Proteogenomisk overvåking og vurdering av levertransplantasjonsmottakere ("Mini-Liver")

Med bruken av mer sensitive molekylære teknikker, har biomarkører for nyretransplantasjonsavvisning blitt foreslått som potensielt er mye mer sensitive, spesifikke og raskt testbare enn konvensjonelle prediktorer for graftfunksjon som GFR eller vevsbiopsier. Noen av de tidlige biomarkørene under denne evolusjonen var de cytotoksiske T-celle (CTL) transkripsjonene som perforin, granzyme B og fas ligand 11-13 for akutt avvisning. Når det gjelder CAN/IFTA og CKD forblir de molekylære mekanismene og testbare biomarkørene også uklare. Noen få studier har rapportert involvering av TGF-beta, ekstracellulære matriseproteiner som fibronektin og trombopondin og vevshemmere av metalloproteiner (TIMPs) som oppregulert hos pasienter med kronisk allograft nefropati (CAN/IFTA). De fleste av disse studiene ble gjort i nyretransplantasjonsbiopsier, og utfordringen med å teste deres uttrykk og korrelasjon i PBL som et minimalt invasivt verktøy ble bare tatt opp i noen få studier. En annen begrensning ved disse første studiene var mangelen på kraften til å profilere gener globalt. For dette formål har bruken av DNA-mikroarrayer ført til et kvantesprang i evnen til å profilere tusenvis av gener samtidig. Så langt har mikroarray-analyse blitt rapportert i nyretransplantasjonsstudier som impliserer gensignaturer for akutt avstøtning i transplantasjonsbiopsier så vel som for første gang av oss i perifert blod. Så vidt vi vet har kun to studier forsøkt å profilere CAN/IFTA i perifert blod. En fersk studie forsøkte å validere tre gener som ble avledet fra en mikroarray-analyse av nyrebiopsier ved bruk av RT-qPCR. Alle tre gener ble signifikant differensielt uttrykt i urin, men ikke i PBL. En annen studie med mikroarrayer viste at blant et panel av 49 perifere blodgener som ble påstått å skille "operasjonell toleranse" ved nyreavvisning, kunne 33 gener også skille "kronisk avvisning" med 86 % spesifisitet.

De fleste studiene i litteraturen, inkludert vår egen, så vel som våre nyere upubliserte genekspresjonsstudier av perifert blod av AR og CAN/IFTA avslører klare molekylære signaturer for begge disse formene for transplantasjonsutfall. I sum etablerer disse dataene et første bevis på at genuttrykksprofilering av perifert blod kan brukes til å utvikle markører for nyre-allograftavvisning og kronisk nyreskade.