Monitorowanie proteogenomiczne i ocena biorców przeszczepów wątroby ("Mini-Liver")

Wraz z pojawieniem się bardziej czułych technik molekularnych zaproponowano biomarkery odrzucenia przeszczepu nerki, które są potencjalnie znacznie bardziej czułe, specyficzne i szybko testowalne niż konwencjonalne czynniki prognostyczne funkcji przeszczepu, takie jak GFR lub biopsje tkanek. Niektóre z wczesnych biomarkerów podczas tej ewolucji to transkrypty cytotoksycznych komórek T (CTL), takie jak perforyna, granzym B i ligand fas 11-13 do ostrego odrzucania. W przypadku CAN/IFTA i CKD mechanizmy molekularne i testowalne biomarkery również pozostają niejasne. Kilka badań wykazało, że TGF-beta, białka macierzy pozakomórkowej, takie jak fibronektyna i trombopondyna oraz tkankowe inhibitory metaloprotein (TIMP), są regulowane w górę u pacjentów z przewlekłą nefropatią alloprzeszczepu (CAN/IFTA). Większość z tych badań przeprowadzono na biopsjach przeszczepów nerki, a wyzwanie polegające na zbadaniu ich ekspresji i korelacji w PBL jako narzędziu minimalnie inwazyjnym zostało podjęte tylko w kilku badaniach. Kolejnym ograniczeniem tych pierwszych badań był brak możliwości globalnego profilowania genów. W tym celu pojawienie się mikromacierzy DNA przyniosło kwantowy skok w możliwości profilowania tysięcy genów jednocześnie. Do tej pory opisano analizę mikromacierzy w badaniach nad przeszczepami nerek, implikując sygnatury genowe dla ostrego odrzucenia w biopsjach przeszczepów, a także po raz pierwszy przez nas we krwi obwodowej. Według naszej wiedzy tylko w dwóch badaniach próbowano profilować CAN/IFTA we krwi obwodowej. W niedawnym badaniu podjęto próbę walidacji trzech genów pochodzących z analizy mikromacierzy biopsji nerki przy użyciu RT-qPCR. Wszystkie trzy geny ulegały znacząco zróżnicowanej ekspresji w moczu, ale nie w PBL. Inne badanie z wykorzystaniem mikromacierzy wykazało, że spośród panelu 49 genów krwi obwodowej, które rzekomo rozróżniają „tolerancję operacyjną” w przypadku odrzucenia nerki, 33 geny mogą również rozróżniać „przewlekłe odrzucanie” z 86% specyficznością.

Większość badań w literaturze, w tym nasze własne, jak również nasze nowsze niepublikowane badania ekspresji genów krwi obwodowej AR i CAN / IFTA, ujawniają wyraźne sygnatury molekularne dla obu tych form wyników przeszczepów. Podsumowując, dane te stanowią pierwszy dowód koncepcji, że profilowanie ekspresji genów krwi obwodowej można wykorzystać do opracowania markerów odrzucenia alloprzeszczepu nerki i przewlekłego uszkodzenia nerek.