Monitoraggio proteogenomico e valutazione dei destinatari del trapianto di fegato ("Mini-Liver")

Con l'avvento di tecniche molecolari più sensibili, sono stati proposti biomarcatori di rigetto del trapianto di rene che sono potenzialmente molto più sensibili, specifici e rapidamente testabili rispetto ai predittori convenzionali della funzione del trapianto come GFR o biopsie tissutali. Alcuni dei primi biomarcatori durante questa evoluzione erano le trascrizioni delle cellule T citotossiche (CTL) come la perforina, il granzima B e il ligando fas 11-13 per il rigetto acuto. Nel caso di CAN/IFTA e CKD anche i meccanismi molecolari ei biomarcatori testabili rimangono poco chiari. Alcuni studi hanno riportato il coinvolgimento di TGF-beta, proteine ​​della matrice extracellulare come fibronectina e trombopondina e inibitori tissutali delle metalloproteine ​​(TIMP) come sovraregolati in pazienti con nefropatia cronica da allotrapianto (CAN/IFTA). La maggior parte di questi studi è stata condotta su biopsie di trapianto di rene e la sfida di testare la loro espressione e correlazione in PBL come strumento minimamente invasivo è stata affrontata solo in pochi studi. Un altro limite di questi primi studi era la mancanza del potere di profilare i geni a livello globale. A tal fine, l'avvento dei microarray di DNA ha portato a un salto di qualità nella capacità di profilare migliaia di geni contemporaneamente. Finora, l'analisi dei microarray è stata riportata negli studi sui trapianti di rene che implicano le firme geniche per il rigetto acuto nelle biopsie dei trapianti e per la prima volta da noi nel sangue periferico. A nostra conoscenza, solo due studi hanno provato a profilare CAN/IFTA nel sangue periferico. Uno studio recente ha tentato di convalidare tre geni derivati ​​da un'analisi di microarray di biopsie renali mediante RT-qPCR. Tutti e tre i geni erano significativamente differenzialmente espressi nelle urine ma non in PBL. Un altro studio che utilizzava i microarray ha mostrato che tra un pannello di 49 geni del sangue periferico che si presumeva distinguessero la "tolleranza operativa" nel rigetto renale, 33 geni potevano anche distinguere il "rigetto cronico" con una specificità dell'86%.

La maggior parte degli studi in letteratura, compresi i nostri, così come i nostri più recenti studi non pubblicati sull'espressione genica del sangue periferico di AR e CAN/IFTA rivelano chiare firme molecolari per entrambe queste forme di esiti del trapianto. In sintesi, questi dati stabiliscono una prima prova del concetto che il profilo di espressione genica del sangue periferico può essere utilizzato per sviluppare marcatori di rigetto di allotrapianto renale e danno renale cronico.