Étudier des biomarqueurs dans des échantillons de patients plus jeunes présentant une progression tumorale maligne des cellules germinales

OBJECTIFS:

• Explorer l'hétérogénéité inter-tumorale dans la méthylation de l'ADN par histologie tumorale.
• Déterminer le modèle de méthylation génomique dans les tumeurs.
• Corréler le schéma de méthylation avec l'histologie tumorale et les caractéristiques cliniques.
• Effectuez une capture d'exome et un séquençage massivement parallèle sur des tumeurs germinales sélectionnées (GCT) et des tissus normaux appariés.
• Effectuer la capture d'exome et le séquençage Solexa sur un ensemble sélectionné de GCT.
• Validez les mutations candidates dans un ensemble indépendant de tumeurs.
• Déterminer le profil d'expression des ARNm, des lincARN et des microARN dans les tumeurs à l'aide de l'ARN Seq.

APERÇU : Les échantillons de sang et de tissus tumoraux archivés sont analysés pour le modèle de méthylation génomique, la capture et le séquençage de l'exome, et les mutations candidates par des techniques de PCR spécifiques à la méthylation, des puces à polymorphisme nucléotidique unique (SNP) et des méthodes de séquençage Solexa. Les résultats sont validés en utilisant des tests de pyroséquençage et des tests d'extension d'amorce. Le schéma de méthylation est également associé à l'histologie tumorale et aux données cliniques de chaque patient.