Studerer biomarkører i prøver fra yngre pasienter med ondartet kimcelletumorprogresjon
Genomiske signaturer av ondartet kimcelletumorprogresjon: En retrospektiv studie av bankede prøver
BAKGRUNN: Å studere prøver av blod og vev fra pasienter med kreft i laboratoriet kan hjelpe leger å lære mer om endringer som skjer i DNA og identifisere biomarkører relatert til kreft. Det kan også hjelpe leger med å finne bedre måter å behandle kreft på.
FORMÅL: Denne forskningsstudien studerer prøver fra yngre pasienter med ondartet kimcelletumorprogresjon.
Studieoversikt
Status
Detaljert beskrivelse
MÅL:
- Utforsk intertumoral heterogenitet i DNA-metylering ved tumorhistologi.
- Bestem det genomiske metyleringsmønsteret i svulstene.
- Korreler metyleringsmønster med tumorhistologi og kliniske egenskaper.
- Utfør eksomfangst og massiv parallell sekvensering på utvalgte kimcelletumorer (GCT) og matchet normalt vev.
- Utfør eksomfangst og Solexa-sekvensering på et utvalgt sett med GCT-er.
- Validere kandidatmutasjoner i et uavhengig sett med svulster.
- Bestem ekspresjonsprofilen til mRNA, lincRNA og mikroRNA i svulstene ved å bruke RNA Seq.
OVERSIGT: Arkiverte blod- og tumorvevsprøver analyseres for genomisk metyleringsmønster, eksomfangst og sekvensering, og kandidatmutasjoner ved metyleringsspesifikke PCR-teknikker, single nucleotide polymorphism (SNP)-arrayer og Solexa-sekvenseringsmetoder. Resultatene valideres ved å bruke pyrosekvenseringsanalyser og primerforlengelsesanalyser. Metyleringsmønster er også assosiert med hver pasients tumorhistologi og kliniske data.
Studietype
Registrering (Forventet)
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Barn
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Kjønn som er kvalifisert for studier
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Beskrivelse
SYKDOMS KARAKTERISTIKA:
- Tumor- og blodprøver fra pasienter registrert på Children Oncology Group (COG) Germ Cell Tumor Protocols, og fra andre studiesteder for ikke-COG-pasienter, inkludert Children's Medical Center, Dallas og Dana-Farber Cancer Institute, Boston
- Pasientenes kliniske data
PASIENT EGENSKAPER:
- Ikke spesifisert
FØR SAMTIDIG TERAPI:
- Ikke spesifisert
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
|---|
|
Begivenhetsfri overlevelse
|
|
Genomiske prognostiske signaturer assosiert med GCTS
|
|
Genetiske varianter som bidrar til GCTS-patogenesen
|
|
Ekspresjon av ulike former for RNA
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Sponsor
Samarbeidspartnere
Etterforskere
- Hovedetterforsker: James F. Amatruda, MD, PhD, Simmons Cancer Center
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart
Primær fullføring (Faktiske)
Studiet fullført (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Anslag)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Anslag)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Nøkkelord
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- AGCT11B2 (Annen identifikator: Children's Oncology Group)
- COG-AGCT11B2 (Annen identifikator: Children's Oncology Group)
- NCI-2011-03456 (Registeridentifikator: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .