Proteogenomische monitoring en beoordeling van ontvangers van levertransplantaties ("Mini-Liver")

Met de komst van meer gevoelige moleculaire technieken zijn er biomarkers van afstoting van niertransplantaten voorgesteld die potentieel veel gevoeliger, specifieker en sneller testbaar zijn dan conventionele voorspellers van transplantaatfunctie zoals GFR of weefselbiopten. Enkele van de vroege biomarkers tijdens deze evolutie waren de cytotoxische T-cel (CTL) transcripten zoals perforine, granzyme B en fas ligand 11-13 voor acute afstoting. In het geval van CAN/IFTA en CKD blijven ook de moleculaire mechanismen en testbare biomarkers onduidelijk. Enkele onderzoeken hebben de betrokkenheid van TGF-bèta, extracellulaire matrixeiwitten zoals fibronectine en trombopondine en weefselremmers van metalloproteïnen (TIMP's) gemeld als opgereguleerd bij patiënten met chronische allograftnefropathie (CAN/IFTA). De meeste van deze studies werden uitgevoerd in biopsieën van niertransplantaties en de uitdaging om hun expressie en correlatie in PBL te testen als een minimaal invasieve tool, werd slechts in enkele studies behandeld. Een andere beperking van deze eerste studies was het gebrek aan vermogen om genen wereldwijd te profileren. Daartoe heeft de komst van DNA-microarrays geleid tot een enorme sprong voorwaarts in het vermogen om duizenden genen tegelijkertijd te profileren. Tot nu toe is microarray-analyse gerapporteerd in onderzoeken naar niertransplantaties die gensignaturen impliceren voor acute afstoting in transplantatiebiopten en voor het eerst door ons in perifeer bloed. Voor zover wij weten, hebben slechts twee studies geprobeerd om CAN/IFTA in perifeer bloed te profileren. Een recente studie probeerde drie genen te valideren die waren afgeleid van een microarray-analyse van nierbiopten met behulp van RT-qPCR. Alle drie de genen werden significant differentieel tot expressie gebracht in urine, maar niet in PBL. Een ander onderzoek met behulp van microarrays toonde aan dat van een panel van 49 perifere bloedgenen waarvan werd beweerd dat ze onderscheid maakten tussen "operationele tolerantie" bij nierafstoting, 33 genen ook "chronische afstoting" konden onderscheiden met een specificiteit van 86%.

De meeste onderzoeken in de literatuur, waaronder die van ons, evenals onze recentere niet-gepubliceerde onderzoeken naar genexpressie in perifeer bloed van AR en CAN/IFTA onthullen duidelijke moleculaire handtekeningen voor beide vormen van transplantatieresultaten. Kortom, deze gegevens vormen een eerste proof of concept dat profilering van genexpressie in perifeer bloed kan worden gebruikt om markers van niertransplantaatafstoting en chronisch nierletsel te ontwikkelen.