ALL ved å integrere kopinummer og sekvensendringer med multigensignaturene, og ved å sammenligne disse dataene med data som allerede er generert i pediatrisk ALL.

OVERSIKT: Diagnostiske prøver, fullstendig remisjon og kimlinjeprøver analyseres for DNA-profilering og gensekvensering av Affymetrix SNP6.0 mikroarray-plattformen, PCR og fluorescens in situ hybridisering (FISH). Frekvensen av genetiske endringer utføres av Agilent 2100 Bioanalyzer. Resultatene sammenlignes deretter med data som allerede er generert fra pediatriske pasienter.