Estudio de biomarcadores en muestras de pacientes más jóvenes con progresión tumoral maligna de células germinales

OBJETIVOS:

• Explore la heterogeneidad intertumoral en la metilación del ADN por histología tumoral.
• Determinar el patrón de metilación genómica en los tumores.
• Correlacione el patrón de metilación con la histología del tumor y las características clínicas.
• Lleve a cabo la captura del exoma y la secuenciación paralela masiva en tumores de células germinales seleccionados (TCG) y tejido normal compatible.
• Realice la captura del exoma y la secuenciación de Solexa en un conjunto seleccionado de GCT.
• Valide mutaciones candidatas en un conjunto independiente de tumores.
• Determinar el perfil de expresión de mRNAs, lincRNAs y microRNAs en los tumores utilizando RNA Seq.

ESQUEMA: Las muestras archivadas de sangre y tejido tumoral se analizan en busca de patrones de metilación genómica, captura y secuenciación del exoma y mutaciones candidatas mediante técnicas de PCR específicas de metilación, matrices de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) y métodos de secuenciación de Solexa. Los resultados se validan mediante ensayos de pirosecuenciación y ensayos de extensión de cebadores. El patrón de metilación también está asociado con la histología del tumor y los datos clínicos de cada paciente.